Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

Hasil Pencarian

Ditemukan 12 dokumen yang sesuai dengan query
cover
Siburian, Marlinang Diarta
Abstrak :
[ABSTRAK
Studi cross sectional pada pasien hepatitis B di Indonesia menunjukkan korelasi mutasi kodon start pre-S2 dengan keparahan penyakit hati. Peran protein-protein HBs pada aktivasi NF-ĸB sebagai salah satu faktor dalam induksi keparahan penyakit hati. Studi ini dilakukan untuk melihat efek varian mutan HBs virus hepatitis B subgenotipe B3 sebagai strain endemik di Indonesia pada keparahan penyakit hati dilihat dari ekspresi dan aktivasi NF-ĸB. Gen HBs dari tiga pasien yang membawa tiga varian HBs berbeda diamplifikasi dan diklon dengan plasmid pcDNA3.1, ditransfeksikan dengan metode lipofektamin ke dalam sel Huh7. Nilai ekspresi mRNA dianalisis dengan real-time PCR terhadap mRNA HBs, IĸB-α, dan NF-ĸB (p50). Ekspresi IĸB-α yang diregulasi oleh NF-ĸB digunakan sebagai parameter untuk aktivasi NF-ĸB. Diperoleh plasmid ekspresi HBs dengan mutasi kodon start pre-S2, delesi pre-S2 dan wild type VHB subgenotipe B3. Plasmid rekombinan pcDNA HBs dapat mengekspresikan mRNA HBs dan menurun pada 48 hingga 72 jam. Kecuali pada mutan delesi pre-S2 yang stabil hingga 72 jam. Ekspresi protein HBs berdasar ELISA menunjukkan nilai relatif konstan pada HBs wild type, sedangkan pada HBs mutan kodon start dan delesi meningkat pada 72 jam. Aktivasi NF-ĸB relatif lebih tinggi oleh tipe wild type dibanding mutan kodon start pre-S2 dan delesi pre-S2, sehingga variasi mutasi tidak memberikan pengaruh pada aktivasi NF-ĸB, meski varian mutan delesi pre-S2 menunjukkan peningkatan aktivasi NF-ĸB setelah waktu kultur yang lebih lama dibanding HBs wild type dan mutan kodon start pre-S2. Ekspresi NF-ĸB (p50) dipengaruhi oleh variasi mutasi, ekspresi p50 lebih tinggi pada mutan kodon start pre-S2 dibanding varian HBs lainnya. Keparahan penyakit hati oleh mutasi kodon start pre-S2 dapat terkait dengan peningkatan ekspresi p50.
ABSTRACT
Cross sectional study on hepatitis B patients in Indonesia showed association of pre-S2 start codon mutation with severity liver disease. Role of HBs proteins on the activation of NF-ĸB as one of the factor in liver disease progression. This study was to see the effects of different HBs mutant variants of Hepatitis B Virus (HBV) subgenotype B3 as the endemic strain in Indonesia on the expression and activation of NF-ĸB. HBs genes of three hepatitis B patients were amplified and cloned to pcDNA3.1, and were transfected using lipofectamine into Huh7 cell line. Expressions on mRNA level for HBs, IĸB-α and NF-ĸB (p50) were evaluated using real-time PCR. IĸB-α expression which is regulated by NF-ĸB was used as parameter to measure NF-ĸB activation. Recombinant plasmid for HBs expression with pre-S2 start codon mutation, pre-S2 deletion and wild type of HBV subgenotipe B3 were obtained. All three clones showed high level of mRNA expression which decreased after 48 to 72 hours, except for pre-S2 deletion which was relatively stabil up to72 hours. HBs protein expression detected using ELISA was constant for HBs wild type whilst increased at 72 hours for pre-S2 start codon mutation and pre-S2 deletion. NF-ĸB activation was higher for HBs wild type compared to the two mutant variants, suggesting no effect of mutation to increment of NF-ĸB activation, however pre-S2 deletion mutant showed higher NF-ĸB activation after longer period of incubation. NF-ĸB (p50) expression was higher for pre-S2 start codon mutation, suggesting liver disease progression by pre-S2 start codon mutation might associated to increased expression of p50.;Cross sectional study on hepatitis B patients in Indonesia showed association of pre-S2 start codon mutation with severity liver disease. Role of HBs proteins on the activation of NF-ĸB as one of the factor in liver disease progression. This study was to see the effects of different HBs mutant variants of Hepatitis B Virus (HBV) subgenotype B3 as the endemic strain in Indonesia on the expression and activation of NF-ĸB. HBs genes of three hepatitis B patients were amplified and cloned to pcDNA3.1, and were transfected using lipofectamine into Huh7 cell line. Expressions on mRNA level for HBs, IĸB-α and NF-ĸB (p50) were evaluated using real-time PCR. IĸB-α expression which is regulated by NF-ĸB was used as parameter to measure NF-ĸB activation. Recombinant plasmid for HBs expression with pre-S2 start codon mutation, pre-S2 deletion and wild type of HBV subgenotipe B3 were obtained. All three clones showed high level of mRNA expression which decreased after 48 to 72 hours, except for pre-S2 deletion which was relatively stabil up to72 hours. HBs protein expression detected using ELISA was constant for HBs wild type whilst increased at 72 hours for pre-S2 start codon mutation and pre-S2 deletion. NF-ĸB activation was higher for HBs wild type compared to the two mutant variants, suggesting no effect of mutation to increment of NF-ĸB activation, however pre-S2 deletion mutant showed higher NF-ĸB activation after longer period of incubation. NF-ĸB (p50) expression was higher for pre-S2 start codon mutation, suggesting liver disease progression by pre-S2 start codon mutation might associated to increased expression of p50.;Cross sectional study on hepatitis B patients in Indonesia showed association of pre-S2 start codon mutation with severity liver disease. Role of HBs proteins on the activation of NF-ĸB as one of the factor in liver disease progression. This study was to see the effects of different HBs mutant variants of Hepatitis B Virus (HBV) subgenotype B3 as the endemic strain in Indonesia on the expression and activation of NF-ĸB. HBs genes of three hepatitis B patients were amplified and cloned to pcDNA3.1, and were transfected using lipofectamine into Huh7 cell line. Expressions on mRNA level for HBs, IĸB-α and NF-ĸB (p50) were evaluated using real-time PCR. IĸB-α expression which is regulated by NF-ĸB was used as parameter to measure NF-ĸB activation. Recombinant plasmid for HBs expression with pre-S2 start codon mutation, pre-S2 deletion and wild type of HBV subgenotipe B3 were obtained. All three clones showed high level of mRNA expression which decreased after 48 to 72 hours, except for pre-S2 deletion which was relatively stabil up to72 hours. HBs protein expression detected using ELISA was constant for HBs wild type whilst increased at 72 hours for pre-S2 start codon mutation and pre-S2 deletion. NF-ĸB activation was higher for HBs wild type compared to the two mutant variants, suggesting no effect of mutation to increment of NF-ĸB activation, however pre-S2 deletion mutant showed higher NF-ĸB activation after longer period of incubation. NF-ĸB (p50) expression was higher for pre-S2 start codon mutation, suggesting liver disease progression by pre-S2 start codon mutation might associated to increased expression of p50., Cross sectional study on hepatitis B patients in Indonesia showed association of pre-S2 start codon mutation with severity liver disease. Role of HBs proteins on the activation of NF-ĸB as one of the factor in liver disease progression. This study was to see the effects of different HBs mutant variants of Hepatitis B Virus (HBV) subgenotype B3 as the endemic strain in Indonesia on the expression and activation of NF-ĸB. HBs genes of three hepatitis B patients were amplified and cloned to pcDNA3.1, and were transfected using lipofectamine into Huh7 cell line. Expressions on mRNA level for HBs, IĸB-α and NF-ĸB (p50) were evaluated using real-time PCR. IĸB-α expression which is regulated by NF-ĸB was used as parameter to measure NF-ĸB activation. Recombinant plasmid for HBs expression with pre-S2 start codon mutation, pre-S2 deletion and wild type of HBV subgenotipe B3 were obtained. All three clones showed high level of mRNA expression which decreased after 48 to 72 hours, except for pre-S2 deletion which was relatively stabil up to72 hours. HBs protein expression detected using ELISA was constant for HBs wild type whilst increased at 72 hours for pre-S2 start codon mutation and pre-S2 deletion. NF-ĸB activation was higher for HBs wild type compared to the two mutant variants, suggesting no effect of mutation to increment of NF-ĸB activation, however pre-S2 deletion mutant showed higher NF-ĸB activation after longer period of incubation. NF-ĸB (p50) expression was higher for pre-S2 start codon mutation, suggesting liver disease progression by pre-S2 start codon mutation might associated to increased expression of p50.]
2015
T-Pdf
UI - Tesis Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Turyadi
Abstrak :
Latar Belakang: Mutasi Al762T/GI764A basal core promoter (BCP) dan Gl896A precore pada genom virus hepatitis B (VHB) berhubungan dengan tingkat keparahan penyakit hati, namun demikian peran mutasi-mutasi tersebut pada perjalanan infeksi hepatitis B kronis masih belum jelas. Olch karena itu, penelitian ini bertujuan untuk mengetahui prevalensi mutasi Al762T/Gl764A dan Gl896A serta hubungannya dengan fase-fase pada perjalanan infeksi hepatitis B kronis. Metodologi: Seratus empat puluh pasien hepatitis B kronis yang dilibatkan dalam pcnelitian ini, belum mendapatkan pengobatan, dan dikelompokkan ke dalam fase immunotolerant (IT), immunoclearance (IC), non/Iow replicative (LR) dan hepatitis "c" negatif (ENH). DNA VHB diperiksa dan diul-cur kadarnya dengan teknik polymerase chain reaction, kemudian disekuensing untuk dianalisis. Hasil: Usia subjek lebih tua pada kelompok ENH dan LR dibandingkan dengan fase lain (p<0.05). Kadar DNA paling tinggi pada fase IC dan paling rendah pada fase LR (p<0.00l), sementara pria mempunyai risiko lebih besar terjadi reaktivasi dengan HBeAg negatif (p<0.05). Mutasi Al 762T/GI764A tidak berbeda bermakna pada semua fase (p=0.56) dan lebih tinggi pada genotipe C dan subtipe adr (p<0.05). Mutasi Gl896A paling tinggi pada Pass LR (p<0.05), dan tidak berbeda bcrmakna pada genotipe dan subtipe VHB. Tidak ada hubungan antara kadar DNA V1-IB dengan mutasi di prccore dan BCP. Kesimpulan: Prevalensi mutasi Gl896A berbeda pada fase hepatitis B kronis di Indonesia, ditemukan lebih sering pada usia lebih tua dan fase lanjut. Mutasi A1762T/Gl764A berkorelasi dengan genotipe dan subtipe VHB, sebaliknya tidak berhubungan dengan fase infeksi. Studi ini mengindikasikan bahwa mutasi BCP tidak berhubungan dcngan serokonversi HBeAg pada perjalanan infeksi hepatitis B kronis. ......Background: Precore Gl896A and basal core promoter (BCP) A1762T/G1764A mutations of hepatitis B virus (HBV) genome have been correlated with severe liver diseases; however, their role in the pathogenesis of chronic hepatitis B (CHB) remains unclear. We assessed the prevalence and association of these mutations in different phases of CHB in Indonesian patients. Methods: One-hundred and forty CHB patients, not undergoing antiviral therapy, were classified into immune-tolerance (IT), immune-clearance (IC), nonllow- replicative (LR), and hepatitis B e antigen (HBeAg)-negative hepatitis (ENH) phases. HBV DNA was detected and quantified by polymerase chain reaction then analyzed by sequencing. Results: ENH and LR patients were older than IC or IT patients (p <0.05). HBV DNA levels were highest in IC patients and lowest in LR (p<0.0001). The A1896 pre-core mutants were most prevalent in LR (p<0.00l) and higher in ENH (p<0.00I) than in IT and IC patients, while the Al762T/Gl764A BCP mutants were comparable between all phases. The Al762T/Gl764A BCP mutants were more frequently identified in genotype C than in genotype B (p <0.05), and in subtype adr than in subtypes adw and ayw (p <0.05). The Tl858 mutants were detected in almost all HBV isolates regardless the genotypes (B and C). N0 associations were observed between HBV DNA levels and precore as well as BCP mutations. Conclusions: The prevalence of precore A1896 mutation differed in phases of CHB in Indonesian patients with preponderance in older ages and later stages. BCP AI762T/Gl764A mutations were associated with HBV genotypes and subtypes, itrespective of infection phases. These findings indicate that BCP mutations could be independent of HBeAg seroconversion in the natural history of chronic HBV infection.
Jakarta: Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia, 2010
T32312
UI - Tesis Open  Universitas Indonesia Library
cover
Neni Nurainy
Abstrak :
ABSTRAK Virus Hepatitis B (VHB) adalah virus DNA yang berukuran 42 nm, yang termasuk ke dalam kelompok virus Hepadna (Hepadnaviridae). VHB menyebabkan infeksi hepatitis akut, kronis dan fulminan, serta sirosis sampai dengan kanker hati. VHB terbagi dalam empat serotipe (subtipe) hepatitis B surface antigen (HBsAg) utama, yaitu adw, adn ayw, ayn dan seiring dengan berkembangnya ilmu biologi molekul, delapan genotipe, A,B,C,D,E,F,G dan H. Sekitar 350 juta orang di 'dunia Saat ini terinfeksi hepatitis B dan hampir 75% diantaranya terdapat di Asia. Berdasarkan prevalensi HBsAg, menurut WHO, Indonesia termasuk dalam daerah endemik sedang sampai tinggi. Pengetahuan tentang genotipe VHB sangat penting. Dari segi klinik, telah banyak bukti yang menunjukkan adanya hubungan antara genotipe VHB dengan manifestasi klinik penyakit hati dan respon terhaclap terapi antivirus. Berdasarkan epidemiologi, diketahui bahwa penyebaran virus hepatitis B di dunia berbeda secara geograiis. Sebagai negara kepuiauan, Indonesia memiliki populasi sangat beragam Iebih dari 475 kelompok etnik. Keragaman populasi ini sangat terkait dengan Iatar belakang genetik manusia dan pola migrasi purba, dan diduga mempengaruhi epidemiologi molekul VHB yang tergambarkan dalam distribusi genotipe dan subtipe VHB di Indonesia. Sampai saat ini Iaporan tentang genotipe VHB di Indonesia masih sangat terbatas. Tujuan penelitian ini adalah untuk mencan bukti bahwa polimorfisme Sekuens Pre-S2 dapat digunakan untuk penentuan genotipe VHB dan subgenotipenya, mempelajari hubungan antara genotipe dan serotipe VHB, menentukan pola distribusi genotipe VHB di Indonesia dan kaitan genotipe VHB derlgan migrasi populasi manusia, Serta mengembangkan prinsip metode praktis penentuan genotipe berdasarkan polimorlisme di daerah Pre-S2. Peneiitian ini dilakukan pada 11 populasi Indonesia, terdiri dari 8 populasi sehat yaitu populasi Batak-Karo, Dayak Benuaq (mewakili Indonesia bagian barat); populasi Makassar, Mandar, Toraja dan Kajang (mewakili populasi Indonesia Timur - Sulawesi); populasi Alor dan Sumba (mewakili populasi Nusa Tenggara Timur), dan 3 kelompok pasien hepatitis B dari Sumatera, Jawa dan Cina Indonesia. Pendekatan metodologi yang digunakan bersifat eksploratif-cross sectional. 1. Bukti bahwa daerah Pre-S2 dapat digunakan dalam penentuan genotipe VHB: identifikasi subgenotipe yang terkait dengan populasi manusia. DNA VHB diisolasi dari serum HBsAg positif, dan fragmen DNA daerah Pre-S2 serta daerah pembanding Iainnya diamplifikasi dengan metoda PCR. Penentuan genotipe dilakukan dengan membandingkan hasil perunutan sekuens daerah Pre-S2 dengan sekuens daerah S, total genom, gen P, X, core dan Pre-S1. Penentuan genotipe VHB dengan menggunakan sekuens Pre-S2 sama baiknya dengan berdasarkan daerah S; semua sampel terdistribusi sama pada genotipe B dan C. Genotipe B adalah genotipe utama yang ditemukan (43/56 sampel; 76.B%), diikuti genotipe C dengan 13/56 sampel (23,2%). Variasi sekuens yang tinggi di daerah Pre-S2 memungkinkan pengenalan tiga subgenotipe VHB/B: Bc pada populasi Cina Indonesia, Bwi pada populasi Indonesia bagian barat dan Bei pada populasi Nusa Tenggara Timur. Variasi sekuens ini juga membagi VHB/C menjadi dua kelompok yaitu subgenotipe C1 dan C2. Dibuktikan bahwa subgenotipe Bc identik dengan subgenotipe B Asia non Japan (Ba) yang ditemukan pada populasi Cina di daratan Asia, menunjukkan bahwa genetik VHB dipertahankan pada populasi Cina Indonesia sampai Iebih dari tiga generasi Subgenotipe VHB/B yang ada di Indonesia membawa segmen kecil dari genotipe C di daerah precore dan core hasil proses rekombinasi, seperti halnya dengan genotipe Ba. Perbedaannya terletak pada tambahan titik rekombinasi dan Single Nucleotide Polimorphism (SNP) di daerah precore dan core tersebut. Adanya subgenotipe di atas diverifikasi dengan sekuens total genom VHB. Berbagai SNP di daerah Pre-S2 memberikan pola yang khas untuk masing-masing subgenotipe VHB sehingga dapat dijadikan situs diagnostik untuk penentuan genotipe dan subgenotipe. 2. Hubungan antara serotipe dan genotipe VHB: studi pada genotipe VHB di Asia Tenggara. Pada total 110 sampel VHB yang berasal dari beberapa kelompok populasi: Sumatra (n=12), Cina Indonesia (n=29), Jawa (n=23), Sulawesi (n=19), Alor (n=13) and Sumba (n=14), ditemukan serotipe adw, adr, ayw dan ayr. Pola distribusi serotipe yang ditemukan adalah adw dominan di Indonesia bagian barat seperti daerah Sumatra dan Jawa, ayw serotipe dominan di Nusa Tenggara Timur, dan serotipe campuran (adw, ayw dan add ditemukan di daerah Sulawesi Serotipe ayr merupakan serotipe yang paling jarang ditemukan. Uji statistik Chi-square, menunjukkan seoara bermakna hubungan antara serotipe HBsAg dan genotipelsubgenotipe VHB. Serotipe adw berkaitan dengan subgenotipe Bwi dan Bc, serotipe ayw1 dengan genotipe Bei, serotipe adr dan ayr dengan genotipe C, sedangkan serotipe ayw2 berkaitan dengan genotipe D. Terdapat anomali hubungan antara serotipe dan genotype pada beberapa sampel, yaitu serotipe adr dengan genotipe B (adr-B) dan serotipe adw dengan genotipe C (adw-C). Mekanisme molekul yang mendasarinya telah diselidiki, dan ternyata adalah: (a) isolat adr-B, adanya mixed infection VHB/B (adw) dan VHB/C (adr). Hasil kioning menunjukkan VHBIB (adw) Iebih banyak dari VHB/C (adr), akan tetapi ternyata secara serologi adr Iebih dominan dari adw, sesuai dengan sifat antigenesitas r yang tinggi dibanding w atau adanya mutasi di daerah determinan a pada posisi Iain yang mempengaruhi ekspresi vm (b) isoiat adw-C, adanya recunent mutation pada posisi asam amino ke 160 yang merubah determinan r menjadi w, dan adanya mutasi baru P127T dan C139W. Berdasarkan hasil penelitian ini, diusulkan bahwa data serotipe di Indonesia yang telah dipublikasi olen peneliti-peneliti sebelumnya dapat dikonversi menjadi data genotipe VHB dengan tingkat kesalahan ?I,8% untuk genotipe C yang berserotipe adw, dan 5,4% untuk genotipe B dengan serotipe adr. 3. Epidemiologi molekul VHB di Indonesia: genotipe sebagai marka migrasi populasi. Frekuensi HBsAg di Indonesia ben/ariasi diantara delapan kelompok etnik yang dipelajari, yaitu pada populasi Batak Karo (6,7%), Dayak Benuaq (13.2 %), Makassar (4,2 %), Mandar (5,5%), Toraja (4,2%), Kajang (72%), Alor (10,7%), dan Sumba (7,4%). Dari 138 sampel didapatkan bahwa genotipe B merupakan genotipe utama di Indonesia (73,9%), diikuti genotipe C (24.6%) dan kemudian genotipe D (1,5%). Penemuan ini sesuai dengan hasil konversi serotipe-genotipe yang dilakukan terhadap data serotipe Indonesia yang telan dipublikasikan oleh peneliti-peneliti sebelumnya. Data genotipe VHB 11 populasi Indonesia hasil penelitian ini dan genotipe VHB pada 27 kota hasil konversi serotipe-genotipe telah disusun menjadi petal distribusi genotipe VHB di Indonesia. Distribusi genotipe VHB menunjukkan adanya hubungan dengan pola migrasi purba populasi manusia ke kepulauan Nusantara. G-enotipe C tampaknya datang bersama migrasi manusia modern (Homo sapiens) pertama dari daratan Asia sekitar 40.000 - 60.000 tahun sebelum sekarang (years before presence;YBP). Kemudian gelombang migrasi besar manusia ke dua ke kepulauan Nusantara, tediri dari populasi berbahasa Austronesia (4,000 - 6.000 YBP), diusulkan membawa genotipe B. Sesuai dengan pola migrasi ini, genotipe B dominan di hampir semua wilayah Indonesia dengan populasi penutur bahasa-bahasa Austronesia, dan hanya menyisakan dominasi genotipe C di daerah Papua dan daerah berpopulasi Austromelanosid lain di sekitarnya. Disimpulkan bahwa genotipe B merupakan marka populasi Austronesia. 4. Pengembangan prinsip metoda praktis penentuan genotipe VHB berdasarkan polimorlisme di daerah Pre-S2. Dalam penelitian ini terbukti bahwa penentuan genotipe VHB berdasarkan daerah Pre-S2 dapat dilakukan dan paling sedikit sama baiknya dengan cara berdasarkan daerah S yang sekarang umum dipakai. Metoda penentuan genotipe berdasar daerah Pre-S2 dengan direct sequencing ideal untuk penelitian, tetapi pada saat ini tidak praktis untuk pemeriksaan Iaboratorium kIinik. Pengembangan metoda PCR-RFLP berdasarkan polimorfisme di daerah Pre-S2 akan memungkinkan penentuan genotipe dan subgenotipe secara Iebih praktis. Untuk itu, telah dilakukan analisis 110 sekuens Pre-S2 VHB hasil penelitian ini dan 84 sekuens dari GenBank, untuk menentukan situs pemotongan enzim restriksi endonuldease yang tepat rancang PCR-RFLP. Hasil penelitian menunjukkan bahwa Genotipe C dan D dapat dibedakan dari genotipe B dengan menggunakan enzim Aval, genotipe C dan D dibedakan dengan enzim Bmrl, dan genotipe B dan C-adw dengan enzim Banll. Subgenotipe Bc dibedakan dari Bwi dan Bei dengan enzim Apal. Pembedaan subgenotipe Bwi dan Bei dilakukan dengan menggunakan primer dengan modifikasi satu nukleotida untuk membuat situs enzim restriksi Btsl. Metoda praktis PCR-RFLP untuk membedakan genotipe dan subgenotipe khas Indonesia dapat dikembangkan.
2005
D617
UI - Disertasi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Neni Nurainy
Abstrak :
ABSTRAK Virus Hepatitis B (VHB) adalah virus DNA yang berukuran 42 nm, yang termasuk ke dalam kelompok virus Hepadna (Hepadnaviridae). VHB menyebabkan infeksi hepatitis akut, kronis dan fulminan, serta sirosis sampai dengan kanker hati. VHB terbagi dalam empat serotipe (subtipe) hepatitis B surface antigen (HBsAg) utama, yaitu adw, adn ayw, ayn dan seiring dengan berkembangnya ilmu biologi molekul, delapan genotipe, A,B,C,D,E,F,G dan H. Sekitar 350 juta orang di 'dunia Saat ini terinfeksi hepatitis B dan hampir 75% diantaranya terdapat di Asia. Berdasarkan prevalensi HBsAg, menurut WHO, Indonesia termasuk dalam daerah endemik sedang sampai tinggi. Pengetahuan tentang genotipe VHB sangat penting. Dari segi klinik, telah banyak bukti yang menunjukkan adanya hubungan antara genotipe VHB dengan manifestasi klinik penyakit hati dan respon terhaclap terapi antivirus. Berdasarkan epidemiologi, diketahui bahwa penyebaran virus hepatitis B di dunia berbeda secara geograiis. Sebagai negara kepuiauan, Indonesia memiliki populasi sangat beragam Iebih dari 475 kelompok etnik. Keragaman populasi ini sangat terkait dengan Iatar belakang genetik manusia dan pola migrasi purba, dan diduga mempengaruhi epidemiologi molekul VHB yang tergambarkan dalam distribusi genotipe dan subtipe VHB di Indonesia. Sampai saat ini Iaporan tentang genotipe VHB di Indonesia masih sangat terbatas. Tujuan penelitian ini adalah untuk mencan bukti bahwa polimorfisme Sekuens Pre-S2 dapat digunakan untuk penentuan genotipe VHB dan subgenotipenya, mempelajari hubungan antara genotipe dan serotipe VHB, menentukan pola distribusi genotipe VHB di Indonesia dan kaitan genotipe VHB derlgan migrasi populasi manusia, Serta mengembangkan prinsip metode praktis penentuan genotipe berdasarkan polimorlisme di daerah Pre-S2. Peneiitian ini dilakukan pada 11 populasi Indonesia, terdiri dari 8 populasi sehat yaitu populasi Batak-Karo, Dayak Benuaq (mewakili Indonesia bagian barat); populasi Makassar, Mandar, Toraja dan Kajang (mewakili populasi Indonesia Timur - Sulawesi); populasi Alor dan Sumba (mewakili populasi Nusa Tenggara Timur), dan 3 kelompok pasien hepatitis B dari Sumatera, Jawa dan Cina Indonesia. Pendekatan metodologi yang digunakan bersifat eksploratif-cross sectional. 1. Bukti bahwa daerah Pre-S2 dapat digunakan dalam penentuan genotipe VHB: identifikasi subgenotipe yang terkait dengan populasi manusia. DNA VHB diisolasi dari serum HBsAg positif, dan fragmen DNA daerah Pre-S2 serta daerah pembanding Iainnya diamplifikasi dengan metoda PCR. Penentuan genotipe dilakukan dengan membandingkan hasil perunutan sekuens daerah Pre-S2 dengan sekuens daerah S, total genom, gen P, X, core dan Pre-S1. Penentuan genotipe VHB dengan menggunakan sekuens Pre-S2 sama baiknya dengan berdasarkan daerah S; semua sampel terdistribusi sama pada genotipe B dan C. Genotipe B adalah genotipe utama yang ditemukan (43/56 sampel; 76.B%), diikuti genotipe C dengan 13/56 sampel (23,2%). Variasi sekuens yang tinggi di daerah Pre-S2 memungkinkan pengenalan tiga subgenotipe VHB/B: Bc pada populasi Cina Indonesia, Bwi pada populasi Indonesia bagian barat dan Bei pada populasi Nusa Tenggara Timur. Variasi sekuens ini juga membagi VHB/C menjadi dua kelompok yaitu subgenotipe C1 dan C2. Dibuktikan bahwa subgenotipe Bc identik dengan subgenotipe B Asia non Japan (Ba) yang ditemukan pada populasi Cina di daratan Asia, menunjukkan bahwa genetik VHB dipertahankan pada populasi Cina Indonesia sampai Iebih dari tiga generasi Subgenotipe VHB/B yang ada di Indonesia membawa segmen kecil dari genotipe C di daerah precore dan core hasil proses rekombinasi, seperti halnya dengan genotipe Ba. Perbedaannya terletak pada tambahan titik rekombinasi dan Single Nucleotide Polimorphism (SNP) di daerah precore dan core tersebut. Adanya subgenotipe di atas diverifikasi dengan sekuens total genom VHB. Berbagai SNP di daerah Pre-S2 memberikan pola yang khas untuk masing-masing subgenotipe VHB sehingga dapat dijadikan situs diagnostik untuk penentuan genotipe dan subgenotipe. 2. Hubungan antara serotipe dan genotipe VHB: studi pada genotipe VHB di Asia Tenggara. Pada total 110 sampel VHB yang berasal dari beberapa kelompok populasi: Sumatra (n=12), Cina Indonesia (n=29), Jawa (n=23), Sulawesi (n=19), Alor (n=13) and Sumba (n=14), ditemukan serotipe adw, adr, ayw dan ayr. Pola distribusi serotipe yang ditemukan adalah adw dominan di Indonesia bagian barat seperti daerah Sumatra dan Jawa, ayw serotipe dominan di Nusa Tenggara Timur, dan serotipe campuran (adw, ayw dan add ditemukan di daerah Sulawesi Serotipe ayr merupakan serotipe yang paling jarang ditemukan. Uji statistik Chi-square, menunjukkan seoara bermakna hubungan antara serotipe HBsAg dan genotipelsubgenotipe VHB. Serotipe adw berkaitan dengan subgenotipe Bwi dan Bc, serotipe ayw1 dengan genotipe Bei, serotipe adr dan ayr dengan genotipe C, sedangkan serotipe ayw2 berkaitan dengan genotipe D. Terdapat anomali hubungan antara serotipe dan genotype pada beberapa sampel, yaitu serotipe adr dengan genotipe B (adr-B) dan serotipe adw dengan genotipe C (adw-C). Mekanisme molekul yang mendasarinya telah diselidiki, dan ternyata adalah: (a) isolat adr-B, adanya mixed infection VHB/B (adw) dan VHB/C (adr). Hasil kioning menunjukkan VHBIB (adw) Iebih banyak dari VHB/C (adr), akan tetapi ternyata secara serologi adr Iebih dominan dari adw, sesuai dengan sifat antigenesitas r yang tinggi dibanding w atau adanya mutasi di daerah determinan a pada posisi Iain yang mempengaruhi ekspresi vm (b) isoiat adw-C, adanya recunent mutation pada posisi asam amino ke 160 yang merubah determinan r menjadi w, dan adanya mutasi baru P127T dan C139W. Berdasarkan hasil penelitian ini, diusulkan bahwa data serotipe di Indonesia yang telah dipublikasi olen peneliti-peneliti sebelumnya dapat dikonversi menjadi data genotipe VHB dengan tingkat kesalahan ?I,8% untuk genotipe C yang berserotipe adw, dan 5,4% untuk genotipe B dengan serotipe adr. 3. Epidemiologi molekul VHB di Indonesia: genotipe sebagai marka migrasi populasi. Frekuensi HBsAg di Indonesia ben/ariasi diantara delapan kelompok etnik yang dipelajari, yaitu pada populasi Batak Karo (6,7%), Dayak Benuaq (13.2 %), Makassar (4,2 %), Mandar (5,5%), Toraja (4,2%), Kajang (72%), Alor (10,7%), dan Sumba (7,4%). Dari 138 sampel didapatkan bahwa genotipe B merupakan genotipe utama di Indonesia (73,9%), diikuti genotipe C (24.6%) dan kemudian genotipe D (1,5%). Penemuan ini sesuai dengan hasil konversi serotipe-genotipe yang dilakukan terhadap data serotipe Indonesia yang telan dipublikasikan oleh peneliti-peneliti sebelumnya. Data genotipe VHB 11 populasi Indonesia hasil penelitian ini dan genotipe VHB pada 27 kota hasil konversi serotipe-genotipe telah disusun menjadi petal distribusi genotipe VHB di Indonesia. Distribusi genotipe VHB menunjukkan adanya hubungan dengan pola migrasi purba populasi manusia ke kepulauan Nusantara. G-enotipe C tampaknya datang bersama migrasi manusia modern (Homo sapiens) pertama dari daratan Asia sekitar 40.000 - 60.000 tahun sebelum sekarang (years before presence;YBP). Kemudian gelombang migrasi besar manusia ke dua ke kepulauan Nusantara, tediri dari populasi berbahasa Austronesia (4,000 - 6.000 YBP), diusulkan membawa genotipe B. Sesuai dengan pola migrasi ini, genotipe B dominan di hampir semua wilayah Indonesia dengan populasi penutur bahasa-bahasa Austronesia, dan hanya menyisakan dominasi genotipe C di daerah Papua dan daerah berpopulasi Austromelanosid lain di sekitarnya. Disimpulkan bahwa genotipe B merupakan marka populasi Austronesia. 4. Pengembangan prinsip metoda praktis penentuan genotipe VHB berdasarkan polimorlisme di daerah Pre-S2. Dalam penelitian ini terbukti bahwa penentuan genotipe VHB berdasarkan daerah Pre-S2 dapat dilakukan dan paling sedikit sama baiknya dengan cara berdasarkan daerah S yang sekarang umum dipakai. Metoda penentuan genotipe berdasar daerah Pre-S2 dengan direct sequencing ideal untuk penelitian, tetapi pada saat ini tidak praktis untuk pemeriksaan Iaboratorium kIinik. Pengembangan metoda PCR-RFLP berdasarkan polimorfisme di daerah Pre-S2 akan memungkinkan penentuan genotipe dan subgenotipe secara Iebih praktis. Untuk itu, telah dilakukan analisis 110 sekuens Pre-S2 VHB hasil penelitian ini dan 84 sekuens dari GenBank, untuk menentukan situs pemotongan enzim restriksi endonuldease yang tepat rancang PCR-RFLP. Hasil penelitian menunjukkan bahwa Genotipe C dan D dapat dibedakan dari genotipe B dengan menggunakan enzim Aval, genotipe C dan D dibedakan dengan enzim Bmrl, dan genotipe B dan C-adw dengan enzim Banll. Subgenotipe Bc dibedakan dari Bwi dan Bei dengan enzim Apal. Pembedaan subgenotipe Bwi dan Bei dilakukan dengan menggunakan primer dengan modifikasi satu nukleotida untuk membuat situs enzim restriksi Btsl. Metoda praktis PCR-RFLP untuk membedakan genotipe dan subgenotipe khas Indonesia dapat dikembangkan.
2005
D755
UI - Disertasi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Ulfa Ivonie
Abstrak :
ABSTRAK
Hepatitis B adalah suatu penyakit yang disebabkan oleh virus hepatitis B. Salah satu faktor yang berpengaruh dalam pembentukan virus hepatitis B adalah core protein Cp . Sehingga Cp dapat digunakan sebagai salah satu target pengobatan hepatitis B. Pada penelitian ini dilakukan penapisan virtual senyawa dari basis data tanaman herbal Indonesia sebagai core protein allosteric modulator CpAM menggunakan peranti lunak AutoDock dan AutoDock Vina. Metode divalidasi dengan menggunakan parameter Enrichment Factor EF , Receiver Operating Characteristics ROC , dan Area Under Curve AUC . Pada penapisan menggunakan AutoDock digunakan grid box ukuran 55x55x55 dengan nilai EF10 0.7652 dan AUC 0.6709 sementara grid box ukuran 20.625x20.625x20.625 untuk penapisan menggunakan AutoDock Vina dengan nilai EF5 0.5075 dan AUC 0.7832. Sepuluh senyawa terbaik hasil penapisan virtual menggunakan AutoDock memiliki rentang DG: -11.74 -10.31 kkal/mol adalah yuehchukene, lansionic acid, stigmast-4-en-3-one, myrtillin, sanggenol O, lanosterol, erycristagallin, alpha-spinasterol, cyanidin 3-arabinoside, dan cathasterone. Sepuluh senyawa terbaik hasil penapisan virtual menggunakan AutoDock Vina memiliki rentang DG: -12.1 -10.7 kkal/mol adalah sanggenol O, cucumerin A, yuehchukene, palmarumycin CP1, dehydrocycloguanandin, myrtilin, liriodenine, myricetin 3-alpha-L-Arabinopyranoside, myricetin 3-galactoside, dan cassameridine.
ABSTRACT
Hepatitis B is a disease caused by hepatitis B virus. One of the main factor in virus assembly is core protein Cp . Therefore Cp is suitable to use as one of therapeutic target for hepatitis B. In this study virtual screening of Indonesia herbal database as CpAM of hepatitis B virus was performed using AutoDock and AutoDock Vina software. The methode was validated by Enrichment Factor EF , Receiver Operating Characteristics ROC , and Area Under Curve AUC parameters. The grid box size used in virtual screening with AutoDock is 55x55x55 with EF10 0.7652 and AUC 0.6709 meanwhile grid box size that will be use in virtual screening using AutoDock Vina is 20.625x20.625x20.625 with EF5 0.5075 and AUC 0.7832. The best top ten compounds from virtual screening with AutoDock has DG levels 11.74 10.31 kkal mol theare yuehchukene, lansionic acid, stigmast 4 en 3 one, myrtillin, sanggenol O, lanosterol, erycristagallin, alpha spinasterol, cyanidin 3 arabinoside, dan cathasterone. The best top ten compounds from virtual screening with AutoDock Vina has DG levels 12.1 10.7 kkal mol adalah sanggenol O, cucumerin A, yuehchukene, palmarumycin CP1, dehydrocycloguanandin, myrtilin, liriodenine, myricetin 3 alpha L Arabinopyranoside, myricetin 3 galactoside, dan cassameridine
2018
S-Pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Wulan Wasiatiningsih
Abstrak :
ABSTRAK Virus hepatitis B merupakan jenis hepatitis yang paling banyak terjadi di Indonesia. Ibu hamil menjadi salah satu populasi yang berisiko mengalami VHB. Penularan VHB dapat terjadi ke janin atau bayi selama fase perinatal (saat hamil dan sesaat atau setelah persalinan), yang mengakibatkan terjadinya hepatitis akut dan kemungkinan menjadi VHB kronis carrier. Pada bayi yang lahir dari ibu yang memiliki HBsAg reaktif tanpa intervensi, memiliki risiko terinfeksi VHB secara perinatal sebesar 90%. Pemberian terapi imunoprofilaksis menjadi salah satu intervensi kontrol infeksi yang dapat dilakukan untuk mencegah terjadinya penularan MTCT VHB dari ibu ke janin atau bayi baru lahir. Pemberian ASI eksklusif pada juga berperan penting dengan melihat kandungan dari ASI itu sendiri, yang mengandung antibodi, faktor kekebalan, enzim, dan sel darah putih yang berperan dalam melindungi bayi dari berbagai penyakit dan infeksi. Karya tulis ilmiah ini bertujuan untuk menganalisis intervensi keperawatan kontrol infeksi dan konseling laktasi untuk mencegah penularan infeksi MTCT VHB dalam kehamilan hepatitis B. Hasil evaluasi intervensi keperawatan yang telah dilakukan Ny. N didapatkan hasil bahwa masalah keperawatan risiko infeksi pada janin atau bayi baru lahir dapat teratasi dengan melakukan kontrol infeksi dan konseling laktasi dari fase antenatal, intranatal, sampai postnatal. Oleh karena hal tersebut, karya tulis ilmiah ini merekomendasikan perlu dilakukannya kelas edukasi prenatal pada ibu dengan kehamilan hepatitis B.
ABSTRACT The hepatitis B virus is the most common type of hepatitis in Indonesia. Pregnant women are one of the populations at risk of developing HBV. HBV transmission can occur to the fetus or baby during the perinatal phase (during pregnancy and momentarily or after labor), which results in the occurrence of acute hepatitis and the possibility of becoming a chronic HBV carrier. Infants born from mothers who have HBsAg reactive without intervention have a perinatal risk of HBV infection by 90%. Giving immunoprophylaxis therapy is one of the infection control interventions that can be done to prevent the transmission of MTCT VHB from mother to fetus or newborn. The provision of exclusive breastfeeding also plays an important role by looking at the content of breast milk itself, which contains antibodies, immune factors, enzymes, and white blood cells that play a role in protecting babies from various diseases and infections. This scientific paper aims to analyze nursing control, infection control, intervention nursing and lactation counseling to prevent transmission of MTCT HBV infection in hepatitis B pregnancy. The results of evaluation of nursing interventions that have been done by Mrs. N found that nursing risk of infection risk in the fetus or newborn can be overcome by controlling infection and lactation counseling from the antenatal, intranatal, to postnatal phases. Because of this, the scientific paper recommends prenatal education classes for mothers with hepatitis B pregnancy.
Depok: Fakultas Ilmu Keperawatan, 2019
TA-Pdf
UI - Tugas Akhir  Universitas Indonesia Library
cover
Ulfah Suryani
Abstrak :
[ABSTRAK
Latar belakang. Hepatitis B merupakan salah satu masalah kesehatan yang serius, diperkirakan lebih dari 2 milyar orang didunia telah terinfeksi virus hepatitis B (VHB). Dari jumlah ini kira-kira 360 juta orang mengalami infeksi khronis. Kematian terutama disebabkan karena sirosis hepatis dan karsinoma hepatoseluler. Salah satu upaya pencegahan penularan infeksi VHB adalah uji saring darah donor terhadap hepatitis B surface antigen (HBsAg) yang merupakan pemeriksaan skrinning yang dilakukan oleh Unit Transfusi Darah (UTD) di negara berkembang seperti Indonesia. Banyak peneliti membuktikan bahwa darah HBsAg negatif masih berpotensi menularkan infeksi VHB. Untuk itu meningkatkan keamanan darah, beberapa negara menambahkan parameter pemeriksaan antibodi terhadap hepatits B core (anti-HBc) sebagai petanda paparan terhadap infeksi VHB dan pemeriksaan antibodi terhadap hepatitis B surface (anti-HBs) sebagai tanda respon imun terhadap infeksi VHB. Dengan berkembangnya teknologi biologi molekuler, masa jendela infeksi VHB dengan seronegatif dapat di ketahui lebih cepat melalui deteksi DNA VHB dengan metode Nucleic Acid Test (NAT) multipleks yang dilanjutkan dengan NAT discriminatory. Beberapa penelitian terdahulu menunjukkan, didapatnya DNA VHB pada spesimen darah donor yang seronegatif dengan metoda NAT. Darah dengan HBsAg negatif, DNA VHB positif dengan atau tanpa anti-HBc dan atau anti-HBs merupakan darah asal donor dengan Hepatitis B Occult (HBO). Prevalensi donor dengan HBO di Indonesia berkisar antara 8- 10%. Metodologi. Penelitian ini menggunakan desain potong lintang (cross sectional) yang dilakukan di UTDP dan Lembaga Biologi Molekul Eijkman, dengan jumlah sampel 4.973 asal subyek donor darah dari 4 UTD daerah DKI, Kota Tanggerang,kota Depok dan Kabupaten Tanggerang. Terhadap sampel penelitian dilakukan pemeriksaan serologis HBsAg,anti-HBc,anti-HBs, NAT, dan PCR kuantitatif dan kualitatif, selanjutnya pada sampel yang HBsAg negatif, NAT positif dan didapatkan hasil PCR kuantitatif positif dilakukan pemeriksaan lanjutan sequencing asam amino untuk mengetahui ada tidaknya mutan HBsAg penyebab lolosnya deteksi serologi HBsAg oleh reagensia HBsAg yang digunakan untuk uji saring darah donor. Hasil. Didapatkan hanya 20 subjek (0,40%) mempunyai hasil HBsAg negatif dan NAT positif multipleks, dan hanya 16 subyek (80%) HBsAg negatif dan NAT discrimenatory positif. Lebih lanjut hasil pemeriksaan anti-HBc negatif dan anti- HBs positif/negatif didapatkan hanya1 subyek (6,25%), anti-HBc positif dan anti- Hbs negatif didapatkan 9 subyek (56,25%), hasil pemerksaan anti-Hbc dan anti- HBs positif 5 subyek (31,25%). Lebih lanjut dilakukan pemeriksaan PCR kualitatif dan didapatkan 3 subyek (18,75%) tidak terdeteksi, , 6 (37,5%) subyek menunjukkan hasil viral load yang low detection (dibawah sensitivitas alat), dan 7 subyek (43,75%) menunjukkan hasil viral load dapat di ketahui. Pada pemeriksaan PCR kualitatif dan sequencing didapatkan 2 subyek (28,57%) ditemukan mutasi pada gen S pada posisi 143 dimana terjadi subsitusi asam amino T143M.
ABSTRACT
Background. Hepatitis B is one of the most serious health problem. It is estimated that more than 2 bilion people have been infected by this virus, of which 360 milion are chronically infected with severe and fatal risk especially of cirrosis and hepatocellular carcinoma. One of the main ways to prevent transfusion transmitted HBV infection is blood screening for HBsAg. However, many studies have proven that HBsAg negative blood can still be infection. Therefore to enhance blood safety same countries have added antibody parameters in blood screening of donors – antibody for hepatitis B core antigen (anti-HBc) as marker for HBV infection and antibody for hepatitis B surface antigen (anti-HBs) as marker for immunological response to HBV infection. And with the development of molecular biology technology, HBV infection can be knowing faster in seronegative windows period with HBV DNA examination inspection by methods Nucleic Acid Test (NAT) multiplex and discrimenatory. In fact the results of seronegative blood is still there HBV virus with NAT, and this result we can called with the Occult hepatitis B (HBO). Prevalence of donors with HBO ranges 8- 10% in Indonesia. This study aims to determine the efectivity analized by NAT method blood donor with HBO to see continuity with the examination of anti-HBc, anti-HBs, viral load, and the cause of the HBO that mutations in the gene encoding HBsAg. Methodology. This study used a cross-sectional design (cross-sectional) conducted in UTDP and Eijkman Institute for Molecular Biology, with a sample of 4,973 sampless blood bloods donor from 4 units of blood transfusion area of Jakarta, Tangerang City, Depok and Bekasi district. Against sample serological examination HBsAg, anti-HBc, anti-HBs, NAT, quantitative and qualitative PCR, then samples were HBsAg negative, positive NAT and quantitative PCR positive results obtained further investigation amino acid sequencing to determine whether there is a mutant HBsAg cause serological detection of HBsAg escape by HBsAg reagents used for screening of blood donors Result. There was 20 samples (0.40%) had results of HBsAg negative and positive NAT multiplex, and only 16 samples (80%) HBsAg negative and positive discrimenatory NAT. Furthermore, the results of the examination of anti-HBc and anti-HBs negative positive / negative obtained only 1 samples (6.25%), anti-HBc positive and negative anti-Hbs obtained 9 samples (56.25%), and anti-HBc , anti- HBs positive are 5 samples (31.25%). and then , qualitative PCR examination and had 3 samples (18.75%), is not detected, 6 (37.5%) samples, and some samples showed a low viral load results detection (sensitivity under tools value), and 6 samples (43.75%) shows viral load is positive. In qualitative PCR and sequencing obtained 2 samples (28.57%) found a mutation in the S gene at position 143 where there T143M amino acid substitution.;Background. Hepatitis B is one of the most serious health problem. It is estimated that more than 2 bilion people have been infected by this virus, of which 360 milion are chronically infected with severe and fatal risk especially of cirrosis and hepatocellular carcinoma. One of the main ways to prevent transfusion transmitted HBV infection is blood screening for HBsAg. However, many studies have proven that HBsAg negative blood can still be infection. Therefore to enhance blood safety same countries have added antibody parameters in blood screening of donors – antibody for hepatitis B core antigen (anti-HBc) as marker for HBV infection and antibody for hepatitis B surface antigen (anti-HBs) as marker for immunological response to HBV infection. And with the development of molecular biology technology, HBV infection can be knowing faster in seronegative windows period with HBV DNA examination inspection by methods Nucleic Acid Test (NAT) multiplex and discrimenatory. In fact the results of seronegative blood is still there HBV virus with NAT, and this result we can called with the Occult hepatitis B (HBO). Prevalence of donors with HBO ranges 8- 10% in Indonesia. This study aims to determine the efectivity analized by NAT method blood donor with HBO to see continuity with the examination of anti-HBc, anti-HBs, viral load, and the cause of the HBO that mutations in the gene encoding HBsAg. Methodology. This study used a cross-sectional design (cross-sectional) conducted in UTDP and Eijkman Institute for Molecular Biology, with a sample of 4,973 sampless blood bloods donor from 4 units of blood transfusion area of Jakarta, Tangerang City, Depok and Bekasi district. Against sample serological examination HBsAg, anti-HBc, anti-HBs, NAT, quantitative and qualitative PCR, then samples were HBsAg negative, positive NAT and quantitative PCR positive results obtained further investigation amino acid sequencing to determine whether there is a mutant HBsAg cause serological detection of HBsAg escape by HBsAg reagents used for screening of blood donors Result. There was 20 samples (0.40%) had results of HBsAg negative and positive NAT multiplex, and only 16 samples (80%) HBsAg negative and positive discrimenatory NAT. Furthermore, the results of the examination of anti-HBc and anti-HBs negative positive / negative obtained only 1 samples (6.25%), anti-HBc positive and negative anti-Hbs obtained 9 samples (56.25%), and anti-HBc , anti- HBs positive are 5 samples (31.25%). and then , qualitative PCR examination and had 3 samples (18.75%), is not detected, 6 (37.5%) samples, and some samples showed a low viral load results detection (sensitivity under tools value), and 6 samples (43.75%) shows viral load is positive. In qualitative PCR and sequencing obtained 2 samples (28.57%) found a mutation in the S gene at position 143 where there T143M amino acid substitution.;Background. Hepatitis B is one of the most serious health problem. It is estimated that more than 2 bilion people have been infected by this virus, of which 360 milion are chronically infected with severe and fatal risk especially of cirrosis and hepatocellular carcinoma. One of the main ways to prevent transfusion transmitted HBV infection is blood screening for HBsAg. However, many studies have proven that HBsAg negative blood can still be infection. Therefore to enhance blood safety same countries have added antibody parameters in blood screening of donors – antibody for hepatitis B core antigen (anti-HBc) as marker for HBV infection and antibody for hepatitis B surface antigen (anti-HBs) as marker for immunological response to HBV infection. And with the development of molecular biology technology, HBV infection can be knowing faster in seronegative windows period with HBV DNA examination inspection by methods Nucleic Acid Test (NAT) multiplex and discrimenatory. In fact the results of seronegative blood is still there HBV virus with NAT, and this result we can called with the Occult hepatitis B (HBO). Prevalence of donors with HBO ranges 8- 10% in Indonesia. This study aims to determine the efectivity analized by NAT method blood donor with HBO to see continuity with the examination of anti-HBc, anti-HBs, viral load, and the cause of the HBO that mutations in the gene encoding HBsAg. Methodology. This study used a cross-sectional design (cross-sectional) conducted in UTDP and Eijkman Institute for Molecular Biology, with a sample of 4,973 sampless blood bloods donor from 4 units of blood transfusion area of Jakarta, Tangerang City, Depok and Bekasi district. Against sample serological examination HBsAg, anti-HBc, anti-HBs, NAT, quantitative and qualitative PCR, then samples were HBsAg negative, positive NAT and quantitative PCR positive results obtained further investigation amino acid sequencing to determine whether there is a mutant HBsAg cause serological detection of HBsAg escape by HBsAg reagents used for screening of blood donors Result. There was 20 samples (0.40%) had results of HBsAg negative and positive NAT multiplex, and only 16 samples (80%) HBsAg negative and positive discrimenatory NAT. Furthermore, the results of the examination of anti-HBc and anti-HBs negative positive / negative obtained only 1 samples (6.25%), anti-HBc positive and negative anti-Hbs obtained 9 samples (56.25%), and anti-HBc , anti- HBs positive are 5 samples (31.25%). and then , qualitative PCR examination and had 3 samples (18.75%), is not detected, 6 (37.5%) samples, and some samples showed a low viral load results detection (sensitivity under tools value), and 6 samples (43.75%) shows viral load is positive. In qualitative PCR and sequencing obtained 2 samples (28.57%) found a mutation in the S gene at position 143 where there T143M amino acid substitution.;Background. Hepatitis B is one of the most serious health problem. It is estimated that more than 2 bilion people have been infected by this virus, of which 360 milion are chronically infected with severe and fatal risk especially of cirrosis and hepatocellular carcinoma. One of the main ways to prevent transfusion transmitted HBV infection is blood screening for HBsAg. However, many studies have proven that HBsAg negative blood can still be infection. Therefore to enhance blood safety same countries have added antibody parameters in blood screening of donors – antibody for hepatitis B core antigen (anti-HBc) as marker for HBV infection and antibody for hepatitis B surface antigen (anti-HBs) as marker for immunological response to HBV infection. And with the development of molecular biology technology, HBV infection can be knowing faster in seronegative windows period with HBV DNA examination inspection by methods Nucleic Acid Test (NAT) multiplex and discrimenatory. In fact the results of seronegative blood is still there HBV virus with NAT, and this result we can called with the Occult hepatitis B (HBO). Prevalence of donors with HBO ranges 8- 10% in Indonesia. This study aims to determine the efectivity analized by NAT method blood donor with HBO to see continuity with the examination of anti-HBc, anti-HBs, viral load, and the cause of the HBO that mutations in the gene encoding HBsAg. Methodology. This study used a cross-sectional design (cross-sectional) conducted in UTDP and Eijkman Institute for Molecular Biology, with a sample of 4,973 sampless blood bloods donor from 4 units of blood transfusion area of Jakarta, Tangerang City, Depok and Bekasi district. Against sample serological examination HBsAg, anti-HBc, anti-HBs, NAT, quantitative and qualitative PCR, then samples were HBsAg negative, positive NAT and quantitative PCR positive results obtained further investigation amino acid sequencing to determine whether there is a mutant HBsAg cause serological detection of HBsAg escape by HBsAg reagents used for screening of blood donors Result. There was 20 samples (0.40%) had results of HBsAg negative and positive NAT multiplex, and only 16 samples (80%) HBsAg negative and positive discrimenatory NAT. Furthermore, the results of the examination of anti-HBc and anti-HBs negative positive / negative obtained only 1 samples (6.25%), anti-HBc positive and negative anti-Hbs obtained 9 samples (56.25%), and anti-HBc , anti- HBs positive are 5 samples (31.25%). and then , qualitative PCR examination and had 3 samples (18.75%), is not detected, 6 (37.5%) samples, and some samples showed a low viral load results detection (sensitivity under tools value), and 6 samples (43.75%) shows viral load is positive. In qualitative PCR and sequencing obtained 2 samples (28.57%) found a mutation in the S gene at position 143 where there T143M amino acid substitution.;Background. Hepatitis B is one of the most serious health problem. It is estimated that more than 2 bilion people have been infected by this virus, of which 360 milion are chronically infected with severe and fatal risk especially of cirrosis and hepatocellular carcinoma. One of the main ways to prevent transfusion transmitted HBV infection is blood screening for HBsAg. However, many studies have proven that HBsAg negative blood can still be infection. Therefore to enhance blood safety same countries have added antibody parameters in blood screening of donors – antibody for hepatitis B core antigen (anti-HBc) as marker for HBV infection and antibody for hepatitis B surface antigen (anti-HBs) as marker for immunological response to HBV infection. And with the development of molecular biology technology, HBV infection can be knowing faster in seronegative windows period with HBV DNA examination inspection by methods Nucleic Acid Test (NAT) multiplex and discrimenatory. In fact the results of seronegative blood is still there HBV virus with NAT, and this result we can called with the Occult hepatitis B (HBO). Prevalence of donors with HBO ranges 8- 10% in Indonesia. This study aims to determine the efectivity analized by NAT method blood donor with HBO to see continuity with the examination of anti-HBc, anti-HBs, viral load, and the cause of the HBO that mutations in the gene encoding HBsAg. Methodology. This study used a cross-sectional design (cross-sectional) conducted in UTDP and Eijkman Institute for Molecular Biology, with a sample of 4,973 sampless blood bloods donor from 4 units of blood transfusion area of Jakarta, Tangerang City, Depok and Bekasi district. Against sample serological examination HBsAg, anti-HBc, anti-HBs, NAT, quantitative and qualitative PCR, then samples were HBsAg negative, positive NAT and quantitative PCR positive results obtained further investigation amino acid sequencing to determine whether there is a mutant HBsAg cause serological detection of HBsAg escape by HBsAg reagents used for screening of blood donors Result. There was 20 samples (0.40%) had results of HBsAg negative and positive NAT multiplex, and only 16 samples (80%) HBsAg negative and positive discrimenatory NAT. Furthermore, the results of the examination of anti-HBc and anti-HBs negative positive / negative obtained only 1 samples (6.25%), anti-HBc positive and negative anti-Hbs obtained 9 samples (56.25%), and anti-HBc , anti- HBs positive are 5 samples (31.25%). and then , qualitative PCR examination and had 3 samples (18.75%), is not detected, 6 (37.5%) samples, and some samples showed a low viral load results detection (sensitivity under tools value), and 6 samples (43.75%) shows viral load is positive. In qualitative PCR and sequencing obtained 2 samples (28.57%) found a mutation in the S gene at position 143 where there T143M amino acid substitution., Background. Hepatitis B is one of the most serious health problem. It is estimated that more than 2 bilion people have been infected by this virus, of which 360 milion are chronically infected with severe and fatal risk especially of cirrosis and hepatocellular carcinoma. One of the main ways to prevent transfusion transmitted HBV infection is blood screening for HBsAg. However, many studies have proven that HBsAg negative blood can still be infection. Therefore to enhance blood safety same countries have added antibody parameters in blood screening of donors – antibody for hepatitis B core antigen (anti-HBc) as marker for HBV infection and antibody for hepatitis B surface antigen (anti-HBs) as marker for immunological response to HBV infection. And with the development of molecular biology technology, HBV infection can be knowing faster in seronegative windows period with HBV DNA examination inspection by methods Nucleic Acid Test (NAT) multiplex and discrimenatory. In fact the results of seronegative blood is still there HBV virus with NAT, and this result we can called with the Occult hepatitis B (HBO). Prevalence of donors with HBO ranges 8- 10% in Indonesia. This study aims to determine the efectivity analized by NAT method blood donor with HBO to see continuity with the examination of anti-HBc, anti-HBs, viral load, and the cause of the HBO that mutations in the gene encoding HBsAg. Methodology. This study used a cross-sectional design (cross-sectional) conducted in UTDP and Eijkman Institute for Molecular Biology, with a sample of 4,973 sampless blood bloods donor from 4 units of blood transfusion area of Jakarta, Tangerang City, Depok and Bekasi district. Against sample serological examination HBsAg, anti-HBc, anti-HBs, NAT, quantitative and qualitative PCR, then samples were HBsAg negative, positive NAT and quantitative PCR positive results obtained further investigation amino acid sequencing to determine whether there is a mutant HBsAg cause serological detection of HBsAg escape by HBsAg reagents used for screening of blood donors Result. There was 20 samples (0.40%) had results of HBsAg negative and positive NAT multiplex, and only 16 samples (80%) HBsAg negative and positive discrimenatory NAT. Furthermore, the results of the examination of anti-HBc and anti-HBs negative positive / negative obtained only 1 samples (6.25%), anti-HBc positive and negative anti-Hbs obtained 9 samples (56.25%), and anti-HBc , anti- HBs positive are 5 samples (31.25%). and then , qualitative PCR examination and had 3 samples (18.75%), is not detected, 6 (37.5%) samples, and some samples showed a low viral load results detection (sensitivity under tools value), and 6 samples (43.75%) shows viral load is positive. In qualitative PCR and sequencing obtained 2 samples (28.57%) found a mutation in the S gene at position 143 where there T143M amino acid substitution.]
Jakarta: Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia, 2014
T58764
UI - Tesis Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Erick Sidarta
Abstrak :
ABSTRAK
Infeksi oleh virus hepatitis B (VHB) dapat menjadi infeksi akut yang berakhir dengan resolusi infeksi ataupun berlanjut menjadi infeksi kronis. Resolusi infeksi dalam infeksi VHB ditandai dengan hilangnya hepatitis B surface antigen (HBsAg) dan keberadaan antibodi terhadap HBsAg (anti-HBs). Kemampuan sel B dalam mensintesis anti-HBs dipengaruhi oleh sel T helper 1 (Th1) ataupun T helper 2 (Th2). Sekresi sitokin yang terkoordinasi dari Th1 ataupun Th2 sangat dibutuhkan mengingat sitokin yang dihasilkan oleh kedua sel T helper (Th) tersebut memiliki peranan yang berbeda dan dapat bekerja secara antagonis. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui kemampuan pasien hepatitis B kronis dalam mensintesis anti-HBs dan membandingkan pola sintesis sitokin IL-10, IFN-gamma dan IL-2 dari pasien hepatitis B kronis dengan pasien yang mengalami resolusi infeksi. Pada penelitian ini sel mononuklear darah tepi manusia (SMDT) diambil dari 10 subjek pasien hepatitis B kronis, 10 subjek pasien yang mengalami resolusi infeksi dari hepatitis B dan 10 subjek individu sehat yang berhasil divaksinasi. SMDT dikultur dengan stimulan HBsAg rekombinan (rHBsAg) atau fitohemaglutinin (PHA) untuk sintesis sitokin dan pokeweed mitogen (PWM) untuk sintesis anti-HBs secara in vitro. Hasil dari penelitian ini ditemukan produksi anti-HBs secara in vitro dari 70% individu sehat yang berhasil divaksinasi dan 40% pasien hepatitis B yang mengalami resolusi infeksi, sementara pada pasien hepatitis B kronis tidak ditemukan hal tersebut. Pola sitokin IL-10, IFN-gamma dan IL-2 antara pasien hepatitis B yang mengalami resolusi infeksi dan pasien hepatitis B kronis tidak memiliki perbedaan yang bermakna. Akan tetapi, respons IFN-gamma terhadap rHBsAg pada pasien hepatitis B yang mengalami resolusi infeksi cenderung lebih kuat. Korelasi antara sitokin IL-10, IFN-gamma dan IL-2 dengan produksi anti-HBs secara in vitro tidak ditemukan pada kedua kelompok tersebut, sementara korelasi IL-2 dengan sintesis anti-HBs in vitro ditemukan pada individu yang divaksinasi. Penelitian ini menunjukkan SMDT dari pasien hepatitis B kronis tidak dapat mensintesis anti-HBs secara in vitro dan pada pasien tersebut tidak memiliki perbedaan pola sintesis sitokin IL-10, IFN-gamma dan IL-2 jika dibandingkan dengan pasien hepatitis B yang mengalami resolusi infeksi.
ABSTRACT
Hepatitis B virus (HBV) infection can lead to acute self-limited infection or lead to chronic hepatitis B infection. Resolution of infection is marked by seroconversion of hepatitis B surface antigen (HBsAg) to antibody to HBsAg (anti-HBs) which also give protection to HBV reinfection. Anti-HBs is produced by B cells as response to HBsAg. B cells response to HBsAg is affected by cytokines from T helper 1 (Th1) and T helper 2 (Th2) cells. Coordinated cytokines secreted by Th1 or Th2 cells is necessary due to the fact that they could work antagonistically. Th1 cytokines, such as IFN-gamma, are known to induce cellular immune responses, while Th2 cytokines, such as IL-4, -5 and -10, are known to induce humoral immune responses. This study aimed to investigate the capability of chronic hepatitis B patients (CHB) to synthesize anti-HBs in vitro and to compare IL-10, IFN-gamma and IL-2 levels between CHB patientis with resolved hepatitis B (RHB) patients. In this study, peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) were taken from 10 CHB patients, 10 RHB patients and 10 healthy hepatitis B vaccinated individuals. PBMCs were cultured in presence of recombinant HBsAg (rHBsAg) and PHA to cytokines synthesis and pokeweed mitogen (PWM) to anti-HBs synthesis in vitro. As results, synthesis of anti-HBs in vitro were found in PBMCs from 70% of healthy hepatitis B vaccinated individuals and 40% of RHB patients, while PBMCs from CHB patients could not. No significant differences were found in IL-10, IFN-gamma and IL-2 cytokine levels between CHB patients and RHB patients, although IFN-gamma responses to rHBsAg had a tendency to be stronger in RHB patients. Correlation between IL-10, IFN-gamma and IL-2 cytokine levels and anti-HBs synthesis in vitro was not found in CHB patients and RHB patients. Meanwhile, IL-2 and anti-HBs synthesis in vitro were correlated in healthy hepatitis B vaccinated individuals. In conclusion, this study showed that PBMCs from CHB patients were not capable in synthesizing anti-HBs in vitro and had no differences in IL-10, IFN-gamma and IL-2 cytokine levels with RHB patients.
Jakarta: Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia, 2016
T58665
UI - Tesis Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Firdayani
Abstrak :
Protein inti virus hepatitis B memegang peranan penting pada berbagai tahap siklus hidup virus. Dengan mengganggu peran protein inti ini oleh suatu senyawa maka replikasi virus akan terhambat. Emodin dipilih sebagai senyawa penuntun dan dilakukan modifikasi struktur dengan mengubah sifat hidrofobisitas, elektronik dan steriknya. Untuk memprediksi interaksi yang terjadi antara emodin dan senyawa turunan ester emodin dengan protein inti virus hepatitis B sebagai target obat, dilakukan pemodelan molekul dengan program simulasi penambatan dan dinamika molekul. Interaksi senyawa turunan ester emodin dengan reseptor protein inti virus hepatitis B terjadi di daerah antarmuka dimer-dimer reseptor dan membentuk interaksi yang stabil dengan asam amino pada daerah yang akan mengubah konformasi protein sehingga mengganggu perakitan kapsid dan proses replikasi virus. Senyawa turunan ester emodin disintesis dengan pereaksi dan kondisi yang sesuai kemudian dikonfirmasi strukturnya menggunakan spekrofotometri LCMS/MS, FTIR, 1H-NMR dan 13C-NMR. Senyawa yang diperoleh adalah: 3-asetil emodin, 3-benzoil emodin, 3-o-toluil emodin, 3-m-toluil emodin, 3-p-toluil emodin dan 3-dimetilkarbamoil emodin. Aktivitas inhibisi in vitro ditentukan menggunakan sel HepG2 yang ditransfeksi plasmid genom inti virus hepatitis B, immunositokimia dan fluorometri. Hasil menunjukkan bahwa turunan ester emodin aktivitasnya lebih tinggi dan sitotoksitasnya lebih rendah daripada emodin. Senyawa 3-o-toluil emodin, 3-m-toluil emodin dan 3-p-toluil emodin menunjukkan aktivitas yang tinggi dengan IC50 berturut-turut sebesar 0,4; 0,23 dan 0,11 M. Analisa hubungan struktur aktivitas menunjukkan bahwa hidrofobisitas dan sterik berkorelasi non linear dengan aktivitas inhibisi replikasi virus hepatitis B.
The core protein of hepatitis B virus plays an important role at different stages of the viral life cycle. By disrupting the role of this core protein by a compound, the viral replication will be inhibited. Emodin was chosen as a lead compound and the structure was modified by altering its hydrophobicity, electronic and steric properties to be emodin ester. Prediction of interaction between emodin and their ester derivatives with hepatitis B virus core protein as drug targets, was performed by molecular modeling simulation program of docking and molecular dynamic. The interaction of emodin ester derivatives with hepatitis B virus core protein receptors occurs in the interface area of receptor dimers and forms a stable interaction with amino acids in areas that will alter protein conformation thus disrupting capsid assembly and viral replication processes. Emodin ester derivatives compound were synthesized with reagents and suitable conditions then confirmed their structures using LCMS MS, FTIR, 1H NMR and 13C NMR spectrophotometry. The compounds obtained were 3 acetyl emodin, 3 benzoyl emodin, 3 o toluyl emodin, 3 m toluyl emodin, 3 p toluyl emodin and 3 dimethylcarbamoyl emodin. In vitro inhibitory activity was determined using HepG2 cells transfected plasmid core genomes of hepatitis B virus, immunocytochemistry and fluorometry. The results showed that the emodin ester derivatives activity is higher and its cytotoxicity is lower than emodin. The 3 o toluyl emodin, 3 m toluyl emodin and 3 p toluyl emodin showed high activity with IC50 of 0.4 0.23 and 0.11 M respectively. Structure activity relationship analysis showed that hydrophobicity and steric properties correlate non linearly with activity.
Depok: Universitas Indonesia, 2017
D2390
UI - Disertasi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Khansa Zahrani
Abstrak :
Hepatitis B merupakan penyakit peradangan hati yang disebabkan oleh HBV. Saat ini, belum ada penanganan spesifik untuk infeksi HBV akut. Sambiloto (Andrographis paniculata) merupakan tanaman obat yang diketahui mengandung andrografolida. Senyawa ini dapat menginhibisi α-glukosidase yang berperan dalam sekresi HBV. Penelitian ini bertujuan untuk menanoenkapsulasi ekstrak daun sambiloto untuk meningkatkan bioavailabilitasnya dalam tubuh. Efisiensi enkapsulasi dan loading capacity terbaik sebesar 73,47% dan 46,29% diperoleh dari rasio kitosan:STPP 2%:1% (g/mL). Inhibisi α-glukosidase optimum sebesar 37,17% didapat pada konsentrasi sampel 16%. Profil rilis yang dihasilkan berupa burst release yang dilanjutkan sustained release dengan rilis kumulatif tertinggi 74,83% pada rasio kitosan:STPP 1%:1,5% (g/mL). ......Hepatitis B is a liver inflammation caused by HBV. Currently, there is no specific handling for acute HBV infection. Andrographis paniculata is a medicinal plant contain andrographolide that could inhibits α-glucosidase which may be involved in the HBV secretion. This research aims to nanoencapsulation Andrographis paniculata leaf extract to increase its bioavailability. The optimum EE and LC are 73.47% and 46.29% which obtained from 2%:1% (g/mL) chitosan:STPP ratio. The optimum α-glucosidase inhibition 37.17% was obtained at 16% concentration. Release profile results burst release that followed by sustained release with the highest cumulative release 74.83% in 1%:1,5% (g/mL) chitosan:STPP ratio.
Depok: Fakultas Teknik Universitas Indonesia, 2016
S64164
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
<<   1 2   >>