Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

"Virus dengue ialah penyebab demam dengue yang ditransmisikan melalui nyamuk betina Aedes aegypti. Manifestasi klinis dari infeksi virus ini sangat beragam, mulai dari tidak bergejala hingga dapat menyebabkan sindrom renjatan dengue. Kejadian infeksi dengue diperkirakan mencapai 390 juta kasus per tahun. Belum terdapat pengobatan antivirus spesifik yang bisa digunakan dalam menangani kasus infeksi dengue. Tanaman Moringa oleifera merupakan salah satu tanaman herbal yang diketahui memiliki banyak manfaat akibat zat-zat metabolit yang terkandung di dalamnya. Ekstrak daun ini berpotensi sebagai antivirus DENV, namun belum diketahui bagaimana mekanisme penghambatan yang terjadi. Penelitian ini dilakukan untuk mengevaluasi mekanisme penghambatan replikasi DENV secara in vitro oleh fraksi heksana dari ekstrak daun Moringa oleifera. Sel vero diinfeksi dengan DENV-2 dan diberi fraksi heksan ekstrak daun Moringa oleifera pada tahapan entry-step (awal) dan post-step (akhir). Pada penelitian ini, dilakukan focus assay untuk menghitung persentase penghambatan dan MTT assay untuk menghitung persentase viabilitas. Persentase penghambatan pemberian fraksi heksana ekstrak daun M. oleifera pada perlakuan entry step dan post adalah sebesar 98,08% dan 99,51 dengan persentase viabilitas masing-masing sebesar 104,04% dan 96,4%. Pemberian fraksi heksana ekstrak daun M. oleifera pada perlakuan entry step maupun post infeksi menunjukkan aktivitas antivirus DENV yang baik dan aman bagi sel.

---

Dengue virus is the cause of dengue fever that can be transmitted by female mosquitoes from Aedes aegypti Sp. The clinical manifestation of dengue infection varies, from asymptomatic to dengue shock syndrome. The incidence of dengue infection is estimated to reach 390 million cases each year. There is no specific antivirus yet to treat DENV. Moringa oleifera is a herbal plant that is known to have many benefits as it has lots of important nutrients and essential phytochemicals. The objective of this study is to evaluate the cytotoxic effect and inhibition mechanism of dengue virus replication by hexane fraction of Moringa oleifera leaf extract using vero cells. Inhibitory mechanism was done by entry-step infection method and post infection method. Inhibitory percentage was determined by focus assay meanwhile viability percentage was determined by MTT assay. The viability percentage of vero cells from the entry step infection and post infection were 104,04% and 96,4%. While inhibitory percentage of DENV-2 were 98,08% and 99,51%, respectively. The entry-step infection and post infection mechanism of hexane fraction of Moringa oleifera leaf extract towards dengue virus shows a good antiviral potential with high inhibitory percentage and low cytotoxic effect."

"Latar belakang: Demam Berdarah Dengue (DBD) merupakan penyakit yang disebabkan virus dengue (DENV) dan ditularkan oleh nyamuk. Peningkatan kasus DBD masih menjadi masalah kesehatan utama di berbagai negara. Belum terdapat obat antivirus spesifik untuk mengobati atau mencegah infeksi DENV. Moringa oleifera, atau dikenal dengan tanaman kelor, memiliki kandungan bioaktif sebagai antivirus. Pada penelitian sebelumnya, Moringa oleifera memiliki potensi sebagai antivirus DENV dengan nilai IC50 31.51μg/ml,CC50>320μg/ml,danSI>10,2.Namun,mekanismepenghambatannya masih belum diketahui. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui mekanisme penghambatan replikasi DENV-2 oleh fraksi butanol dari ekstrak etanolik daun Moringa oleifera. Metode: DENV-2 secara in vitro diinfeksikan terhadap sel Vero serta diberi perlakuan ekstrak melalui mekanisme penghambatan yang berbeda yaitu: pre, prepost, post, dan entry step. Metode focus assay dan MTT assay digunakan untuk mengetahui persentase penghambatan dan persentase viabilitas. Hasil: Hasil persentase viabilitas pada perlakuan entry step, pre, pre-post dan post adalah 106,2 %, 125,3%, 112,6% dan 111,8%. Sementara itu, nilai persentase penghambatan tiap perlakuan secara berurutan adalah sebesar 7,42%, 100%, 95,91% dan 93,76% Kesimpulan: Fraksi butanol dari ekstrak etanolik daun Moringa oleifera secara aman memiliki efek antivirus baik pada awal maupun akhir infeksi. Mekanisme penghambatan dengan hasil yang lebih baik ditunjukkan oleh perlakuan pre diikuti perlakuan prepost, post, dan entry step. Namun, penelitian lebih lanjut diperlukan untuk menjawab mengenai kandungan zat bioaktif spesifik yang berperan dalam inhibisi ekstrak daun M. oleifera terhadap DENV.

---

Introduction: Dengue Hemorrhagic Fever (DHF) is a disease caused by the dengue virus (DENV) and is transmitted by mosquitoes. The increase in dengue cases is still a major health problem in many countries. There are no specific antiviral drugs to treat or prevent DENV infection. Moringa oleifera, otherwise known as the Moringa plant, has bioactive properties as an antiviral. In previous studies, Moringa oleifera has potential as a DENV antiviral with IC50 values of IC50 31.51 μg/ml, CC50 >320 μg/ml, and SI >10,2. However, the mechanism of inhibition is still unknown. This study aimed to determine the mechanism of inhibition of DENV-2 replication by the butanol fraction of the ethanolic extract of Moringa oleifera leaves. Method: DENV-2 was infected with Vero cells in vitro and treated with extracts through different inhibition mechanisms, namely: pre, prepost, post, and entry step. Focus assay and MTT assay methods were used to determine the percentage of inhibition and the percentage of viability. Result: The results of the percentage of viability in the entry step, pre, pre-post and post treatments were 106.2%, 125.3%, 112.6% and 111.8%. Meanwhile, the percentage inhibition values for each treatment were respectively 7.42%, 100%, 95.91% and 93.76%. Conclusion: The butanol fraction of the ethanolic extract of Moringa oleifera leaves safely has an antiviral effect both at the beginning and at the end of the infection. The inhibition mechanism with better results was shown by pre treatment followed by prepost, post, and entry steps. However, further research is needed to answer the specific content of bioactive substances that play a role in the inhibition of M. oleifera leaf extract against DENV."

"[Saat ini tengah banyak studi yang dilakukan untuk menemukan antivirus dengue(DENV) dari ekstrak bebagai tumbuhan sebagai alternatif pengobatan terhadapinfeksi DENV. Calophyllum flavoramulum (C. flavoramulum) merupakantanaman yang banyak hidup di daerah Asia Tenggara ini memiliki kandungan dariturunan xanthone dan flavonoid yang memiliki potensi sebagai antivirus. Padastudi ini dilakukan evaluasi efek inhibisi dari fraksi etanol ekstrak daun C.flavoramulum terhadap DENV-2 strain New Guinea C (NGC). Efek inhibisi(IC50) dievaluasi dengan menggunakan focus assay. Sedangkan efek toksisitas(CC50) terhadap sel dievaluasi pada sel Huh7it-1 menggunakan metode MTTassay. Hasil dari studi ini menunjukan CC50 = 473,50ug/ml, IC50 = 41,74ug/ml,dan SI=11,33. Hasil tersebut menunjukan bahwa C. flavoramulum tidak toksikterhadap sel hidup dan memiliki nilai SI yang cukup tinggi sehingga efektif untukdigunakan sebagai antivirus dengue. Akan tetapi, perlu diteliti lebih lanjutmengenai kandungan aktif dalam C. flavoramulum yang memiliki aktivitas untukmenghambat replikasi DENV.;In recent years, several studies have been conducted to find dengue (DENV)antiviral from natural extract as an alternative management for dengue infection.Calophyllum flavoramulum(C. flavoramulum), one of South East Asia plants,contains derivates of flavonoid and xanthone where both have been known aspotential dengue antivirals. This study evaluated inhibitory potential of ethanolextract from C. flavoramulum leaf to DENV-2 strain New Guinea C (NGC)through focus assay. Along with inhibitory effect (IC50), toxicity effect (CC50) toHuh7it-1 cell also evaluated through MTT assay. The result of this study shownIC50 = 41.74 μg/mL, CC50 = 473.50 μg/mL, and SI=11.33. In conclusion, extractof C. flavoramulum can be used selectively as a dengue antiviral, besides it is nottoxic for living cells. More studies are needed to find its active ingredients whichspecifically have the ability to inhibit DENV replication.;In recent years, several studies have been conducted to find dengue (DENV)antiviral from natural extract as an alternative management for dengue infection.Calophyllum flavoramulum(C. flavoramulum), one of South East Asia plants,contains derivates of flavonoid and xanthone where both have been known aspotential dengue antivirals. This study evaluated inhibitory potential of ethanolextract from C. flavoramulum leaf to DENV-2 strain New Guinea C (NGC)through focus assay. Along with inhibitory effect (IC50), toxicity effect (CC50) toHuh7it-1 cell also evaluated through MTT assay. The result of this study shownIC50 = 41.74 μg/mL, CC50 = 473.50 μg/mL, and SI=11.33. In conclusion, extractof C. flavoramulum can be used selectively as a dengue antiviral, besides it is nottoxic for living cells. More studies are needed to find its active ingredients whichspecifically have the ability to inhibit DENV replication., In recent years, several studies have been conducted to find dengue (DENV)antiviral from natural extract as an alternative management for dengue infection.Calophyllum flavoramulum(C. flavoramulum), one of South East Asia plants,contains derivates of flavonoid and xanthone where both have been known aspotential dengue antivirals. This study evaluated inhibitory potential of ethanolextract from C. flavoramulum leaf to DENV-2 strain New Guinea C (NGC)through focus assay. Along with inhibitory effect (IC50), toxicity effect (CC50) toHuh7it-1 cell also evaluated through MTT assay. The result of this study shownIC50 = 41.74 μg/mL, CC50 = 473.50 μg/mL, and SI=11.33. In conclusion, extractof C. flavoramulum can be used selectively as a dengue antiviral, besides it is nottoxic for living cells. More studies are needed to find its active ingredients whichspecifically have the ability to inhibit DENV replication.]"

"Deteksi cepat protein non-structural 1 (NS1) telah banyak digunakan untuk diagnosis infeksi dengue. Beberapa kit diagnostik yang mampu mendeteksi antigen NS1 sudah tersedia di Indonesia, salah satunya adalah SD Bioline Dengue Duo®. Penelitian ini merupakan studi cross-sectional, berbasis komunitas, yang mengevaluasi sensitivitas dan spesifisitas SD Bioline Dengue Duo® pada infeksi dengue primer dan sekunder di Jakarta, Indonesia dari tahun 2010 sampai 2011. Kinetika NS1 serta antibodi antidengue juga diamati. Sampel serum diambil dari 105 pasien dengan demam kurang dari 48 jam. Infeksi dengue dikonfirmasi menggunakan tiga tes standar emas, Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) dan/atau isolasi virus di cell line C6/36 dan/atau Imunoglobulin G (IgG) Enzyme Linked Immunosorbent Assay (ELISA). Sensitivitas SD Bioline Dengue Duo® lebih tinggi pada infeksi primer (93,1% [95% CI, 92,7 sampai 100]) dibandingkan infeksi sekunder (86,1% [95% CI, 82,7 sampai 100]). Spesifisitas kit di kedua kelompok penelitian adalah 100%. Selain itu, penelitian kami menunjukkan bahwa pada infeksi sekunder, tes NS1 yang dilakukan sedini mungkin setelah onset demam berbuah pada sensitivitas kit yang lebih baik dibandingkan dengan studi-studi sebelumnya. Kemampuan kit untuk mendeteksi NS1 menurun seiring dengan perjalanan penyakit dan mencapai titik nadir pada hari ke 7 di kelompok infeksi primer maupun sekunder. Oleh karena sensitivitas yang baik dan spesifisitas yang sempurna, SD Bioline Dengue Duo® adalah alat yang dapat dipercaya untuk keperluan skrining infeksi dengue pada awal demam.

---

Some diagnostic kits capable of detecting dengue virus (DENV) NS1 are already available in Indonesia, one of which is SD Bioline Dengue Duo®. This research is a cross-sectional that evaluates the sensitivity and specificity of SD Bioline Dengue Duo® for primary and secondary DENV infection in Jakarta, Indonesia between 2010 and 2011. The kinetics of NS1 as well as anti-DENV antibodies detected by the kit was also observed. A panel of sera samples from 105 patients experiencing fever within the last 48 hours was tested. DENV infection was confirmed using three gold standard tests, Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) and/or virus isolation in C6/36 cell line and/or Imunoglobulin G (IgG) Enzyme Linked Immunosorbent Assay (ELISA).

The sensitivity of SD Bioline Dengue Duo® was higher in primary infection (93.1% [95% CI, 92.7 to 100]) than in secondary infection (86.1% [95% CI, 82.7 to 100]). The kit's specificity in both study groups was 100%. Moreover, our study showed that in secondary infection, NS1 test performed as early as 1 or 2 days after fever onset resulted in a better sensitivity of the kit compared to past studies. NS1 detection rate reduced over the course of the illness and was lowest on day 7 in both primary and secondary infection. Given its high sensitivity and excellent specificity, SD Bioline Dengue Duo® is a reliable tool for early screening for DENV infection."

"Penyakit demam berdarah merupakan salah satu penyakit utama yang tergolong dalam penyakit infeksi tropis di dunia dan di saat yang bersamaan, masih kurang adanya vaksin yang disetujui dan terapi antiviral yang dapat mengimunisasi dan menyembuhkan pasien dari penyakit tersebut. Sampai saat ini, perawatan suportif adalah tata laksana yang paling efektif untuk infeksi virus dengue (DENV), sehingga strategi terapeutik dengan menggunakan ekstrak natural telah dikembangkan. Indonesia sangat kaya dengan aneka ragam tanaman yang memiliki potensi sebagai obat antiviral, seperti contohnya Artocarpus communis.Tujuan dari penelitian ini adalah menilai efek inhibitorik dari A. communis terhadap replikasi dan infeksi virus dengue. Dalam eksperimen ini, enam sampel sel Huh7it-1 diinfeksikan dengan DENV-2 NGC dan diberi perlakuan menggunakan berbagai konsentrasi dari ekstrak natural A.communis untuk menginvestigasi aktifitas antiviral extract tersebut. Cytotoxic effect dari ekstrak tersebut ditentukan oleh nilai 50% cytotoxic concentration (CC50) yang didapat dari cell viability (MTT) assay. Selain itu, focus assay digunakan untuk mencari nilai 50% inhibitory concentration (IC50) yang menentukan inhibitory effect.Eksperimen ini diakhiri dengan menghitung selectivity index (SI) untuk mengukur aktifitas antiviral dari ekstrak. Infeksi virus terhambat sangat efektif sebanyak 95.4% (p=0.0035) dengan perlakuan konsentrasi ekstrak tertinggi yaitu 80μg/ml. Namun, hambatan infeksi virus menurun dengan perlakuan konsentrasi ekstrak yang lebih rendah yaitu 40μg/ml, 20μg/ml, 10μg/ml dan 5μg/ml dengan inhibisi sebanyak 52.3% (p=0.0238), 12.6% (p=0.4408), 5.8% (p=0.5832) dan 2.1% (p=0.7881) secara urut. A. communis memiliki nilai IC50, CC50 dan SI yaitu 43.26μg/ml, 366.67μg/ml dan 8.48. Hasil yang didapatkan dari eksperimen ini menunjukkan bahwa pada konsentrasi yang tinggi, ekstrak natural A. communis memiliki properti antiviral terhadap virus dengue. Selain itu, ekstrak tersebut memiliki nilai CC50 yang tinggi yang menandakan level cytotoxicity yang rendah dan nilai SI yang signifikan,sehingga menunjukkan potensi yang baik sebagai agen antiviral terhadap DENV.

---

Dengue hemorrhagic fever is currently a major tropical and subtropical infection in the world with lack of approved vaccines as well as antiviral therapies to immunize and cure patients towards this disease. Up until now, supportive care is the only effective management with no promising therapeutic treatment available against dengue virus (DENV) infection, therefore development of therapeutic strategies using natural extracts have arisen. Indonesia is rich in plant varieties in which their natural extracts have the potential for antiviral drugs, for example Artocarpus communis.The aim of this study was to investigate antiviral properties present in the natural extract of A. communis against DENV infection. In the experiment, six replicates of Huh7it-1 cells were infected with DENV-2 NGC and given various concentrations of natural extracts to determine antiviral activity. The toxicity effects of the extract were determined by cell viability (MTT) assay to find 50% cytotoxic concentration (CC50). Focus assay was used to find 50% inhibitory concentration (IC50), which determined the inhibitory effect.We concluded the experiment with calculating the selectivity index (SI) to measure antiviral activity of the extract. Upon treatment with the highest extract concentration of 80μg/ml, the infection was inhibited impressively as much as 95.4% (p=0.0035). The inhibition of infection decreased with lower extract concentration of 40μg/ml, 20μg/ml, 10μg/ml and 5μg/ml as much as 52.3% (p=0.0238), 12.6% (p=0.4408), 5.8% (p=0.5832) and 2.1% (p=0.7881) respectively. The results also exemplified that A. communis has an IC50, CC50 and SI of 43.26μg/ml, 366.67μg/ml and 8.48. The results of this study indicate that the natural extract of Artocarpus communis shows some level of antiviral property towards dengue virus at high concentrations. Furthermore, it has a high CC50 value that signifies low cytotoxicity and a significant SI thus demonstrating a good potency as an antiviral agent against DENV."

"ABSTRAKSampai sekarang, belum ada rekomendasi vaksin maupun anti-viral untuk virusDengue. Menimbang besarnya masalah demam berdarah di sektor kesehatanmasyarakat di Indonesia, penemuan obat demam berdarah sangatlah diperlukan.Sulokrin, senyawa yang diisolasi dari Aspergillus terreus diketahui dapatmenghambat pertumbuhan HCV, sesama virus flaviviridae seperti virus dengue.Riset ini bertujuan untuk menginvestigasi adanya aktivitas antiviral dari senyawasulochrin sebagai obat demam berdarah yang potensial. Antiviral assay dilakukanterhadap sel huh7 yang telah diinfeksi virus dengue. Sulokrin dengan 6konsentrasi berbeda diuji cobakan untuk mengetahui nilai maksimumpenghambatan 50% sel (IC50) dengan metode Focus Assay. Efek toksisitas(CC50) diukur dengan menggunakan metode MTT Assay. Indeks selektivitasditentukan melalui ratio CC50/IC50. Aktivitas inhibisi signifikan senilai 91,78%(p=0.005) ditemukan pada konsentrasi sulokrin 80μg/ml. Ketika konsentrasisulokrin diturunkan menjadi 40μg/ml dan 20μg/ml, aktivitas inhibisi turunmenjadi 39.73% (p=0.02) dan 17.69 (p=0.09). Pada konsentrasi sulokrin 10μg/ml,aktivitas inhibisi tidak teramati (p=0.98). Peningkatan pertumbuhan virus dengueditemukan pada konsentrasi sulokrin dibawah 10μg/ml, tepatnya padakonsentrasi 5μg/ml dan 2.5μg/ml dengan nilai inhibisi -11.32% (p=0.21) dan -2.35% (p=0.38). Hasil penelitian mendapatkan nilai IC50 sebesar 56.86μg/ml,CC50 sebesar 150.85μg/ml dan SI sebesar 2.65. Sebagai kesimpulan, Aspergillusterreus (sulokrin) menunjukan kedua sifat inhibisi dan peningkatan pertumbuhan.Meskipun demikian, rendahnya nilai toksisitas ekstrak menunjukan karakteristikyang baik untuk sebuah antiviral. Eksplorasi lebih lanjut dengan derivat sulokrinperlu dilakukan untuk mengetahui aktifitas inhibisi terhadap virus dengue darisenyawa murni.

---

ABSTRACTTo date, there is no approved vaccine and anti-viral regime for Dengue fever.Considering how dengue fever poses a significant burden to Indonesian publichealth sector, discovery on therapeutic agent against DENV is imperative.Sulochrin, a compound isolated from Aspergillus terreus is known to potentlyinhibit HCV, a flaviviridae virus similar to DENV. This research aims toinvestigate the anti-viral activity of sulochrin from Aspergillus terreus as apossible cure for DENV infection. Anti-viral assay of Sulochrin is evaluated inHuh7 infected cells. 6 different concentrations of Sulochrin (80μg/ml, 40μg/ml,20μg/ml, 10μg/ml, 5μg/ml, and 2.5μg/ml) were given to measure its half maximalinhibitory concentration (IC50) using Focus Assay. Toxicity effect was measuredusing MTT Assay (CC50). Selectivity Index was determined through ratio ofCC50/IC50. Significant inhibition of 91,78% was observed upon treatment withsulochrin 80μg/ml (p=0.005). As concentration was decreased to 40μg/ml and20μg/ml, inhibition activity decreased accordingly to 39.73% (p=0.02) and 17.69(p=0.09) respectively. At treatment concentration of 10μg/ml, zero inhibition wasobserved similar to control DMSO (p=0.98). An improved in replication was seenwith treatment below 10μg/ml, with -11.32% (p=0.21) and -2.35%(p=0.38) atconcentration of 5μg/ml and 2.5μg/ml respectively. The results also showed halfmaximal inhibitory concentration of 56.86μg/ml (IC50), half toxicityconcentration of 150.85μg/ml (CC50) and Selectivity Index of 2.65. To conclude,Aspergillus terreus (sulochrin) exert both anti-viral and enhancement activity toDENV. Nonetheless, its low cytotoxic value reflects a favorable feature forpotential anti-viral. A further exploration on its derivate should be done to find thepure compound inhibition activity to DENV."

"Infeksi yang disebabkan oleh virus dengue atau juga diketahui sebagai demam berdarah, adalah masalah kesehatan yang sangat signifikan dengan adanya sebanyak 150.000 kasus per tahun. saat ini, belum ada vaksin maupun antiviral yang ada untuk mencegah maupun untuk pengelolaan penyakit. Hal-hal ini lah yang meningkatkan urgensi untuk menginvestigasi kemungkinan adanya aktifitas antiviral dalam ekstrak natural yang dapat digunakan sebagai intervensi terapeutik. Garcinia dulcis (G. dulcis) adalah tumbuhan yang berasal dari Indonesia dan negara Asia Tenggara lainnya. Tumbuhan ini diketahui memiliki aktifitas antimalarial dan antioxidan yang tinggi.Tujuan dari riset ini adalah untuk meneliti efektifitas ekstrak daun G. dulcis sebagai antiviral terhadap virus dengue (DENV). Dalam percobaan ini, DENV dengan serotype 2 NGC dan Huh-7 cell line digunakan untuk antiviral assay. Maximal inhibitory concentration (IC50), didapatkan dengan cara memberikan perlakuan dengan berbagai konsentrasi G. dulcis (80μg/ml, 40μg/ml, 20μg/ml, 10μg/ml and 5μg/ml) terhadap sel Huh-7 yang sudah diinfeksikan oleh DENV-2 NGC. Jumlah inhibisi terhadap replikasi DENV ditentukan dengan menggunakan focus assay. Dimethyl sulfoxide (DMSO), digunakan sebagai kontrol positif. Sitotoksisitas (CC50) dicari menggunakan MTT assay. Pada perlakuan dengan konsentrasi G. dulcis sebesar 80μg/ml dan 40μg/ml, DENV terhambat secara signifikan sebanyak 92.8% (p=0.01) dan 71.3% (p=0.02) secara berurutan. Selanjutnya, pada konsentrasi 20μg/ml, DENV terhambat sebesar 11.7% (p=0.83).Hasil dari percobaan ini, menunjukkan bahwa IC50, CC50, dan SI dari G. dulcis adalah sebesar 44.7μg/ml, 314.8μg/ml, dan 7.04 secara berurutan. Ekstrak daun G. dulcis menunjukkan aktivitas penghambatan yang signifikan terhadap DENV pada konsentrasi 80 μg/ml dan 40 μg/ml dan sitotoksisitas yang rendah. Rendahnya sitotoksisitas merupakan karakteristik yang menguntungkan untuk menjadi antiviral. Maka, sub-fraksi dari G. dulcis harus dicari untuk dapat menemukan senyawa murni yang dapat mennghambat replikasi DENV dengan efektif. Selain itu, investigasi lebih lanjut pada batang, kulit dan benih G. dulcis dapat dilakukan. Ekstrak natural perlu diperlajari secara ekstensif perlu dilakukan untuk menemukan antiviral yang efektif untuk menangani infeksi DENV.

---

Dengue virus (DENV) infection is a major health problem in Indonesia, with more than 150,000 cases occurring annually. Currently, no approved vaccines or antivirals are available to prevent or manage the disease. This urges the need to investigate possible antiviral activity of natural extracts to be used as therapeutic management for DENV infection. Garcinia dulcis (G. dulcis) is a plant native to Indonesia and other Southeast Asia countries; it is known to have antimalarial and high antioxidant activities.The objective of this research is to investigate the effectivity of G. dulcis leaves extract as a viable antiviral against DENV. In this study, we used DENV serotype 2 NGC and Huh-7 cells line for antiviral assay. Maximal inhibitory concentration (IC50) was determined by applying various concentrations of G. dulcis (80μg/ml, 40μg/ml, 20μg/ml, 10μg/ml and 5μg/ml) to DENV-2 NGC-infected Huh-7 cells with 6 times replication. Inhibition of DENV replication was determined by focus assay from G. dulcis treated supernatant. We used dimethyl sulfoxide (DMSO) on dengue-infected cells as positive control. The cytotoxicity (CC50) was determined by MTT assay. Upon treatment with 80μg/ml and 40μg/ml of G. dulcis extract, DENV infection was significantly inhibited as much as 92.8% (p=0.01) and 71.3% (p=0.02) respectively. At concentrations of 20μg/ml, DENV was insignificantly inhibited by 11.7% (p=0.83).The result showed, that IC50, CC50, and SI of G. dulcis extract were 44.7μg/ml, 314.8μg/ml, and 7.04, respectively. G. dulcis leaves extract showed significant inhibitory effect towards dengue virus in vitro at concentrations of 80 μg/ml and 40 μg/ml and it has low cytotoxicity. Low cytotoxicity is a characteristic that can be advantageous for an antiviral agent. Thus, sub-fractions of G. dulcis leaves needs to be done to find pure compound that effectively inhibit DENV replication. Alternatively, further investigations on stems, barks and seeds of G. dulcis can also be done. Extensive studies on natural extracts should be continued to develop an antiviral in managing DENV infection."

"Indonesia merupakan negara dengan jumlah kasus dengue terbanyak dan terparah di Asia Tenggara Studi filogenetik virus dengue DENV diperlukan sebagai dasar pengembangan struktur vaksin yang cocok Meskipun demikian data sekuens DENV masih terbatas Penelitian ini bertujuan menganalisis sekuens dan filogenetik keseluruhan gen envelope DENV 1 dibandingkan dengan domain III saja Data didapatkan dari GenBank dan Laboratorium Mikrobiologi Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia berupa whole genome DENV 1 sebanyak 30 sekuens yang diolah dengan Genetyx 5 1 Hasil analisis nukleotida gen envelope DENV 1 menunjukan strain Indonesia termasuk genotipe I dan IV Sedangkan analisis nukleotida dengan hanya domain III menunjukan adanya perbedaan cluster antar strain namun tetap dalam genotipe yang sama Dengan demikian studi filogenetik penentuan genotipe dapat dilakukan dengan hanya menggunakan domain III saja Analisis homologi asam amino domain III menunjukan epitope utama dilestarikan dan dapat menjadi landasan penting dalam pembuatan vaksin dengue berbasis domain III

---

Phylogenetic study of dengue virus DENV is required as a basis to develop a suitable structure for vaccine development Nonetheless DENV sequence data is limited This study aims to analyze and compare the sequence and phylogenetic of DENV 1 envelope gene with domain III The data is obtained from GenBank and Laboratory of Microbiology Faculty of Medicine Universitas Indonesia Thirty sequences of DENV 1 whole genome were processed using Genetyx 5 1 Analysis using DENV 1 envelope nucleotide showed that strain Indonesia has genotype I and IV Analysis using only the nucleotide of domain III showed the same genotype with difference of clusters between strains Thus phylogenetic studies determining the genotype can be done using domain III alone Homology analysis of amino acid of domain III showed that the main epitope is well reserved This finding can be an important cornerstone in the development of domain III based dengue vaccine."

"ABSTRAKPenelitian terkait karakteristik genetik sekuens virus dengue (DENV) diperlukan dalam menilai kekerabatan antara strain DENV yang tersebar di seluruh dunia. Tujuan dalam penelitian ini adalah membandingkan karakteristik genotype dan sekuens data DENV serotipe 2 (DENV-2) nukleotida envelope dibandingkan dengan sekuens data DENV-2 nukleotida Non-Struktural 1 (NS1). Data didapatkan dari Laboratorium Mikrobiologi Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia untuk strain data yang berasal dari Indonesia dan GenBank untuk strain data yang berasal dari seluruh dunia sebagai data pembanding dengan jumlah sebanyak 42 data, yang kemudian dianalisis menggunakan Genetyx 5.1. Hasil penelitian didapatkan bahwa sekuens data NS1 strain DENV-2 yang berasal dari Indonesia termasuk ke dalam kelompok genotype Cosmopolitan, serupa dengan hasil analisis data dengan sekuens data envelope strain DENV-2. Sementara pada analisis epitope LX1 yang merupakan epitope khas dari NS1, terdapat berbagai peubahan komponen asam amino pada epitope tersebut dibandingkan dengan sekuens data strain Indonesia yang tergabung ke dalam kelompok genotype Cosmopolitan. Kesimpulan dari penelitian ini adalah bahwa filogenetik dengan menggunakan NS1 sebagai bahan analisis dapat digunakan untuk menentukan genotipe. Sehingga gen NS1 pada DENV-2 strain Indonesia masih dapat dipertimbangkan sebagai salah satu dasar metode pengembangan vaksin.

---

ABSTRACTStudies about genetic characteristic between dengue virus serotype 2 (DENV-2) sequence data is needed to determine its relationship between DENV strain over the world. The main purpose of this study is to compare between characteristic of sequence data DENV-2 envelope nucleotide and sequence data DENV-2 Non- Structural 1 (NS1) nucleotide, and analyze between amino acid homology in this study and related previous studies. 42 data used for this study are obtained from Laboratory of Microbiology Faculty of Medicine University of Indonesia for data from Indonesia and form GenBank for data from other countries as a comparison, which is analyzed with software Genetyx 5.1. NS1 sequence data from DENV-2 strain from Indonesia is classified in Cosmpolitan genotype group, which are similar than data analysis from envelope sequence data from same data. Meanwhile in analysis of LX1 epitope, which is considered as typical epitope from NS1, there are any differences in amino acid component at it compared than strain Indonesia data sequences which are included in Cosmopolitan genotype group. As a conclusion, phylogenetic analysis of NS1 nucleotide is useful for determining the genotypes, which means NS1 DENV-2 gene strain Indonesia can be useful as the basis for vaccine development"

"ABSTRAKDemam berdarah dengue masih terus menjadi penyakit yang mengakibatkan morbiditas dan mortalitas terutama di negara berkembang. Jumlah infeksi di seluruh dunia sendiri mencapai 50 juta hingga 200 juta dengan 75% infeksi berada di asia tenggara. Indonesia sendiri mengalami peningkatan tren infeksi dengue sejak tahun 1998. Pengobatan antiviral terhadap demam berdarah masih belum ditemukan hingga saat ini meskipun infeksi terus meningkat. Penelitian ini bertujuan untuk meneliti efek dari A. communis terhadap replikasi virus dengue. Uji antiviral in vitro dilakukan dengan menggunakan sel yang diinfeksi dengan virus dengue serotipe 2 strain new guinea C (DENV-2 NGC). Pada plate dengan 48 sumur ditumbuhkan sel sebanyak 5 x 104 sel/sumur, setelah 24 jam sel diinfeksikan dengan DENV-2 NGC yang telah diberi perlakuan ekstrak A. communis dengan konsentrasi 40 ,20 ,10 ,5 , 2,5 dan 1,25 ug/mL. Sebagai kontrol perlakuan digunakan DENV-2 NGC yang diberikan DMSO tanpa ekstrak. Titer virus nantinya dihitung menggunakan metode focus assay sedangkan toksisitas diukur dengan metode MTT. Dari hasil penelitian yang dilakukan didapatkan kadar CC50 dari A. communis adalah 379,84 dengan kadar IC50 adalah 26,7, dan didapatkan Selectivity Index 379,84/26,7=14,2. Dari pemeriksaan kemaknaan konsentrasi dengan menggunakan kruskal wallis didapatkan adanya perbedaan bermakna pada masing-masing konsentrasi terhadap inhibisi virus dengue

---

ABSTRACTDengue fever is disease that have high level of morbidity and mortality, especially in developing countries. The prevalence of infection worldwide is about 50 million to 200 million cases, 75% of them occur in south east asian. In indonesia there’s an increasing pattern of dengue virus infection since 1998 until now. However there isnt any antiviral therapy for dengue fever. This research conducted to know the effect of A. communis on replication of dengue virus. Antiviral in-vitro test is done using cell that is infected with new guinea strain dengue virus serotype 2 (DENV-2 NGC). On plate with 48 well, the cell is grown to the amount of 5x104 cell/well, after 24 hours the cell will be infected using DENV-2 NGC and given A. communis extract with concentration of 40 ug/ml, 20 ug/ml, 10 ug/ml, 5 ug/ml, 2,5 ug/ml, and 1,25 ug/ml. As control we use DENV-2 NGC that is given DMSO without extract. The virus titre is counted using focus assay and toxicity using MTT. Result from research is CC50 of A. communis is 379,84 and IC50 is 26,7, with selectivity index 14,2. From kruskal wallis test there is significant difference between each concentration."