Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

"Demam berdarah merupakan salah satu masalah kesehatan di dunia. Infeksi virus dengue yang berulang dengan serotipe yang berbeda dapat memacu terjadinya demam berdarah bahkan kematian. Dengue serotipe 4 dilaporkan dapat menyebabkan infeksi sekunder yang lebih parah dibandingkan dengue serotipe lainnya. Sampai saat ini pengobatan demam berdarah belum ditemukan, maka itu pencegahan jauh lebih penting. Para peneliti telah merekomendasikan vaksin aman berbasis nonstructural protein 1 (NS1) karena sifat imunogeniknya. Mereka telah mengidentifikasi empat epitope di NS1 yang diduga bereaksi kuat dengan epitope B cells, yaitu LD2, 24A, LX1, 24C. Tujuan dari riset ini adalah untuk menganalisa dan membandingkan strain DENV-4 yang diisolasi di Jakarta 2010 dengan 34 strain DENV-4 lainnya yang didapat dari GenBank menggunakan UGENE software sebagai basis dari pengembangan vaksin. Penelitian ini menggunakan data sekunder berupa urutan nukelotida virus dengue serotipe 4 strain IDSS44/10 yang diamplifikasi dan diurutkan di Departemen Mikrobiologi, FKUI. Dari hasil penelitian ini dapat disimpulkan bahwa gen NS1 dari DENV-4 strain IDSS44/10 dapat digunakan sebagai kandidat vaksin dengue di masa mendatang. Hasil menunjukkan bahwa epitope 24C menunjukkan motif yang homolog di setiap sekuens asam amino pada NS1 DENV-4. Hampir seluruh DENV-4 strain yang diisolasi termasuk IDSS44/2010 memiliki urutan asam amino yang sama pada epitop LD2, 24A, LX1, 24C.

---

Dengue hemorrhagic fever has become a worldwide issue. Heterologous infection by different serotypes may lead to this advanced stage of dengue infection and even death. Dengue virus serotype 4 has been reported to cause more severe secondary infection compared to other serotypes. To date, there is no specific treatment for this disease therefore prevention is much more important.

Researchers have proposed a safe vaccine strategy that is based on nonstructural protein 1 (NS1) as it is strongly immunogenic. They identified four epitopes on NS1 that reacted strongly to B cell epitopes which are LD2, 24A, LX1, and 24C. The goal of this research is to identify and compare these NS1 epitopes among DENV-4isolated in Indonesia 2010 with other DENV-4 strains using UGENE softwareas a base of vaccine development. This study used a nucleotide sequence data of DENV-4 strain IDSS44/10 that was amplified and sequenced in Microbiology Department, FKUI.

The results show that NS1 gene DENV-4, IDSS44/2010 strain could be used as a dengue vaccine candidate in the future.The results show that 24C epitope was highly conserved among 35 DENV-4 NS1 sequences. Most of the DENV-4 including IDSS44/10 Indonesian strain have similar amino acids sequences on the epitopes (LD2, 24A, LX1, and 24C)."

"Latar Belakang: Orofacial cleft merupakan salah satu dari banyak malformasi bawaan lahir yang sering terjadi pada manusia. Keadaan ini ditandai dengan kelainan morfologi yang dapat mengubah struktur wajah dan mempengaruhi struktur anatomi, juga fungsi otot dengan tingkat keparahan yang bervariasi. Adapun, penyebab celah bibir dan palatum ini dihasilkan dari banyak faktor, dimana terjadi kombinasi antara faktor genetik dan faktor lingkungan.Tujuan: Mengetahui distribusi polimorfisme gen Wnt10a C392T pada penderita orofacial cleft.Metode: Analisis polimorfisme gen Wnt10a C392T dilakukan dengan metode PCR-RFLP dengan enzim restriksi AfeI.Hasil: Menggunakan 25 sampel orofacial cleft dan 75 sampel kontrol, ditemukan 25 sampel orofacial cleft memiliki genotip TT 100 , 20 sampel kontrol memiliki genotip CC 26,6 , 53 sampel memiliki genotip CT 70,6 , dan 2 sampel memiliki genotip TT 2,8 . Tidak ditemukan alel C pada sampel orofacial cleft, semenatara sampel kontrol memiliki 91 alel C 60,7 dan 59 alel T 39,3.Kesimpulan: Terdapat perbedaan bermakna pada distribusi genotip dan alel polimorfisme Gen Wnt10a C392T antara penderita orofacial cleft dan kontrol p value genotip = 0,003, p value alel =0,001.

---

Background: Orofacial cleft is one of the many congenital malformations that often occur in humans. It is characterized by morphological abnormalities that can alter the facial structure and affect the anatomical structure, as well as muscle function with variations of severity. The cause of orofacial cleft is generated from many factors, where there is a combination of genetic factors and environmental factors.

Aim: To describe the distibution of Wnt10a C392T gene polymorphism in orofacial cleft patients.

Methods: Analysis of Wnt10a C392T gene polymorphism was performed by PCR RFLP method with AfeI restriction enzyme.

Results: Using 25 orofacial cleft samples and 75 control samples, 25 orofacial cleft samples had 25 TT genotype 100 , 20 control samples had CC genotype 26,6 , 53 samples had CT genotype 70,6 , and 2 samples had TT genotype 2,8 . No C alleles were found in orofacial cleft samples, while control samples had 91 C allele 60,7 and 59 T alleles 39,3.

Conclusions: There were significant differences in genotype distribution and allele of Wnt10a C392T gene polymorphism between orofacial cleft and control patients p value genotype 0.003, p value allele 0.001."

"Latar Belakang: Stromal Cell-Derived Factor-1 SDF-1 mengkode protein SDF-1 yang berperan dalam angiogenesis dan metastasis sel kanker. Polimorfisme genetik SDF-1 G801A telah dilaporkan memiliki hubungan dengan kanker kepala leher KKL. Tujuan: Mendeteksi polimorfisme genetik SDF-1 G801A pada penderita KKL dan individu sehat populasi Indonesia. Metode: Sampel DNA tersimpan dari 50 penderita KKL dan 50 individu sehat dianalisis dengan metode PCR-RFLP dengan menggunakan enzim restriksi HpaII serta divisualisasi dengan elektroforesis. Hasil: Polimorfisme genetik SDF-1 G801A terdeteksi sebesar 54 pada kelompok penderita KKL dan 74 pada kelompok individu sehat. Simpulan: Polimorfisme genetik SDF-1 G801A terdeteksi pada penderita KKL dan individu sehat populasi Indonesia.

---

Introduction: Stromal Cell Derived Factor 1 SDF 1 gene encodes SDF 1 protein which plays roles in angiogenesis and metastasis of cancer cell. SDF 1 G801A genetic polymorphism has been reported to have an association with head and neck cancer HNC.

Aims: To detect SDF 1 G801A genetic polymorphism in HNC patients and healthy subjects of Indonesian population.

Methods: Stored DNA samples extracted from blood of 50 HNC patients and 50 healthy subjects were analyzed with PCR RFLP method using HpaII restriction enzyme and visualized by electrophoresis.

Results: There were 54 and 74 SDF 1 G801A genetic polymorphisms detected in HNC samples and healthy subject samples.

Conclusion: SDF 1 G801A genetic polymorphism was detected in HNC patients and healthy subject of Indonesian population."

"Varian virus dan Variasi genetik menjadi salah satu masalah dalam menentukan Farmakoterapi COVID-19. Mekanisme variasi orang-ke-orang dan antar-populasi dalam keamanan dan kemanjuran obat merupakan dasar untuk pengembangan obat yang rasional. Penelitian ini menggambarkan karakteristik dan profil Farmakoterapi pada pasien COVID-19 dan menganalisis hubungan profil Farmakoterapi dengan variasi gen ACE dan ACE2. Desain penelitian ini adalah cross sectional dengan pengambilan data profil Farmakoterapi dilakukan secara retrospektif dan Pemeriksaan Polimorfisme dilakukan pada 50 orang penyintas COVID-19 di RSUD Lahat yang terjangkit COVID-19 periode September 2020 hingga Agustus 2021. Hubungan profil Farmakoterapi dalam bentuk Penggunaan Antivirus dan Antibiotik serta durasinya terhadap Polimorfisme SNP gen ACE pada rs1799752 dan rs4331 dan gen ACE2 pada rs2014792 dengan menggunakan metode regresi logistik. Subjek penelitian terdiri dari 28 pasien rawat jalan dan 22 orang pasien rawat inap. Ada perbedaan karakteristik usia, tingkat stress dan status vaksinasi pada kelompok rawat inap dan rawat jalan. Sebanyak 98% pasien mendapatkan Antibiotik dan 84% pasien mendapatkan terapi Antivirus selama dalam terapi COVID-19. Antivirus yang digunakan selama terapi adalah Oseltamivir, Favipiravir dan Remdesivir dan Antibiotik yang digunakan adalah Azitromycin, Levofloxacin, Ceftriaxone dan Meropenem. Sebanyak 29 orang memiliki genotipe II, 14 orang memilik genotipe ID dan 7 orang mempunyai genotipe DD pada pada SNP rs1799752 gen ACE. Pada SNP rs4331 gen ACE 30 orang memiliki genotipe GG, 12 orang memiliki genotipe AG dan 8 orang memiliki genotipe AA. Dan pada SNP rs2014792 gen ACE2 18 orang memilik genotipe CC dan 32 orang memiliki genotipe CC. Secara statistik tidak hubungan signifikan antara polimorfisme gen ACE pada SNP rs1799752 dan rs4331 dan gen ACE2 pada rs2014792 dengan resiko rawat inap dan penggunaan Antivirus dan Antibiotik serta durasinya pada pasien COVID-19.

---

One of the challenges in selecting COVID-19 Pharmacotherapy is the presence of viral variants and genetic variation. Mechanisms of person-to-person and interpopulation variation in drug safety and efficacy are the basis for rational drug development. This research describes the characteristics and profile of pharmacotherapy in COVID-19 patients and analyzes the relationship between pharmacotherapy profile and ACE and ACE2 gene variations. The study was crosssectional, involved the retrospective collection of pharmacotherapy profile data and the polymorphism testing on 50 COVID-19 survivors at Lahat Hospital who contracted the virus between September 2020 and August 2021. Use of logistic regression approach to examine the association between Pharmacotherapy profiles in the form of Antiviral and Antibiotic Use, as well as their duration, and SNP polymorphisms at rs1799752 and rs4331 of the ACE gene and rs2014792 of the ACE2 gene. There were 28 non-hospitalized and 22 hospitalized patients who participated in the study. Age, stress level, and vaccination status were all different between non-hospitalized and hospitalized groups. While undergoing COVID-19 therapy, up to 98% of patients received antibiotics, and 84% of patients received antiviral therapy. Oseltamivir, Favipiravir, and Remdesivir are the antivirals utilized throughout therapy. Azithromycin, Levofloxacin, Ceftriaxone, and Meropenem are the antibiotics. On SNP rs1799752 ACE gene, 29 participants had genotype II, 14 had genotype ID, and 7 had genotype DD. Thirty people had the GG genotype, twelve had the AG genotype, and eight had the AA genotype for the SNP rs4331 ACE gene. Additionally, 32 and 18 individuals with the CC genotype in the SNP rs2014792 ACE2 gene. The likelihood of hospitalization, the usage of antivirals and antibiotics, and the length of time those treatments were used in COVID-19 patients were not significantly associated with the ACE gene polymorphism at SNP rs1799752 and rs4331 or the ACE2 gene at rs2014792."