Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

Hasil Pencarian

Ditemukan 3 dokumen yang sesuai dengan query
cover
Rina Hidayati Pratiwi
Abstrak :
Penelitian bertujuan untuk memperoleh dan mengidentifikasi isolat-isolat bakteri endofit yang potensial senyawa bioaktif antidiare dari tanaman N. altissima; mendeteksi, memurnikan dan mengidentifikasi senyawa bioaktif antidiare yang dihasilkan; serta menganalisis mekanisme kerjanya dalam menghambat pertumbuhan bakteri uji. Bakteri endofit diisolasi dari bagian akar, kulit batang, dan daun tanaman N. altissima. Bakteri endofit diisolasi dan dimurnikan menggunakan medium Nutrient Agar NA dan Luria Bertani LB agar. Aktinomisetes endofit diisolasi dan dimurnikan menggunakan medium Starch Casein Agar SCA dan International Streptomyces Project ISP 2 agar. Identifikasi bakteri dan aktinomisetes endofit dilakukan secara molekuler dengan melakukan analisis filogenetik sekuen nukleotida bakteri dari daerah 16S rRNA dengan metode Neighbour Joining NJ . Isolasi dan purifikasi senyawa dilakukan dengan metode maserasi menggunakan pelarut etil asetat dan kromatografi kolom. Senyawa bioaktif dideteksi dengan teknik Kromatografi Lapis Tipis KLT bioautografi. Senyawa bioaktif yang dihasilkan oleh bakteri dan aktinomisetes endofit diidentifikasi dengan menggunakan KLT, spektroskopi Resonansi Magnetik Inti NMR dan Spektroskopi Massa LC-MS . Mekanisme aksi dari senyawa bioaktif antidiare dianalisis dengan menggunakan mikroskop elektron scanning SEM . Dari 185 isolat bakteri endofit yang diperoleh, 104 isolat 56,21 dari bagian daun; 51 isolat 27,56 dari bagian kulit batang; dan 30 isolat 16,21 dari bagian akar. Sedangkan dari 33 isolat aktinomisetes endofit yang diperoleh, dua isolat 6,06 dari bagian kulit batang, 31 isolat 93,94 dari bagian akar, dan tidak diperoleh isolat aktinomisetes dari daun. Spesies bakteri endofit potensial ialah Pseudomonas aeruginosa strain UICC B-40, P. aeruginosa strain UICC B-93, dan P. azotoformans strain UICC B-91. Sedangkan aktinomisetes endofit potensial diidentifikasi sebagai Streptomyces sp. strain UICC B-92 dan Nonomuraea sp. strain UICC B-94. Hasil identifikasi senyawa menunjukkan bahwa senyawa bioaktif yang diperoleh dari P. aeruginosa strain UICC B-40 diduga merupakan senyawa metabolit baru, terdiri atas 2E,5E -phenyl tetradeca-2,5-dienoate C20H28O2 . Senyawa bioaktif aktinomisetes Streptomyces sp. strain UICC B-92 ialah 4-O-glucocyl, 1-carboxyl-phenazine C19H18N2O8 . Senyawa turunan phenazine dengan adanya gugus gula dari isolat Streptomyces sp. strain UICC B-92 diduga merupakan senyawa bioaktif baru. Hasil bioassai aktivitas antibakteri menunjukkan baik senyawa bioaktif dari P. aeruginosa strain UICC B-40 maupun Streptomyces sp. strain UICC B-92 menghambat bakteri Gram positif Bacillus cereus strain ATCC 10876 dan Staphylococcus aureus strain ATCC 25923. Mekanisme penghambatan dari kedua senyawa menunjukkan adanya aktivitas lisis terhadap membran sel bakteri uji, ditunjukkan dengan terjadinya pemanjangan ukuran sel, kerusakan dan kebocoran membran sel sehingga mengganggu permeabilitas membran sel dan akhirnya menyebabkan kematina sel. Senyawa metabolit P. aeruginosa strain UICC B-40 lebih potensial sebagai senyawa antidiare dibandingkan senyawa metabolit dari Streptomyces sp. strain UICC B-92.Kata kunci : antidiare, bakteri endofit, 16S rRNA, lisis, Neesia altissima, spektroskopi.
The aims of this study were to obtain potential endophytic bacteria and actinomycetes from N. altissima as anti diarrhea bioactive producer and to screen and identify their anti diarrhea bioactive compound and to investigate the mechanism of action of the bioactive compound in inhibiting the growth of diarrhea causing bacteria. Media for endophytic bacteria isolation and purification were NA and LB agar, while media for endophytic actinomycetes isolation and purification were SCA and ISP2 agar. Identification of endophytic bacteria and actinomycetes was carried out based on phylogenetic analysis of DNA sequence generated from 16S rRNA region. Isolation, purification, and detection of bioactive compounds were carried out using maceration process, column chromatography and Thin Layer Chromatography TLC bioautography, respectively. Identification were elucidated using Nuclear Magnetic Resonance NMR and Liquid Chromatography Mass Spectroscopy LC MS analyses. The mechanism of action of bioactive compound were morphologically observed using scanning electron microscope SEM . In this study, from a total 185 endophytic bacteria obtained, 104 isolates 56.21 obtained from leaves, 30 isolates 16.21 from roots, and 51 isolates 27.56 from stem barks. From a total 33 endophytic actinomycetes isolates obtained, 31 isolates 93.94 from roots, two isolates 6.06 from stem barks, and no isolates obtained from leaves. Based on phylogenetic analysis of nucleotide sequence generated from 16S rRNA region, two isolates of endophytic bacteria determined as P. aeruginosa strain UICC B 40 and one isolate belongs to P. azotoformans strain UICC B 91 two isolates of endophytic actinomycetes determined as Streptomyces sp. strain UICC B 92 and Nonomuraea sp. strain UICC B 94 . On the basis of 1H NMR spectral data and supported with molecular weight data from LC MS analysis, bioactive compound from P. aeruginosa strain UICC B 40 was identified as growth associated metabolite, and determined as 2E,5E phenyl tetradeca 2,5 dienoate C20H28O2 . In addition, bioactive compound from Streptomyces sp. strain UICC B 92 was identified as 4 O glucocyl, 1 carboxyl phenazine C19H18N2O8 . The bioactive compound from Streptomyces sp. strain UICC B 92 is suggested as novel type of phenazine derivative. All of bioactive compounds showed high in vitro antibacterial activity against two Gram positive bacteria, Bacillus cereus strain ATCC 10876 and Staphylococcus aureus strain ATCC 25923. The bioactive compounds from P. aeruginosa strain UICC B 40 and Streptomyces sp. strain UICC B 92 showed membrane cell walls lysis mechanism. The cell walls of S. aureus strain ATCC 25923 and B. cereus strain ATCC 10876 were apparently damaged after treated by the antibacterial compound. Occurrence of local rupture or pore formation in the cell membranes was also found and causing leakage of essential intracellular constituents from the cells. The bioactive compound from P. aeruginosa strain UICC B 40 is more potential as anti diarrhea compound than that from Streptomyces sp. strain UICC B 92.Key words antidiarrhea, endophyte bacteria, 16S rRNA, lysis, Neesia altissima, spectroscopy.
Depok: Universitas Indonesia, 2016
D2036
UI - Disertasi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Teni Ernawati
Abstrak :
Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengamati interaksi molekular antara alfa glukosidase dari Saccharomyces cerevisiae dengan senyawa turunan sinamamid yang disintesis dari asam sinamat. Dalam penelitian ini, senyawa turunan sinamamid disintesis dan dievaluasi untuk penghambatan alfa glukosidase. Struktur senyawa yang disintesis diidentifkasi dengan IR, H-NMR, C-NMR dan Mass Spektral. Semua senyawa turunan sinamamid menunjukkan penghambatan potensial yang lebih unggul dari bahan awal. Tiga belas senyawa turunan sinamamid menunjukkan aktivitas alfa glukosidase dengan nilai IC50 0,71-4,0 mM dengan standar 1-deoksinojirimisin dan akarbosa IC50 =0,97 mM dan IC50=1,78 mM . Studi molecular docking dilakukan untuk mengeksplorasi interaksi pengikatan kandidat turunan sinamamid dengan enzim alfa glukosidase.
The aim of this study was to observe molecular interactions between alpha glucosidase from Saccharomyces cerevisiae with cinamamide derivatives which were synthesized by amidation of cinnamic acid. In this study, a series cinamamide derivatives was synthesized and evaluated for alpha glucosidase inhibitory. The structure of synthesized compounds were characterized by IR, H NMR, C NMR and Mass Spectral analysis. All compound cinamamide derivatives showed a potent inhibition superior to the starting material. Thirteen compounds showed alpha glucosidase activity with IC50 value of 0.71 4.02 mM with the standard 1 deoxynojirimycin and acarbose IC50 0,97 mM and IC50 1.78 mM, respectively . Molecular docking studies were carried out to explore the binding interactions of cinnamamide derivative candidates with enzyme alpha glucosidase.
Depok: Universitas Indonesia, 2017
D2378
UI - Disertasi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Irma Kartika Kusumaningrum
Abstrak :
Telah dilakukan penelitian untuk mengisolasi dan mengidentifikasi senyawa kimia dari ekstrak talus lichen Parmotrema tinctorum (Despr Ex. Nyl. Hale) dan Hypotrachyna osseoalba (Vain) Y.S. Park & Hale serta menguji bioaktivitas senyawa hasil isolasi sebagai senyawa sitotoksik terhadap sel murine leukemia P-388 dan senyawa antioksidan. Ekstraksi senyawa dari talus lichen dilakukan dengan pelarut n-heksana, diklorometana, etil asetat dan aseton. Untuk melihat potensi bioaktif ekstrak lichen dilakukan uji toksisitas ekstrak terhadap Artemia salina dengan metode Brine Shrimp Lethality Test (BSLT). Berdasarkan hasil uji BSLT keseluruhan ekstrak talus lichen toksik terhadap A. salina. Uji warna dilakukan terhadap ekstrak untuk melihat jenis senyawa yang terkandung pada ekstrak talus lichen. Terdapat kandungan senyawa fenolik pada seluruh ekstrak, sedangkan depsida, metabolit sekunder pada lichen yang umumnya bersifat bioaktif banyak terdapat pada ekstrak etil asetat dan aseton. Dari hasil pemisahan dan isolasi telah diperoleh tiga senyawa murni dari ekstrak talus lichen P. tinctorum yaitu asam orselinat, metil orselinat, dan senyawa yang diusulkan sebagai senyawa baru pada ranah penelitian lichen yang diberi nama 2,4 dihidroksi 3,5-dimetil benzoat metil ester, serta dua senyawa murni dari ekstrak talus lichen H. osseoalba yaitu, asam difraktat, dan asam iso everninat. Senyawa asam iso everninat (IC50=21,5 Dg/ml) memiliki kemampuan dalam taraf sedang untuk menghambat pertumbuhan sel murine leukemia P-388, sedangkan senyawa asam orselinat, metil orselinat, 2,4 dihidroksi 3,5-dimetil benzoat metil ester, dan asam difraktat tidak aktif sebagai penghambat pertumbuhan sel murine leukemia P-388. Dari hasil uji bioaktivitas sebagai antioksidan seluruh ekstrak bersifat aktif dengan nilai IC50 masing-masing adalah, asam orselinat IC50= sebesar 77.42 µg/mL , metil orselinat IC50=87.77 µg/mL, asam difraktat IC50=90,06 µg/mL, senyawa 2,4 dihidroksi 3,5-dimetil benzoat metil ester IC50=84,57 µg/mL, senyawa asam iso everninat IC50=70,83 µg/mL.
The aims of the research is to isolate and to identify chemical compounds of Parmotrema tinctorum?s (Despr Ex. Nyl. Hale) and Hypotrachyna osseoalba?s (Vain) YS Park & Hale thallus extract and test their bioactivity as cytotoxic compounds against murine leukemia P-388 cell and antioxidant compounds. Extraction of the compounds from the lichen?s thallus was done with n-hexane, dichloromethane, ethyl acetate and acetone . To observe the bioactive potency of the lichen extract, toxicity test against Artemia salina with Brine Shrimp Lethality Test (BSLT) test method was done. The lichen? thallus extracts are toxic to A. salina. Color test was done to observe the content of the extract . All of the extract have phenolic compound. The ethyl acetic and acetone extract, rich of depsida, the lichen secondary metabolites which commonly has bioactive potency. Five pure compounds have been obtained from extracts, three from P. tinctorum extract , there are orsellinic acid, methyl orselinate, and 2,4 dihydroxy 3,5-dimethyl benzoic acid methyl ester, the compounds that are proposed as new natural product compounds. Two pure compounds have been isolated from H. osseoalba extract, there are, difractaic acid, and iso everninic acid . Iso everninic acid (IC50 = 21.5 µg/ mL) could inhibit murine leukemia P-388 cell growth at medium stage, but orselinic acid, methyl orselinate, 2,4 dihydroxy 3,5-dimethyl benzoic acid methyl ester, and diffractaic acid couldn?t inhibit murine leukemia P-388 cell growth. All of the extract has antioxidant potency with IC50 values are, orsellinic acid IC50= 77.42 µg/mL , methyl orsellinic IC50= 87.77 µg/mL, diffractaic acid IC50=90,06 µg/mL, 2,4 dihydroxy 3,5-dimethyl benzoic acid methyl ester IC50=84,57 µg/mL, iso everninic acid IC50=70,83 µg/mL.
Depok: Universitas Indonesia, 2011
D1319
UI - Disertasi Open  Universitas Indonesia Library