Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

Hasil Pencarian

Ditemukan 28 dokumen yang sesuai dengan query
cover
Astria Deviyani Zakaria
"ABSTRAK

Turbinaria decurrens Bory merupakan salah satu rumput laut coklat yang tumbuh di perairan Indonesia yang telah diuji memiliki aktivitas sitotoksik terhadap sel Hela dan T47D. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk menentukan kandungan fukosantin dan potensi aktivitas sitotoksik dan selektifitas dari ekstrak dan fraksi T. decurrens pada sel line kanker kolon HCT-116 dan sel normal liver Chang, serta kandungan fukosantin dan fukosantinol dalam plasma darah hewan uji yang diinduksi azoksimetan (AOM) dan dekstran sodium sulfat (DSS). Pengujian sitotoksik ekstrak etanol, fraksi n-heksan, etil asetat dan etanol T. decurrens menggunakan metode pengujian Cell Counting Kit-8 (CCK-8). Kandungan fukosantin pada ekstrak, fraksi T. decurrens dan plasma darah dianalisis menggunakan Kromatografi Cair Kinerja Tinggi (KCKT) fase terbalik dan Liquid Chromatography - Mass Spectrometric (LC-MS). Ekstrak dan fraksi T. decurrens mengandung fukosantin dengan kandungan tertinggi terdapat pada fraksi etil asetat. Pengujian CCK-8 menunjukkan bahwa ekstrak dan etil asetat selektif terhadap penghambatan pertumbuhan sel HCT-116 dan tidak menghambat sel Chang. Pada plasma darah hewan uji yang diinduksi AOM-DSS, kadar fukosantin lebih rendah dibandingkan kelompok hewan normal. Fukosantin diabsorbsi dan dimetabolisme menjadi fukosantinol. Spektrum plasma darah hewan uji pada pengujian menggunakan LC-MS menunjukkan adanya senyawa fukosantinol. Dari hasil penelitian, Turbinaria decurrens Bory merupakan agen yang potensial untuk antikanker kolon.


ABSTRACT

Turbinaria deccurrens Bory is one of many species of brown seaweed that grow in Indonesian marine that has been studied has cytotoxic activity on Hela and T47D cell line.  The aim of this study is for determine fucoxantin content, the potential of cytotoxic activity and selectivity of extract and fraction T. decurrens on colon cancer HCT-116 cell line and normal liver Chang cell line, examine the absorption of fucoxanthin and fucoxanthinol in blood plasma on animal induced by azoximethan (AOM) and dextran sodium sulphate (DSS). Cytotoxic assay of ethanolic extract, n-hexane, ethyl acetate and ethanolic fractions against HCT-116 using Cell Counting Kit-8 (CCK-8) assay.  Fucoxantin content in extract, fraction and blood plasma were analyzed using Reversed-Phase High Performance Liquid Chromatography (RP-HPLC) and Liquid Chromatography - Mass Spectrometric (LC-MS) analysis. Extract and fraction of T. decurrens contain fucoxanthin with the higest content was in ethyl acetate fraction. CCK-8 assay showed that extract and ethyl acetate fraction has selectivity in inhibition the growth of HCT-116 but didn't inhibit Chang cell line. In blood plasma of animal induced by AOM-DSS, fucoxanthin level was lower than normal group. Fucoxanthin was absorbed and metabolized to fucoxanthinol. Spektrum of blood plasma animal tested, showed fucoxanthinol fragmen by LC-MS testing. Turbinaria decurrens can be potential for anticolon cancer agent.

"
Depok: Fakultas Farmasi Universitas Indonesia, 2019
T51888
UI - Tesis Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Turnip, Oktaviani Naulita
"Virus Dengue (DENV) dan virus Chikungunya (CHIKV) merupakan arbovirus yang menyebabkan infeksi di negara tropis dan subtropis. Penularan kedua virus ini diperantarai oleh vektor yang sama yaitu nyamuk Aedes aegypti. Baik infeksi DENV maupun CHIKV, akan memunculkan respon imun spesifik yang disebabkan oleh sekresi sitokin, kemokin, dan faktor pertumbuhan sebagai mediator inflamasi. Respon imun ini menimbulkan gejala klinis yang mirip hingga sulit dibedakan antara infeksi kedua virus ini. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis profil ekspresi sitokin antara infeksi DENV dan CHIKV dengan sistem galur sel A549 dan HepG2. Untuk mencapai tujuan tersebut, metode yang dilakukan yaitu dengan metode Fluorescence-Activated Cell Sorting (FACS) untuk menentukan tingkat infeksi tertinggi pada masing-masing galur sel dan Enzyme Linked Immunosorbent (ELISA) untuk analisis sitokin/kemokin. Hasil FACS menunjukkan tropisme DENV terhadap galur sel A549 dan CHIKV terhadap galur sel HepG2. Dari keempat sitokin dan kemokin yang diuji yakni IL-8, IL-4, IL-13, dan MCP-3, hasil signifikan ditunjukkan ekspresi IL-8 dan MCP-3. Profil ekspresi kemokin IL-8 lebih tinggi pada galur sel A549 dibandingkan HepG2 sedangkan profil ekspresi kemokin MCP-3 lebih tinggi pada galur sel HepG2 dibandingkan A549. Perbandingan profil ekspresi keduanya, lebih tinggi pada galur sel yang terinfeksi DENV (DENV-4) dibandingkan CHIKV. Penelitian ini membuktikan adanya perbedaan ekspresi sitokin/ kemokin pada galur sel A549 dan HepG2 terhadap infeksi DENV dan CHIKV.

Dengue Virus (DENV) and Chikungunya virus (CHIKV) are arboviruses infect human living in tropical and subtropical countries. These two viruses are transmitted by the same vector, Aedes aegypti mosquito. DENV and CHIKV infection induce unique immune response characterized by the secretion of cytokines, chemokines, and growth factors as inflammatory mediators. This immune response produces similar clinical symptoms, therefore it is difficult to distinguish between DENV and CHIKV infection. This study was aimed to compare the expression profiles of cytokine/chemokine expression in A549 and HepG2 cell lines infected with DENV and CHIKV. The study used Fluorescence Activated Cell Sorter (FACS) method to determine the infection rate in cell line and Enzyme Linked Immunosorbent (ELISA) for cytokine/chemokine analyses. The FACS results showed the tropism DENV in A549 cells and CHIKV in HepG2 cells. Among four cytokines and chemokines examined, i.e. IL-8, IL-4, IL-13, and MCP-3, significant different in expression was observed for IL-8 and MCP-3. The IL-8 expression was higher in A549 than HepG2 cells, whereas the profile of MCP-3 expression was higher in HepG2 than that in A549 cells. The IL-8 and MCP-3 expression was higher in cell lines infected with DENV (DENV-4) than CHIKV. This study demonstrated the differences of cytokine/chemokine expression in A549 and HepG2 cell lines infected with DENV and CHIKV.
"
Jakarta: Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia, 2018
T-Pdf
UI - Tesis Membership  Universitas Indonesia Library
cover
"Multiple myeloma shows resistance to chemotheraphy after being treated for some time and one of the causes is overexpression of bcl-2. ...."
Artikel Jurnal  Universitas Indonesia Library
cover
Medwin Setia
"Kanker mulut berada diurutan 32 dunia penyebab kematian yang paling sering terjadi. Pada beberapa penelitian, kitosan berefek pada beberapa jenis sel baik menaikkan maupun menurunkan viabilitas sel. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui efek kitosan terhadap galur sel kanker skuamosa mulut (HSC-4) dan sel epitel dental (HAT-7) in vitro dan dipajan kitosan pada konsentrasi 0,0005%; 0,0025%; 0,005%; 0,25%; 0,5%. Kemudian hasilnya diukur dengan 3-(4,5- dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyltetrazolium bromide assay atau MTT assay. Viabilitas pada kedua jenis sel lebih tinggi pada konsentrasi 0,0005%; 0,0025%; 0,005%, sedangkan pada konsentrasi 0,25% dan 0,5% lebih rendah dibandingkan kontrol. Kitosan memiliki efek pada kedua jenis sel bergantung pada konsentrasinya.

Oral cancer ranked 32th as most causes of death in the world. From past research, chitosan has inhibit proliferation effect. The present study examined the effect of chitosan to oral cancer squamous carcinoma cell line (HSC-4) and dental epithelial cell line (HAT-7) in vitro. Both cells were exposed by chitosan with concentration 0,0005%; 0,0025%; 0,005%; 0,25%; and 0,5%. Then, the result was measured by 3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyltetrazolium bromide assay or MTT assay. Both cells has higher viability at 0,000%; 0,0025%; and 0,005%, whereas lower viability showed at 0,25% and 0,5%. Chitosan has effect on both cells depends on concentration."
Depok: Universitas Indonesia, 2008
S-Pdf
UI - Skripsi Open  Universitas Indonesia Library
cover
"Cytotoxicity tests on ethanol extract of aglalia elliptica blume leaves and its fractions on cervical cencer cell line (HeLa) were carried out. Dried powder of Aglaia elliptica leaves was extracted using ethanol and then fractionated by n-hrxane, ethyl acetate and buthanol extraxt solvents. The cytotoxicity tets using MTT method (prolipheration inhibition tests on HeLa cell lines were conducted for ethanol extract, n-hexana ethyl acetate and buthanol fractions. The results showed that the ethanol extraxt of aglaia elliptica and its fractions have inhibition effect againts HeLa Cell line with IC50 of 282.44 ppm,177.64 ppm, 16.03 ppm,211.77 ppm, 181.33 ppm. 181.33 for ethanol extracts ,n-hexane(Heal extract , ethyl acceate, buthanol,and water fractions respecively."
Artikel Jurnal  Universitas Indonesia Library
cover
Pruput Dwi Mutiari Soekarno
"Defek pada daerah kraniofasial memiliki struktur 3 dimensi yang rumit, sehingga memiliki tingkat kesulitan tersendiri saat dilakukan restorasi. Bone graft tetap menjadi pilihan utama pada rekonstruksi defek tulang segmental. Beberapa metode rekonstruksi defek tulang adalah dengan penggunaan bone graftberupa autograft, allograft, dan bone graft sintetik. Bone graft sintetik merupakan bahan yang paling mudah didapatkan, namun memiliki keterbatasan sifat osteogenik. Seperti beta tricalcium phospate yang terlalu cepat diresorbsi. Fibronectin merupakan komponen matriks ekstraselular yang diharapkan dapat meningkatkan aktivitas sel osteoblast sehingga meningkatkan potensi osteogenik pada bone graft sintetik. Metode: kultur sel osteoblas manusia (MG63) dalam jumlah yang cukup, dibagi dalam beberapa kelompok kelompok: kelompok 1 dipajankan dengan beta tricalcium phosphate dan kelompok lainnya dipajankan dengan beta tricalcium phospate dan fibronectin dengan konsentrasi yang berbeda . Pada hari ke-2, 6, 8 setelah pemajanan dilakukan pemeriksaan kadar osteokalsin terhadap kelompok-kelompok tersebut. Hasil yang didapat menunjukkan perbedaan yang tidak signifikan pada ekspresi osteokalsin pada kedua kelompok. Kesimpulan: Peran Fibronectin untuk mempercepat dan meningkatkan konsentrasi osteoklasin pada sel osteoblast tidak terlalu signifikan. Fibronectin dapat digunakan sebagai scaffold dalam rekayasa jaringan. Kata kunci: bone graft, Beta tricalcium phosphate, fibronectin, sel osteoblast, osteokalsin.

Craniofacial defect comprises of complex 3D structure, therefore have high level of difficulty to restore. In segmental bone defect, bone graft remain a gold standard. Several methods of in bone defect reconstruction are using autograft, allograft, and synthetic bone graft. Synthetic bone graft have high availability but less of osteogenic potency. Beta Tricalcium phospate have good structure but the resorbtion time is fast. Fibronectin is an extracelullar matrix component that can increase osteoblast cell activity and osteogenic potency in synthetic bone graft. Method: human osteoblast cell line (MG63) divided into several groups, one group was given Beta tricalcium phospate and other groups was given beta tricalcium phospate and fibronectin with different concentration. On day 2, 6, 8 concentration of osteocalcin wasmeasured. The result shows no significant different in osteocalcin expression in those groups. Fibronectin role in increasing and accelerating osteocalcin concentration are not too significant. Fibronectin can be used as a scaffold in bone regeneration."
Jakarta: Fakultas Kedokteran Gigi Universitas Indonesia, 2015
T-Pdf
UI - Tesis Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Fahmi Radityamurti
"Latar Belakang: Vitamin D telah terbukti memiliki sifat anti kanker sebagai antioksidan, anti-proliferasi, dan diferensiasi sel. Khasiat vitamin D sebagai agen antikanker memicu peneliti untuk mencari tahu apakah vitamin D bermanfaat sebagai radiosensitizer. Berbagai penelitian telah dilakukan pada cell line dalam berbagai jenis kanker, tetapi manfaat vitamin D sebagai radiosensitizer masih kontroversial.
Tujuan: Manfaat vitamin D sebagai radiosensitizer masih kontroversial karena beberapa hasil studi yang tidak jelas. Ulasan ini bertujuan untuk menyelidiki pemanfaatan Vitamin D3 (Kalsitriol) sebagai radiosensitizer di berbagai lini sel melalui tinjauan literatur.
Bahan/Metode: Pencarian sistematis dari pangkalan data literatur medis yang tersedia dilakukan pada studi in vitro dengan Vitamin D sebagai radiosensitizer di semua jenis cell line. Sebanyak 11 studi in vitro dievaluasi.
Hasil: Sembilan studi dalam ulasan ini menunjukkan efek yang signifikan dari Vitamin D sebagai agen radiosensitizer dengan meningkatkan autofagi sitotoksik, meningkatkan apoptosis, menghambat kesintasan sel dan gen pemicu proliferasi sel dengan menghambat ReIB, dan menginduksi senesens. Dua penelitian lainnya menunjukkan tidak ada efek yang signifikan dalam mekanisme radiosensitisasi vitamin D karena kurangnya bukti dalam lingkungan in vitro.
Kesimpulan: Vitamin D memiliki sifat antikanker dan dapat digunakan sebagai radiosensitizer dengan berbagai mekanisme di berbagai cell line. Penelitian lebih lanjut terutama dalam pengaturan in vivo perlu dievaluasi.

Background: Vitamin D has been shown to have anti-cancer properties as antioxidants, anti-proliferative, and cell differentiation. The property of vitamin D as an anticancer agent triggers researchers to find out whether vitamin D is useful as a radiosensitizer. Multiple studies have been carried out on cell lines in various types of cancer, but the benefits of vitamin D as a radiosensitizer are still become controversial.
Purpose: The benefits of vitamin D as a radiosensitizer are still controversial due to some incoherent study results. This review aim to investigate the utilization of Vitamin D3 (Calcitriol) as radiosensitizer in various cell line through review of literature.
Materials/Methods: A systematic search of available medical literature databases was performed on in vitro studies with Vitamin D as radiosensitizer in all types of cell line. A total of 11 in vitro studies were evaluated.
Results: Nine studies in this review showed significant effect of Vitamin D as radiosensitizer agent by promoting cytotoxic autofagi, increasing apoptosis, inhibition of cell survival and proliferation promoting gene in ReIB inhibition, and inducing senescenes. The two remaining studies showed no significant effect in radiosensitizing mechanism of Vitamin D due to lack of evidence in vitro settings.
Conclusion: Vitamin D have anticancer property and can be used as radiosensitizer by imploring various mechanism pathways in various cell line. Further research especially in vivo setting need to be evaluated.
"
Depok: Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia, 2020
T-pdf
UI - Tesis Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Susanto
"Iradiasi gamma banyak digunakan oleh beberapa industri obat herbal sebagai metode pengawetan yang efisien dalam mengurangi kontaminasi mikroorganisme. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengevaluasi pengaruh iradiasi gamma (0; 5; 7.5; and 10 kGy) pada ekstrak etanol H. sabdariffa (EEHS) terhadap uji total mikroorganisme, total kandungan fenol dan flavonoid, aktivitas antioksidan, TLC profiling, total kuersetin dan bobot molekul, aktivitas penghambatan terhadap enzim α-glukosidase dan in-vitro analisis terhadap galur sel kanker manusia (A-549,HUT-78, dan MCF-7). Iradiasi dosis 5 kGy menunjukkan bahwa tidak adanya kapang yang tumbuh dan terjadi penurunan jumlah total bakteri, lebih lanjut iradiasi pada dosis 10 kGy tidak terjadi pertumbuhan bakteri. Analisis total fenol, dan flavonoid, serta aktivitas antioksidan menunjukkan adanya penurunan sebesar 5-11% setelah diiradiasi pada dosis 5 kGy. Analisis profil TLC dan HPLC menunjukkan bahwa salah satu senyawa dalam EEHS adalah kuersetin yang ditunjukan dengan adanya [M+H]+ pada m/z 303,04 dari hasil analisis LC-Ms/Ms. EEHS juga memiliki penghambatan terhadap aktivitas enzim α-glukosidase dengan nilai penghambatan 4,75-7,55%. Uji aktivitas anti kanker terhadap galur sel kanker manusia menunjukkan bahwa EEHS memiliki kemampuan menginhibisi sel kanker sangat kuat dengan nilai IC50 < 20 µg/mL. Lebih lanjut, khasiat anti kanker paling kuat terhadap HUT-78, dengan nilai IC50 10,51 µg/mL, diikuti terhadap MCF-7 (IC50 13,39 µg/mL), dan  A-549 (IC50 14,19 µg/mL). Diketahui pula bahwa iradiasi dosis 5-10 kGy mampu menurunkan aktivitas anti kanker, namun penurunan tersebut tidak menghilangkan aktivitasnya yang ditandai nilai IC50 < 20 µg/mL. Berdasarkan data yang diperoleh, dapat disimpulkan bahwa iradiasi gamma dapat digunakan sebagai pengawetan pada ekstrak etanol H. sabdariffa Linn.

Gamma irradiation is widely used by many herbal medicine industries as an efficient preservative method in reducing microorganism contamination. The purpose of this study was to evaluate the effect of gamma irradiation (0; 5; 7.5; and 10 kGy) on the ethanol extract of H. sabdariffa (EEHS) toward the total microorganism test, total phenol and flavonoid contents, antioxidant activity, TLC profile, total quercetin and its molecular weight, inhibitory activity against α-glucosidase enzyme , as well as in-vitro bioassay against human cancer cell lines (A-549, HUT-78, and MCF-7). Irradiation at a dose of 5 kGy showed that no mold grew and there was a decrease in the total number of bacteria, moreover at a dose of 10 kGy there was no bacterial growth. Analysis of total phenols and flavonoids, as well as antioxidant activitiy showed a decrease of 5-11% after irradiation at a dose of 5 kGy. TLC and HPLC profile analysis showed that one of the compounds in the H. sabdariffa extract was quercetin which was indicated by the presence of [M+H]+ at m/z = 303.04 from the LC-MS/MS analysis. EEHS also had inhibitoty  activity against α-glucosidase enzyme with the inhibition value of 4.75-7.55%. Bioassay anticancer against human cancer cell lines showed that EEHS had a very strong ability to inhibit cancer cells with the IC50 value < 21 µg/mL. Furthermore, the anti-cancer properties were strongest against HUT-78 with the IC50 value of 10.51 µg/mL, followed by MCF-7 (IC50 13.39 µg/mL), and A-549 (IC50 14.19 µg/mL). It is also known that irradiation doses of 5-10 kGy could reduce anti-cancer activity, however the decrease did not eliminate its activity which was the IC50 values still lower than 20 µg/mL. Based on the data obtained, it can be concluded that gamma irradiation can be used as a preservative method for ethanol extract of H. sabdariffa Linn."
Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2023
T-pdf
UI - Tesis Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Wiza Iswanti
"Ekspresi gen adenosine triphosphate-binding cassette subfamily A member 1 (ABCA1) lebih rendah pada kanker kolon sehingga ekspor kolesterol yang terakumulasi di dalam sel-sel kanker oleh protein ABCA1 menjadi berkurang. Studi ini bertujuan mengetahui pengaruh ekstrak bekatul beras hitam yang mengandung antosianin terhadap ekspresi mRNA gen ABCA1 dan proliferasi sel kanker kolorektal. Studi ini dilakukan secara eksperimental pada galur sel HT-29. Antosianin diekstraksi dari serbuk bekatul beras hitam yang dimaserasi menggunakan pelarut etanol yang diasamkan dengan asam sitrat. 12 kelompok konsentrasi ekstrak dan satu kelompok kontrol digunakan untuk menentukan nilai konsentrasi penghambatan 50% proliferasi sel (Inhibitory concentration 50/IC50) dan IC % proliferasi sel masing-masing kelompok berdasarkan uji 3-(4,5- dimethylthiazol-2-yl)-5-(3-carboxymethoxyphenyl)-2-(4-sulfophenyl)-2Htetrazolium (MTS). Sel HT-29 diintervensi dengan ekstrak kemudian dilakukan pembacaan spektrofotometri 24 dan 48 jam pasca intervensi ekstrak. Satu nilai IC dipilih untuk acuan analisis ekspresi gen. Ada tiga kelompok konsentrasi ekstrak untuk pemeriksaan ekspresi gen, yaitu kelompok IC yang dipilih, kelompok dengan nilai di atas IC yang dipilih, dan kelompok kontrol. Ekspresi gen dianalisis secara kuantitatif relatif menggunakan quantitative polymerase chain reaction (qPCR). IC50 waktu inkubasi 24 jam adalah 1,57 mg/mL dan IC50 waktu inkubasi 48 jam adalah 1,35 mg/mL. Konsentrasi ekstrak bekatul beras hitam yang mengandung antosianin berkorelasi positif sangat kuat dengan aktivitas antiproliferatif dengan waktu inkubasi 24 jam (r=0,97; p = 0,001)dan waktu inkubasi 48 jam (r=0,95; p = 0,001). IC yang dipilih untuk analisis ekspresi gen adalah 1,7 mg/mL dan 2,0 mg/mL. Ekspresi relatif mRNA gen ABCA1 meningkat 2,32 kali lebih tinggi pada konsentrasi ekstrak bekatul beras hitam 2,0 mg/mL dibandingkan kontrol. Intervensi ekstrak bekatul beras hitam yang mengandung antosianin pada sel HT-29 meningkatkan ekspresi mRNA gen ABCA1 dan menghambat proliferasi sel.

The expression of the adenosine triphosphate-binding cassette subfamily A member 1 (ABCA1) gene is lower in colon cancer so that the export of cholesterol accumulated in cancer cells reduced by the ABCA1 protein. This study aims to determine the influence of black rice bran extract containing anthocyanins on ABCA1 gene mRNA expression and colorectal cancer cell proliferation. This study was conducted experimentally on the HT-29 cell line. Anthocyanins were extracted from black rice bran powder using ethanol solvent acidified with citric acid. 12 groups of extract concentration and one control group were used to determine the inhibitory concentration of 50% of cell proliferation (IC50) and IC of each group based on the 3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-5-(3- carboxymethoxyphenyl)-2-(4-sulfophenyl)-2H-tetrazolium (MTS) assay and spectrophotometric readings. HT-29 cells intervened with the extract after 24 and 48 hours of cells incubation. One IC value was selected as a reference for gene expression analysis. There were three groups of extract concentrations for gene expression examination, namely the selected IC group, the group above the selected IC value, and the control group. Gene expression was analyzed quantitatively relative using quantitative polymerase chain reaction (qPCR). The IC50 is 1.60 mg/mL and 1.35 mg/mL (24 and 48 hours of incubation time, respectively). The concentration of black rice bran extract containing anthocyanins is very strongly correlated with antiproliferative activity at 24 and 48 hours of incubation time (r = 0.97; p = 0,001 and r = 0.95; p = 0,001, respectively). The selected ICs for gene expression analysis are 1.7 and 2.0 mg/mL. ABCA1 gene mRNA relative expression increase 2.32 times higher at 2.0 mg/mL of black rice bran extract concentration than control. The intervention of black rice bran extract containing anthocyanin in HT-29 cells increases the ABCA1 gene mRNA expression and inhibits cell proliferation."
Jakarta: Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia, 2021
T-pdf
UI - Tesis Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Tiara Aulia Zalyanti
"Kanker kolorektal adalah kanker yang menyerang kolon dan rektum. Secara global, kanker kolorektal menempati urutan kedua sebagai kanker penyebab mortalitas tertinggi. Tingginya angka mortalitas kanker kolorektal dipengaruhi oleh resistansi obat yang berkaitan dengan heterogenitas sel kanker. Salah satu faktor pemicu heterogenitas sel adalah keberadaan extrachromosomal DNA (ecDNA), yaitu fragmen DNA sirkular di luar kromosom linear yang terbentuk akibat kerusakan DNA. Extrachromosomal DNA hanya ditemukan pada sel kanker, membawa onkogen dengan tingkat amplifikasi yang tinggi, serta memicu agresivitas kanker. Penelitian mengenai karakterisasi ecDNA pada sel HT-29 yang merupakan cell line representatif untuk kanker kolorektal belum pernah dilakuka n. Oleh karena itu, penelitian ini bertujuan untuk mendeteksi dan mengarakterisasi ecDNA pada kanker kolorektal cell line HT-29 menggunakan pewarnaan Giemsa, pewarnaan DAPI, dan scanning electron microscopy (SEM). Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa ecDNA terdeteksi pada 18 dari 180 sebaran metafase atau setara 10% dari total sebaran metafase yang diamati. Dari 18 sebaran metafase, 12 di antaranya memiliki satu ecDNA dalam bentuk tunggal, sementara 6 lainnya memiliki dua ecDNA dalam bentuk tunggal maupun berpasangan. Luas area ecDNA sebesar 0,455 μm² dengan intensitas fluoresens DAPI 102,747 A.U. Hasil gambar SEM menunjukkan struktur sirkular (ring-like structure) dengan luas ukuran 0,884 μm². Ultrastruktur tersebut memiliki morfologi yang konsisten dengan karakteristik ecDNA pada penelitian sebelumnya. Keberadaan ecDNA pada cell line HT-29 dapat dideteksi melalui pengamatan dengan mikroskop cahaya, mikroskop konfokal, dan scanning electron microscopy (SEM).

Colorectal cancer is a type of cancer that affects the colon and rectum. Globally, it ranks as the second leading cause of cancer-related deaths. The high mortality rate of colorectal cancer is influenced by drug resistance, which is linked to cancer cell heterogeneity. One of the key factors driving this heterogeneity is the presence of extrachromosomal DNA (ecDNA), which refers to circular DNA fragments located outside linear chromosomes and formed as a result of DNA damage. ecDNA is found only in cancer cells, carries highly amplified oncogenes, and contributes to increased cancer aggressiveness. To date, no studies have characterized ecDNA in HT-29 cells, a commonly used colorectal cancer cell line. Therefore, this study aims to detect and characterize ecDNA in the HT-29 cell line using Giemsa staining, DAPI staining, and scanning electron microscopy (SEM). In this study, ecDNA was detected in 18 out of 180 metaphase spreads, representing 10% of the total. Among these, 12 spreads contained a single ecDNA, while 6 had two ecDNAs, either as single or paired forms. The average area of ecDNA was 0.455 μm² with a DAPI fluorescence intensity of 102.747 A.U. SEM imaging revealed a circular structure with an area of 0.884 μm². The ultrastructure showed morphological features consistent with ecDNA, as described in previous studies. The presence of ecDNA in the HT-29 cell line can be detected through observations using light microscopy, confocal microscopy, and scanning electron microscopy (SEM). "
Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2025
S-pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
<<   1 2 3   >>