Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

Hasil Pencarian

Ditemukan 15 dokumen yang sesuai dengan query
cover
Silvia
Metode imputasi missing values chronological biclustering dengan basis korelasi pearson, skor mean squared residue, dan jarak euclidean (PCor-MSRE) pada data ekspresi gen = Pearson correlation, mean squared residue score, and euclidean distance (PCor-MSRE) based chronological biclustering missing values imputation method on gene expression data
" Teknologi microarray merupakan analisis terhadap tingkat ekspresi puluhan ribu gen secara paralel untuk melihat perbedaan ekspresi gen. Penelitian microarray menghasilkan suatu nilai yang dirangkum dalam sebuah data yang disebut sebagai data ekspresi gen. Data ekspresi gen umumnya memiliki ukuran yang besar dan penggunaannya luas. Akan tetapi, data ekspresi gen sering mengalami masalah missing values. Data ekspresi gen umumnya mengandung persentase missing values sebesar 10% atau bahkan hingga 90% gen memiliki satu hingga lebih missing values. ... "
Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2021
S-pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Luthfi Zahiya
Evaluasi Kualitas Grafis Tricluster pada Algoritma Order Preserving Tricluster (OPTricluster) dengan Menggunakan Multi Slope Measure (MSL) pada Data Gene-Sample-Time (GST) = Tricluster Graphical Quality Evaluation on the Order Preserving Tricluster (OPTricluster) Algorithm using Multi Slope Measure (MSL) on Gene-Sample-Time (GST) Data
"

Triclustering merupakan metode unsupervised learning yang bekerja pada data tiga dimensi dengan dimensi-dimensi berupa observasi, atribut, dan konteks. Tujuan dari triclustering adalah untuk membentuk himpunan submatriks yang disebut sebagai tricluster berdasarkan ketiga dimensi pada data yang diberikan. Data tiga dimensi banyak ditemukan dalam bidang biomedis, di mana hal tersebut turut mendorong penggunaan dan pengembangan triclustering untuk keperluan analisis data ekspresi gen di mana salah satu alternatif dimensi-dimensinya adalah gen, sampel, dan waktu (gene, sample, time) ... "

Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2024
S-pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Bertrand Jordan, editor
Microarrays in diagnostics and biomarker development: current and future applications
" This book provides a comprehensive overview of microarrays in diagnostics and biomarker development, covering DNA, peptide, protein and tissue arrays. The focus is on entities that are in actual clinical use, or quite close, and on recent developments, such as peptide and aptamer arrays. A further topic is the miniaturisation towards “nanoarrays”, which is expected to have great potential in clinical applications. Relevant issues of bioinformatics and statistical analysis of array data are discussed in ... "
Berlin: [Springer, ], 2012
e20417762
eBooks  Universitas Indonesia Library
cover
Soeganda Formalidin
Mencari korelasi bicluster pada data ekspresi gen penyakit diabetes melitus dengan menggunakan metode three-phase biclustering = Finding correlated bicluster from gene expression data of diabetes melitus using three-phase biclustering
" Penelitian ini bertujuan untuk mencari korelasi yang kuat antar gen dan kondisi dari data ekspresi gen penyakit Diabetes Melitus (DM) pada sampel obesitas dan sampel kurus dengan menggunakan metode three phase biclustering. Tahap pertama pada metode ini adalah dengan menggunakan matriks dekomposisi Singular Value Decomposition (SVD) yang mentransformasikan data menjadi dua matriks berbasis gen dan kondisi. Selanjutnya pada tahap kedua menggunakan metode partisi Partition Around Medoids (PAM) pada dua matriks gen dan kondisi menggunakan jarak ... "
Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2018
T49441
UI - Tesis Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Fahrezal Zubedi
Implementasi algoritma similarity based biclustering dengan menggunakan pam clustering pada data ekspresi gen microarray = Implementation of similarity based biclustering algorithm using pam clustering from microarray gene expression data
" Pada penelitian ini mengimplementasikan algoritma Similarity Based Biclustering dengan menggunakan PAM clustering pada tiga dataset ekspresi gen microarray. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui ekspresi regulasi dari masing-masing bicluster yang diperoleh dan mengetahui kinerja algoritma Similarity Based Biclustering-PAM clustering berdasarkan hasil analisis kelompok kondisi. Similarity based biclustering-PAM clustering secara teoritis terdiri dari empat tahap utama yaitu: mentransformasi data, membangun matriks similaritas, proses clustering khususnya dalam tesis ini menggunakan metode partisi PAM dan mengekstrak bicluster. Algoritma similarity ... "
Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2018
T49505
UI - Tesis Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Sofia Debi Puspa
Implementasi metode similarity based biclustering (SBB) pada microarray data ekspresi gen dengan menggunakan algoritma partisi k-means = Implementation of similarity based biclustering (SBB) on microarray gene expression data by using k means partition algorithm
" Penelitian ini bertujuan untuk mengimplementasikan similarity based biclustering SBB dalam memperoleh bicluster sekumpulan gen dengan ekspresi yang similar di bawah kondisi tertentu yang signifikan pada data microarray. Secara teoritis similarity based biclustering terdiri atas tiga tahap utama, yaitu: membangun matriks similaritas baris gen dan matriks similaritas kolom kondisi , mempartisi masing-masing matriks similaritas dengan hard clustering khususnya dalam penelitian ini menggunakan partisi k-means, dan ekstrak bicluster. Sebelum mengimplementasikan metode SBB, strategi seleksi gen diterapkan dan ... "
Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2018
T49530
UI - Tesis Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Nurul Hanifah
Pengujian kinerja Deep Stacking Network (DSN) pada diagnosis tipe kanker payudara menggunakan data microarray = Deep Stacking Network (DSN) performance analysis on breast cancer type diagnosis using microarray data
" Diagnosis kanker payudara umum menggunakan data morfologi dan infomasi klinis. Akan tetapi diagnosis kanker yang akurat dibutuhkan untuk menangani dan terapi yang tepat. Deteksi ekspresi gen merupakan cara yang dapat digunakan untuk menganalisis kanker hingga tingkat molekuler. Microarray adalah teknologi yang memungkinkan analisis ribuan ekspresi gen dalam waktu yang bersamaan. Pembelajaran mesin dapat digunakan untuk menganalisis pola pada microarray dataset. Model pembelajan dengan deep learning, seperti deep stacking network DSN diperlukan untuk data yang kompleks ... "
Depok: Fakultas Teknik Universitas Indonesia, 2018
T50170
UI - Tesis Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Syahputri Riani
Triclustering menggunakan Metode Hybrid Delta-TRIMAX Binary Particle Swarm Optimization dan Ontologi Gen pada Data Ekspresi Gen Tiga Dimensi Sel Kanker Pankreas PANC-1 = Triclustering with Hybrid Delta Trimax Binary Particle Swarm Optimization and Gene Ontology on Three-dimensional Gene Expression Data of Pancreatic Cancer Cells PANC-1
"

Salah satu teknik analisis yang dapat digunakan pada data mining dalam mengelompokkan data adalah Triclustering. Triclustering merupakan metode pengelompokan secara bersamaan pada data tiga dimensi yang terdiri dari observasi, atribut, dan konteks. Triclustering kerap digunakan pada bidang bioinformatika untuk mengelompokkan data ekspresi gen di titik waktu tertentu pada suatu kondisi eksperimen. Triclustering yang diajukan pada penelitian ini menggunakan metode Hybrid  – TRIMAX Binary Particle Swarm Optimization. Particle Swarm Optimization (PSO) adalah teknik pengelompokan yang terinspirasi ... "

Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2023
S-pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Noval Saputra
Implementasi triclustering menggunakan metode &-trimax pada data ekspresi gen microarray = Triclustering implementation using &-trimax methode on microarray gene expression dataset
"

Analisis triclustering merupakan teknik analisis pada data 3D (observasi – atribut – konteks). Analisis triclustering dapat mengelompokkan observasi pada beberapa atribut dan konteks secara bersamaan. Analisis triclustering telah sering diterapkan untuk menganalisis data ekspresi gen microarray. Penelitian ini menggunakan metode δ-Trimax untuk melakukan analisis triclustering pada data ekspresi gen microarray. Metode δ-Trimax bertujuan untuk menemukan tricluster yang memiliki mean square residual kecil dari δ dan volume maksimal. Tricluster diperoleh dengan cara melakukan penghapusan node dari ... "

Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2020
S-pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Selly Anastassia Amellia Kharis
Klasifikasi kanker paru-paru menggunakan support vector machine dengan pemilihan fitur berbasis support vector machine recursive feature elimination dan artificial bee colony = Classification of lung cancer using support vector machine and feature selection based on support vector machine recursive feature elimination and artificial bee colony
" Kanker merupakan kelompok penyakit yang ditandai dengan pertumbuhan dan penyebaran sel-sel abnormal yang tidak terkendali. Jika penyebaran sel tersebut tidak terkendali, hal ini dapat menyebabkan kematian. Berdasarkan American Cancer Society, pendeteksian dini terhadap sel kanker dapat meningkatkan angka harapan hidup seorang pasien lebih dari 97 . Banyak penelitian yang telah meneliti mengenai klasifikasi kanker menggunakan microarray data. Microarray data terdiri dari ribuan fitur gen namun hanya memiliki puluhan atau ratusan sampel. Hal tersebut dapat menurunkan ... "
Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2018
T49733
UI - Tesis Membership  Universitas Indonesia Library
<<   1 2   >>