Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

"Bacterial leaf blight (BLB) is one of the major diseases in rice caused by Xanthomonas oryzae pv. oryzae. This studyaimed to identify and analyze the genetic diversity of 18 BLB isolates that consist of 7 races and 11 haplotypes fromvarious locations in Indonesia. The genetic diversity analysis was conducted on the basis of the VNTR (VariableNumber of Tandem Repeat) markers and the avrxa7 gene marker. The banding pattern of the amplification product wasmade into binary data as input for the construction of a dendogram. Based on the dendogram, three X. oryzae pv. oryzaegenotype groups with different virulence levels were formed. The VII (IXO80_021) race of X. oryzae pv. oryzaegenotype group I and the VIII-A (IXO 80_024) race of genotype group II were avirulent, whereas the races andhaplotypes of genotype group III were virulent.Keragaman Genetik Core Collection Isolat Bacterial Leaf Blight (Xanthomonas oryzae pv. oryzae) Indonesiaberdasarkan Marka Molekular VNTR dan avrXa7. Bacterial leaf blight (BLB) adalah salah satu penyakit utama padiyang disebabkan oleh bakteri pathogen Xanthomonas oryzae pv. oryzae. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasidan menganalisis keragaman genetik 18 isolat isolates yang terdiri dari 7 ras dan 11 haplotipe yang berasal daribeberapa lokasi koleksi di Indonesia. Analisis keragaman genetik dilakukan menggunakan marka VNTR (VariableNumber of Tandem Repeat) dan marka gen avrxa7. Pola pita DNA hasil amplifikasi digunakan sebagai data input bineruntuk membuat dendogram keragaman. Berdasarkan dendogram tersebut, terdapat tiga kelompok genotipe X. oryzaepv. oryzae dengan tingkat virulensi yang berbeda. Ras VII (IXO80_021) yang termasuk dalam kelompok I dan RasVIII-A (IXO 80_024) yang termasuk dalam kelompok II merupakan ras BLB yang tidak virulen. Sedangkan kelompokIII merupakan kelompok ras dan haplotipe yang bersifat virulen."

"ABSTRAKPenyakit hawur daun bakteri (HDB) merupakan salah satu kendala dalam peningkatan produksi padi. Penggunaan varietas tanah merupakan carapengendalian yang efektif dan mudah diterapkan petani. Tulisan ini membahas heritabilitas dan sumber gen ketahanan varietas padi terhadap penyakit HDB dan strategi mempertahankan durabilitas varietas tahan sebagai salah satu upaya pengendalian melalui pemulihan tanaman mendukung upaya peningkatan produksi padi. periaktan dan pengembangan varietas tahan berperan penting mengendalikan penyakit DB, karena memilki mekanisme ketahanan genetik yang dapat diwariskan kepada keturunannya. Varietas dengan ketahanan vartikel mudah dipatahkan oleh patogen, sehingga perlu upaya perakitan varietas dengan ketahanan horizontal. Untuk memperoleh keturunan tanaman padi yang tahan terhadap penyakit HDB dalam perakitan varietas, posisi tetua tahan sebaiknya diperankan sebagai tetua betina yang memilki daya gabung khusus yang tinggi. sifat ketahanan HDB dari populasi tetua yang mengandung gen dari hasil silang ganda memilki heritabilitas lebih tinggi. Populasi turunan dari silang ganda memilki ketahanan multigenik dan berpeluang menghasilkan individu rekombian tahan untuk periode yang lama (durable). Ketersediaan varietas tahan yang durable menjadi syarat utama dalam pengendalian penyakit HDB secara berkelanjutan. Hal ini dapat dilakukan dengan perbaikan ketahanan varietas melalui perakitan varietas dengan berbagai sumber ketahanan, di antaranya padi liar, padi lokal, dan padi intoduksi."

"Bawang merah (Allium ascalonicum L.) adalah komoditas sayuran dengan ancaman penyakit hawar daun bakteri yang disebabkan oleh Pantoea sp. dalam produksinya. Pemanfaatan agen biokontrol dari bakteri yang berasosiasi dengan akar tanaman berpotensi tinggi menghasilkan mekanisme penghambatan patogen pada tanaman. Penelitian ini bertujuan untuk memperoleh isolat bakteri agen biokontrol yang mampu menghambat pertumbuhan patogen Pantoea sp., mempelajari karakterisasi dan mekanisme aktivitas agen biokontrol dalam penghambatan patogen Pantoea sp., serta mengidentifikasi isolat bakteri agen biokontrol. Kultur bakteri kandidat agen biokontrol diisolasi dari tanah perakaran tanaman bawang merah di lahan pertanian bawang merah di Cirebon dan Majalengka, Jawa Barat, serta Brebes, Jawa Tengah. Pengujian aktivitas meliputi uji antagonisme dan karakterisasi aktivitas biokontrol (produksi enzim protease, kitinase, selulase, siderofor, hidrogen sianida, ammonia, peroksidase dan aktivitas katalase) secara in vitro. Identifikasi isolat bakteri agen biokontrol dengan dilakukan gen 16S rRNA dan dilanjutkan dengan pembuatan rekonstruksi pohon filogenetik. Berdasarkan hasil penelitian, diperoleh 5 isolat rizobakteri (I-8, L1-9, L1-12, BM-L3(2), dan BM-L3(3)) yang memiliki kemampuan antagonis terhadap patogen Pantoea sp. penyebab penyakit hawar daun bakteri pada bawang merah. Kelima isolat tersebut menunjukkan hasil positif pada uji aktivitas enzim protease, kitinase, selulase, siderofor, hidrogen sianida, ammonia, peroksidase dan aktivitas katalase. Hanya isolat BM-L3(2) yang tidak memiliki kemampuan dalam produksi enzim kitinase. Isolat BM-L3(2) dan BM-L3(3) teridentifikasi sebagai Brevibacillus schisleri dan Bacillus sp., sedangkan isolat I-8, L1-9, dan L1-12 teridentifikasi sebagai Streptomyces rochei berdasarkan sifat morfologi, analisis sekuens 16S rRNA, dan kekerabatan pada hasil rekonstruksi pohon filogeni.

---

Shallot (Allium ascalonicum L.) is vegetable commodity that has the threat of bacterial leaf blight caused by Pantoea sp. in its production. Utilization of biocontrol agents from bacteria associated with plant roots has high potential to produce pathogen inhibition mechanisms in plants. This research aims to obtain bacterial isolates of biocontrol agents that are able to inhibit the growth of Pantoea sp., study the characterization and mechanism activity of biocontrol agents, and identify bacterial of biocontrol agents. Bacterial of biocontrol agent candidates were isolated from root soil of shallot plants in Cirebon, Majalengka, and Brebes. The activity of the antagonism and biocontrol charaterization (enzyme production of protease, chitinase, cellulase, siderophore, HCN, ammonia, peroxidase and catalase) was tested by in vitro. Identification of biocontrol agent bacterial with the 16S rRNA gene was carried out and continued with phylogenetic tree reconstruction. Based on the results of the study, 5 rhizobacterial isolates (I-8, L1-9, L1-12, BM-L3(2), and BM-L3(3)) were obtained that have antagonism activity as biocontrol agent bacteria against the pathogen Pantoea sp. causing bacterial leaf blight in shallots. The five isolates showed positive results in the enzyme activity tests of protease, chitinase, cellulase, siderophore, hydrogen cyanide, ammonia, peroxidase, and catalase. Only isolate BM-L3 (2) does not have the ability to produce chitinase enzyme. Isolates BM-L3(2) and BM-L3(3) were identified as Brevibacillus schisleri and Bacillus sp., while isolates I-8, L1-9, and L1-12 were identified as Streptomyces rochei based on morphological characters, 16S rRNA sequence analysis, and kinship on phylogeny tree reconstruction results."

"ABSTRAKXanthomonas oryzaepv. oryzae (Xoo) menyebabkan hawar daun bakteri (HDB) pada padi (Oryza sativaL.), yangmerupakan penyakit utama dan menjadi pembatas bagi produksi tanaman pokok di banyak negara di dunia. IsolasiXoodilakukan dari daun padi yang terserang hawar daun bakteri. Identifikasi X. oryzae pv. oryzae dilakukan berdasarkanpada gejala yang ditimbulkannya, patogenisitas, karaktermorfologi, fisiologi, dan genetik biakan bakteri yang diisolasidari tanaman padi yang terinfeksi Xoo. Sebanyak 50 isolat yang didugaXoo telah berhasil diisolasi. Bakteri tersebutbersifat aerobik, berbentuk batang, dan tergolong Gram negatif. Isolat-isolat tersebut diuji hipersensitivitasnya padatanaman tembakau dan patogenisitasnya pada padi. Kelima puluh isolat bakteri tersebut mampu menginduksi reaksihipersensitif pada tanaman tembakau dan menyebabkan gejala sakit pada tanaman padi dengan perkembangan gejalayang berbeda. Hasil uji fisiologi, reaksi hipersensitivitasdan patogenisitas, tiga isolat bakteri yang diduga kuat Xooyaitu STG21, STG42, dan STG46 menunjukkan bahwa bakteri tersebut tidak membentuk indol, tidak menghasilkanpigmen flouresens, menghidrolisis kasein, memiliki aktivitas enzim katalase, tetapi tidak memiliki aktivitas enzimoksidase. Hasil parsial sekuensing gen penyandi 16S rRNA dari STG21 dan STG42 menunjukkan homologi dengan X.oryzae pv oryzae masing-masing sebesar 80% dan 82%,sedangkan STG46 menunjukkan homologi dengan X.campestris sebesar 84%. Mutagenesis dengan transposon Mini-Tn5 pada STG21 menghasilkan salah mutan (M5) yangtidak dapat menginduksi reaksi hipersensitif pada tanaman tembakau dan berkurang patogenisitasnya pada padi.Panjang gejala HDB pada padi yang ditimbulkan mutan M5 berkurang sebesar 80%.

---

AbstractX. oryzae pv. oryzae (Xoo) causes bacterial leaf blight (BLB) of rice (Oryza sativa L.), a major disease that constrains production of the staple crop in many countries of the world. Identification of X.oryzae pv. oryzae (Xoo) was conducted based on the disease symptoms, pathogenicity, morphological, physiological,and genetic characteristics of bacterial cultures isolated from the infected plants. Fifty bacterial isolates predicted as Xoohave been successfully isolated. They are aerobic, rod shaped, and Gram negative bacteria. The isolates were evaluatedfor their hypersensitivity in tobacco andpathogenicity in rice plant. Fifty isolates induced hypersensitive reaction intobacco and showed pathogenicity symptom in rice in different length. Based on physiological test, hypersensitivity andpathogenicity reactions, three bacterial isolates strongly predicted asXoo, i.e. STG21, STG42, and STG46, were nonindole formation, non pigment fluorescent, hydrolyzed casein, catalase activity positive, but negative oxidase. Partialsequencing of 16S rRNA genes of STG21 and STG42 showed 80% and 82% homology with X. oryzae, respectively,while STG46 showed 84% homology withX. campestris. Mini-Tn5 transposon mutagenesis of STG21 generated one ofthe mutants (M5) lossed it?s ability to induce hypersensitive reaction in tobacco plant and deficient in pathogenicity onrice. The lesion length of rice leaf causedby the mutant M5 decreased up to 80%. "