Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

Abstrak :
andida spp. merupakan patogen nosokomial yang paling umum diisolasi di antara spesies ragi dan menyebabkan mortalitas yang tinggi. Kontaminasi Candida yang resistan antifungal banyak ditemukan pada berbagai permukaan di lingkungan rumah sakit, sehingga meningkatkan kemungkinan transmisinya dari lingkungan. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui gambaran kontaminasi, efektivitas desinfeksi, serta karakteristik kepekaan Candida spp. terhadap antifungal. Penelitian dilakukan dengan pengambilan sampel permukaan di ruang perawatan intensif rumah sakit rujukan di Jakarta pada area high touch surfaces. Sampel dibiakkan pada medium CHROMagar Candida™, kemudian koloni ragi dihitung untuk mengetahui pengaruh disinfektan. Identifikasi spesies dilakukan menggunakan VITEK, kemudian dilanjutkan dengan PCR dan sekuensing dengan target regio ITS, serta dilakukan analisis filogenetik. Profil kepekaan Candida spp. dianalisis menggunakan VITEK. Berdasarkan hasil dijumpai 7 spesies Candida yang mengontaminasi permukaan yang didominasi oleh C. haemulonii. Hasil uji kepekaan antifungal menunjukkan bahwa seluruh isolat C. haemulonii resistan terhadap amphotericin B, dan satu isolat C. glabrata resistan terhadap caspofungin. Berdasarkan analisis efektivitas disinfektan, terdapat penurunan jumlah koloni Candida spp. sesudah prosedur desinfeksi yang menunjukkan bahwa prosedur desinfeksi sudah cukup efektif. Sebagai kesimpulan, C. haemulonii merupakan kontaminan utama pada permukaan yang resistan amphotericin B. Adapun tindakan desinfeksi sudah efektif namun cara melakukan desinfeksi perlu diperbaiki. ......Candida spp. is the most common nosocomial pathogen isolated among yeast species with a high mortality rate. Antifungal-resistant Candida contamination has been found on various surfaces in the hospital environment, thus increasing the possibility of transmission. This study was conducted to determine Candida’s contamination profile, disinfection efficacy, and antifungal susceptibility features. Surface samples were collected in the intensive care unit ofreferral hospital in Jakarta, at the high touch surfaces area. The samples were then cultured on CHROMagar™ Candida, then yeast colonies were counted to determine the disinfectant efficacy. Species were identified using VITEK, PCR and sequencing targeting the ITS region, followed by phylogenetic analysis. Susceptibility characteristic of Candida spp. were analyzed using VITEK. The surface was contaminated by seven species of Candida, with C. haemuloni predominating. All C. haemulonii isolates were resistant to amphotericin B, and one C. glabrata isolate was resistant to caspofungin. The disinfectant efficacy analysis showed that there was a decrease in the number of Candida spp. after disinfection treatment, indicating that the disinfectant is quite effective. In summary, C. haemulonii is the main contaminant on surfaces that are resistant to amphotericin B. Although the disinfection techniques have been effective, they still require improvement

Abstrak :
Jamur penyebab mikosis tertinggi di dunia dan di Indonesia adalah Candida spp. yang selanjutnya disebut sebagai kandidiasis. Tanaman johar merupakan salah satu sumber altenatif pencarian senyawa yang berkhasiat sebagai anti Candida spp. Sampai saat ini, belum ada penelitian menyeluruh aktivitas antijamur Candida spp. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi ekstrak, fraksi dan isolat paling aktif dari tanaman johar serta mengkarakterisasi senyawa aktif tersebut. Ekstraksi dilakukan secara bertingkat (n-heksan, etil asetat, metanol) dan dilanjutkan uji aktivitas anti Candida spp. Ekstrak teraktif yang di dapat difraksinasi dengan kromatografi kolom dan diuji aktivitas anti Candida spp. Pada fraksi teraktif dilakukan pemurnian isolat dengan kromatografi kolom dan rekristalisasi, serta uji aktivitas antijamur. Isolat teraktif yang didapat diidentifikasi menggunakan spektrometri FTIR, GCMS, 1H-NMR, 13C-NMR dan DEPT. Evaluasi anti Candida albicans dan Candida krusei menunjukan diameter hambat 2,20 cm; 1,36 cm untuk ekstrak n-heksan (ENH), 1,76 cm; 1,16 cm untuk ekstrak etil asetat (EEA) sedangkan ekstrak metanol tidak menunjukkan aktivitas. Hasil uji aktivitas anti Candida spp. dari 6 fraksi ENH menunjukkan adanya 2 fraksi teraktif yaitu fraksi 1 dan 2. Sedangkan dari 7 fraksi dari EEA, didapatkan fraksi teraktif adalah fraksi 1. Selanjutnya dilakukan isolasi terhadap semua fraksi teraktif dan didapat hanya 1 isolat aktif dari fraksi 2 ENH dengan nilai penghambatan 100 ppm pada C.albicans. dan 50 ppm pada C.krusei. Hasil karakterisasi dari isolat teraktif menunjukkan adanya stigmasterol. Penambatan molekuler antara senyawa stigmasterol dengan protein CYP51 menunjukkan nilai binding afinitas -11,44 untuk CYP51 C.albicans dan -10,84 untuk CYP51 C.krusei. ......The highest number of mycosis-causing fungi in the world and in Indonesia are Candida spp. hereinafter referred to as candidiasis. Johar plant is an alternative source of compounds that are efficacious as anti-Candida spp. To date, there has been no thorough study of the antifungal activity of Candida spp. This study aims to identify the most active extracts, fractions and isolates from the johar plant and to characterize these active compounds. Extraction was carried out in stages (n-hexane, ethyl acetate, methanol) and continued with anti-Candida spp. The most active extract could be fractionated by column chromatography and tested for anti-Candida spp. The most active fraction was purified by column chromatography and recrystallization, as well as antifungal activity test. The most active isolates obtained were identified using FTIR, GCMS, 1H-NMR, 13C-NMR and DEPT spectrometry. Evaluation of anti Candida albicans and Candida krusei showed an inhibition diameter of 2.20 cm; 1.36 cm for n-hexane extract (ENH), 1.76 cm; 1.16 cm for ethyl acetate extract (EEA) while the methanol extract showed no activity. The results of the anti-Candida spp. activity test. of the 6 ENH fractions showed the presence of 2 of the most active fractions, namely fractions 1 and 2. Meanwhile, of the 7 fractions from EEA, the most active fraction was obtained was fraction 1. Further isolation of all the most active fractions was carried out and only 1 active isolate was obtained from ENH fraction 2 with an inhibition value of 100 ppm in C.albicans. and 50 ppm on C. krusei. The characterization results of the most active isolates showed the presence of stigmasterol. Molecular binding between the stigmasterol compound and the CYP51 protein showed a binding affinity value of -11.44 for CYP51 C.albicans and -10.84 for CYP51 C.krusei. 

Abstrak :
Dari semua spesies Candida yang ada, Candida krusei memiliki resistansi alami terhadap flukonazol, terapi lini pertama pada infeksi jamur. Salah satu faktor resistansi yang ada adalah adanya protein Abc1p yang dikode oleh gen ABC1. Penelitian eksperimental observasional ini menganalisis 16 whole-genome sequence (WGS) dari C. krusei dan membandingkannya terhadap gen ABC1 pada C. krusei lain dan homolognya pada Candid lain yang didapat dari database NCBI dan UniProtKB. Hasil analisis menunjukkan karakteristik dari gen Abc1p yang ditemukan memiliki common ancestor dengan gen serupa pada Candida lain. Hasil analisis juga memprediksi lokasi-lokasi pada sekuens yang diduga memiliki efek perubahan fungsi yang besar jika terjadi mutasi pada titik tersebut. Pemodelan 3D menemukan protein Pdr5 dari S. cerevisiae sebagai protein dengan struktur yang paling mirip dengan Abc1p. ......Of all the Candida species, Candida krusei has a natural resistance to fluconazole, the first line therapy for fungal infections. One of the factors that contributes to C. krusei’s resistance is the Abc1p protein that is coded by the ABC1 gene. This experimental observational study analyzed 16 whole-genome sequences (WGS) of C. krusei and compared them with the ABC1 genes of other C. krusei and its homologues in other Candida species gathered from the NCBI and UniProtKB databases. Results showed the characteristics of the Abc1p gene. A common ancestor among the ABC1p protein and other similar proteins in other Candida species was found. A prediction was also made on the effects an amino acid mutation would have and the location of the mutation. Three-dimensional modeling of the Abc1p protein showed that the protein with the most similar structure is the Pdr5 protein from S. cerevisiase.

Abstrak :
Pendahuluan: Pasien kanker paru di seluruh dunia meningkat, demikian pula dengan infeksi oportunistiknya, mikosis paru. Meskipun mikosis paru sudah lama dikenal, namunpenelitian yang tepat tentang prevalensi dan insidensinya masih terbatas di Indonesia.Informasi tentang kerentanan itrakonazol sebagai obat oral yang dapat digunakan untuk mengobati mikosis paru juga diperlukan. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui profil jamur dan kerentanannya terhadap itrakonazol pada penderita kanker paru. Metode: Desain penelitian deskriptif cross-sectional. Subyek dalam penelitian ini adalah pasien kanker paru yang dirawat di RS Persahabatan dari Januari sampai Mei 2020, dan sputumnya dilakukan pemeriksaan di Laboratorium Mikologi Departemen Parasitologi Universitas Indonesia. Pasien berusia sama atau lebih dari 18 tahun, belum menjalani kemoterapi, dan diperiksa dengan bronkoskopi. Uji kepekaan jamur dilakukan dengan difusi cakram pada agar Müeller Hinton. Itraconazole (8 μg) digunakan dan Amphotericin B (20 μg) dan Fluconazole (25 μg) sebagai kontrol positif. Hasil: Tujuh puluh tujuh pasien didapatkan. Kanker yang paling banyak dijumpai adalah adenokarsinoma pada 58 penderita, sisanya adalah karsinoma sel skuamos. Jenis jamur yang ditemukan adalah Aspergillus niger (22,1%), Aspergillus flavus (15%), Aspergillus fumigatus (14,3%), Candida albicans (40%), Candida glabrata (5%), Candida parapsilosis (2,1%), Candida krusei ( 0,7%), dan Candida tropicalis (0,7%). Sebagian besar spesies masih sensitif terhadap itrakonazol dan amfoterisin B. Kesimpulan: Jenis jamur yang paling banyak ditemukan adalah Candida albicans. Aspergillus spp dan Candida spp dan mayoritas sensitif terhadap Itraconazole. Kata kunci: Kanker paru-paru, Mikosis Paru, Kolonisasi jamur, Candida spp, Aspergillus spp, sputum

---

Introduction: Lung cancer patients around the globe are increasing along with its opportunistic infection, pulmonary mycosis. Despite pulmonary mycosis being wellknown, a proper research about the prevalence and incidence are limited in Indonesia. An update about the susceptibility of itraconazole as the most common drug used to treat pulmonary mycosis is also needed. The aim of this study was to determine the fungal profile and its susceptibility to itraconazole in lung cancer patients. Methods: This is a descriptive cross-sectional study using both secondary and primary data. Lung cancer patients who had been admitted to Persahabatan Hospital from January to May 2020 were tested for mycological examinations by Mycology Laboratory of the Department of Parasitology, University of Indonesia. Patients aged equal or more than 18 years old, had not undergone chemotherapy, and examined with bronchoscopy were included. The fungi susceptibility test were conducted using disk diffusion on Müeller Hinton agar. Itraconazole (8 μg) were used and Amphotericin B (20 μg) and Fluconazole (25 μg) were also measured as a positive control. Results: Seventy-seven patients were involved. The most common cancer was adenocarcinoma in 58 subjects, the rest were squamos cell carcinoma. The fungal species found were Aspergillus niger (22.1%), Aspergillus flavus (15%), Aspergillus fumigatus (14.3%), Candida albicans (40%), Candida glabrata (5%), Candida parapsilosis (2.1%), Candida krusei (0.7%), and Candida tropicalis (0.7%). Most of the species were still sensitive to itraconazole and amphotericin B. Conclusion: The most common fungal species was Candida albicans. Aspergillus spp and Candida spp were sensitive to Itraconazole. Key words: Lung cancer, Lung Mycosis, Fungal Colonization, Candida spp, Aspergillus spp, sputum