Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

Hasil Pencarian

Ditemukan 196192 dokumen yang sesuai dengan query
cover
Rifdah Hanifah
"Amfoterisin B merupakan antijamur berspektrum luas yang digunakan untuk terapi kandidiasis invasif. Candida haemulonii merupakan salah satu species Candida yang dapat menyebabkan kandidiasis yang dapat menyebabkan tingginya angka morbiditas dan mortalitas, terutama di Intensive Care Unit (ICU). Beberapa isolat C. haemulonii yang diisolasi dari pasien menunjukan resistansi terhadap Amfoterisin B yang diduga disandi oleh gen ERG2 dan ERG11, namun isolat yang diisolasi dari lingkungan ICU belum dilaporkan. Tujuan penelitian ini menganalisis gen ERG2 dan ERG11 penyandi resistansi Amfoterisin B pada Candida haemulonii yang diisolasi dari ruang rawat intensif. Dilakukan uji identifikasi dan uji kepekaan terhadap enam sampel yang berasal dari keran ICU rumah sakit menggunakan VITEK 2. Selanjutnya dilakukan analisis sekuensing dengan metode Sanger dan analisis filogenetik menggunakan metode Neighbor-Joining. Berdasarkan hasil uji homologi, sekuens gen ERG2 dan ERG11 pada keenam sampel C. haemulonii menunjukkan similaritas 100% dengan sekuens referensi C. haemulonii resistan terhadap Amfoterisin B yang diisolasi dari pasien di Israel dan hasil filogenetik menunjukkan semua sampel berada pada satu clade yang sama. Tidak dapat disimpulkan kemungkinan terdapatnya mutasi yang dikode oleh gen ERG2 dan ERG11 pada isolat yang diteliti, oleh karena tidak tersedianya data sekuens C. haemulonii yang peka terhadap Amfoterisin B pada pangkalan data GenBank.

Amphotericin B is a broad-spectrum antifungal that is commonly used for the treatment of invasive candidiasis. Candida haemulonii can cause invasive candidiasis and high morbidity and mortality rates, especially in the intensive care unit (ICU). While many C. haemulonii isolates derived from patients have resistance to Amphotericin B, which is thought encoded by ERG2 and ERG11, isolates from the hospital environment have not been widely reported. This study aimed to analyze the ERG2 and ERG11 genes encoding amphotericin B resistance in C. haemulonii isolated from the intensive care unit. VITEK2 was used to conduct identification and susceptibility tests on six samples obtained from taps in the ICU. Sequencing and phylogenetic analysis were conducted using Sanger and neighbor-joining methods, respectively. The results of the homology test, the ERG2 and ERG11 gene sequences in the six C. haemulonii samples showed 100% similarity with the reference sequences of C. haemulonii resistant to Amphotericin B isolated from patients in Israel. Furthermore, the phylogenetic results showed that all samples belonged to the same clade. We cannot conclude whether there is any mutation encoded by ERG2 and ERG11 in our isolates under study since no Amphotericin B susceptible sequences of C. haemulonii are available on the GenBank database"
Jakarta: Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia, 2022
T-pdf
UI - Tesis Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Jihaan Hafirain
"Salah satu infeksi jamur yang paling sering ditemukan pada manusia adalah kandidiasis. Infeksi ini disebabkan oleh jamur Candida sp, terutama spesies Candida albicans. Insidens kandidiasis yang kian meningkat terutama disebabkan oleh meluasnya penggunaan antibiotik spektrum luas serta meningkatnya penderita imunokompromis seperti penderita HIV, diabetes melitus, dan keganasan. Selain itu, meningkatnya insidens kandidiasis juga disertai dengan angka resistensi antifungal yang meningkat. Tujuan pada penelitian ini adalah untuk mengetahui profil suseptibilitas Candida albicans terhadap antifungal amfoterisin b dan vorikonazol secara in vitro dari spesimen yang terdata di Laboratorium Mikologi Departemen Parasitologi FKUI periode 2012-2015. Penelitian ini menggunakan studi potong lintang. Pemilihan sampel menggunakan metode total sampling dan kemudian diolah dengan SPSS versi 20 menggunakan uji hipotesis Wilcoxon. Dari 590 sampel, hasil uji suseptibilitas terhadap amfoterisin b menunjukkan enamspesimen 1 resisten, lima spesimen 0,8 peka tergantung dosis atau SDD, dan579 spesimen 98,1 sensitif. Sedangkan hasil uji suseptibilitas terhadap vorikonazol menunjukkan keseluruhan spesimen yaitu sebanyak 590 spesimen 100 sensitif terhadap Vorikonazol. Terdapat perbedaan bermakna p=0,003 antara profil suseptibilitas Candida albicans terhadap amfoterisin b dan vorikonazol. Hasil penelitian menunjukkan bahwa profil suseptibilitas Candidaalbicans terhadap vorikonazol yang lebih baik dibandingkan dengan amfoterisin b secara in vitro.

One of the most common fungal infection in human is candidiasis. It is caused byCandida fungus, mostly Candida albicans. The incidence of candidiasis hasincreased significantly over the past decades and is linked to widely use of broadspectrumantibiotics and immunocompromised patients, such as diabetes mellitus,HIV, and malignancy. It is also linked to rising incidence of antifungal resistance. The aim of this study is to determine the susceptibility profiles of clinically isolatesCandida albicans in the the Mycology Laboratory of the Department ofParasitology Faculty of Medicine University of Indonesia 2010 2011 period toantifungal amphotericin b and voriconazole in vitro. This was an analytical crosssectional study and total population sampling was used for the sample selectionmethod. Data were analyze with SPSS 20th version using Wilcoxon's test. From 590 samples of Candida albicans, the susceptibility profile for amphotericin b aresix samples 1 resistant, five samples 0,8 susceptible dose dependent or SDD,and 579 samples 98,1 sensitive. While the susceptibility profile for voriconazoleare 590 samples 100 sensitive. There were significant difference p 0,003 ofthe susceptibility profile of Candida albicans for amphotericin b and voriconazole.As a result, the susceptibility profile of Candida albicans for antifungalvoricanazole are higher than for amphotericin b in vitro."
Jakarta: Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia, 2016
S70393
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Husnun Amalia
"Mata adalah organ dengan aktivitas farmakokinetik yang spesifik karena memiliki sawar yang membuat obat sulit berpenetrasi ke dalam bola mata terutama kornea. Keratomikosis adalah infeksi kornea yang disebabkan oleh jamur terutama terjadi pada daerah tropis dan membuat kerusakan kornea yang berakhir dengan kebutaan. Hal ini masih menjadi masalah di negara berkembang. Obat antijamur yang saat ini memiliki aktivitas yang sangat baik adalah Amfoterisin B dan bentuk liposom memiliki kemampuan efektivitas yang lebih tinggi dan menurunkan toksisitas obat. Penelitian terhadap tetes mata Amfoterisin B liposom (AmB-L) ini masih memerlukan penelitian lebih lanjut sehingga obat tetes ini dapat digunakan pada penderita keratomikosis. Penelitian ini menilai sejauh mana tetes mata AmBL dapat berpenetrasi di dalam bola mata, adakah efek toksik pada jaringan mata dan bagaimana efektivitasnya pada keratomikosis kelinci Metode: Penelitian ini menggunakan desain eksperimental Laboratorium dan animal study. Subyek penelitian adalah 11 ekor hewan kelinci New Zealand yang dibagi menjadi 5 kelompok yaitu kelompok uji kadar dan toksisitas AmB-L 0,15% dan 0,5% masing-masing 3 ekor, kelompok uji efektivitas AmB-L 0,15% dan 0,5% terhadap keratomikosis kelinci masing-masing 2 ekor, dan kelompok kontrol 1 ekor. Pengukuran kadar Amfoterisin B pada jaringan mata (kornea, akuos, lensa, vitreus, dan sklera) dilakukan setelah ditetes obat AmB-L 0,15% dan 0,5% setiap 1 jam selama 3 hari dengan cara menggunakan Kromatografi Cair Kinerja Tinggi (KCKT). Toksisitas tetes mata AmB-L 0,15% dan 0,5% pada jaringan mata (kornea, iris, sklera dan retina) dievaluasi dengan pemeriksaan klinid dan histopatologis (Haematoksilin Eosin). Pada uji efektivitas menilai waktu kesembuhan keratomikosis kelinci, hasil kultur kornea dan akuos pasca terapi dengan agar Sabouraud, kadar Amfoterisin B pada kornea dan akuos serta efek toksik. Hasil: Kadar Amfoterisin B pada AmB-L 0,5% terukur lebih tinggi dibandingkan AmB-L 0,15% dan kadar AmB-L pada setiap jaringan di kedua konsentrasi hasilnya lebih tinggi dari MIC. Tetes mata AmB-L 0,5% dan 0,15% tidak memperlihatkan efek toksik secara klinis maupun histopatologi pada jaringan mata kelinci. Tetes mata AmB-L 0,5% dan 0,15% adalah antijamur yang efektif untuk keratomikosis kelinci akibat Aspergillus sp. dan waktu kesembuhan pada kedua konsentrasi tidak berbeda bermakna (p=0,2) Kesimpulan : Liposom adalah drug carrier yang dapat membawa obat amfoterisin B mencapai bagian anterior dan posterior bola mata serta mampu berpenetrasi dengan baik, efektif, tidak toksik terhadap jaringan mata. Karena itu, penggunaan amfoterisin B liposom dapat menjadi terapi standar untuk keratomikosis

The eye has a specific pharmacokinetic because of its complex barrier to drug entry, especially the cornea. Keratomycosis is a fungal infection of the cornea in tropical areas and the cause of corneal morbidity and blindness. This remains a problem in developing countries. Amphotericin B (AmB) is still considered the treatment of choice for fungal infection. Liposomal formulation of AmB (L-AmB) has demonstrated promising results with higher efficacy and lower toxicity. The research of L-AmB eye drops still needs further studies before it can be used in humans. This study will evaluate L-AmB eye drop penetration, toxicity, and efficacy on keratomycosis of the rabbit eye. Methods: The study is using laboratory design and animal study. Eleven New Zealand rabbits were devided into five groups. Six rabbits were used for the pharmacokinetic and toxicological studies, four rabbits for studying the efficacy, and one served as normal and keratomycosis control. All treatment used two concentrations of L-AmB (0.15% and 0.5%) given as eye drops every hour for three days. The pharmacokinetic study measured AmB concentration in the tissues (cornea, aqueous, lens, vitreus, sclera) using high performance liquid chromatography (HPLC), and toxic reactions were evaluated in clinical signs and histopathological examination (cornea, iris, sclera, retina). Efficacy was evaluated by length of therapy, concentration of AmB in the tissues (cornea, aqueous), and toxic effects. Result: In all tissues, L-AmB 0.5% had higher concentrations of AmB than 0.15%, reached MIC in both concentrations and showed no toxic effects. L-AmB eye drops in both concentrations were effective for Aspergyllus sp. keratomycosis in rabbits. Length of therapy varied insignificantly between the two concentrations (p=0.2); both concentrations of AmB reached MIC and did not reveal toxic reactions. Conclusion: Liposomes are promising drug carriers for eye diseases that can penetrate to the anterior and posterior tissues of the eye. L-AMB can be successfully applie"
Jakarta: Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia, 2015
D-pdf
UI - Disertasi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Lubis, Rosmawaty
"ABSTRAK
Resistensi terhadap lamivudin merupakan masalah yang sering dihadapi pada pengobatan penderita hepatitis B. Resistensi lamivudin biasanya dihubungkan dengan faktor virus yaitu mutasi gen P terutama di daerah YMDD, sedangkan penelitian pada faktor pejamu (host) belum pernah dilakukan. Penelitian ini bertujuan : 1) Untuk mengetahui peranan gen dCK pejamu (host) yang mengkode enzim deoksisitidin kinase pada resistensi lamivudin 2) Untuk mengetahui peranan gen P virus hepatitis B yang mengkode polimerase/reverse transcriptase pada resistensi lamivudin. Penelitian ini menggunakan metode Polymerase Chain Reaction (PCR) dan direct sequencing. Hasil penelitian menunjukkan bahwa gen dCK (ekson 2) relatif conserved. Mutasi yang tidak signifikan (G33W) ditemukan hanya pada satu pasien yang sensitif terhadap lamivudin, sedangkan pada kelompok pasien yang resisten terhadap lamivudin dan kelompok populasi nonnal tidak ditemukan mutasi. Penelitian pada gen P (domain RT) virus hepatitis B menemukan 1 (6,25 %) mutasi pada domain B yaitu L526M (rt LISOM) dan 6 (37,5%) mutasi pada domain C yaitu mutan YMDD yang terdiri atas 5 (3l,25%) mutan M5501 (rt M2040 dan 1 (6,25%) mutan M550V (rt M20-4V). Satu mutan MSSOV juga mengalami mutasi L526M. Pada penelitian ini juga ditemukan mutasi baru pada domain A yang belum pemah dipublikasikan yaitu Y487F (rt YI4IF), D480N (rt Dl34N) dan N485S (rt Nl39S). Mutan Y487F ditemukan pada 5 pasien (3l,25%) yang sama persis dengan mutasi MSSOI. Domain A dan C mempunyai peranan pada binding nukleosida trifosfal, sehingga diperkirakan mutasi baru yang ditemukan pada domain A juga mempunyai kontribusi terhadap terjadinya resistensi lamivudin. Virus yang mengalami mutasi L526M + MSSZV tidak menunjukkan mutasi pada Y487F, tetapi mengalami mutasi pada D48ON dan N485S. Kesimpulan yang dapat diambil dari penelitian ini adalah : 1) Pada level genetik tidak terjadi perubahan atau mutasi gen dCK (ekson 2) yang berhubungan dengan resistensi lamivudin. 2) Pada gen P (domain RT) virus hepatitis B terdapat mutasi pada domain A, B dan C yang berhubungan dengan resistensi terhadap lamivudin.

Abstract
The resistance against lamivudine treatment in hepatitis B patients is a problem frequently encountered by physicians. Lamivudine resistance is usually associated with viral mutations especially in the YMDD region of P gene, the involvement of host factors however, was not studied yet so far. This investigation is designed to determine either host or viral factors responsible responsible for lamivudine resistance. The aim of this study are : 1) To understand the involvement of host dCK gene which code for deoxycytidine kinase in lamivudine resistance. 2) To understand the involvement of viral P gene which code for polymerase/reverse transcriptase in lamivudine resistance. The investigation was performed by means of Polymerase Chain Reaction (PCR) and direct sequencing methods. The results indicate that dCK gene (exon 2) is relatively conserved. Unsignificant mutation (G33W) was found in only one patient who was sensitive to lamivudine treatment.
"
Jakarta: Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia, 2005
D751
UI - Disertasi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Lubis, Rosmawaty
"ABSTRAK
Resistensi terhadap lamivudin merupakan masalah yang sering dihadapi pada pengobatan penderita hepatitis B. Resistensi lamivudin biasanya dihubungkan dengan faktor virus yaitu mutasi gen P terutama di daerah YMDD, sedangkan penelitian pada faktor pejamu (host) belum pernah dilakukan. Penelitian ini bertujuan : 1) Untuk mengetahui peranan gen dCK pejamu (host) yang mengkode enzim deoksisitidin kinase pada resistensi lamivudin 2) Untuk mengetahui peranan gen P virus hepatitis B yang mengkode polimerase/reverse transcriptase pada resistensi lamivudin. Penelitian ini menggunakan metode Polymerase Chain Reaction (PCR) dan direct sequencing.
Hasil penelitian menunjukkan bahwa gen dCK (ekson 2) relatif conserved. Mutasi yang tidak signifikan (G33W) ditemukan hanya pada satu pasien yang sensitif terhadap lamivudin, sedangkan pada kelompok pasien yang resisten terhadap lamivudin dan kelompok populasi nonnal tidak ditemukan mutasi. Penelitian pada gen P (domain RT) virus hepatitis B menemukan 1 (6,25 %) mutasi pada domain B yaitu L526M (rt LISOM) dan 6 (37,5%) mutasi pada domain C yaitu mutan YMDD yang terdiri atas 5 (3l,25%) mutan M5501 (rt M2040 dan 1 (6,25%) mutan M550V (rt M20-4V). Satu mutan MSSOV juga mengalami mutasi L526M. Pada penelitian ini juga ditemukan mutasi baru pada domain A yang belum pemah dipublikasikan yaitu Y487F (rt YI4IF), D480N (rt Dl34N) dan N485S (rt Nl39S). Mutan Y487F ditemukan pada 5 pasien (3l,25%) yang sama persis dengan mutasi MSSOI. Domain A dan C mempunyai peranan pada binding nukleosida trifosfal, sehingga diperkirakan mutasi baru yang ditemukan pada domain A juga mempunyai kontribusi terhadap terjadinya resistensi lamivudin. Virus yang mengalami mutasi L526M + MSSZV tidak menunjukkan mutasi pada Y487F, tetapi mengalami mutasi pada D48ON dan N485S. Kesimpulan yang dapat diambil dari penelitian ini adalah : 1) Pada level genetik tidak terjadi perubahan atau mutasi gen dCK (ekson 2) yang berhubungan dengan resistensi lamivudin. 2) Pada gen P (domain RT) virus hepatitis B terdapat mutasi pada domain A, B dan C yang berhubungan dengan resistensi terhadap lamivudin.

Abstract
The resistance against lamivudine treatment in hepatitis B patients is a problem frequently encountered by physicians. Lamivudine resistance is usually associated with viral mutations especially in the YMDD region of P gene, the involvement of host factors however, was not studied yet so far. This investigation is designed to determine either host or viral factors responsible responsible for lamivudine resistance. The aim of this study are : 1) To understand the involvement of host dCK gene which code for deoxycytidine kinase in lamivudine resistance. 2) To understand the involvement of viral P gene which code for polymerase/reverse transcriptase in lamivudine resistance. The investigation was performed by means of Polymerase Chain Reaction (PCR) and direct sequencing methods.
The results indicate that dCK gene (exon 2) is relatively conserved. Unsignificant mutation (G33W) was found in only one patient who was sensitive to lamivudine treatment; while no mutations were fotmd in either patients resistance agains lamivudine treatment or normal population. A study on P gene (RT domain) of hepatitis B virus have found l (6,25 %) mutation on B domain as L526M (rt LISOM) and 6 (37.5 %) mutations on C domain as YMDD mutants composing of 5 (31.25 %) mutant M5501 (rt M204l) and 1 (6.25 %) mutant MSSOV (rt M204V). A mutant of MSSOV is also mutate on L526M. This study also discovered new mutations in A domain which have unpublished yet; thhey are Y487F (rt Y141F), D430N (rt D131N) and N485S (rt Nl39S). Y-487F mutants were found in 5 patients (31.25 %) who definitely similar to mutation of M550I. The A and C domain are responsible for nucleside triphosphate binding, therefore the mutation found in A domain is also considered to contribute to lamivudine resistance manifestation. Virus with mutation of L526 + M55 OV did not indicate mutation in Y487F, but mutated in D480N and N485S otherwise. The conclusion of this study are : 1) There are no changes or mutations of dCK gene (exon 2) associate to lamivudine resistance. 2) There are mutations on hepatitis B virus P gene (RT domain) present on A, B and C domain which are associated with resistance to lamivudine treatment.
"
Jakarta: Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia, 2005
D709
UI - Disertasi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Anugrah Dwi Handayu
"Amplifikasi DNA virus hepatitis B (VHB) dari sampel plasma sulit dilakukan apabila kadar DNA VHB <10.000 kopi/ml. Sehingga, langkah awal ekstraksi menjadi penting bagi keberhasilan amplifikasi dan sekuensing. Peningkatan konsentrasi DNA dalam jumlah yang cukup dan berkualitas baik memerlukan metode isolasi yang optimal. Tujuan penelitian ini adalah mendapatkan teknik isolasi DNA yang optimal untuk menghasilkan DNA VHB dalam jumlah yang cukup sehingga dapat digunakan untuk mendeteksi perubahan genetik gen polimerase VHB terkait resistensi obat antivirus pada kasus hepatitis B kronik. Optimasi prosedur penanganan sampel untuk mengekstraksi partikel DNA VHB dilakukan dengan mengisolasi sampel plasma dengan kadar virus 105 kopi/ml menggunakan delapan perlakuan yang berbeda yaitu 1 ml dan 200 µL plasma disentrifugasi 4000xg selama 20 menit pada suhu 25°C (P1 dan P2), 1 ml dan 200 µL plasma disentrifugasi 16000xg selama 1 jam pada suhu 4°C (P3 dan P4), 1 ml plasma disentrifugasi 21000xg selama 1 jam pada suhu 4°C (P5), 1 ml plasma dalam PEG6000 20% diinkubasi semalaman pada 2-8°C kemudian disentrifugasi 21000xg selama 1 jam pada suhu 4°C (P6), 1 ml plasma dalam PEG6000 20% dan NaCl 0.5M diinkubasi semalaman pada 2-8oC kemudian disentrifugasi 21000xg selama 1 jam pada suhu 4°C (P7), dan 200 µL sampel plasma tanpa penambahan perlakuan (P8). Kadar virus diukur menggunakan kuantitatif realtime PCR, dan hasil dari setiap perlakuan sampel dibandingkan dengan kontrol (P8). Uji simulasi dilakukan pada sampel plasma dengan kadar virus 105; 104; 103 dan 102 kopi/ml yang diberikan perlakuan 3 (P3) yang dipilih berdasarkan hasil sebelumnya, DNA kemudian disekuensing untuk dianalisis mutasi resistensinya terhadap obat antivirus dan hasilnya dibandingkan dengan sampel yang tanpa diberikan perlakuan.
Hasil menunjukkan bahwa terjadi peningkatan konsentrasi DNA pada rerata sampel yang diisolasi menggunakan P3 jika dibandingkan dengan kontrol (P8). Sedangkan hasil sekuensing untuk analisis mutasi pada gen polimerase terkait resistensi terhadap obat antivirus dapat dilakukan pada sampel dengan kadar virus 105; 104; 103 kopi/ml baik yang diberikan perlakuan maupun tanpa perlakuan. Namun, sampel dengan kadar virus 102 kopi/ml hanya dapat dianalisis mutasi resistensinya pada sampel yang ditambahkan perlakuan 3 (P3).
Kesimpulan: 1 ml plasma yang disentrifugasi 16000xg selama 1 jam pada suhu 4°C (perlakuan 3) merupakan metode isolasi DNA yang mampu meningkatkan perolehan DNA secara optimal dari sampel plasma penderita hepatitis B kronik, sehingga analisis resistensi terhadap obat antivirus menggunakan teknik in-house assay dapat di lakukan pada sampel dengan kadar virus <10.000 kopi DNA/ml.

The amplification of hepatitis B virus DNA from plasma samples is difficult when HBV DNA levels <10.000 copies/ml. Thus, the initial step of extraction become crucial for the success of amplification and sequencing. Increasing concentrations of DNA in sufficient quantity and good quality need an optimal isolation method. The aim of this study is to obtain an optimal DNA isolation technique and generate HBV DNA in sufficient quantities, so that it can be used to detect genetic changes of HBV polymerase gene related to drugs resistance on chronic hepatitis B. The optimization of sample handling procedure for extracting HBV DNA particles were performed by isolating plasma samples with viral load 105 copies/ml using eight different kinds of treatment are 1 ml and 200 µL of plasma was centrifuged at 4000×g for 20 minutes at 25°C (P1 and P2); 1 ml and 200 µL of plasma centrifuged at 16000×g for 1 hour at 4°C (P3 and P4); 1 ml of plasma centrifuged at 21000×g for 1 hour at 4°C (P5); 1 ml of plasma in 20% PEG6000 were incubated overnight at 2-8°C then centrifuged at 21000xg for 1 hour at 4°C (P6), 1 ml of plasma in 20% PEG6000 and 0.5M NaCl were incubated overnight at 2-8oC then centrifuged at 21000xg for 1 hour at 4°C (P7), and 200 µL of plasma without treatment (P8). Hepatitis B virus level were measured using quantitative real-time PCR, and the results of each treatment compared to the control samples (P8). Simulation test performed on plasma samples with grading of virus level (i.e 105; 104; 103 and 102 copies/ml) were given treatment 3 (P3) were selected based on previous results, the DNA was sequenced and then analyzed for drugs resistance and the results were compared with samples without treatment.
Result showed that an increasing in average concentration of DNA samples was isolated using the P3 when compared with controls (P8). While the results of sequencing for analysis of mutations in polymerase gene associated with drugs resistance can be performed on samples with virus level 105; 104; 103 copies/ml were given either treatment or no treatment. However, samples with virus level 102 copies/ml can be analyzed only
on treatment samples.
Conclusion: 1 ml plasma were centrifuged at 16000xg for 1 h at 4°C (treatment 3) is a DNA isolation method that can improve the recovery of optimal DNA from plasma samples of patients with chronic hepatitis B, so that the analysis of drug resistance using in-house assay techniques can be done on samples with virus levels <10,000 copies/ml.
"
Jakarta: Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia, 2013
T-Pdf
UI - Tesis Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Meta Dewi Tedja
"Ruang lingkup dan Cara penelitian: Virus Hepatitis B (VHB) merupakan penyebab tersering hepatitis kronik, sirosis hepatis dan karsinoma hepatoselular di negara-negara Asia Tenggara.
VHB merupakan virus DNA berukuran 3,2 kb, mempunyai untai ganda dengan susunan genom yang kompak dan sating tumpang tindih. Materi genetik VHB tersimpan daiam 4 Open Reading Frames pada untai negatif. Transmisi VHB terjadi melalui kontak dengan darah, komponen darah atau cairan tubuh lainnya. Diagnosis infeksi VHB didasarkan adanya HBsAg dalam serum. Hilangnya HBsAg dan terbentuknya anti-HBs merupakan petanda eliminasi virus. Namun demikian mutasi yang terjadi pada gen penyandi HBsAg mengakibatkan perubahan antigenisitas HBsAg sehingga virus lolos dart pemeriksaan yang menggunakan antibodi monoklonal terhadap HBsAg. Untuk mengetahui perubahan molekuler pada gen penyandi HBsAg maka dilakukan penelitian program magister ini dengan tujuan umum untuk mengetahui dasar molekuler kegagalan deteksi serologi HBsAg pada serum donor darah di Indonesia. Untuk itu dilakukan isolasi DNA VHB, ligasi ke vektor dan transformasi ke bakteri E.coli, dilanjutkan dengan reaksi sekuensing yang hasilnya dianalisis dengan perangkat bioinformatika.
Hasil dan kesimpulan: Pada serum donor darah dengan HBsAg (-), anti-HBs (-) dan anti-HBc (+) berhasil didapat DNA VHB pada 20 (29,9%) dart 67 sampeI; pada donor darah dengan HBsAg (-), anti-HBs (+) dan anti-HBc (+) didapat DNA VHB pada 5 (7.5%) dart 67 sampel. Sehingga jumlah total DNA VHB (+) didapat pada 25 (8,I%) dari 309 sampel dengan HBsAg (-), Pada sekuensing determinan 'a' gen S DNA VHB didapat 7 (28%) dari 25 sampel menunjukkan mutasi asam amino. Terdapat 3 pola substitusi asam amino: pola pertama substitusi M I 33L sebanyak I (4%) dari 25 sampel, polar kedua T123A sebanyak I (4%) dari 25 sampel, dan pola ketigaTI43M sebanyak 5 (20%) dari 25 sampel. Semua virus; termasuk dalam subtipe adw.
Pada studi bioinformatika, substitusi ini menyebabkan terjadinya penurunan nilai indeks antigenisitas asam amino yang bersangkutan dan asam amino yang berada di sekitarnya. Substitusi asam amino pada gen S mengakibatkan terjadinya perubahan sekuens gen P daerah reverse transcriplase yang tumpang tindih dengan gen S."
Jakarta: Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia, 2002
T8366
UI - Tesis Membership  Universitas Indonesia Library
cover
"Genotipe virus hepatitis B (VHB) mempunyai hubungan yang erat dengan prognosis dan terapinya serta diperlukan untuk studi epidemiologi. Pemeriksaan ini hanya bisa dikerjakan di kota-kota besar saja karena kesulitan pengiriman sampel akibat masalah geografis maupun fasilitas. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui apakah genotipe VHB dapat ditentukan dari serum kering pada kertas saring dan membandingkan hasil tersebut dengan serum yang diambil langsung dari pasien hepatitis B kronik (HBK) dan hepatoma. Dua puluh tiga sampel dapat diambil dari pasien HBK dan konsentrasi DNA VHB di tentukan dengan Cobas Amplicor HBM (Roche Diagnostics GmBH, Germany) kemudian diteteskan pada kertas saring (3 x 1 cm). Setelah dikeringkan dalam kantong plastik, diletakkan dalam amplop tertutup dan disimpan selama 1 minggu dalam suhu kamar (27 – 33 oC). Ekstraksi DNA dilakukan dari kertas saring tersebut setelah diinkubasi dan penentuan genotipe VHB dilakukan dengan PCR menggunakan primer-primer spesifik. Untuk perbandingan, telah didapatkan 20 sampel pasien HBK-HBe (+) dan 29 sampel pasien hepatoma yang tidak dikeringkan. Genotipe VHB dapat dideteksi pada 18/23 (78,2%) serum kering pada kertas saring sedangkan pada serum yang tidak dikeringkan, dari pasien HBK-HBe(+) 20/20 (100%) sampel terdeteksi dan dari pasien hepatoma 24/29 (82,7%) sampel. Proporsi genotipe yang terdeteksi sesuai dengan proporsi genotipe yang pernah dilaporkan di Indonesia. Kesimpulan penelitian ini adalah genotipe VHB dapat dideteksi dari serum kering pada kertas saring yang disimpan selama 1 minggu. (Med J Indones 2005; 14: 215-9)

HBV genotype has a close association with prognosis and therapy as well as for epidemiology study. However, this examination can be done only in large cities that are not practical to send serum sample due to geographical burden and facilities. The aim of this study is to know whether HBV genotype can be determined from dried and stored serum on filter paper and compare the result with sera drawn directly from chronic hepatitis B (CHB) and hepatoma patients. Twenty-three serum samples were obtained from CHB patients. HBV DNA were quantitatively determined with Cobas Amplicor HBM (Roche Diagnostics GmBH, Germany) and dropped on to 3 x 1 cm filter papers. After allowed to dry in a plastic clip, it were put in a closed envelope then stored for 1 week in room condition (27 – 33 oC). DNA extraction were done from the filter papers after a short incubation period and HBV genotypes were determined with PCR and specific primers. For comparison, 20 CHB-Hbe(+) samples and 29 hepatoma samples were drawn directly and not dried. HBV genotype were detected in 18/23 (78.2%) from dried serum samples on filter paper while in sera that were not stored, from CHB-HBe(+) samples, 20/20 (100%) could be determined while from hepatoma patients, 24/29 (82.7%) samples. The proportion of genotype were in line with other reported HBV genotype examination for Indonesia. It is concluded that detection of HBV genotype can be done from dried serum in filter paper and stored for 1 week. (Med J Indones 2005; 14: 215-9)"
Medical Journal Of Indonesia, 14 (4) October December 2005: 215-219, 2005
MJIN-14-4-OctDec2005-215
Artikel Jurnal  Universitas Indonesia Library
cover
"[Standard Operating of Procedur dalam melaksanakan tindakan medis, termasuk Pemasangan dan pencabutan implan sampai detik ini dipakai untuk meminimalir terjadinya sesuatu yang tidak diinginkan termasuk infeksi ataupun transmisi dari penyakit menular seperti Hepatitis B. Penelitian ini digunakan untuk melihat sejauh mana Pengetahuan, sikap dan perilaku bidan desa di Kabupaten Purworejo dalam mencegah transmisi Hepatitis B saat melaksanakan salah satu tugasnya yaitu memberikan pelayanan Implan. Desain dalam penelitian ini adalah cross sectional, dengan sampel bidan desa yang bertugas di Kabupaten Purworejo, berjumlah 80 orang, menggunakan kuesioner dan ceklis, Bidan desa yang berperilaku baik sebanyak 5,3%, ada hubungan antara Pengetahuan dengan perilaku pencegahan transmisi Hepatitis B dengan nilai p=0,028, Standard Operating of Procedure in carrying out of medical practice, including the installation and retraction until the second implant is used to reduce the occurrence of unwanted things including infection or transmission of infectious diseases such as Hepatitis B. This research is used to see the extent to which knowledge, attitudes and behavior in Purworejo midwife in preventing the transmission of Hepatitis B while executing one of his duties is to provide services Implants. Design in this study is cross-sectional, with a sample of midwives who served in Purworejo, with the number of 80 people, using questionnaires and checklists, the village midwife who behaved much as 5.3%, there is a relationship between knowledge of the behavior of the transmission prevention Hepatitis B, p value=0,028.;Standard Operating of Procedure in carrying out of medical practice, including the installation and retraction until the second implant is used to reduce the occurrence of unwanted things including infection or transmission of infectious diseases such as Hepatitis B. This research is used to see the extent to which knowledge, attitudes and behavior in Purworejo midwife in preventing the transmission of Hepatitis B while executing one of his duties is to provide services Implants. Design in this study is cross-sectional, with a sample of midwives who served in Purworejo, with the number of 80 people, using questionnaires and checklists, the village midwife who behaved much as 5.3%, there is a relationship between knowledge of the behavior of the transmission prevention Hepatitis B, p value=0,028.;Standard Operating of Procedure in carrying out of medical practice, including the installation and retraction until the second implant is used to reduce the occurrence of unwanted things including infection or transmission of infectious diseases such as Hepatitis B. This research is used to see the extent to which knowledge, attitudes and behavior in Purworejo midwife in preventing the transmission of Hepatitis B while executing one of his duties is to provide services Implants. Design in this study is cross-sectional, with a sample of midwives who served in Purworejo, with the number of 80 people, using questionnaires and checklists, the village midwife who behaved much as 5.3%, there is a relationship between knowledge of the behavior of the transmission prevention Hepatitis B, p value=0,028.;Standard Operating of Procedure in carrying out of medical practice, including the installation and retraction until the second implant is used to reduce the occurrence of unwanted things including infection or transmission of infectious diseases such as Hepatitis B. This research is used to see the extent to which knowledge, attitudes and behavior in Purworejo midwife in preventing the transmission of Hepatitis B while executing one of his duties is to provide services Implants. Design in this study is cross-sectional, with a sample of midwives who served in Purworejo, with the number of 80 people, using questionnaires and checklists, the village midwife who behaved much as 5.3%, there is a relationship between knowledge of the behavior of the transmission prevention Hepatitis B, p value=0,028. ]"
Universitas Indonesia, 2013
S46539
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Prasna Pramita
"Chronic hepatitis B is still a major health problem in Indonesia. Unfortunately, to date, treatment of chronic HBV (Hepatitis B virus) infection had not shown satisfactory result. Monotherapy with alpha interferon or lamivudine have been widely used as treatment of chronic HBV. However, treatment response to Alpha interferon in Asian people was not satisfactory (15% - 20%), while monotherapy with lamivudine was not sufficient to eradicate HBV in chronically infected patients and commonly induce drug resistance. The occurrence of chronic hepatitis B resistant to lamivudine had encouraged development of newer agents such as adefovir, entecavir, emtricitabine and nucleoside analog. New therapeutic strategy using combination therapy should be considered if there is no sufficient response to monotherapy"
2005
IJGH-6-1-April2005-9
Artikel Jurnal  Universitas Indonesia Library
<<   1 2 3 4 5 6 7 8 9 10   >>