Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

Abstrak :
Penelitian bertujuan untuk memperoleh dan mengidentifikasi isolat-isolat bakteri endofit yang potensial senyawa bioaktif antidiare dari tanaman N. altissima; mendeteksi, memurnikan dan mengidentifikasi senyawa bioaktif antidiare yang dihasilkan; serta menganalisis mekanisme kerjanya dalam menghambat pertumbuhan bakteri uji. Bakteri endofit diisolasi dari bagian akar, kulit batang, dan daun tanaman N. altissima. Bakteri endofit diisolasi dan dimurnikan menggunakan medium Nutrient Agar NA dan Luria Bertani LB agar. Aktinomisetes endofit diisolasi dan dimurnikan menggunakan medium Starch Casein Agar SCA dan International Streptomyces Project ISP 2 agar. Identifikasi bakteri dan aktinomisetes endofit dilakukan secara molekuler dengan melakukan analisis filogenetik sekuen nukleotida bakteri dari daerah 16S rRNA dengan metode Neighbour Joining NJ . Isolasi dan purifikasi senyawa dilakukan dengan metode maserasi menggunakan pelarut etil asetat dan kromatografi kolom. Senyawa bioaktif dideteksi dengan teknik Kromatografi Lapis Tipis KLT bioautografi. Senyawa bioaktif yang dihasilkan oleh bakteri dan aktinomisetes endofit diidentifikasi dengan menggunakan KLT, spektroskopi Resonansi Magnetik Inti NMR dan Spektroskopi Massa LC-MS . Mekanisme aksi dari senyawa bioaktif antidiare dianalisis dengan menggunakan mikroskop elektron scanning SEM . Dari 185 isolat bakteri endofit yang diperoleh, 104 isolat 56,21 dari bagian daun; 51 isolat 27,56 dari bagian kulit batang; dan 30 isolat 16,21 dari bagian akar. Sedangkan dari 33 isolat aktinomisetes endofit yang diperoleh, dua isolat 6,06 dari bagian kulit batang, 31 isolat 93,94 dari bagian akar, dan tidak diperoleh isolat aktinomisetes dari daun. Spesies bakteri endofit potensial ialah Pseudomonas aeruginosa strain UICC B-40, P. aeruginosa strain UICC B-93, dan P. azotoformans strain UICC B-91. Sedangkan aktinomisetes endofit potensial diidentifikasi sebagai Streptomyces sp. strain UICC B-92 dan Nonomuraea sp. strain UICC B-94. Hasil identifikasi senyawa menunjukkan bahwa senyawa bioaktif yang diperoleh dari P. aeruginosa strain UICC B-40 diduga merupakan senyawa metabolit baru, terdiri atas 2E,5E -phenyl tetradeca-2,5-dienoate C20H28O2 . Senyawa bioaktif aktinomisetes Streptomyces sp. strain UICC B-92 ialah 4-O-glucocyl, 1-carboxyl-phenazine C19H18N2O8 . Senyawa turunan phenazine dengan adanya gugus gula dari isolat Streptomyces sp. strain UICC B-92 diduga merupakan senyawa bioaktif baru. Hasil bioassai aktivitas antibakteri menunjukkan baik senyawa bioaktif dari P. aeruginosa strain UICC B-40 maupun Streptomyces sp. strain UICC B-92 menghambat bakteri Gram positif Bacillus cereus strain ATCC 10876 dan Staphylococcus aureus strain ATCC 25923. Mekanisme penghambatan dari kedua senyawa menunjukkan adanya aktivitas lisis terhadap membran sel bakteri uji, ditunjukkan dengan terjadinya pemanjangan ukuran sel, kerusakan dan kebocoran membran sel sehingga mengganggu permeabilitas membran sel dan akhirnya menyebabkan kematina sel. Senyawa metabolit P. aeruginosa strain UICC B-40 lebih potensial sebagai senyawa antidiare dibandingkan senyawa metabolit dari Streptomyces sp. strain UICC B-92.Kata kunci : antidiare, bakteri endofit, 16S rRNA, lisis, Neesia altissima, spektroskopi.

---

The aims of this study were to obtain potential endophytic bacteria and actinomycetes from N. altissima as anti diarrhea bioactive producer and to screen and identify their anti diarrhea bioactive compound and to investigate the mechanism of action of the bioactive compound in inhibiting the growth of diarrhea causing bacteria. Media for endophytic bacteria isolation and purification were NA and LB agar, while media for endophytic actinomycetes isolation and purification were SCA and ISP2 agar. Identification of endophytic bacteria and actinomycetes was carried out based on phylogenetic analysis of DNA sequence generated from 16S rRNA region. Isolation, purification, and detection of bioactive compounds were carried out using maceration process, column chromatography and Thin Layer Chromatography TLC bioautography, respectively. Identification were elucidated using Nuclear Magnetic Resonance NMR and Liquid Chromatography Mass Spectroscopy LC MS analyses. The mechanism of action of bioactive compound were morphologically observed using scanning electron microscope SEM . In this study, from a total 185 endophytic bacteria obtained, 104 isolates 56.21 obtained from leaves, 30 isolates 16.21 from roots, and 51 isolates 27.56 from stem barks. From a total 33 endophytic actinomycetes isolates obtained, 31 isolates 93.94 from roots, two isolates 6.06 from stem barks, and no isolates obtained from leaves. Based on phylogenetic analysis of nucleotide sequence generated from 16S rRNA region, two isolates of endophytic bacteria determined as P. aeruginosa strain UICC B 40 and one isolate belongs to P. azotoformans strain UICC B 91 two isolates of endophytic actinomycetes determined as Streptomyces sp. strain UICC B 92 and Nonomuraea sp. strain UICC B 94 . On the basis of 1H NMR spectral data and supported with molecular weight data from LC MS analysis, bioactive compound from P. aeruginosa strain UICC B 40 was identified as growth associated metabolite, and determined as 2E,5E phenyl tetradeca 2,5 dienoate C20H28O2 . In addition, bioactive compound from Streptomyces sp. strain UICC B 92 was identified as 4 O glucocyl, 1 carboxyl phenazine C19H18N2O8 . The bioactive compound from Streptomyces sp. strain UICC B 92 is suggested as novel type of phenazine derivative. All of bioactive compounds showed high in vitro antibacterial activity against two Gram positive bacteria, Bacillus cereus strain ATCC 10876 and Staphylococcus aureus strain ATCC 25923. The bioactive compounds from P. aeruginosa strain UICC B 40 and Streptomyces sp. strain UICC B 92 showed membrane cell walls lysis mechanism. The cell walls of S. aureus strain ATCC 25923 and B. cereus strain ATCC 10876 were apparently damaged after treated by the antibacterial compound. Occurrence of local rupture or pore formation in the cell membranes was also found and causing leakage of essential intracellular constituents from the cells. The bioactive compound from P. aeruginosa strain UICC B 40 is more potential as anti diarrhea compound than that from Streptomyces sp. strain UICC B 92.Key words antidiarrhea, endophyte bacteria, 16S rRNA, lysis, Neesia altissima, spectroscopy.

Abstrak :
Lipoprotein (a) adalah suatu lipoprotein plasma yang mempunyai struktur dan komposisi yang mirip dengan lipoprotein berdensitas rendah (LDL) dengan tambahan apo(a) yang terikat pada apo B100. Struktur apo(a) mirip dengan plasminogen, suatu proenzim dalam sistem fibrinolitik. Oleh karena kemiripan ini, diduga Lp(a) dapat menghambat aktivitas plasminogen dan menurunkan aktivitas fibrinolitik. Penelitian ini bertujuan untuk membuktikan bahwa penambahan Lp(a) ke dalam plasma normal dapat menghambat aktivitas fibrinolitik. Subyek penelitian terdiri atas 4 orang sehat dengan kadar fibrinogen, aktivitas plasminogen dan masa lisis bekuan euglobulin dalam batas normal. Pada percobaan pertama, penambahan Lp(a) dilakukan sebelum sentrifugasi untuk memperoleh endapan euglobulin, sedang pada percobaan kedua Lp(a) ditambahkan pada endapan euglobulin. Sebagai kontrol, masa lisis bekuan euglobulin dikerjakan pada plasma yang ditambahkan NaCl 0,9% dengan volume yang sama seperti Lp(a). Hasil penelitian menunjukkan bahwa pada percobaan pertama tidak ada bekuan yang terbentuk. Diduga Lp(a) dapat mengikat fibrinogen dan keduanya berada di supernatan, sehingga tidak ada fibrinogen dalam endapan euglobulin yang dapat dibekukan oleh trombin. Pada percobaan kedua, sampai hari ke empat bekuan belum lisis. Kesimpulan: Penambahan Lp(a) ke dalam plasma normal dapat menghambat aktivitas sistem fibrinolitik. (Med J Indones 2004; 13: 135-9)

---

Lipoprotein(a) is a plasma lipoprotein whose structure and composition are similar with low density lipoprotein (LDL) with an addition of apo(a) that is bound to apo B100. The structure of apo(a) is similar with plasminogen, a proenzym in fibrinolytic system. Due to this similarity, it is assumed that Lp(a) can inhibit plasminogen activity and decreases fibrinolytic activity. The purpose of this study is to prove that addition of Lp(a) to normal plasma can inhibit fibrinolytic activity. Four healthy people whose fibrinogen levels, plasminogen activities and euglobulin clot lysis time were within normal range were enrolled in this study. Fibrinolytic activity were assessed by euglobulin clot lysis time (ECLT). In the first experiment, the addition of Lp(a) was done before centrifugation to obtain euglobulin precipitates, while in the second experiment, Lp(a) was added to the euglobulin precipitates. As a control, ECLT was performed in the plasma with the addition of NaCl 0.9% in the same volume with Lp(a). The results of the study showed that in the first experiment, there was no clot formation. It is assumed that Lp(a) can bind fibrinogen and both of them floated in the supernatant, so there was no fibrinogen in the euglobulin precipitate that can be clotted by thrombin. In the second experiment, the clot did not dissolve until the fourth day. In conclusion, the addition of Lp(a) to normal plasma can inhibit the activity of fibrinolytic system. (Med J Indones 2004; 13: 135-9)

Abstrak :

Pemanfaatan bakteri telah banyak dilakukan pada banyak aspek kehidupan manusia dan menghasilkan dampak yang positif. Salah satu pemanfaatannya adalah asam laktat dan bakteriosin yang diekskresikan dari bakteri Streptococcus macedonicus. Bakteri Streptococcus macedonicus MBF10-2 adalah salah satu galur dari bakteri asam laktat yang diketahui memiliki potensi aktivitas antimikroba terhadap beberapa bakteri Gram positif. Aktivitas antimikroba ini diharapkan dapat dikembangkan sebagai produk perawatan kulit. Dalam penelitian ini digunakan medium berbasis nabati yaitu de Man, Rogose, dan Sharpe (MRS) Vegitone untuk menjamin kehalalan dari proses dan produk akhir. Oleh karena itu, penelitian ini bertujuan untuk memperoleh kondisi optimum perolehan massa sel terbanyak selama fermentasi pada medium de Man, Rogose, Sharpe (MRS) Vegitone pada skala yang diperbesar untuk meningkatkan produksi lisat. Optimasi kondisi optimum perolehan massa sel dilakukan dengan melakukan pengkulturan sel secara bertahap hingga skala besar pada fermentor. Optimasi pelisisan sel dilakukan dengan cara menggunakan metode ultrasonikasi dan gabungan dari ultrasonikasi dengan penambahan lisozim (enzimatik) dengan kondisi pada pH 7 dan 8 dengan pengulangan 20x dan 40x. Pengujian untuk mengkonfirmasi bahwa bakteri sudah terlisis dengan baik yaitu menggunakan pewarnaan Gram dan pengujian MTT Assay. Hasil percobaan menunjukkan bahwa perolehan massa sel yang didapat pada medium MRS Vegitone adalah 7.987 gram, dan perolehan massa sel pada medium MRS standar adalah 8.7013 gram. Hasil dari optimasi lisis menunjukkan bahwa metode gabungan ultrasonikasi dan enzimatik dengan kondisi pH 8 dan pengulangan 40x memberikan hasil yang lebih baik, dibuktikan dengan pengujian perwarnaan Gram yang menunjukkan bahwa sel yang terlisis paling banyak dan rendemen hasil freeze dry sebesar 5.7267%. Dari pengujian MTT Assay juga menunjukkan bahwa sel telah terlisis dengan baik. Dapat disimpulkan bahwa waktu inkubasi optimum medium MRS Vegitone adalah 16 jam dengan efisiensi jumlah massa sel pada medium MRS Vegitone adalah 8,21% lebih sedikit jika dibandingkan dengan medium MRS Standar dan kondisi lisis yang optimum adalah dengan metode gabungan ultrasonikasi dan enzimatik dengan kondisi pH 8 dan pengulangan 40x dengan perolehan rendemen hasil freeze dry sebesar 5.7267%.

---

The use of bacteria has been done in many aspects of human life and has a positive impact. Several of the potential substance are lactic acid and bacteriocin. One of the example is Streptococcus macedonicus. Streptococcus macedonicus MBF10-2 is one of the strains of lactic acid bacteria that have antimicrobial activity against several Gram-positive bacteria. This antimicrobial activity is expected to be developed as a skin care product. In this study, vegetable-based medium was used, namely de Man, Rogose, and Sharpe (MRS) Vegitone to ensure halalness of the process and final product. Therefore, this study aims to obtain the optimum conditions for obtaining the most cell mass gain during fermentation in the de Man, Rogose, and Sharpe (MRS) Vegitone on a scale that is enlarged to increase lysate production. Optimization of the optimum conditions for cell mass gain was done by culturing cells gradually to a large scale in fermentor. Optimization of cell lysis is done by using ultrasonication method and a combination of ultrasonication with the addition of lysozyme (enzymatic) with conditions at pH 7 and 8 with repetitions of 20 times and 40 times. Tests to confirm that the bacteria has been properly destroyed, that is, using Gram staining and MTT assay. The results showed that the cell mass gain obtained in the MRS Vegitone medium was 7.987 grams and the cell mass gain obtained in Standard MRS medium was 8.7013 grams. The results of lysis optimization showed that the combined method of ultrasonication and enzymatic with condition at pH 8 with repetitions of 40 times gave better results, proven by the Gram staining test which showed that the most cells are destroyed and the freeze dry yield was 5.7267 %. In MTT assay also shows that the cell has been properly destroyed. It can be concluded that the optimum incubation time of MRS Vegitone medium is 16 hours with the efficiency of cell mass in the MRS Vegitone medium was 8.21% less when compared to the standard MRS medium and the optimum lysis condition is the combined of ultrasonication and enzymatic method with pH 8 and 40 times repetition with the yield of freeze dry is 5.7267%.