Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

"ABSTRAKPelipatan protein merupakan hal penting dalam pembentukan struktur native protein dan fungsi biologisnya. Kesalahan pelipatan protein dapat menyebabkan penyakit seperti Alzheimers dan fibrosis kistik. Struktur native protein Transforming growth factor b3 (TGF-b3) berbentuk dimer yang diperoleh dari hasil pelipatan monomer identik. Struktur native TGF-b3 dapat diperoleh dari rekombinan TGF-b3 dari E.coli dengan beberapa perlakuan kimia, namun proses ini cenderung membentuk badan iklusi yang mengandung protein non-aktif. Pada umumnya, protein yang terlipat dengan benar menjadi bentuk native merupakan protein yang aktif. Oleh karena itu diperlukan simulasi dinamika molekuler untuk mengetahui mampukah monomer protein TGF-b3 melakukan selffolding. Simulasi dinamika molekuler protein menggunakan perangkat Amber dilakukan pada rantai asam amino struktur monomer protein TGF-b3 dengan identitas PDB 1TGJ. Proses simulasi dilakukan selama 9 μs menggunakan parameter gabungan Amber forcefield ff14SBonlysc, GBNeck2, dan mbondi3 dalam sistem yang tidak menghitung interaksi atom dengan air. Hasil simulasi diperoleh struktur yang berbeda dari struktur monomer kristal protein pada PDB. Rata-rata RMSD dari perbandingan kedua struktur didapatkan kurang lebih 15-16 Å dengan RMSD terendah yakni 14,0479 Å. Dari simulasidinamika molekuler yang dilakukan dengan pendekatan all atom dalam implisit solven, diperoleh struktur monomer non-native protein TGF-b3

---

ABSTRACTProtein folding has an important role in the formation of native structure and their biological functions. Incorrect folding can cause diseases such as Alzheimer's and cystic fibrosis. The structure of Transforming growth factor b3 (TGF-b3), in the form of dimers, obtained from folded monomer. Its native structure can be obtained from recombinant TGF-b3 from E. coli when given several chemical treatments, but prone to be misfolded therefore a molecular dynamics simulation is needed to determine whether self-folding of monomer TGF-b3 can be done. Molecular dynamics simulations of protein using Amber software were performed on amino acid chains of monomer TGF-b3 from PDB, the identity is 1TGJ. The simulation process is carried out for 9 μs using a combined parameter of Amber forcefield ff14SBonlysc, GBNeck2, and mbondi3 at an implicit water environment. Unfortunately, the structure obtained from the simulation was different from its monomer crystal structure. The average RMSD we got in the comparison between result structure and monomer crystal structures was approximately 15-16 Å with the lowest RMSD was 14,0479 Å. From the molecular dynamics simulation carried out with the approach of all atoms in implicit water, the non-native structure of monomer TGF-b3 protein was obtained."

"Latar Belakang: Breast Cancer Stem Cells (BCSC) merupakan populasi selkanker payudara yang mempunyai sifat sel punca. BCSC menjaga stabilitas tumordengan menginisiasi pembentukan populasi sel kanker baru serta memberikankekebalan terhadap terapi. BCSC dapat berinteraksi dengan lingkungan mikrotumor yang melepaskan berbagai sitokin dan growth factor, termasuk TGF-β1.Melalui mekanisme autoinduksi, TGF-β1 dapat meningkatkan produksi TGF-β1endogen dan pensinyalan autokrinnya. Pensinyalan autokrin TGF-β1 dapatmeningkatkan pengaruh tumor promotor TGF-β1 dalam perkembangan kankermelalui penguatan karakter kepuncaan dan sifat tumorigenik. Penelitian inibertujuan untuk enganalisis efek pemberian TGF-β1 rekombinan manusia pada selpunca kanker payudara (aldehyde dehydrogenase positive, ALDH+) terhadapekspresi marker kepuncaan melalui pensinyalan autokrin TGF-β1. Sebagaipembanding digunakan kanker payudara subtipe triple negative (TNBC).Metode: BCSCs manusia (ALDH+) dan TNBC (MDA-MB-231) dikultur dalamDulbecco's Modified Eagle Medium/Nutrient Mixture F12/HG (DMEM F12/HG)dengan suplemen 0,1 ng/ml protein rekombinan TGF-β1 manusia (rhTGF-β1)selama periode 1, 2 dan 4 jam. Medium kultur kemudian diganti dengan DMEMF12/HG tanpa serum selama 24 jam. Tingkat ekspresi mRNA reseptor TGF-β tipe1 (TβR1), TGF-β1, faktor transkripsi pengikat oktamer 4 (OCT4), dan anggota A1keluarga aldehida dehidrogenase 1 (ALDH1A1) dianalisis menggunakan real timereverse transcriptase polymerase chain reactions (RT-qPCR). Kadar protein TGF-β1 dalam media kultur ditentukan dengan menggunakan enzyme-linkedimmunosorbent assay (ELISA). Sifat tumorigenik sel diuji dengan ujimammosphere forming unit (MFU assay).Hasil: Tingkat ekspresi mRNA dan protein TGF-β1 BCSC setelah perlakuantampak meningkat namun tidak pada TNBC. mRNA TβR1 BCSCs meningkat padaperiode perlakuan 1 dan 2 jam, sedangkan pada TNBC hanya pada periode 1 jam.Penanda kepuncaan ALDH1A1 dan OCT4 tampak meningkat pada BCSC namuntidak pada TNBC. Uji MFU menunjukkan sifat tumorigenik kedua kelompok selterutama pada periode perlakuan 2 jam tampak meningkat.Kesimpulan: Perlakuan TGF-β1 dalam konsentrasi rendah dan dalam waktusingkat memicu autoinduksi pada BCSCs yang menyebabkan peningkatan ekspresigen kepuncaan melalui pensinyalan autokrin. Sedangkan pada TNBC, peningkatanekspresi marker kepuncaan tidak terjadi. Namun demikian, sifat tumorigenik BCSCdan TNBC tetap meningkat.

---

Background: Breast Cancer Stem Cells (BCSC) is a population of breast cancer

cells that have stem cell characteristics. BCSCs maintain tumor stability by

initiating the formation of new cancer cell populations and providing resistance to

therapy. BCSCs can interact with the tumor microenvironment which releasing

various cytokines and growth factors, including TGF-β1. Through the

autoinduction mechanism, TGF-β1 can increase endogenous TGF-β1 production

and autocrine signaling. TGF-β1 autocrine signaling can increase the tumor

promoter role of TGF-β1 in cancer development by enhancing the stemness and

tumorigenic properties. This study aims to analyze the effect of Human TGF-β1

recombinant protein treatment to breast cancer stem cells (aldehyde dehydrogenase

positive, ALDH+) on the expression of stemness marker through TGF-β1 autocrine

signaling. Triple negative breast cancer (TNBC) was used as a comparison.

Methods: Human BCSCs (ALDH+) and TNBC (MDA-MB-231) were cultured in

Dulbecco's Modified Eagle Medium/Nutrient Mixture F12/HG (DMEM F12/HG)

with 0.1 ng / ml recombinant protein of human TGF-β1 supplementation (rhTGF-

β1) over 1, 2 and 4 hour periods. The culture medium was then replaced with

DMEM F12/HG serum-free for 24 hours. The expression levels of the TGF-β

receptor type 1 (TβR1), TGF-β1, octamer-binding transcription factor 4 (OCT4),

and members of the A1 family of aldehyde dehydrogenase 1 (ALDH1A1) mRNA

were analyzed using real time reverse transcriptase polymerase chain reactions

(RT-qPCR). TGF-β1 protein levels in conditioned medium were determined using

an enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). The tumorigenic properties of

cells were tested by the mammosphere forming unit (MFU) assay.

Results: The expression level of mRNA and TGF-β1 BCSC protein after treatment

appeared to be increased but not in TNBC. mRNA TβR1 BCSCs increased in the

treatment period of 1 and 2 hours, whereas in TNBC only in the 1 hour period. The

markers of ALDH1A1 and OCT4 expression appeared to be increased in BCSC but

not in TNBC. The MFU test showed that the tumorigenic properties of both cell

groups, especially in the 2 hour treatment period, appeared to be increasing.

Conclusion: Treatment of TGF-β1 in low concentrations and in a short time

triggered autoinduction of BCSCs and leads to the increased expression of stemness

genes marker via autocrine signaling. Whereas in TNBC, this increase in the

expression of the stemness markers did not occur. However, the tumorigenic nature

of BCSC and TNBC continues to increase."

"

Latar Belakang : Penyakit insufisiensi vena kronik (PIVK) memiliki prevalensi yang cukup tinggi di seluruh dunia, yaitu sekitar 60-70%. Penyebab paling sering pada penyakit insufisiensi vena kronik adalah kelainan primer dari dinding vena dan katupnya mengakibatkan inkompetensi pada katup vena, reflux dan obstruksi vena. Transforming growth factor-𝛽1 (TGF-𝛽1) adalah  sitokin dengan polipeptida kompleks yang secara signifikan ditemukan pada semua pasien penyakit insufisiensi vena kronik. Waktu refluks yang didapat dari pemeriksaan Ultrasonografi duplex (DUS) menunjukkan derajat keparahan dari insufisiensi katup vena. Akan tetapi, Hubungan kadar TGF-𝛽1 terhadap tingkat keparahan dari penyakit insufisiensi vena kronik belum diketahui.

Tujuan : untuk mengetahui perbedaan kadar TGF-𝛽1 terhadap tingkat keparahan dari penyakit insufisiensi vena kronik pada vena superfisial tungkai bawah.

Metode : Studi menggunakan desain potong lintang pada pasien dengan vena yang sehat dan pasien dengan penyakit insufisiensi vena kronik yang dilakukan oeprasi bedah pintas arteri koroner (BPAK) di Rumah Sakit Pusat Jantung dan Pembuluh Darah Harapan Kita pada April – Mei 2024. Tingkat keparahan penyakit insufisiensi vena kronik dinilai dengan waktu refluks dari pemeriksaan ultrasonografi duplex. TGF-𝛽1 didapat dari pemeriksaan ELISA pada jaringan vena. Luaran primer adalah perbedaan kadar TGF-𝛽1 berdasarkan tingkat keparahan penyakit insufisiensi vena kronik.

Hasil : Sebanyak total 56 subjek berhasil dilakukan analisis akhir. Mayoritas subjek dengan PIVK pada penelitian ini (67,7%) tergolong ke dalam PIVK derajat berat (waktu refluks >1000 ms). Tidak terdapat perbedaan nilai median yang signifikan antara derajat keparahan PIVK dengan kadar TGF-β1 (p>0.05). Namun dapat dilihat bahwa median kadar TGF-β1 lebih meningkat pada vena dengan PIVK ringan-sedang dan berat (14,27 pg/mg dan 14,04 pg/mg) jika dibandingkan dengan vena normal (10,97 pg/mg).

Kesimpulan : Tidak terdapat perbedaan signifikan antara kadar TGF-𝛽1 terhadap tingkat keparahan penyakit insufisiensi vena kronik pada vena superfisial tungkai bawah pada pasien yang dilakukan tindakan bedah pintas arteri koroner.

 

Kata kunci: Insufisiensi vena kronik, Transforming growth factor - Beta 1, Waktu refluks

 

---

Background: Chronic venous insufficiency (PIVK) has a fairly high prevalence throughout the world, around 60-70%. The most common cause of chronic venous insufficiency is primary abnormalities of the venous wall and valve resulting in valve incompetence, reflux, and venous obstruction. Transforming Growth Factor-β1 (TGF-β1) is a complex polypeptide cytokine that is significantly found in all patients with chronic venous insufficiency. Reflux time obtained from Duplex Ultrasonography (DUS) examination indicates the severity of valve insufficiency. However, the relationship between TGF-β1 levels and the severity of CVI has not yet been determined.

Objective: To determine the differences in TGF-β1 levels concerning the severity of chronic venous insufficiency in the superficial veins of the lower limbs.

Method: The study used a cross-sectional design in patients with healthy veins and patients with chronic venous insufficiency who undergoing coronary artery bypass surgery at the Harapan Kita National Cardiovascular Center from April to May 2024. The severity of chronic venous insufficiency was assessed by reflux time from duplex ultrasonography examination. TGF-β1 was obtained from ELISA examination of venous tissue. The primary outcome was the difference in TGF-β1 levels based on the severity of chronic venous insufficiency.            

Results: A total of 56 subjects underwent final analysis. The majority of subjects with CVI in this study (67.7%) were classified into severe CVI (reflux time >1000 ms). There were no significant differences in median values between the severity of CVI and TGF-β1 levels (p>0.05). However, it was observed that the median TGF-β1 levels increased in veins with mild-moderate and severe CVI (14.27 pg/mg and 14.04 pg/mg) compared to normal veins (10.97 pg/mg).

Conclusion: There is no significant differences in TGF-β1 levels concerning the severity of chronic venous insufficiency in the superficial veins of the lower limbs in patients undergoing coronary artery bypass graft surgery.

Keywords: Chronic venous insufficiency, Transforming Growth Factor-β1, Reflux time.

 

"