Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

Abstrak :
Metilasi DNA merupakan perubahan epigenetik yang umum terjadi sebagai penyebab inaktivasi gen pada tumor suppressor genes (TSGs). Metilasi pada promoter TSG memiliki asosiasi dengan pembentukan kanker tiroid. Metode methylation-specific multiplex ligation dependent-probe amplification (MS-MLPA) merupakan salah satu metode berbasis PCR yang dapat melakukan identifikasi metilasi pada beberapa gen dan analisis copy number variant secara simultan. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengoptimasi metode MS-MLPA dan mengidentifikasi metilasi TSG pada kanker tiroid dengan metode MS-MLPA. Sebanyak 40 sampel fine needle aspiration biopsy (FNAB) dikumpulkan secara retrospektif di Rumah Sakit Kanker Dharmais. Sampel FNAB berasal dari pasien yang memiliki kelainan nodul tiroid. Metilasi TSG dianalisis dengan metode MS-MLPA menggunakan probemix Tumour Suppressor Mix 1 ME001-C2 (MRC-Holland). Sampel FNAB dibandingkan dengan reference sample berupa sampel darah yang berasal dari individu sehat. Penelitian ini berhasil mengoptimasi metode MS-MLPA dan mendeteksi metilasi pada 4 jenis tumor suppressor genes, yaitu gen RASSF1A, gen CASP8, gen FHIT, dan gen CHFR. Hasil identifikasi menunjukkan bahwa terdapat 20 sampel tumor ganas dan 2 sampel tumor jinak mengalami metilasi. ......DNA methylation is a common epigenetic change that causes gene inactivation in tumor suppressor genes (TSGs). TSGpromoter methylation has an association with the formation of thyroid cancer. Methylation-specific multiplex ligation-dependent probe amplification (MS-MLPA) is a PCR-based method that can identify methylation in several genes and copy number variant simultaneously. The aim of this study is to optimize methylation-specific multiplex ligation-dependent probe amplification (MS-MLPA) and to identify tumor suppressor genes methylation of thyroid cancer using MS-MLPA. Retrospectively 40 Fine Needle Aspiration Biopsy samples were collected in Dharmais Cancer Hospital. FNAB samples were collected from patients with thyroid nodules abnormalities. Tumor suppressor genes methylation were analyzed using Tumour Suppressor Mix 1 ME001-C2 probemix (MRC-Holland) as MS-MLPA reagents. FNAB samples were compared with reference sample from blood that were collected from healthy people. This study has successfully optimizing MS-MLPA method and detecting 4 methylated tumor suppressor genes, RASSF1A, CAPS8, FHIT and CHFR. Methylation identification shows 20 malignant histopathology samples and 2 benign histopathology samples were methylated.

Abstrak :
Latar belakang: Resistensi klopidogrel merupakan salah satu faktor risiko penting terjadinya kejadian iskemik berulang pada pasien yang telah mendapat terapi anti platelet yang optimal. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui peran metilasi DNA gen CYP2C19 sebagai salah satu faktor epigenetik terhadap kejadian resistensi klopidogrel pada pasien infark miokard akut dengan elevasi segmen ST (IMA-EST) yang menjalani intervensi koroner perkutan primer (IKPP). Metode: Pasien IMA-EST yang menjalani IKPP diberikan antiplatelet klopidogrel dan menjalani pemeriksaan fungsi platelet degan VerifyNowTM. Kriteria untuk mendefinisikan resistensi klopidogrel adalah nilai PRU >208. Pemeriksaan metilasi DNA gen CYP2C19 dilakukan dengan metode bisulfite genomic sequencing technology. Data klinis, laboratorium, dan angiografik termasuk TIMI flow dikumpulkan untuk dilakukan analisis. Hasil: Dari 122 subjek, resistensi klopidogrel ditemukan pada 22% subjek. Kelompok dengan presentase metilasi DNA <50% mempunyai risiko lebih tinggi terjadinya resistensi klopidogrel (OR 4.5 IK95% 2.1-9.3, nilai p 0.018). Grup ini juga diketahui mempunyai TIMI flow post-IKPP yang suboptimal (OR 3.4 IK95% 1.3 - 8.7, nilai p 0.045). Kesimpulan: Hipometilasi DNA gen CYP2C19 meningkatkan risiko terjadinya resistensi klopidogrel dan luaran klinis yang lebih buruk. ......Background: Clopidogrel resistance is an important risk factor of recurrence of ischemic event after optimal antiplatelet therapy. We aimed to investigate the role of DNA methylation of CYP2C19 gene as one of epigenetic factor to the risk of clopidogrel resistance in ST-segment elevation myocardial infarction (STEMI) patients undergoing primary percutaneous coronary intervention (PPCI). Methods: STEMI patients undergoing PPCI were pretreated with clopidogrel, and their platelet function was measured using VerifyNowTM assay. The criteria for high on- treatment platelet reactivity (HPR) was defined according to the expert consensus criteria (PRU >208). DNA methylation of the CYP2C19 gene was performed using bisulfite genomic sequencing technology. Furthermore, clinical, laboratory and angiographic data including TIMI flow were collected. Result: Among 122 patients, clopidogrel resistance was found in 22% patients. After dividing into two groups, methylation <50% was associated with increased risk of clopidogrel resistance (OR 4.5 95%CI 2.1-9.3, P value 0.018). This group also found to have suboptimal post-PCI TIMI flow (OR 3.4 95%CI 1.3 - 8.7, P value 0.045). Conclusions: The lower DNA methylation level of the CYP2C19 gene increases the risk of clopidogrel resistance and subsequent poorer clinical outcome.