Ditemukan 2 dokumen yang sesuai dengan query
Wiza Iswanti
"Ekspresi gen adenosine triphosphate-binding cassette subfamily A member 1 (ABCA1) lebih rendah pada kanker kolon sehingga ekspor kolesterol yang terakumulasi di dalam sel-sel kanker oleh protein ABCA1 menjadi berkurang. Studi ini bertujuan mengetahui pengaruh ekstrak bekatul beras hitam yang mengandung antosianin terhadap ekspresi mRNA gen ABCA1 dan proliferasi sel kanker kolorektal. Studi ini dilakukan secara eksperimental pada galur sel HT-29. Antosianin diekstraksi dari serbuk bekatul beras hitam yang dimaserasi menggunakan pelarut etanol yang diasamkan dengan asam sitrat. 12 kelompok konsentrasi ekstrak dan satu kelompok kontrol digunakan untuk menentukan nilai konsentrasi penghambatan 50% proliferasi sel (Inhibitory concentration 50/IC50) dan IC % proliferasi sel masing-masing kelompok berdasarkan uji 3-(4,5- dimethylthiazol-2-yl)-5-(3-carboxymethoxyphenyl)-2-(4-sulfophenyl)-2Htetrazolium (MTS). Sel HT-29 diintervensi dengan ekstrak kemudian dilakukan pembacaan spektrofotometri 24 dan 48 jam pasca intervensi ekstrak. Satu nilai IC dipilih untuk acuan analisis ekspresi gen. Ada tiga kelompok konsentrasi ekstrak untuk pemeriksaan ekspresi gen, yaitu kelompok IC yang dipilih, kelompok dengan nilai di atas IC yang dipilih, dan kelompok kontrol. Ekspresi gen dianalisis secara kuantitatif relatif menggunakan quantitative polymerase chain reaction (qPCR). IC50 waktu inkubasi 24 jam adalah 1,57 mg/mL dan IC50 waktu inkubasi 48 jam adalah 1,35 mg/mL. Konsentrasi ekstrak bekatul beras hitam yang mengandung antosianin berkorelasi positif sangat kuat dengan aktivitas antiproliferatif dengan waktu inkubasi 24 jam (r=0,97; p = 0,001)dan waktu inkubasi 48 jam (r=0,95; p = 0,001). IC yang dipilih untuk analisis ekspresi gen adalah 1,7 mg/mL dan 2,0 mg/mL. Ekspresi relatif mRNA gen ABCA1 meningkat 2,32 kali lebih tinggi pada konsentrasi ekstrak bekatul beras hitam 2,0 mg/mL dibandingkan kontrol. Intervensi ekstrak bekatul beras hitam yang mengandung antosianin pada sel HT-29 meningkatkan ekspresi mRNA gen ABCA1 dan menghambat proliferasi sel.
The expression of the adenosine triphosphate-binding cassette subfamily A member 1 (ABCA1) gene is lower in colon cancer so that the export of cholesterol accumulated in cancer cells reduced by the ABCA1 protein. This study aims to determine the influence of black rice bran extract containing anthocyanins on ABCA1 gene mRNA expression and colorectal cancer cell proliferation. This study was conducted experimentally on the HT-29 cell line. Anthocyanins were extracted from black rice bran powder using ethanol solvent acidified with citric acid. 12 groups of extract concentration and one control group were used to determine the inhibitory concentration of 50% of cell proliferation (IC50) and IC of each group based on the 3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-5-(3- carboxymethoxyphenyl)-2-(4-sulfophenyl)-2H-tetrazolium (MTS) assay and spectrophotometric readings. HT-29 cells intervened with the extract after 24 and 48 hours of cells incubation. One IC value was selected as a reference for gene expression analysis. There were three groups of extract concentrations for gene expression examination, namely the selected IC group, the group above the selected IC value, and the control group. Gene expression was analyzed quantitatively relative using quantitative polymerase chain reaction (qPCR). The IC50 is 1.60 mg/mL and 1.35 mg/mL (24 and 48 hours of incubation time, respectively). The concentration of black rice bran extract containing anthocyanins is very strongly correlated with antiproliferative activity at 24 and 48 hours of incubation time (r = 0.97; p = 0,001 and r = 0.95; p = 0,001, respectively). The selected ICs for gene expression analysis are 1.7 and 2.0 mg/mL. ABCA1 gene mRNA relative expression increase 2.32 times higher at 2.0 mg/mL of black rice bran extract concentration than control. The intervention of black rice bran extract containing anthocyanin in HT-29 cells increases the ABCA1 gene mRNA expression and inhibits cell proliferation."
Jakarta: Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia, 2021
T-pdf
UI - Tesis Membership Universitas Indonesia Library
Tiara Aulia Zalyanti
"Kanker kolorektal adalah kanker yang menyerang kolon dan rektum. Secara global, kanker kolorektal menempati urutan kedua sebagai kanker penyebab mortalitas tertinggi. Tingginya angka mortalitas kanker kolorektal dipengaruhi oleh resistansi obat yang berkaitan dengan heterogenitas sel kanker. Salah satu faktor pemicu heterogenitas sel adalah keberadaan extrachromosomal DNA (ecDNA), yaitu fragmen DNA sirkular di luar kromosom linear yang terbentuk akibat kerusakan DNA. Extrachromosomal DNA hanya ditemukan pada sel kanker, membawa onkogen dengan tingkat amplifikasi yang tinggi, serta memicu agresivitas kanker. Penelitian mengenai karakterisasi ecDNA pada sel HT-29 yang merupakan cell line representatif untuk kanker kolorektal belum pernah dilakuka n. Oleh karena itu, penelitian ini bertujuan untuk mendeteksi dan mengarakterisasi ecDNA pada kanker kolorektal cell line HT-29 menggunakan pewarnaan Giemsa, pewarnaan DAPI, dan scanning electron microscopy (SEM). Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa ecDNA terdeteksi pada 18 dari 180 sebaran metafase atau setara 10% dari total sebaran metafase yang diamati. Dari 18 sebaran metafase, 12 di antaranya memiliki satu ecDNA dalam bentuk tunggal, sementara 6 lainnya memiliki dua ecDNA dalam bentuk tunggal maupun berpasangan. Luas area ecDNA sebesar 0,455 μm² dengan intensitas fluoresens DAPI 102,747 A.U. Hasil gambar SEM menunjukkan struktur sirkular (ring-like structure) dengan luas ukuran 0,884 μm². Ultrastruktur tersebut memiliki morfologi yang konsisten dengan karakteristik ecDNA pada penelitian sebelumnya. Keberadaan ecDNA pada cell line HT-29 dapat dideteksi melalui pengamatan dengan mikroskop cahaya, mikroskop konfokal, dan scanning electron microscopy (SEM).
Colorectal cancer is a type of cancer that affects the colon and rectum. Globally, it ranks as the second leading cause of cancer-related deaths. The high mortality rate of colorectal cancer is influenced by drug resistance, which is linked to cancer cell heterogeneity. One of the key factors driving this heterogeneity is the presence of extrachromosomal DNA (ecDNA), which refers to circular DNA fragments located outside linear chromosomes and formed as a result of DNA damage. ecDNA is found only in cancer cells, carries highly amplified oncogenes, and contributes to increased cancer aggressiveness. To date, no studies have characterized ecDNA in HT-29 cells, a commonly used colorectal cancer cell line. Therefore, this study aims to detect and characterize ecDNA in the HT-29 cell line using Giemsa staining, DAPI staining, and scanning electron microscopy (SEM). In this study, ecDNA was detected in 18 out of 180 metaphase spreads, representing 10% of the total. Among these, 12 spreads contained a single ecDNA, while 6 had two ecDNAs, either as single or paired forms. The average area of ecDNA was 0.455 μm² with a DAPI fluorescence intensity of 102.747 A.U. SEM imaging revealed a circular structure with an area of 0.884 μm². The ultrastructure showed morphological features consistent with ecDNA, as described in previous studies. The presence of ecDNA in the HT-29 cell line can be detected through observations using light microscopy, confocal microscopy, and scanning electron microscopy (SEM). "
Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2025
S-pdf
UI - Skripsi Membership Universitas Indonesia Library