Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

Hasil Pencarian

Ditemukan 62759 dokumen yang sesuai dengan query
cover
Ghani Deori
"SARS-COV-2 merupakan jenis virus yang menyebabkan pandemi COVID-19. Pandemi COVID-19 pertama kali terdeteksi di Wuhan, Cina. Berdasarkan data World Health Organization (WHO), jumlah orang yang telah terpapar COVID-19 adalah 123.216.178 orang dan 2.714.517 orang meninggal akibat COVID-19 berdasarkan data www.who.int pada tanggal 23 Maret 2021. Pada skripsi ini, dilakukan klasifikasi untuk SARS-COV-2 dengan menggunakan sekuens protein dari SARS-COV-2. Sekuens protein SARS-COV- 2 di ekstraksi fitur dengan menggunakan package discere dari Python. Package discere akan menghasilkan 27 fitur, dimana fitur-fitur diseleksi dengan menggunakan metode LASSO (Least Absolute Shrinkage and Selection Operator). Setelah dilakukan seleksi fitur, dilakukan klasifikasi dengan menggunakan dua metode, yaitu metode Absolute Correlation Weighted Naïve Bayes dan metode Naïve Bayes. Rata-rata akurasi, sensitifitas, dan spesifisitas tertinggi untuk metode Absolute Correlation Weighted Naïve Bayes berturut-turut adalah 81,85%, 74,81%, dan 89,19%, sedangkan rata-rata akurasi, sensitifitas, dan spesifisitas tertinggi untuk metode Naïve Bayes berturut-turut adalah 81,44%, 74,58%, dan 88,24%. Terlihat bahwa metode Absolute Correlation Weighted Naïve Bayes mempunyai rata-rata akurasi, sensitifitas, dan spesifisitas yang lebih tinggi dibandingkan dengan metode Naïve Bayes.

SARS-COV-2 is the type of virus that causes the COVID-19 pandemic. The COVID-19 pandemic was first detected in Wuhan, China. Based on data from the World Health Organization (WHO), the number of people who have been exposed to COVID-19 is 123,216,178 people and 2,714,517 people died from COVID-19 based on data from www.who.int on March 23, 2021. In this paper, the SARS-COV-2 classification is done by using the protein sequence of SARS-COV-2. The SARS-COV-2 protein sequence will be feature extraction using the discere package from Python. The discere package will produce 27 features, where the features are selected using the LASSO (Least Absolute Shrinkage and Selection Operator) method. After feature selection, classification is carried out using two methods, namely the Absolute Correlation Weighted Naïve Bayes method and the Naïve Bayes method. The highest average accuracy, sensitivity, and specificity for the Absolute Correlation Weighted Naïve Bayes method are 81.85%, 74.81%, and 89.19%, respectively, whereas the highest average accuracy, sensitivity, and specificity for the Naïve Bayes method are 81.44%, 74.58%, and 88.24%, respectively. It can be seen that the Absolute Correlation Weighted Naïve Bayes method has a higher average accuracy, sensitivity, and specificity than the Naïve Bayes method."
Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2021
S-pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Dian Puspita Sari
"Coronavirus yaitu kelompok virus yang menginfeksi sistem pernapasan yang dapat menyebabkan infeksi pernapasan ringan maupun berat. Salah satu virus yang termasuk ke dalam coronavirus adalah SARS-CoV-2. Penyakit yang disebabkan oleh virus SARS-CoV-2 disebut COVID-19. COVID-19 pertama kali terdeteksi pada tahun 2019 di Wuhan, China. Penyebaran COVID-19 sangat cepat dengan tingkat kematian yang tinggi terus terjadi di berbagai negara sehingga penyakit ini berstatus pandemi. Skripsi ini menyelesaikan masalah klasifikasi virus SARS-CoV-2 dengan menggunakan data sekuens protein coronavirus. Seleksi fitur pada data sekuens protein coronavirus menggunakan metode seleksi fitur Random Forest-Recurisive Feature Elimination (RF-RFE). Setelah dilakukan seleksi fitur, dilakukan klasifikasi menggunakan pendekatan machine learning dengan metode Support Vector Machine (SVM) dan Particle Swarm Optimization-Support Vector Machine (PSO-SVM). Hasil terbaik performa rata-rata akurasi, spesifisitas, dan sensitivitas untuk metode SVM berturut-turut adalah 93,43%, 98,06%, dan 88,84% pada data pelatihan sebesar 80%. Untuk metode PSO-SVM, hasil terbaik rata-rata akurasi dan spesifisitas adalah 98,48% dan 98,57% pada data pelatihan sebesar 80%, sedangkan hasil terbaik rata-rata sensitivitas adalah 98,96% pada data pelatihan sebesar 90%. Oleh karena itu, pada penelitian ini dapat disimpulkan bahwa metode PSO-SVM menghasilkan performa yang lebih baik dibandingkan dengan metode SVM.

Coronaviruses are a group of viruses that infect the respiratory system that can cause mild or severe respiratory infections. One of the viruses that belongs to the coronavirus is SARS-CoV-2. The disease caused by the SARS-CoV-2 virus is called COVID-19. COVID-19 was first detected in 2019 in Wuhan, China. The spread of COVID-19 is very fast with a high mortality rate that continues to occur in various countries so that this disease has a pandemic status. This thesis solves the problem of classifying the SARS-CoV-2 virus using coronavirus protein sequence data. Feature selection on coronavirus protein sequence data used the Random Forest-Recursive Feature Elimination (RF-RFE) feature selection method. After feature selection, classification is carried out using a machine learning approach with the Support Vector Machine (SVM) and Particle Swarm Optimization-Support Vector Machine (PSO-SVM) methods. The best results of the average performance of accuracy, specificity, and sensitivity for the SVM method are 93.43%, 98.06%, and 88.84%, respectively, for training data of 80%. For the PSO-SVM method, the best results on average accuracy and specificity are 98.48% and 98.57% on training data of 80%, while the best results on average sensitivity are 98.96% on training data of 90%. Therefore, in this study it can be concluded that the PSO-SVM method produces better performance than the SVM method."
Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2021
S-pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Situmeang, Jason Nimrod Joshua
"

Penelitian ini bertujuan untuk melakukan pengelompokan varian virus SARS-CoV-2 melalui proses clustering menggunakan metode unsupervised learning. Data yang digunakan adalah sekuens protein SARS-CoV-2 yang diekstraksi fiturnya menggunakan paket Discere dalam bahasa pemrograman Python. Sebanyak 27 fitur dihasilkan dan diseleksi dengan metode seleksi fitur Least Absolute Shrinkage and Selection Operator (LASSO). Metode Elbow digunakan untuk menentukan jumlah cluster yang optimal. Dalam penelitian ini, digunakan metode clustering K-Means dan Balanced Iterative Reducing and Clustering using Hierarchies (BIRCH). Evaluasi hasil clustering dilakukan menggunakan metrik evaluasi Silhouette Score dan Davies-Bouldin Index, serta memperhatikan waktu runtime untuk setiap simulasi. Hasil evaluasi kemudian dibandingkan untuk melihat perbedaan performa antara kedua metode clustering yang digunakan, serta pengaruh seleksi fitur terhadap performa clustering. Hasil terbaik diperoleh pada simulasi dengan metode clustering BIRCH + LASSO, dengan nilai Silhouette Score 0,74186 untuk jumlah cluster k=4 dan 0,73207 untuk k=5. Nilai Davies-Bouldin Index terbaik juga diperoleh pada simulasi tersebut, yaitu 0,42697 untuk k=4 dan 0,37949 untuk k=5. Waktu runtime terbaik tercatat pada simulasi dengan metode K-Means + LASSO, yaitu 0,21551 detik untuk k=4 dan 0,17539 detik untuk k=5. Dapat disimpulkan bahwa metode BIRCH menghasilkan cluster yang lebih baik berdasarkan metrik evaluasi, namun K-Means memberikan proses clustering yang lebih cepat. Seleksi fitur dengan metode LASSO juga membantu meningkatkan performa clustering.


This study aims to perform clustering of SARS-CoV-2 virus variants using unsupervised learning methods. The data used consists of SARS-CoV-2 protein sequences whose features are extracted using the Discere package in the Python programming language. A total of 27 features are generated and selected using the Least Absolute Shrinkage and Selection Operator (LASSO) feature selection method. The Elbow method is employed to determine the optimal number of clusters for the clustering process. The clustering methods used in this research are K-Means clustering and Balanced Iterative Reducing and Clustering using Hierarchies (BIRCH). The clustering results are evaluated using the Silhouette Score and Davies-Bouldin Index metrics, while also considering the runtime for each simulation. The evaluation results are then compared to examine the performance differences between the two clustering methods and the impact of feature selection on clustering performance. The best Silhouette Score is obtained in the simulation using the BIRCH + LASSO clustering method, with a value of 0.74186 for k=4 and 0.73207 for k=5. The best Davies-Bouldin Index is also achieved in the same simulation, with values of 0.42697 for k=4 and 0.37949 for k=5. The fastest runtime is recorded in the simulation using the K-Means + LASSO method, with a time of 0.21551 seconds for k=4 and 0.17539 seconds for k=5. In conclusion, the BIRCH method yields better clustering results based on the evaluation metrics, while K-Means provides faster clustering processes. The LASSO feature selection method also aids in improving clustering performance.

"
Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2022
S-pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Febiola Damayanti
"Pandemi COVID-19 (coronavirus disease 2019) membuat para peneliti di seluruh dunia bekerja untuk memahaminya dengan menerapkan pendekatan machine learning. Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) merupakan penyebab dari COVID-19. Penelitian ini membahas klasifikaasi sekuens protein SARS-CoV-2 menggunakan metode LightGBM dan Elastic Net. Metode LightGBM merupakan metode gradient boosting yang cepat dan memiliki high-performance berbasis decision tree untuk melakukan prediksi. Total data sekuens protein yang digunakan adalah 2000 data yang diambil dari situs Uniprot. Uniprot merupakan salah satu situs yang digunakan terkait bioinformatika atau sumber daya sekuens protein dan informasi fungsional yang memiliki kualitas tinggi, komprehensif dan dapat diakses secara bebas. Data tersebut memiliki perincian yaitu 1000 data sekuens protein SARS-CoV-2 dan 1000 data sekuens protein bukan SARS-CoV-2. Python package Discere digunakan untuk mengekstraksi 27 fitur sekuens protein. Selanjutnya, Elastic Net digunakan untuk memilih fitur-fitur yang optimal dan terpilih sebanyak 10 fitur. Terakhir, LightGBM digunakan sebagai metode klasifikasi sekuens protein SARS-CoV-2. Hasil evaluasi performa LightGBM diukur dari akurasi, sensitivitas, dan spesifisitas. Nilai rata-rata akurasi diperoleh 98,87%, nilai rata-rata sensitivitas diperoleh 99,02%, dan nilai rata-rata spesifisitas diperoleh 98,82%

The COVID-19 (coronavirus disease 2019) pandemic has researchers around the world working to understand it by applying a machine-learning approach. Secere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-Cov-2) is the cause of COVID-19. This research discusses the classification of SARS-Cov-2 protein sequences using the LightGBM and Elastic Net methods. The LightGBM method is a gradient-boosting method that fast and has a high-performance decision tree based for making predictions. The total protein sequence data used is 2000 data taken from UniProt site. UniProt is one of the sites used for bioinformatics or protein sequence resources and functional information which is of high quality, comprehensive and freely accesible. The data has details, namely 1000 protein sequence data for SARS-CoV-2 and 1000 protein sequnce data for non-SARS-CoV-2. Python package Dsiscere is used to extraxt 27 protein sequence features. Futhermore, Elastic Net is used to select optimal features and 10 features are selected. While LightGBM is used as a classification method for SARS-Cov-2 protein sequences. The results of the LightGBM performance evaluation are measured by accuracy, sensitivity, and specificity. The average value for accuracy was 98,87%, the average value for sensitivity was 99,02%, and average value for specificity was 98,82%."
Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2021
S-pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Mufarrido Husnah
"Coronavirus (CoV) adalah keluarga virus penyebab penyakit sistem pernapasan ringan hingga berat pada berbagai spesies hewan termasuk manusia. Salah satu spesies Coronavirus yang muncul pada akhir tahun 2019 yaitu SARS-CoV-2 (Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2) dan menimbulkan penyakit baru bernama Covid-19 (Coronavirus disease-2019) kemudian berstatus pandemi. Penyebaran Covid-19 yang cepat dan dengan tingkat kematian yang tinggi terus terjadi di berbagai negara. Oleh karena itu, deteksi dini patogen perlu dilakukan secara cepat dengan menggunakan data sekuens protein Coronavirus. Sekuens protein merupakan data struktur primer dari suatu protein yang memiliki 27 fitur berdasarkan discere. Dalam penerapannya, tidak semua fitur relevan dengan data yang digunakan sehingga perlu seleksi fitur untuk menghindari dimensi data yang tinggi dan tidak optimal. Seleksi fitur algoritma genetika memberikan fitur-fitur optimal pada data dan metode K-Nearest Neighbor (KNN) melakukan klasifikasi data sekuens protein Coronavirus dengan fitur hasil seleksi fitur algoritma genetika. Seleksi fitur algoritma genetika menghasilkan 11 fitur optimal yang meningkatkan performa running time metode klasifikasi KNN menjadi 0,0541 detik. Fitur optimal diperoleh dari karakteristik AA-count , secondary structure fraction , isoelectric point dan instability index. Hasil terbaik performa akurasi, spesifisitas beserta sensitifitas secara berurutan yaitu 96,68%, 98,7% dan 94,4% yang diperoleh pada nilai parameter K=3.

Coronaviruses (CoV) are a family of viruses that cause mild to severe respiratory system diseases in various animal species including humans. One of the Coronavirus species that emerged at the end of 2019 was SARS-CoV-2 (Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2) and caused a new disease called Covid-19 (Coronavirus disease-2019) then had a pandemic status. The rapid spread of Covid-19 and with a high death rate continues to occur in most of countries. Therefore, early detection of pathogens needs to be done quickly using Coronavirus protein sequence data. Protein sequences are primary structural data of a protein that has 27 features but not all of the existing features are relevant to the data used, so feature selection is necessary to avoid high and suboptimal data dimensions. The genetic algorithm feature selection provides optimal features to the data and the K-Nearest Neighbor (KNN) method performs the classification of Coronavirus protein sequences data with features resulting from the genetic algorithm feature selection. The genetic algorithm feature selection produces 11 optimal features that improve the running time performance of the KNN classification method. The average result of running time is 0.0541 second. The best results were accuracy performance, specificity and sensitivity are 96.68%, 98.7% and 94.4% respectively which were obtained at the parameter value K=3."
Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2021
S-pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Dhita Putri Pratama
"COVID-19 telah merenggut nyawa banyak manusia. Tercatat per tanggal 29 Juni 2021, sudah terdapat sekitar 3,923,238 pasien yang meninggal dunia akibat penyakit dengan tingkat penularan yang tinggi ini. Dengan semakin banyaknya orang yang terinfeksi COVID-19, persediaan alat untuk mendeteksi penyakit ini pun juga semakin terbatas yang dapat menyebabkan pandemi COVID-19 pun menjadi semakin tidak terkendali. Oleh karena itu, penting untuk mempertimbangkan metode deteksi COVID-19 lainnya yang dapat membantu para staf kesehatan untuk melakukan deteksi pasien positif COVID-19.
Metode deteksi COVID-19 lainnya yang bisa dipertimbangkan untuk dikembangkan adalah metode deteksi COVID-19 dengan artificial intelligence. Dengan metode tersebut, data-data seperti data gejala pasien, data citra toraks, serta data interpretasi citra berupa teks dapat dimanfaatkan untuk mengembangkan suatu model prediksi COVID-19. Ketiga tipe data yang berbeda tersebut dapat dikombinasikan sebagai data input untuk membangun suatu model klasifikasi COVID-19. Pengkombinasian data yang berbeda dapat dilakukan dengan cara melakukan konkatenasi pada tiap input layer yang menerima data gejala dan data teks dengan suatu layer dari arsitektur CNN. Beberapa arsitektur CNN yang dapat digunakan pada penelitian ini adalah ResNet, DenseNet, Inception-ResNet, DarkCovidNet, CoroNet, dan COVID-Net. Selain itu, metode Grad-CAM juga dipilih untuk proses deteksi persebaran coronavirus.
Hasil pengujian menunjukkan bahwa banyak model yang dihasilkan dari pendekatan kombinasi data gambar, data tabular, dan data teks memiliki nilai sensitivitas, akurasi, serta f1-score yang tinggi. Hal tersebut menunjukkan bahwa pendekatan tersebut secara umum menghasilkan model-model dengan performa yang tinggi juga seimbang. Namun, berdasarkan hasil pengujian pula, diketahui bahwa model yang memiliki performa tertinggi dicapai oleh model dari pendekatan klasifikasi gambar dengan data tabular yang menggunakan arsitektur DenseNet khususnya dengan nilai learning rate = 10-3. Model tersebut tercatat memiliki performa yang tinggi dan seimbang dengan nilai sensitivitasnya mencapai angka 1,00, akurasi mencapai angka 0,94, dan F1-Score mencapai angka 0,94.

COVID-19 has taken the lives of many people. As of June 29th 2021, there were approximately 3.923.238 deaths due to this highly contagious disease. With the increasing number of infected people, the COVID-19 detection tool supplies are also getting limited that can lead to an out-of-control situation. Therefore, it is quite necessary to consider alternative methods for COVID-19 detection.
Another COVID-19 detection that can be considered to be developed is a COVID-19 detection method with artificial intelligence. With artificial intelligence, a COVID-19 prediction model can be built by using any available data such as patient symptom dataset, patient thorax images especially chest X-Ray, and thorax interpretations in text form. Those three types of data can be utilized and combined as data input to build a COVID-19 detection system. The combination of those three different types of data can be done with the concatenation of each input layer of tabular and text data with a layer from a CNN architecture. In this study, there are six CNN architectures used and those are ResNet, DenseNet, Inception-ResNet, DarkCovidNet, CoroNet, and COVID-Net. Besides, the Grad-CAM technique is also implemented for coronavirus detection purposes.
The result shows that most of the models from the combined image, tabular, and text datasets offer high sensitivities, accuracies, and scores of F1-Score. It means that the combined image, tabular, and text datasets generally obtained high performance and balanced models. However, according to the test results, the best performance model is achieved by the combined image and tabular datasets approach with DenseNet architecture and the learning rate of \(10^{-3}\). Such a model achieves the best performance model with an accuracy score of 0.94, a sensitivity score of 1.00, and an f1-score of 0.94.
"
Depok: Fakultas Ilmu Komputer Universitas Indonesia, 2021
S-pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Dhita Putri Pratama
"COVID-19 telah merenggut nyawa banyak manusia. Tercatat per tanggal 29 Juni 2021, sudah terdapat sekitar 3,923,238 pasien yang meninggal dunia akibat penyakit dengan tingkat penularan yang tinggi ini. Dengan semakin banyaknya orang yang terinfeksi COVID-19, persediaan alat untuk mendeteksi penyakit ini pun juga semakin terbatas yang dapat menyebabkan pandemi COVID-19 pun menjadi semakin tidak terkendali. Oleh karena itu, penting untuk mempertimbangkan metode deteksi COVID-19 lainnya yang dapat membantu para staf kesehatan untuk melakukan deteksi pasien positif COVID-19.
Metode deteksi COVID-19 lainnya yang bisa dipertimbangkan untuk dikembangkan adalah metode deteksi COVID-19 dengan artificial intelligence. Dengan metode tersebut, data-data seperti data gejala pasien, data citra toraks, serta data interpretasi citra berupa teks dapat dimanfaatkan untuk mengembangkan suatu model prediksi COVID- 19. Ketiga tipe data yang berbeda tersebut dapat dikombinasikan sebagai data input untuk membangun suatu model klasifikasi COVID-19. Pengkombinasian data yang berbeda dapat dilakukan dengan cara melakukan konkatenasi pada tiap input layer yang menerima data gejala dan data teks dengan suatu layer dari arsitektur CNN. Beberapa arsitektur CNN yang dapat digunakan pada penelitian ini adalah ResNet, DenseNet, Inception- ResNet, DarkCovidNet, CoroNet, dan COVID-Net. Selain itu, metode Grad-CAM juga dipilih untuk proses deteksi persebaran coronavirus.
Hasil pengujian menunjukkan bahwa banyak model yang dihasilkan dari pendekatan kombinasi data gambar, data tabular, dan data teks memiliki nilai sensitivitas, akurasi, serta f1-score yang tinggi. Hal tersebut menunjukkan bahwa pendekatan tersebut secara umum menghasilkan model-model dengan performa yang tinggi juga seimbang. Namun, berdasarkan hasil pengujian pula, diketahui bahwa model yang memiliki performa tertinggi dicapai oleh model dari pendekatan klasifikasi gambar dengan data tabular yang menggunakan arsitektur DenseNet khususnya dengan nilai learning rate = 10−3. Model tersebut tercatat memiliki performa yang tinggi dan seimbang dengan nilai sensitivitasnya mencapai angka 1,00, akurasi mencapai angka 0,94, dan F1-Score mencapai angka 0,94.

COVID-19 has taken the lives of many people. As of June 29th 2021, there were approximately 3.923.238 deaths due to this highly contagious disease. With the increasing number of infected people, the COVID-19 detection tool supplies are also getting limited that can lead to an out-of-control situation. Therefore, it is quite necessary to consider alternative methods for COVID-19 detection.
Another COVID-19 detection that can be considered to be developed is a COVID- 19 detection method with artificial intelligence. With artificial intelligence, a COVID-19 prediction model can be built by using any available data such as patient symptom dataset, patient thorax images especially chest X-Ray, and thorax interpretations in text form. Those three types of data can be utilized and combined as data input to build a COVID-19 detection system. The combination of those three different types of data can be done with the concatenation of each input layer of tabular and text data with a layer from a CNN architecture. In this study, there are six CNN architectures used and those are ResNet, DenseNet, Inception-ResNet, DarkCovidNet, CoroNet, and COVID-Net. Besides, the Grad-CAM technique is also implemented for coronavirus detection purposes.
The result shows that most of the models from the combined image, tabular, and text datasets offer high sensitivities, accuracies, and scores of F1-Score. It means that the combined image, tabular, and text datasets generally obtained high performance and balanced models. However, according to the test results, the best performance model is achieved by the combined image and tabular datasets approach with DenseNet architecture and the learning rate of 10−3. Such a model achieves the best performance model with an accuracy score of 0.94, a sensitivity score of 1.00, and an f1-score of 0.94.
"
Depok: Fakultas Ilmu Komputer Universitas Indonesia, 2021
S-pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Terry Argyadiva
"Corona Virus Disease atau COVID-19 merupakan sebuah wabah yang ditemukan pada akhir tahun 2019 di provinsi Wuhan, China, yang kemudian menyebar ke seluruh dunia. Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) kemudian digunakan sebagai metode diagnosa COVID-19. Namun metode RT-PCR memerlukan waktu yang lama dalam proses diagnosa sehingga American College of Radiography (ACR) merekomendasi penggunaan alat radiografi seperti Computed Tomography Scan (CT- Scan) dan X-ray sebagai metode tambahan dalam mendiagnosa COVID-19. X-ray kemudian dipilih sebagai metode tambahan dalam mendiagnosa COVID-19 karena alat yang digunakan lebih fleksibel dan sudah tersebar luas di berbagai klinik kesehatan. Pada penelitian ini, penulis menggunakan pendekatan neural network yaitu Convolutional Neural Network (CNN) untuk metode Deep Feature Extraction dan metode klasifikasi klasik dalam membuat model yang dapat mengklasifikasi paru-paru normal, terjangkit COVID-19, dan pneumonia berdasarkan data citra X-ray. Arsitektur CNN yang digunakan dalam penelitian ini adalah ResNet-50 dan metode klasifikasi klasik yang digunakan adalah Support Vector Machine (SVM), Random forest, K-Nearest Neighbor (KNN), dan Extreme Gradient Boosting (XGBoost). Dataset yang digunakan dalam penelitian ini adalah COVID-19 Image Data Collection oleh J. P. Cohen, ChestX-Ray8 Dataset oleh National Institute of Health, dan Chest X-ray Dataset oleh Mendeley Data. Selanjutnya, model dilatih menggunakan ResNet-50 untuk proses ekstraksi fitur dari fully connected layer. Kemudian, vektor fitur dari fully connected layer diklasifikasi menggunakan metode klasifikasi klasik SVM, Random forest, KNN, dan XGBoost. Berdasarkan hasil simulasi, diketahui akurasi terbaik didapatkan oleh kombinasi antara ResNet-50 dan SVM dengan 94,22%. Recall terbaik didapatkan oleh kombinasi antara ResNet-50 dan KNN dengan 94%. Precision terbaik didapatkan oleh ResNet-50 dengan 94,36%. Running time terbaik didapatkan oleh ResNet-50 dengan 0,0006 detik.

Corona Virus Disease or COVID-19 is an outbreak that was discovered at the end of 2019 in the province of Wuhan, China, which then spread throughout the world. Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) was then used as a method of diagnosing COVID-19. However, the RT-PCR method requires a long time in the diagnostic process so the American College of Radiography (ACR) recommends the use of radiographic tools such as Computed Tomography Scan (CT-Scan) and X-ray as additional methods in diagnosing COVID-19. X-ray was then chosen as an additional method in diagnosing COVID-19 because the tool used is more flexible and is already widespread in various health clinics. In this study, the author uses a neural network approach, namely the Convolutional Neural Network (CNN) for the Deep Feature Extraction method and the Machine Learning approach for the classification method in making a model that can classify normal lungs, infected with COVID-19, and pneumonia based on X-ray image. The CNN architecture used in this study is ResNet-50 and the Classifier used is Support Vector Machine (SVM), Random forest, K-Nearest Neighbor (KNN), and Extreme Gradient Boosting (XGBoost). The datasets used in this study were the COVID-19 Image Data Collection by J. P. Cohen, the ChestX-Ray8 Dataset by the National Institute of Health, and the Chest X-ray Dataset by Mendeley Data. The model was then trained using the CNN method with the ResNet-50 architecture. Furthermore, the fully connected layer in the ResNet-50 architecture was replaced using the SVM, Random forest, KNN, and XGBoost classifiers. Based on the simulation results, the best accuracy is obtained by combination of ResNet-50 and SVM with 94.22%. The best recall was obtained by a combination of ResNet-50 and KNN with 94%. The best precision was obtained by ResNet-50 with 94.36%. The best running time was obtained by ResNet-50 with 0.0006 seconds."
Depok: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Indonesia, 2021
S-pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Devina Itsnia Rizka
"ABSTRAK
Kanker serviks merupakan salah satu jenis kanker yang berbahaya. Berdasarkan data dari Departemen Kesehatan Republik Indonesia Depkes RI , kanker serviks merupakan salah satu penyakit kanker dengan prevelensi tertinggi sebesar 0.8 di Indonesia. Maka dari itu diperlukan tindakan pendeteksian dini dengan menggunakan microarray dataset. Microarray dataset mempunyai jumlah fitur yang banyak tetapi tidak semua fitur yang ada relevan dengan data yang digunakan. Oleh karena itu, perlu dilakukan pemilihan fitur untuk meningkatkan akurasi. Pemilihan fitur yang digunakan adalah Artificial Bee Colony ABC . Setelah dilakukan pemilihan fitur, akan dilakukan klasifikasi menggunakan metode klasifikasi Na ve Bayes. Hasilnya, didapatkan akurasi terbaik klasifikasi Na ve Bayes tanpa pemilihan fitur adalah 60 pada saat data training 90 dan untuk klasifikasi Na ve Bayes dengan menggunkan pemilihan fitur Artificial Bee Colony didapatkan akurasi tertinggi adalah 93.33333 . dengan fitur sebanyak 50 dan data training 90
.
ABSTRACT
Cervical cancer is one of the most dangerous cancer. Based on data from Departemen Kesehatan Republik Indonesia Depkes RI , cervical cancer is one of the diseases with the highest prevalence of 0.8 in Indonesia. Therefore, early detection action is needed with using microarray dataset. Microarray datasets have a large number of features but not all features are relevant to the data is used. Therefore, feature selection is needed to improve the accuracy. The feature selection that used is Artificial Bee Colony ABC . After feature selection process is done, Naive Bayes classification method will be implemented for classification process. As a result, the best accuracy of Na ve Bayes classification without feature selection is 60 with 90 training data and for Na ve Bayes classification using Artificial Bee Colony feature selection is 93.33333 with using 50 features selection and 90 training data."
2017
S-Pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Almas Ferar Aila
"Pandemi COVID-19 membuat banyak negara terpaksa melakukan kebijakan-kebijakan tegas seperti pemberlakuan karantina, pembatasan kegiatan sosial, dan pemberlakuan protokol kesehatan yang ketat. Pembuatan kebijakan tersebut membutuhkan penelitian yang matang serta data-data yang menunjang. Data-data yang dipakai bisa berasal dari sektor sosial, ekonomi, kesehatan, keamanan, dan lain sebagainya. Di dalam datadata tadi bisa saja ada informasi-informasi pribadi dari individu atau kelompok yang terambil secara sengaja ataupun tidak. Informasi pribadi termasuk dalam ranah privasi yang seharusnya dijaga. Di masa pandemi ini, penjagaan atas privasi menjadi lebih longgar karena dikalahkan oleh kepentingan akan kesehatan, pemulihan ekonomi sosial, dan kepentingan otoritas lainnya. Otoritas menggunakan data privasi penduduknya demi kepentingan penduduk itu sendiri. Akan tetapi, data privasi tadi juga dipakai sebagai bahan bakar otoritas dalam melanggengkan kekuasaan dengan cara melakukan pengawasan terhadap penduduk dan mendisiplinkan mereka. Pengambilan data-data pribadi dapat dilanjutkan kendati pandemi COVID-19 telah berlalu karena kekuasaan perlu untuk tetap eksis. Penduduk menjadi subjek sekaligus objek dari kekuasaan yang mampu berjalan tanpa mereka sadar sedang dikuasai. Kekuasaan yang berjalan hingga tingkat penduduk dikenal dengan sebutan governmentality.

The COVID-19 pandemic has forced many countries to carry out strict policies such as the implementation of quarantine, restrictions on social activities, and the implementation of strict health protocols. Making these policies requires careful research and supporting data. The data used can come from social, economic, health, security, and so on. In the above data, there may be personal information from individuals or groups that is taken intentionally or not. Personal information is included in the realm of privacy that should be protected. During this pandemic, the safeguards on privacy have become looser because they are defeated by the interests of health, social-economic recovery, and the interests of other authorities. The authority uses the private data of its residents for the benefit of the residents themselves. However, this privacy data is also used as fuel for authorities to maintain power by monitoring the population and disciplining them. The collection of personal data can be continued even though the COVID-19 pandemic has passed because power needs to exist. Residents become the subject as well as the object of power that can run without them knowing they are being controlled. The power that runs to the level of the population is known as governmentality."
Depok: Fakultas Ilmu Pengetahuan Budaya Universitas Indonesia, 2021
MK-pdf
UI - Makalah dan Kertas Kerja  Universitas Indonesia Library
<<   1 2 3 4 5 6 7 8 9 10   >>