Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

Abstrak :
Indonesian National Committee for human immunodeficiency virus (HIV) and acquired immune deficiency syndrome (AIDS) has reported the significant increase of HIV infected individual in Indonesia. A sensitive accurate diagnostics are urgently needed to prevent the dissemination of HIV and also to provide a suitable therapy. For this reason, we have developed HIV diagnostic method based on PCR to elucidate this problem. For this research, samples were collected from hospitals and Indonesian Red Cross that consist of samples possesing HIV serological test positive and indeterminate. Ribonucleic Acid (RNA) were isolated from blood plasma. These RNA then were amplified after Reverse transcriptase reaction by using primers which have been designed using env (C2V3C3), Long Terminal Repeats (LTR) (U3) and Capsid gag (p24) as target regions. The obtained results shown 26/34 (76.5%) positive in LTR, 10/33 (36.4%) positive in Env and 11/33 (33.3%) positive in p24. These results showed that LTR primers detect HIV more than other primers. It suggests that LTR could be used as detection target as complement of env and p24 These results need to be explored further by using sequencing method.

Abstrak :
Beberapa hasil uji serologi HIV indeterminate pada tes skrining darah ditemukan di Indonesia. Prosedur skrining darah yang dilakukan saat ini sesuai ketentuan yang ditetapkan oleh WHO untuk skrining darah, yaitu 3 tes uji serologi HIV selama pemeriksaan darah. Ketidaksesuaian hasil yang satu dengan yang lain didefinisikan sebagai hasil indeterminate. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi galur-galur HIV yang sulit teridentifikasi dari darah dengan uji serologi HIV intermediate dan mengevaluasi apakah galur HIV yang beredar di Indonesia mempunyai kemungkinan lolos dari sistem pendeteksian yang ada. Deteksi RT-PCR dilakukan pada 40 sampel RNA HIV dari donor darah yang mempunyai hasil uji serologi indeterminate dengan sebelumnya melakukan uji konfirmasi dengan menggunakan western blot. Deteksi RT-PCR menunjukkan bahwa sebanyak 24/32 (75%) sampel positif LTR, 4/31 (13%) positif pol dan 3/5 (60%) positif env. Amplifikasi pada daerah p24, pita-pita yang ditemukan pada sampel selalu lebih rendah dari yang diharapkan. Sekuensing dilakukan untuk mengkonfirmasi hasil amplifikasi menunjukkan bahwa perlu analisis lebih lanjut untuk mengetahui apakah perubahan ini yang menyebabkan hasil indeterminate.

Indeterminate results of serological HIV test have been found in Indonesia. The screening procedure is following the prescribed by WHO for screening of blood donors which is based on 3 different serological HIV test during screening of blood donors. Discordant results are interpreted as indeterminate. This research aims to identify GIV strains that previously difficult to determine, and to evaluate whether the HIV strains present in Indonesia could pass the existing screening system. RTPCR detection test of HIV RNA were conducted for 40 blood donors samples with indeterminate serological HIV-test after a confirmatory test using western blot. Preliminary results showed that 24/32 (75%) of the samples are positive LTR, 4/31 (12%) positive pol and 1/3 (33%) positive env. Amplification in p24 region showed that bands found have lower size than expected. Sequencing performed to confirm these findings show that further analysis is needed to determine whether this change is what behind the indeterminate results.

Abstrak :
Penelitian subcloning daerah imunodominan gen env HIV-1 ke dalam vektor ekspresi pMETαC telah dilakukan di Laboratorium Mikrobiologi FK UI dari Januari--September 2008. Tujuan penelitian menghasilkan subklona daerah imunodominan gen env HIV-1 pada vektor ekspresi pMETαC. Daerah imunodominan gen env HIV-1 (505 pb) diperoleh dari hasil PCR dengan primer forward pIMUDMT dan reverse IMUDMTc1. Daerah imunodominan gen env HIV-1 diligasi dengan vektor ekspresi pMETαC yang didigesti dengan BamHI dan SalI. Hasil ligasi ditransformasi ke dalam Escherichia coli TOP10 dan ditumbuhkan pada medium LB padat (+ampisilin). Koloni tumbuh sebanyak 32 dan 10 di antaranya diisolasi. Sepuluh koloni tersebut didigesti dengan EcoRI dan SacII. Sebanyak 3 koloni menunjukkan pita DNA berukuran 552 pb (DNA sisipan) dan 7.953 pb (vektor). Selanjutnya dilakukan PCR terhadap 3 koloni tersebut dan menghasilkan pita DNA berukuran 505 pb. Analisis BLASTN menunjukkan bahwa sekuen sisipan (187 pb) memiliki persentase kemiripan (identity) 98% (185/187) dengan human immunodeficiency virus type 1, NY5/BRU (LAV-1) recombinant clone pNL4-3 [Acc. No. M19921.1]. Hasil tersebut menunjukkan telah diperoleh subklona daerah imunodominan gen env HIV-1 di dalam vektor ekspresi pMETαC. Akan tetapi, perlu dilakukan sequencing ulang guna mengetahui seluruh basa DNA sisipan agar hasilnya dapat lebih dipercaya.