Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

Abstrak :
Studi keragaman genetik dilakukan untuk mengetahui hubungan kekerabatan bakteri asam laktat indigenos Indonesia yang memiliki kemampuan resistansi terhadap chloramphenicol dan erythromycin. Hasil uji resistansi menunjukkan bahwa isolat DH1, DH7, dan S34 resistan terhadap chloramphenicol (5 μg/ml), sedangkan isolat T8 resistan terhadap erythromycin (15 μg/ml). Isolat D2, S23, dan T8 diketahui resistan terhadap kombinasi chloramphenicol dan erythromycin (1 μg/ml). Analisis BLAST menunjukkan bahwa isolat bakteri asam laktat terdiri atas Lactobacillus plantarum, L. fermentum, Pediococcus acidilactici, dan P. pentosaceus. Analisis pohon filogenetik diketahui bahwa isolat D2, S12, S34, T3, dan T8 memiliki kekerabatan yang dekat dengan L. plantarum. Isolat R31 dan DH1 memiliki kekerabatan yang dekat dengan L. fermentum. Isolat LK14, S23, R24, DH7,DS13, GR3, HB3 memiliki kekerabatan yang dekat dengan genus Pediococcus.

---

Study on genetic diversity was useful to determine the kinship of Indigenous Indonesia lactic acid bacteria which have the capability of resistance to chloramphenicol and erythromycin. The resistance test showed isolates DH1, DH7, and S34 that were resistant to chloramphenicol (5 μg/ml), whereas T8 was resistant to erythromycin (15 μg/ml). Isolates D2, S23, and T8 were remain resistant to the combination of chloramphenicol and erythromycin (1 μg/ml). The results of BLAST analysis showed that there were four different species of lactic acid bacteria, such as Lactobacillus plantarum, L. fermentum, Pediococcus acidilactici, and P. pentosaceus. The results of phylogenetic trees analysis showed that isolates D2, S12, S34, T3, and T8 have a close kinship with L. plantarum, whereas isolates R31 and DH1 have a close kinship with L. fermentum. Moreover, isolates LK14, S23, R24, DH7, DS13, GR3, HB3 have a close kinship to the genus Pediococcus.

Abstrak :
Penelitian bertujuan untuk mendeteksi gen resistan chloramphenicol dan erythromycin pada plasmid bakteri asam laktat (BAL) yang diisolasi dari pangan fermentasi tradisional Indonesia. Sebanyak 120 isolat bakteri asam laktat diuji resistansinya terhadap chloramphenicol 2 μg/ml dan erythromycin 1 μg/ml. Hasil penapisan menunjukkan sebanyak 49 isolat resistan terhadap chloramphenicol dan 16 isolat resistan terhadap erythromycin. Isolasi plasmid dilakukan pada isolat yang resistan dan diketahui plasmid terdapat pada isolat D2, T8, dan S34. Plasmid tersebut selanjutnya dideteksi dengan menggunakan lima pasang primer, yaitu cat, catpIP501, ermB, ermC, dan Tn554. Hasil menunjukkan gen resistan chloramphenicol (cat) berhasil dideteksi pada plasmid BAL dari pangan fermentasi tradisional Indonesia, sedangkan gen resistan erythromycin (ermB) tidak berhasil dideteksi. ...... The research investigated to detect the chloramphenicol and erythromycin resistance genes on plasmid of lactic acid bacteria (LAB) isolated from Indonesian traditional fermented foods. A total 120 isolates were screened for resistance to 2 μg/ml chloramphenicol and 1 μg/ml erythromycin. The result showed that 49 isolates were resistance to chloramphenicol and 16 isolates were resistance to erythromycin. Plasmids from potential isolates then isolated and has been known there were in isolate D2, T8, and S34. Plasmids then has been detected with 5 pairs of specific primers: cat, catpIP501, ermB, ermC, and Tn554. The result showed that chloramphenicol resistance gene (cat) has successfully detected on plasmid of LAB from Indonesian traditional fermented foods, however the erythromycin resistance gene (ermB) has not detected.

Abstrak :
Pengembangan biosensor dengan kombinasi DNA aptamer dari penislin G dan nanopartikel emas (AuNP) digunakan untuk mendeteksi penisilin G. Kondisi optimum aptasensor diperoleh dengan konsentrasi NaCl dan aptamer masing-masing 0,25 M dan 2 μM. Uji sensitifitas menunjukkan nilai limit deteksi aptasensor penisilin G sebesar 1 mg/L dan mampu mendeteksi penislin G dalam kisaran 1-27 mg/L. Aptasensor penisilin G menujukkan hasil yang spesifik dalam mendeteksi penisilin G setelah dilakukan uji dengan beberapa antibiotik; ampisilin, kanamisin, kloramfenikol dan eritromisin. Hasil mutasi iradiasi ultaviolet dan iradiasi gamma terhadap P.chrysogenum tipe liar menunjukkan peningkatan produksi pensilin G secara signifikan. Melalui metode deteksi aptasensor menunjukkan bahwa penisilin G dari strain P. chrysogenum tipe liar, mutan (iradiasi ultraviolet), mutan (iradiasi gamma), serta mutan (iradiasi ultraviolet dan iradiasi gamma) masing-masing menunjukkan konsentrasi deteksi sebesar 9,75 ± 0,004; 25,25 ± 0,005; 37,5 ± 0,005; dan 45 ± 0,004 mg/L. ......The development of biosensors with a combination of aptamer DNA from penislin G and gold nanoparticles (AuNP) was used to detect penicillin G. The optimum condition of aptasensor was obtained with NaCl and aptamer concentrations of 0.25 M and 2 μM, respectively. The sensitivity test showed the aptasensor penicillin G detection limit value of 1 mg/L and was able to detect penicline G in the range 1-27 mg/L. Aptasensor penicillin G shows specific results in detecting penicillin G after testing with several antibiotics ampicillin, kanamycin, chloramphenicol and erythromycin. The results of ultaviolet irradiation and gamma irradiation on wild-type P. chrysogenum showed a significant increase in production of penicillin G. Through aptasensor detection method showed that penicillin G from strains of wild type P. chrysogenum, mutants (ultraviolet irradiation), mutants (gamma irradiation), and mutants (ultraviolet irradiation and gamma irradiation) showed detection concentrations of 9.75 ± 0.004; 25.25 ± 0.005; 37.5 ± 0.005; and 45 ± 0.004 mg / L, respectively.

Abstrak :

Enteropatogenik Escherichia coli (EPEC) merupakan salah satu bakteri patogen gram negatif yang menjadi penyebab diare khususnya pada bayi dan anak-anak. Aptamer yaitu oligonukleotida rantai pendek yang memiliki afinitas, spesifisitas, dan selektivitas yang tinggi terhadap targetnya, dimana memiliki potesi untuk dikembangkan dalam metode diagnosa patogen. Melalui metode Systematic Evolution of Ligands by Exponential Enrichment (SELEX) telah berhasil diisolasi 6 DNA Aptamer spesifik terhadap bakteri EPEC K1.1, dimana merupakan strain bakteri E.coli yang di isolasi dari anak-anak penderita diare di Indonesia. Metode karakterisasi yang dilakukan untuk melihat spesifisitas pengikatan aptamer terhadap target bakteri didapatkan dua aptamer terbaik yaitu S8-7 dan S10-5, dengan nilai Kd yang berada pada rentang nanomolar. Pengembangan kedua aptamer terbaik sebagai biosensor (Aptasensor) berbasis AuNP (nanopartikel emas) terhadap bakteri target EPEC K1.1 menunjukan adanya sensitivitas deteksi bakteri pada 10⁷ CFU/mL untuk aptamer S8-7 dan 10⁸ CFU/mL untuk aptamer S10-5, dimana dengan inkubasi lebih lama dapat mendeteksi bakteri pada 10⁶ CFU/mL. Selanjutnya kedua aptamer tersebut menunjukkan spesifisitas deteksi terhadap bakteri EPEC K1.1 dibandingkan dengan bakteri uji yang lain. Hasil tersebut menunjukkan bahwa kedua aptamer berpotensi sebagai biosensor dalam mendeteksi keberadaan bakteri patogen EPEC K1.1.

---

Enteropathogenic Escherichia coli (EPEC) is a gram-negative pathogenic bacterium that can cause diarrhea, especially in infants and children. Aptamers are short chain oligonucleotides that have high affinity, specificity, and selectivity to their targets, which have the potential to be developed as a method of diagnosing pathogens. Through the Systematic Evolution of Ligands by Exponential Enrichment (SELEX) method, 6 DNA aptamer specific to EPEC K1.1 bacteria have been isolated. EPEC K1.1 is a strain of E.coli bacteria that isolated from children with diarrhea in Indonesia. The characterization method carried out to evaluate aptamer binding specificity to bacterial target and obtained two best aptamer, S8-7 and S10-5, with Kd values in the nanomolar range. The development of the best two aptamer as Aptasensor with AuNP (gold nanoparticles)-based biosensors against the target bacteria EPEC K1.1 showed bacterial detection sensitivity or LOD (limit of detection) in 10⁷ CFU/mL for aptamer S8-7 and 10⁸ CFU/mL for aptamer S10-5, where with longer incubation it can detect bacteria at 10⁶ CFU/mL. Furthermore, the two aptamer showed specificity detection against EPEC K1.1 bacteria compared to other test bacteria. These results indicate that both aptamers have potential as biosensors in detecting pathogenic bacteria EPEC K1.1.

Abstrak :
Pendahuluan: Infeksi virus hepatitis B kronis adalah salah satu faktor utama sirosis yang dapat berkembang menjadi karsinoma hepatoseluler. Vaksin Hepatitis B (mengandung HBsAg) yang tersedia saat ini digunakan untuk pencegahan, diberikan dengan cara injeksi yang memiliki kelemahan: dapat menyebabkan rasa sakit, mengurangi kepatuhan pasien, membutuhkan biaya produksi yang lebih tinggi dan tidak dapat diterapkan dalam vaksinasi massal, sehingga perlu dilakukan pengembangan vaksin dengan pemberian secara oral. Tujuan: Mengkarakterisasi enkapsulasi kitosan alginat sebagai penghantar kombinasi HBcAg dan HBsAg sebagai kandidat vaksin oral hepatitis B. Metode: Formula vaksin dibuat dengan metode gelasi ionik. Ada dua formulasi yaitu mikropartikel HBcAg (MPS) dan mikropartikel kombinasi HBcAg and HBsAg (MPC). Parameter yang diuji meliputi loading efikasi, karakteristik partikel, respons imun IgA hari ke-51, dan IgG hari ke-21, 35, dan 51. Hasil: Loading efikasi MPS dan MPC sebesar 82,5±9,57 dan 75,0±11,78%. Ukuran rata-rata partikel (Zaverage), indeks polidispersitas/PdI, dan potensial zeta dari MPS dan MPC adalah 4869 ± 739 nm dan 8712 ± 2110 nm; 0,32 ± 0,032 dan 0,37 ± 0,088; -7,50 ± 1,82 mV dan; -2.10 ± 1,59 mV. Hasil kadar IgA hari ke-51 menunjukkan tidak adanya perbedaan yang signifikan antar kelompok perlakuan dengan rincian sebagai berikut: 61679, 69736, 62789, 72622, dan 70214 ng/mL berturut-turut untuk kelompok normal, HBcAg tanpa enkapsulasi, MPS, kombinasi HBcAg dan HBsAg, serta MPC. Sedangkan untuk kadar IgG tertinggi diperoleh pada sampel serum hari ke-21. Kesimpulan: Berdasarkan parameter loading efikasi, PdI, zeta potensial, dan ukuran partikel, serta FTIR dapat disimpulkan bahwa kombinasi HBcAg dan HBsAg dapat dienkapsulasi dalam MP kitosan alginat. ......Introduction: Chronic hepatitis B virus infection is one of the main factors of cirrhosis that can develop into hepatocellular carcinoma. The Hepatitis B vaccine (containing HBsAg) currently available for prevention and administration given by injection which has disadvantages: it can cause pain, reduce patient compliance, requires higher production costs, and cannot be applied in mass vaccination, it is necessary to develop a vaccine by giving orally. Objective: Characterizing chitosan alginate encapsulation as a combination carrier of HBcAg and HBsAg as a candidate for oral hepatitis B vaccine. Method: The vaccine formula was prepared by the ionic gelation method. There are two formulations, namely HBcAg microparticles (MPS) and combination of HBcAg and HBsAg (MPC) microparticles. The parameters tested included loading efficacy, particle characteristics, immune response IgA on day 51, and IgG on days 21, 35, and 51. Results: Loading efficacy of MPS and MPC were 82.5 ± 9.57 and 75.0 ± 11.78%. The mean particle size (Zaverage), polydispersity index/PdI, and zeta potential of MPS and MPC were 4869 ± 739 nm and 8712 ± 2110 nm; 0.32 ± 0.032 and 0.37 ± 0.088; -7.50 ± 1.82 mV and -2.10 ± 1.59 mV. The results of IgA levels on day 51 showed no significant difference between treatment groups with the following details: 61679, 69736, 62789, 72622, and 70214 ng/mL for the normal group, HBcAg without encapsulation, MPS, combination of HBcAg and HBsAg, and MPC. Meanwhile, the highest IgG levels were obtained on the 21st day of serum sample. Conclusion: Based on parameters the loading efficacy, PdI, zeta potential, and particle size, as well as FTIR, it can be concluded that the combination of HBcAg and HBsAg can be encapsulated in MP chitosan alginate.