Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

Abstrak :
ABSTRACT
Kelas Ktedonobacteria dari filum Chloroflexi terdiri atas sejumlah besar taksa yang tidak dapat dikultur, klona-klona gen 16S rRNA yang berasal dari lingkungan, dan sejumlah kecil taksa yang dapat dikultur. Tulisan ini mengulas temuan terakhir mengenai taksonomi dan ekologi kelas Ktedonobacteria dari filum Chloroflexi berdasarkan karateristik yang ditemukan pada biakan Ktedonobacteria dan analisis molekuler. Sejauh ini, mikroorganisme yang telah dikarakterisasi mencakup empat spesies dari tiga marga, yaitu Ktedonobacter, Thermosporothrix, dan Thermogemmatispora. Ketiga marga tersebut diusulkan untuk mewakili tiga famili, yaitu Ktedonobacteraceae, Thermosporotricaceae, dan Thermogemmatisporaceae, dan dua bangsa, Ktedonobacterales dan Thermogemmatisporales. Strain-strain Ktedonobacteria memiliki ciri-ciri umum gram-positif, bersifat aerob, menghasilkan hifa vegetatif yang bercabang, dan membentuk spora dengan cara pertunasan.

---

Abstract
The clas Ktedonobacteria in the phylum Chloroflexi is known to contain a large number of uncultured, environmental 16S rRNA gene clones, and cultured representatives are alimited number. In this review, recent findings on the taxonomical and ecological significance of the class Ktedonobacteria in the phylum Chloroflexi are discussed based on the findings from both the characteristics of the cultured Ktedonobacteria and molecular-based analysis. The microorganisms characterized so far include four species in three genera, Ktedonobacter, Thermosporothrix and Thermogemmatispora , and were proposed to represent three families, Ktedonobacteraceae, Thermosporotricaceae, and Thermogemmatisporaceae, and two orders, Ktedonobacterales and Thermogemmatisporales. Ktedonobacteria strains showed a common property of gram-positive, aerobic organisms that produce branched vegetative mycelia and form spores by budding.

Abstrak :
ABSTRAK
Dalam rangka mengukur kandungan vitamin B1, B2 dan B9 secara simultan dalam tepung terigu yang difortifikasi telah dikembangkan metoda yang cepat, selektif, akurat menggunakan kromatografi cair tandem triple quadrupole spektrometri massa (LC-MS/MS). Analisis dilakukan menggunakan tehnik ionisasi elektrospray (ESI) positive mode dan detektor MS-MS menggunakan multi reaction monitoring (MRM) mode. Ion prekursor dan ion produk pada m/z 265 → 144 untuk vitamin B1, 377 → 243 untuk vitamin B2, dan 442 → 295 untuk vitamin B9 digunakan untuk identifikasi dan karakterisasi. Kinerja metoda yang dievaluasi adalah selektifitas, linearitas, rentang, akurasi, limit deteksi, limit kuantitasi. Hasil analisis statistik menunjukkan selektifitas yang baik, koefisien korelasi (r2) untuk vitamin B1, B2, B9 adalah 0.9986, 0.9999, 0.9988 dengan rentang konsentrasi 0,1 ? 200 ppb, limit deteksi (LOD) 3,10 (B1), 4,60 (B2), 7,0 (B9), μg/L, limit kuantitasi (LOQ) 10,0 (B1), 15,0 (B2), 23,0 (B9), μg/L dan akurasi 90,89 % (B1), 78,11 % (B2), 64,01 % (B9).

---

Abstract
In order to monitor the fortification level of vitamins B1, B2 dan B9 in wheat flours simoultansly, developed a selective, fast and accurate methods using the liquid Chromatography with tandem triple quadrupole mass spectrometry (LC-MS/MS) technique. The analysis was performed using electrospray ionization (ESI) tehnique with positive mode and the instrument was set in MRM (Multiple Reaction Monitoring) . Ion precursor and product was identified and characterized at m/z 265 → 144 for vitamin B1, 377 → 243 for vitamin B2, dan 442 → 295 for vitamin B9. The methods performance was evaluated in regard to selectivity, linearity, range, accuracy, limit of detection, limit of quantitation. The statistical analysis of the result showed good selectivity, correlation coefficient (r2) 0.9986, 0.9999, 0.9988 vitamins B1, B2, B9 respectively, with the concentration range 0,1 ? 200 μg/L, limit of detection (LOD) 3,10 (B1), 4,60 (B2), 7,0 (B9), μg/L, limit of quantitaion (LOQ) 10,0 (B1), 15,0 (B2), 23,0 (B9), μg/L and accuracy 90,89 % (B1), 78,11 % (B2), 64,01 % (B9).

Abstrak :
Latar belakang: Metode loop-mediated isothermal amplification (LAMP) merupakan metode sederhana yang dapat mengamplifikasi DNA/RNA menggunakan empat sampai dengan enam primer dalam bentuk ?pasangan? dari sekuens conserved gen. Penelitian ini bertujuan untuk mengoptimasi LAMP dalam menegakkan diagnosis kasus TB di Indonesia. Metode: Setelah uji optimasi, metode LAMP kemudian diujikan pada 122 DNA Mycobacterium tuberculosis (Mtb) sampel tersimpan, yang merupakan spesimen sputum pasien TB dengan BTA positif yang dikumpulkan dari 13 provinsi di Indonesia pada tahun 2008 untuk studi genotipe dan merupakan koleksi Pusat Biomedis dan Teknologi Dasar Kesehatan (PBTDK), Balitbangkes. Uji optimasi meliputi uji sensitifitas dan uji spesifisitas sejumlah pasangan primer LAMP terhadap larutan serial DNA Mtb H37Rv dan 12 spesies Mycobacteria. Uji LAMP dilakukan menggunakan tiga jenis instrumen yaitu LAMP turbidemeter, pelat pemanas dan penangas air. Hasil pengujian beberapa pasang primer dan instrument ini kemudian diterapkan untuk uji LAMP pada isolat spesimen klinik Indonesia, yaitu menggunakan pasangan primer dari gen gyrB, Hasil amplifikasi dideteksi dengan lampu UV. Hasil: Uji sensitivitas menunjukkan bahwa pasangan primer gen 16S rRNA dan gyrB memberikan hasil terbaik yaitu mampu mendeteksi 10.0 fg - 1.0 pg genomik DNA Mtb H37Rv. Uji spesifisitas menunjukkan bahwa pasangan primer gen gyrB merupakan pasangan primer paling spesifik. Hasil pengujian pasangan primer gyrB pada isolat klinis Indonesia didapatkan positivity rate 94,2% (114/121). Kesimpulan: Metode LAMP berpotensi untuk digunakan dalam diagnosis kasus TB di Indonesia.

---

Abstract
Background: Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) is a method already claimed as a simple technique to amplify DNA/ RNA using four to six primers as ?a set? from conserved sequence of target gene. In this study we optimize the use of LAMP for detection of Mycobacterium tuberculosis in clinical isolates from Indonesia. Methods: Procedures to perform LAMP were optimized, then the method was applied to 122 archieved samples of DNA?s Mtb from clinical TB patients with Acid Fast Bacilli (AFB) smears positive. The samples were obtained in 2008 from 13 provinces in Indonesia for genotyping study, which then become collections of Center for Biomedical and Basic Technology of Health (CBBTH), NIHRD Indonesia. The optimization tests include sensitivity and specificity tests of several sets primers, which were evaluated using 10-fold serially diluted DNA of Mtb H37Rv and 12 species of Mycobacteria. Three equipments consisted of LAMP turbidimeter, heating block and water bath were compared for its ability in DNA amplification. Detection of M. tuberculosis from clinical isolates used set primers specific for gyrB gene, amplicon was detected with UV fluorescence system. Results: The results showed that the highest sensitivity was obtained using the set primers specific for 16S rRNA and gyrB which could detect 10.0 fg to 1.0 pg genomic DNA of Mtb H37Rv. The set primers specific for gyrB gene was the most specific primers. Application of LAMP using gyrB set primers on Indonesian clinical isolates showed 94.2% (114/121) positivity rate. Conclusion: LAMP method is potentially used in TB diagnosis in Indonesia.

Abstrak :
Tujuan Uji biokimia untuk identifikasi Candida spp. memakan waktu dan menunjukkan hasil yang tidak dapat ditentukan. Metoda deteksi spesifik untuk antibodi, antigen dan metabolit Candida spp. memiliki sensitivitas dan spesifisitas yang rendah. Pada penelitian ini kami mengembangkan metoda diagnostik cepat, Uji Reaksi Rantai Polimerasa Multipleks (Multiplex-PCR) assay untuk identifikasi Candida spp. Metode Lima isolate Candida spp. dibiak, iidentifikasi menggunakan uji germ tub, dan kit API® 20 C AUX (BioMerieux®SA). Selanjutnya, DNA dipurifikasi dengan kit QIAamp DNA mini (Qiagen®) untuk uji Multiplex-PCR. Hasil Batas deteksi DNA dengan uji Multiplex-PCR assay dari C. albicans, C. tropicalis, C. arapsilosis, C. krusei dan C. glabrata berturut-turut adalah 4 pg, 0,98 pg, 0,98 pg, 0,5 pg and 16 pg Uji ini lebih sensitif daripada biakan karena multiplex-PCR dapat mendeteksi 2.6-2.9 x 100 CFU/ml, sementara biakan hanya 2.6-2.9 x 102 CFU/ml. Kesimpulan Multiplex PCR menunjukkan sensitivitas yang lebih tinggi dari biakan. Uji ini dapat direkomendasikan sebagai uji yang sensitive dan spesifik untuk identifikasi Candida spp.

---

Abstract
Aim Candida spp. infection commonly occur in immunocompromised patients. Biochemical assay for identification of Candida spp. is time-consuming and shows many undetermined results. Specific detection for antibody, antigen and metabolites of Candida spp. had low sensitivity and specifi city. In this study, we developed a rapid diagnostic method, Multiplex-PCR, to identify Candida spp. Methods Five Candida spp. isolates were cultured, identified with germ tube and API® 20 C AUX (BioMerieux® SA) kit. Furthermore, DNA was purifi ed by QIAamp DNA mini (Qiagen®) kit for Multiplex-PCR assay. Result DNA detection limit by Multiplex-PCR assays for C. albicans, C. tropicalis, C. parapsilosis, C. krusei and C. glabrata were 4 pg, 0,98 pg, 0,98 pg, 0,5 pg and 16 pg respectively. This assay was also more sensitive than culture in that Multiplex-PCR could detect 2.6-2.9 x 100 CFU/ml, whereas culture 2.6-2.9 x 102 CFU/ml Conclusion Multiplex-PCR is much more sensitive than culture and thus, can be recommended as a sensitive and specific assay for identifi cation of Candida spp.

Abstrak :
Glycyrrhizae Succus dan air yang terdapat di dalam Obat Batuk Hitam akan mempermudah tumbuhnya mila'oorganisme sehingga Obat Batuk Hitam tidak bisa tahan lama. Telah di: lakukan perielitian stabilitas mil'obio1ogik Obat Batuk Hi tam de=an pengawet NiDagin dan Asam Benzoat. Femeriksaan stabilitas milobiologik dilakukan de - ngan menghiturig jumlah miioo.anis1e total yang, terdaçat di dalam Obat Batuk 1-litam den-an mempergunakan perbenihan Agar tripton soya. Untuk pemeriksaan bakteri patogen Esche richia coli, Salmonella, Shigella..dan Staphylococcus aureus digunakan perbenihan perbenihan Agar Endo, Agar EMB, Agar Salmonella Shigella dan perbenihan gula-gula. Hasil yang diperoleh menunjukkan bahwa Obat Batul: - Hitam dent--an pengawet Nipagin 0,1% ; 0,15% dan 02% sesu - dali enam bulan masih memenuhi syarat. Demikian juga Obat - Batuk Hitam dengan pengawet Asam Benzoat 0,05% ; 0,1% dan 0,15% sesudah enambulan masih memenuhi syarat. ......The Glycyrrhizae Succus and water contained in Potio Nigra Contra Tussim will make the microorganism's growth easier, that cause Potio Nigra Contra Tussim unstable.There fore the study to determine microbiological stability of Po tio Nigra Contra Tussim with Ni pagin and Benzoic acid .• as reservatives have been done. The observation of microbiological stability carried out by counting the total microorganism contained in Potio Nigra Contra Tussim using Tryptic soya agar medium • To observe patogeni.cmicrooranism such as Escherichia coli, Salmonella, Shigella and Staphylococcus aureus, the media Endo agar, EMB agar, Salmonella Shigella agax and sugars media have been used. The result obtained showed Potio Nira Contra Tussim containing Nipagin 00% ; 0,15% and 0,2% after six month still qualified. The Potio Nigra Contra Tussim that contained Benzoic acid 0,05% ; 00% and 0,15% after six month also give the same result

Abstrak :
Summary: This new 13th edition features the same comprehensive, authoritative content - and adds new and updated material throughout. The team of authors includes three well-respected clinical microbiologists, all of whom have experience both in the classroom and the clinical laboratory. A NEW section on clinical laboratory management. More case studies help to develop critical thinking skills, with answers in an appendix. More photos of the major organisms have been included to help in identifying different organisms.