Ditemukan 5 dokumen yang sesuai dengan query
Ida Mujtahidah
"
ABSTRAK
Protein memiliki peranan penting dalam mengontrol fungsi enzim, mengatur produksi dan aktivitas di dalam sel. Untuk melakukan hal ini, protein berinteraksi dengan protein-protein lainnya, DNA dan molekul-molekul lainnya. Jaringan interaksi protein-protein ini memiliki ukuran yang sangat besar. Sehingga untuk memudahkan dalam menganalisis jaringan ini diperlukan metode clustering. Pada penelitian ini, algoritma Markov clustering digabungkan dengan algoritma firefly yang disebut sebagai algoritma firefly-Markov clustering FMCL . Pada algoritma FMCL, posisi kunang-kunang akan menggantikan nilai parameter inflate. ...
"
2018
T49526
UI - Tesis Membership Universitas Indonesia Library
Muhammad Fauzan Akbar Masyhudi
"
ABSTRAK
Algoritma Markov Clustering adalah algoritma pengelompokan yang banyak digunakan pada bidang bioinformatik. Operasi utama pada algoritma ini adalah operasi ekspansi. Pada operasi ekspansi dilakukan perkalian dua buah matriks. Karena data pada bidang bioinformatik umumnya berukuran sangat besar dan memiliki tingkat sparsity yang sangat tinggi, diperlukan metode untuk menghemat penggunaan memori dan mempercepat proses komputasi. Sementara itu, Graphics Processing Unit (GPU) berkembang menjadi suatu platform komputasi paralel dengan performa yang lebih baik dari pada Central Processing ...
"
Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2012
S43685
UI - Skripsi Open Universitas Indonesia Library
Rizky Ginanjar
"
ABSTRAK
Skizofrenia telah diderita oleh lebih dari 21 juta orang di seluruh dunia. Masalah
genetik dan lingkungan menjadi salah satu faktor yang berkontribusi dalam
perkembangan penyakit ini. Beberapa penelitian menunjukkan beberapa gen yang
berhubungan dapat meningkatkan risiko penyakit ini. Gen-gen kandidat yang
diperoleh dari beberapa penelitian ternyata membentuk sebuah jaringan besar pada
interaksi tingkat proteinnya. Oleh karena itu, perlu dilakukan studi terhadap
jaringan interaksi protein dari gen kandidat. Algoritma Regularized Markov
Clustering (RMCL) adalah salah satu metode graph clustering yang merupakan
pengembangan dari algoritma ...
"
2016
S63944
UI - Skripsi Membership Universitas Indonesia Library
Vira Yustia Nurazmi
"
ABSTRAK
Algoritma Regularized Markov Clustering RMCL adalah suatu metode graf clustering yang merupakan pengembangan dari Markov Clustering MCL . Algoritma RMCL masih memiliki kelemahan pada parameter penggelembungan yang biasanya selalu diinputkan oleh pengguna untuk mendapatkan hasil clustering yang baik. Pada penelitian ini, RMCL digabungkan dengan algoritma Firefly untuk menganalisis jaringan interaksi protein yang disebut algoritma Firefly Regularized Markov Clustering FRMCL . Algoritma Firefly merupakan algoritma yang terinspirasi dari perilaku kunang-kunang dalam mencari koloninya. Implementasi algoritma FRMCL ...
"
2018
T49488
UI - Tesis Membership Universitas Indonesia Library
Elfi Fauziah
"
Tesis ini membahas pengelompokan virus-virus influenza A. Virus influenza A adalah virus RNA yang berbahaya, karena memiliki kemampuan mutasi yang tinggi dan menyebabkan wabah di beberapa negara. Dengan kemajuan bioinformatika, virus-virus dapat dikelompokkan dengan menganalisis sekuens-sekuens protein dari virus-virus tersebut. Markov clustering (MCL) telah diaplikasikan dengan baik pada bioinformatika, seperti; mengelompokkan jaringan-jaringan antara protein yang satu dengan yang lain, jaringan kemiripan antar protein, dan penentuan keluarga protein.
Tujuan penelitian ini adalah mengelompokkan virus-virus influenza A ...
"
Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2014
T42347
UI - Tesis Membership Universitas Indonesia Library
