Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

"Tuberkulosis masih menjadi masalah penting kesehatan dunia, merupakan penyebab kematian terbesar ke-13 dan menempati posisi kedua setelah COVID-19 sebagai penyakit menular penyebab kematian terbesar. Tuberkulosis merupakan penyakit yang diakibatkan oleh infeksi bakteri Mycobacterium tuberculosis (Mtb), yang dapat ditularkan melalui udara ketika penderita berbicara, batuk, atau bersin. Penelitian terhadap obat dan vaksin TB telah lama dilakukan, pada penelitian ini telah dilakukan pembuatan vaksin berbasis conserved region epitop secara in silico. Desain vaksin pada penelitian ini didasarkan pada prediksi epitop yang terdiri dari epitop dari sekuens protein Mce2E untuk bakteri Mtb yang terdiri dari epitop sel B dan sel T. Prediksi epitop sel B telah dilakukan menggunakan ABCpred, sedangkan prediksi epitop sel T menggunakan IEDB. Proses penambatan molekul (molecular docking) dilakukan menggunakan MOE2014.09. Kandidat epitop terbaik yang didapat berdasakan nilai ?Gbinding dan juga interaksi antara ikatan epitop dengan molekul HLA. Teridentifikasi dua kandidat epitop terbaik yaitu GTGISGMLR dengan HLA-C*12:03 untuk MHC kelas I dan GTGISGMLRALEQAW dengan HLA-DRB1*11:01 untuk MHC kelas II, dengan nilai ?Gbinding untuk masing-masing epitope secara berurutan yaitu -9,4737 kkal//mol dan -8,2259 kkal/mol. Cakupan populasi yang dimiliki oleh vaksin yang telah didesain pada penelitian ini sebesar 75,68% dari populasi global.

---

Tuberculosis is still a critical world health problem, is the 13th most significant cause of death, and ranks second after COVID-19 as an infectious disease that causes the most death. Tuberculosis is a disease caused by infection with the bacterium Mycobacterium tuberculosis (Mtb), which can be transmitted through the air when the patient speaks, coughs, or sneezes. Research on TB drugs and vaccines has been carried out for a long time. This research develops a novel vaccine utilizing in silico method based on conserved region epitopes. The vaccine design in this study was based on epitope prediction from the Mce2E protein sequence for Mtb bacteria consisting of B-cell and T-cell epitopes. B-cell epitope prediction was carried out using ABCpred, while T cell epitope prediction used IEDB. The process of molecular docking was carried out using MOE2014.09. The best epitope candidate was obtained based on the value of ?Gbinding and the interaction between the epitope bond and the HLA molecule. The two best epitope candidates identified were GTGISGMLR with HLA-C*12:03 for class I MHC and GTGISGMLRALEQAW with HLA-DRB1*11:01 for class II MHC, with ?Gbinding values for each epitope respectively -9.4737 kcal/mol and -8.2259 kcal/mol. The population coverage prediction from the obtained epitopes could cover 75.68% of the global population"

"Salah satu metode deteksi dini kanker mulut rahim melalui deteksikeberadaan atau infeksi HPVadalah metode Hybrid Capture. Dalampenelitian ini akan dicari primer sebagai pengganti probe dalam rangkamemodifikasi metode Hybrid Capture. Metode yang digunakan adalahmetode bioinformatik. Sekuens genom HPV dari database dibagi menjaditiga kelompok beidasarkan kecenderungannya menyebabkan kanker, dandata dibuat dalam tiga bentuk yaitu genom total, gen E?, dan gen E7.Multiple alignment dilakukan untuk menoari kesamaan antar sekuenstersebut, dan memperoleh conserved area yang akan digunakan sebagaitemplate. Untuk mendapatkan daerah yang spesifik, maka seleksi lebih lanjutterhadap conserved region menggunakan Basic Local Alignment SearchTool (BLAST). Diperoleh empat segmen dengan basil terbaik, yaitu segmen3 dan 27 dari basil alignment genom total High-Risk. segmen 1 dari basilalignment daerah gen E7 High-Risk, dan segmen 4 dari basil alignmentdaerah gen E7 High-Risk + Low Risk. "

"Kanker mulut rahim merupakan penyakit yang disebabkan oleh infeksiHuman papillomavirus, sampai saat ini cara deteksi yang dilakukan melaluipendekatan genomic yaitu deteksi berdasarkan keberadaan genom HPV,misaikan metode Hybrid Capture dan PGR yang berhasil menolong banyaknyawa wanita. Tujuan jangka panjang penelitian ini adalah mencari suatuprotein yang dapat mendeteksi keberadaan HPV sebagai alat deteksi dini.Kanker mulut rahim disebabkan oleh onkoprotein E6 (|an E7 HPV yangmengadakan ikatan dengan tumor suppresor gene sehingga menjadi tidakberfungsi dan akan membuat pembelahan sel menjadi tidak terkontrol.Metode yang digunakan adalah bioinformatik dengan menggunakan datasekuens asam amino onkoprotein HPV dan Juga tumor suppressor gene p53dan pRb yang bisa didapat dari database. Conserved region yangdigunakan adalah tumor suppressor gene p53 dan pRb dari hasil penelitanyang ada kemudian dengan PS! BLAST dicari protein lain yang memilikif jfTjil!3n|35- Pfrj pp^^Tdiambil p^jp^rapg yang similar dan untukmelihat sebarapa besar similiaritasnya dilakukan mplltiple alignment denganClustalW 1.82. Hasil yang didapatkan akan dikembangkan lebih lanjut yangakan digunakan untuk mendeteteksi keberadaan HPV sebagai penyebabutama kanker mulut rahim"