Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

"

 

Daluga atau talas rawa raksasa (Cyrtosperma merkusii (Hassk.) Schott) merupakan tanaman pangan minor dari keluarga Araceae. Penelitian daluga di Indonesia masih sangat sedikit dikerjakan. Sebanyak 36 aksesi daluga dikoleksi dari Kepulauan Siau, Sangihe dan Talaud (Pulau Karakelang dan P. Salibabu), Sulawesi Utara, pada bulan April – May 2017. Identifikasi karakter dilakukan berdasarkan morfologi, anatomi, sitologi dan molekuler. Karakterisasi morfologi memperlihatkan adanya 11 varian daluga. Berdasarkan analisis klaster dan PCA yang dilakukan menggunakan karakter morfologi dan molekuler, ke 11 varian dapat dikelompokkan menjadi 2 klaster utama, yaitu klaster pertama yang beranggotakan varian-varian dengan tangkai perbungaan panjang dan klaster kedua yang beranggotakan varian-varian dengan tangkai perbungaan pendek. Di antara 4 populasi yang diteliti, populasi Pulau Siau mempunyai tingkat variasi genetik tertinggi, sementara itu populasi Pulau Salibabu mempunyai variasi genetik terendah. Penelitian anatomi menunjukkan bahwa pada bagian adaksial daun mempunyai sel epidermis yang berbentuk hampir sama, namun sel epidermis bagian abaksial daun, bentuk dan jumlah kristal kalsium oksalat berbeda di antara varian-varian dengan tangkai perbungaan panjang dan pendek.  Jumlah kromosom sama yaitu  2n = 26, meskipun tipe kromosom berbeda-beda di antara varian-varian. Hasil klasifikasi serta informasi baru mengenai karakter lengkap daluga dapat digunakan sebagai data dasar dalam mengembangkan daluga di masa depan, baik sebagai pangan alternatif maupun pangan fungsional. 

---

Daluga or the giant swamp taro (Cyrtosperma merkusii (Hassk.) Schott) is one of the minor root crops belongs to Araceae family. Study about daluga in Indonesia is still poorly known. A total of 36 daluga accessions were collected from Siau, Sangihe and Talaud islands, North of Sulawesi, Indonesia on April – May 2017. Identification was done using morphology, anatomy, cytology and molecular. Morphological characters shows that there are 11 variants. Based on claster and PCA analysis using morphology and molecular characters, those variants can grouped into 2 main clasters, those are claster with long peduncle and claster with short peduncle. Amongst four populations studied, Siau Island population has the highest level of genetic variation, meanwhile Salibabu Island has the lowest level. Anatomy study showed that adaxial surface have the same shape of epidermal cells. However, the epidermal cells on abaxial of leaf, the shape and number of calcium oxalate crystals were different between variants with long peduncle and short peduncle. All of variants have the same number of chromosomes 2n = 26, although the type of chromosomes different among variants. This result of classification and new informations about daluga can be used for baseline data to improving and developing daluga for the future as an alternative and functional food. 

"

"Latar Belakang: Infeksi Human Papillomavirus risiko tinggi(hrHPV) dianggap sebagai etiologi utama terjadinya kanker serviks. Target WHO pada tahun 2030 skrining kanker serviks diharapkan mencapai 70%. Keengganan masyarakat untuk melakukan pemeriksaan hrHPV DNA serviks salah satunya karena rasa malu karena harus dilakukan pemeriksaan dalam. Pemeriksaan hrHPV DNA pada urine diharapkan akan meningkatkan cakupan skrining kanker serviks. Objektif: Penelitian ini dilakukan untuk membandingkan keakuratan, sensitivitas, spesifisitas, nilai prediksi positif, nilai prediksi negatif, serta faktor yang mempengaruhi hasil pemeriksaan hrHPV DNA urine dan serviks dengan Cobas® 4800 di RSUPN dr. Cipto Mangunkusumo Jakarta. Metode: Penelitian ini merupakan penelitian potong lintang. Sebanyak 72 sampel diambil dari data rekam medis hasil pemeriksaan hrHPV DNA serviks sebelumnya dengan hasil positif atau negatif pada pemeriksaan tahun 2017-2020. Subyek diperiksakan kembali sampel urine dan swab serviksnya dengan PCR Cobas® 4800 pada satu waktu. Selanjutnya pada sampel dengan hasil pemeriksaan hrHPV DNA positif pada serviks, urine maupun keduanya kemudian diperiksakan sitologi serviksnya(LBC). Analisis data menggunakan chi square. Hasil: Akurasi deteksi hrHPV DNA dalam sampel urine dibandingkan serviks adalah 84,72%. Tingkat kesesuaian substansial dari deteksi hrHPV DNA pada kedua sampel (ka = 0,62; 95% IC: 39-84). Dalam populasi ini sensitivitas, spesifisitas, NPP dan NPN untuk deteksi hrHPV DNA dari sampel urine versus serviks masing-masing adalah 87,5% (95% IC: 64–97%), 84%(95% IC: 72–91%), 60,9% (95% IC: 40,8–77,8) dan 96%(95% IC: 86,3–98,9). Analisis lebih lanjut didapatkan bahwa usia, tingkat pendidikan, dan paritas tidak berpengaruh terhadap kesesuaian hasil hrHPV DNA urine terhadap serviks. Pada pemeriksaan lanjut sitologi pada hrHPV DNA positif baik di serviks, urine maupun keduanya, ditemukan 68% sitologi normal, 20% LSIL, 8% ASCH dan 4% ASCUS. Kesimpulan: Deteksi hrHPV DNA dengan urine cukup akurat untuk menilai adanya infeksi hrHPV di serviks. Hasil ini menunjukkan bahwa sampel urine yang diproses dengan uji Cobas® 4800 HPV berguna untuk manajemen klinis infeksi hrHPV.

---

Backgound: High risk Human Papillomavirus(hrHPV) infection is the main cause of cervical cancer. WHO target in 2030 cervical cancer screening is expected to reach 70%. One of the reasons for the reluctance of the to carry out cervical hrHPV DNA examination is because of the shame that gynecological examinations have to be carried out. The development of non-invasive self-sample collection methods would have the potential advantage of increasing the acceptance of the screening procedures. High risk HPV DNA examination in urine is expected to increase the coverage of cervical cancer screening. Objectives: To compare accuracy, sensitivity, specificity, positive predictive value, negative predictive value, and factors that influence high risk human papillomavirus (hrHPV) DNA detection and genotyping with the Cobas® 4800 HPV test on paired cervical and urine at dr. Cipto Mangunkusumo National General Hospital Jakarta. Methods: This research is a cross sectional study. The number of subjects was 72 samples with result were positive or negative on medical record data from previous any hrHPV DNA tests in year 2017-2020. Subjects were re-collected and re-examine for urine samples and cervical swabs with Cobas® 4800 at one time. On the results of positive hrHPV DNA examination on the cervix, urine or both then examined for cytology(LBC). Data analysis using chi square. Results: The overall percent agreement between hrHPV DNA detection in urine and cervical samples was 84.72%. A Substantial concordance rate of hrHPV DNA detection in both samples was observed (ka = 0.62; 95% IC: 39-84). In this population, the sensitivity, specificity, PPV and NPV for detection of hrHPV DNA from urine versus cervical samples were 87.5% (95% IC: 64–97%), 84%(95% IC: 72–91%), 60.9% (95% IC: 40.8–77.8) and 96% (95% IC: 86.3–98.9) respectively. Further analysis found that age, education level, and parity had no effect on the concordance of the hrHPV DNA between cervix and urine results. On cytological follow-up examination of positive hrHPV DNA either in the cervix, urine or both found 68% normal cytology, 20% LSIL, 8% ASCH and 4% ASCUS. Conclusions: Detection of hrHPV DNA with urine is accurate to assess the presence of hrHPV infection in the cervix. These results suggest that urine samples processed with Cobas® 4800 HPV test may be useful for clinical management of hrHPV infection."

"Tingginya kasus TB paru di Indonesia meningkatkan risiko terjadinya infeksi jamur paru, termasuk Aspergillus spp. yang menyebabkan aspergilosis paru kronik (APK). Identifikasi Aspergillus sampai tingkat spesies perlu dilakukan karena setiap spesies memiliki kepekaan yang berbeda terhadap obat antijamur. Identifikasi fenotipik pada beberapa spesies yang berbeda mungkin identik, sehingga identifikasi molekuler diperlukan untuk memastikan identifikasi spesies. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi Aspergillus spp. yang diisolasi dari pasien diduga APK dan kepekaannya terhadap obat antijamur. Identifikasi dilakukan dengan metode fenotipik, dilanjutkan dengan uji kepekaan menggunakan metode difusi cakram. Isolat resisten dikonfirmasi dengan identifikasi molekuler menggunakan teknik PCR pada target daerah ITS rDNA dan gen BenA. Identifikasi fenotipik 49 isolat Aspergillus yang berasal dari 39 sputum pasien menunjukkan 25 (51%) isolat A. fumigatus, 17 (34,6%) isolat A. niger, enam (12,2%) isolat A. flavus dan satu (2%) isolat A. clavatus. Uji kepekaan menunjukkan 15 (30,6%) isolat resisten terhadap vorikonazol dan atau itrakonazol yang selanjutnya dikonfirmasi dengan identifikasi molekuler. Hasil sekuensing menunjukkan 11 (73,3%) isolat A. fumigatus, dua (13,3%) isolat A. flavus, satu (6,7%) isolat A. niger, dan satu (6,7%) isolat A. clavatus . Identifikasi fenotipik dan genotipk isolat resisten menunjukkan kesesuaian.

---

The increase number of pulmonary tuberculosis (PTB) can increase the risk to pulmonary fungal infections, including Aspergillus spp. that causes chronic pulmonary aspergillosis (CPA). Aspergillus identification to the species level is necessary because each species has a different sensitivity to antifungal agents. The phenotypic identification in some different species may be identical, therefore, the molecular method is recommended to confirm the species. The study aimed to identify Aspergillus isolated from suspected CPA patients and their susceptibility profile to antifungal drugs. Fungal identification was conducted by phenotypic method, while the susceptibility testing performed with disk-diffusion method. The resistant isolates were confirmed by molecular identification using PCR technique in the target area of the ITS rDNA region and BenA gene. The phenotypic identification of 49 Aspergillus isolated from 39 sputum sample showed 25 (51%) isolates of A. fumigatus, 17 (34,6%) isolates of A. niger, six isolates of A. flavus, and one (2%) isolate A. clavatus. The susceptibility testing showed 15 (30,6%) resistant isolates were resistant to voriconazole and or itraconazole which was further confirmed by molecular identification. The sequencing results obtained 11 (73,3%) isolates of A. fumigatus, two (13,3%) isolates of A. flavus, one (6,7%) isolate of A. niger, and one (6,7%) isolate A. clavatus. The results of phenotypic and molecular examinations showed the congruence of the results."