Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

"ABSTRAKDisertasi ini ditulis untuk menguji apakah posisi etika dalam menghadapi riset yang menyangkut embryo manusia dalam riset stem cells yang diperoleh dengan cara menghancurkan embryo manusis dianggap sama dengan membunuh manusia. Terutama setelah para peneliti membuktikan di laboratorium bahwa manfaat yang akan dicapai adalah memberikan kesembuhan pada penyakit degeneratif yang tidak dapat disembuhkan oleh pengobatan kontermporer. Stem cells yang berasal dari embryo itu telah terbukti dapat mengganti seluruh sel utama yang rusak atau mati. Apakah etika akan berdiri di luar gelanggang dengan mengatakan bahwa penelitian itu bertentangan dengan etika dan karena itu harus dihentikan, ataukah etika akan tetap menjadi dasar moral bagi para peneliti yang jelas tidak menginginkan penelitiannya dihentikan.? Apakah embryo sudah mempunyai status persona? Perdebatan tentang status moral embryo inilah yang menjadi dasar dari ditentangnya penggunaan embryo manusia dalam riset. Teori-teori etika deontologi Immanuel Kant [1724 ? 1804] dan utilitarian Jeremy Bentham [1748 - 1832] maupun Etika Situasi Joseph Fletcher, dipakai sebagai dasar untuk menguji apakah riset itu bertentangan dengan etika atau tidak. Masalah embryo yang dianggap merupakan awal kehidupan manusia yang telah mengandung genetika manusia ini apakah patut dirusak demi untuk penyembuhan orang lain? Empat abad SM masalah embryo ini telah dibahas secara serius oleh Aristoteles [384 ? 322 SM]. Melalui teori epigenetiknya, ia membagi embryo menjadi embryo yang belum berbentuk dan yang sudah berbentuk. Dalam embryo yang belum berbentuk belum ada kehidupan. Hanya pada embryo yang sudah berbentuk terdapat kehidupan. Pada abad ke 17 ditemukan teori preformation yang menyatakan bahwa dalam sperma dan sel telur sudah ada bentuk manusia yang lengkap, sudah ada homunculus?manusia kecil. Debat berkepanjangan tentang hal ini tidak akan pernah berakhir. Hanya saja ada satu hal yang sering dilupakan tatakala membicarakan embryo yang digunakan dalam penelitian stem cells itu. Embryo yang digunakan adalah bukan embryo yang di dalam rahim tetapi embryo di luar rahim, yang ada di dalam cawan petri di laboratorium yang tidak mungkin akan berkembang menjadi manusia. Melihat praktek tentang riset hES cells ini di beberapa negara telah memberikan manfaat yang dapat dihasilkan bukan hanya dibidang kesehatan atau kedokteran terapeutik tetapi juga dibidang ekonomi bangsa maka saya melihat bahwa riset hES cells ini perlu dilanjutkan, dengan tetap didasari oleh etika sebagai norma moral yang memberikan rambu-rambu yang jelas yaitu manfaat yang akan dicapai harus didasari oleh keutamaan kemanusiaan yaitu emerging ethics.

---

ABSTRACT

This dissertation is written to assess the ethics of stem cells research involving human embryos, where the controversial destruction of human embryos required by current state of technology to create human embryonic stem cells is often viewed as killing innocent human creatures. The ethical evaluation of such viewpoint is important in light of laboratory results showing significant benefits of the science, on developing treatments for physical, degenerative and genetic diseases that are not curable using contemporary medicine. Stem cells that originate from embryos have been proven to be able to completely replace damaged or dead cells. Will ethics stand outside of the arena by stating that such research is unethical and must be discontinued, or will ethics stand as a moral basis for the researchers that are pursuing the science? Is a human embryo considered a person? Debates regarding the moral status of embryos have been the source of rejection in the use of human embryos for such scientific researches. Deontological ethics of Immanuel Kant [1724-1804] and Utilitarian of Jeremy Bentham [1748-1832] as well as Situational Ethics of Joseph Fletcher, have been used as bases when evaluating whether or not a research is unethical. Can human embryos, seen as the commencing platform of human life with complete genetic formation, be destroyed in order to provide cure for other humans? Aristoteles [384-322 BC] extensively discussed this issue through his epigenetics theory, where embryos are divided into two stages: unformed and formed; life begins only when they are formed. In the 17th century, the establishment of the preformation theory challenges this view by stating that homunculus (little human) already exists from within the human sperm and egg cells. Such debates will never end. However, often time debates surrounding this topic fail to underline the fact that the human embryos involved are not in utero (in the womb), but they reside in the petri dishes across the laboratories, without any possibility of forming into humans. Seeing that practices regarding hES cells research across various countries have shown to provide benefits not only on health, medical and therapeutic areas, but on economy as well, I believe that such researches need to continue to be pursued with ethics being the moral norm, providing them with concrete guides and benefits that are based on humanity, as emerging ethics."

"Triclustering merupakan salah satu teknik data mining yang bertujuan untuk mengelompokkan data berbentuk tiga dimensi secara simultan. Salah satu pendekatan yang digunakan dalam triclustering adalah pendekatan pattern-based, contohnya Timesvector. Metode timesvector dirancang khusus untuk pengelompokan data deret waktu tiga dimensi yang bertujuan menangkap pola ekspresi gen yang sama atau berbeda antara dua atau lebih kondisi eksperimen. Implementasi metode timesvector dilakukan pada data ekspresi gen human embryonic stem cell (H1-hESC) yang diberi protein morfogenetik tulang (BMP4) dan dikondisikan di dalam ruang dengan tingkat oksigen 4% dan 20, serta diamati pada 6 titik waktu berbeda selama 120 jam. Triclustering dilakukan dengan lima skenario menggunakan cluster sejumlah 257 dan threshold yang berbeda. Berdasarkan skenario tersebut, metode timesvector menghasilkan skenario terbaik pada skenario dengan threshold 1,5 yang menggunakan validasi berdasarkan nilai coverage. Berdasarkan hasil skenario terbaik, dihasilkan 9 pola DEP, 24 pola ODEP, dan 37 pola SEP dan dari pola tersebut dilakukan analisis Gene Ontology (GO) untuk mengukur kualitas tricluster dalam penggambaran konsep GO. Analisis GO menggunakan Database for Annotation, Visualization, and Integrated Discovery (DAVID) tools untuk menghitung nilai p-value. Pada analisis GO dipilih p-value terkecil pada pola DEP, ODEP, dan SEP sebagai tricluster terbaik, yaitu DEP pada tricluster ke 8, ODEP pada tricluster ke-1, dan SEP pada tricluster ke-26. Berdasarkan tricluster terbaik pada pola DEP dan ODEP dapat dikatakan bahwa kondisi oksigen tingkat fisiologis 4 % dan tingkat atmosfer 20 % memiliki perbedaan dalam mengidentifikasi gen kandidat pada H1-hESC yang mampu berdiferensiasi menjadi trofoblas, sedangkan SEP tidak memiliki perbedaan dalam mengidentifikasi gen kandidat pada H1-hESC dengan dua kondisi berbeda.

---

Triclustering is one of the data mining techniques that aims to cluster three-dimensional data simultaneously. One of the approaches used in triclustering is a pattern-based approach, such as Timesvector. The timesvector method is specifically designed for clustering three-dimensional time series data that aims to capture gene expression patterns that are the same or different between two or more experimental conditions. The implementation of the timesvector method was performed on human embryonic stem cell (H1-hESC) gene expression data treated with bone morphogenetic protein (BMP4) and conditioned in a chamber with 4% and 20 oxygen levels and observed at 6 different time points for 120 hours. Triclustering was performed with five scenarios using 257 clusters and different thresholds. Based on these scenarios, the timesvector method produces the best scenario in the scenario with a threshold of 1.5 which uses validation based on the coverage value. Based on the results of the best scenario, 9 DEP patterns, 24 ODEP patterns, and 37 SEP patterns were generated from these patterns. Gene Ontology (GO) analysis was carried out to measure the quality of the tricluster in describing the GO concept. GO analysis uses Database for Annotation, Visualization, and Integrated Discovery (DAVID) tools to calculate the p-value. In the GO analysis, the smallest p value in the DEP, ODEP, and SEP patterns was selected as the best tricluster, namely DEP in the 8th tricluster, ODEP in the 1st tricluster, and SEP in the 26th tricluster. Based on the best tricluster in the DEP and ODEP patterns, it can be said that the oxygen conditions of 4% physiological level and 20% atmospheric level have differences in identifying candidate genes in H1-hESC that are able to differentiate into trophoblasts, while SEP has no difference in identifying candidate genes in H1-hESC with two different conditions."