Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

"COVID-19 atau Corona Virus Disease 2019 adalah penyakit yang disebabkan oleh severe acute respiratory syndrome coronavirus-2 (SARS-CoV-2). SARS-CoV-2 masuk melalui saluran pernapasan dan menginfeksi paru-paru. Pada penelitian ini metode sensor elektrokimia menggunakan S-protein sebagai biomarker untuk mendeteksi SARS-CoV-2 dikembangkan dengan menggunakan dua jenis senyawa pengenal yang berbeda, yaitu umifenovir dan N-acetylneuraminic acid (Neu5Ac). Umifenovir dan Neu5Ac merupakan senyawa elektroakif yang mampu berikatan dengan spike glikoprotein SARS-CoV-2. Studi elektrokimia dengan metode voltametri siklik menunjukkan puncak arus oksidasi umifenovir pada elektroda screen-printed boron-doped diamond (SPE-BDD) pada potensial +0,29 V. Penambahan spike glikoprotein S2 SARS-CoV-2 pada larutan umifenovir menyebabkan penurunan puncak arus oksidasi dengan waktu kontak optimum 10 menit. Penurunan puncak arus oksidasi ini linear dengan meningkatnya konsentrasi spike glikoprotein S2 pada rentang konsentrasi 1 sampai 100 ng/mL dan limit deteksi (LOD) 18,98 ng/mL dan limit kuantifikasi (LOQ) 63,27 ng/mL dapat dicapai. Sementara itu, keberadaan senyawa Neu5Ac tidak menunjukkan respon pada elektroda SPE-BDD. Namun, pada elektroda screen-printed gold (SPGE) Neu5Ac dapat diidentifikasi dengan meningkatnya puncak arus reduksi Au pada potensial +0,23 V. Penambahan spike glikoprotein S1 SARS-CoV-2 pada larutan Neu5Ac menyebabkan penurunan puncak arus reduksi dengan waktu kontak optimum 10 menit. Penurunan ini linear dengan meningkatnya konsentrasi spike glikoprotein S1 pada rentang konsentrasi 1 sampai 100 ng/mL dengan nilai LOD dan LOQ masing-masing 21,80 ng/mL dan 72,69 ng/mL. Kedua jenis sensor memiliki keberulangan yang baik dengan % RSD kurang dari 5% pada 10 kali pengukuran. Sensor ini juga memiliki selektivitas yang baik dan tidak dipengaruhi keberadaan hemaglutinin H1N1 pada rentang konsentrasi 1 sampai 100 ng/mL yang ditambahkan pada pengukuran spike glikoprotein SARS-CoV-2.

---

COVID-19 or Corona Virus Disease 2019 is a disease caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus-2 (SARS-CoV-2). SARS-CoV-2 enters through the respiratory tract and infects the lungs. In this study an electrochemical sensor method using S-protein as a biomarker to detect SARS-CoV-2 was developed using two different types of identifier compounds, namely umifenovir and N-acetylneuraminic acid (Neu5Ac). Umifenovir and Neu5Ac are electroactive compounds that are able to bind to the spike glycoprotein of SARS-CoV-2. An electrochemical study using the cyclic voltammetry method showed the peak of the oxidation current of umifenovir at a screen-printed electrode boron-doped diamond (SPE-BDD) at a potential of +0.29 V. The addition of spike glycoprotein S2 SARS-CoV-2 to the umifenovir solution caused a decrease in the peak of the oxidation current with an optimum contact time of 10 minutes. This decrease in the peak of the oxidation current was linear with increasing concentrations of the spike glycoprotein S2 in the concentration range of 1 to 100 ng/mL and a detection limit (LOD) of 18.98 ng/mL and a quantification limit (LOQ) of 63.27 ng/mL could be achieved. Meanwhile, the presence of the Neu5Ac compound did not show a response to the SPE-BDD electrode. However, on the screen-printed gold electrode (SPGE) Neu5Ac can be identified by increasing the peak reduction current of Au at a potential of +0.23 V. The addition of spike glycoprotein S1 SARS-CoV-2 to Neu5Ac solution causes a decrease in the peak of the reduction current with an optimum contact time of 10 minute. This decrease was linear with increasing concentrations of spike glycoprotein S1 in the concentration range of 1 to 100 ng/mL with LOD and LOQ values of 21.80 ng/mL and 72.69 ng/mL, respectively. Both types of sensors have good repeatability with % RSD less than 5% for 10 measurements. This sensor also has good selectivity and is not affected by the presence of hemagglutinin H1N1 in the concentration range of 1 to 100 ng/mL added to the measurement of the spike glycoprotein of SARS-CoV-2."

"SARS-CoV-2 merupakan virus RNA penyebab COVID-19 yang telah menjadi pandemi dunia selama dua tahun terakhir. Hingga saat ini, metode deteksi RT-PCR menjadi metode terbaik dalam deteksi COVID-19. Namun mahalnya biaya reagen dan instrumentasi menyebabkan diperlukannya metode lain yang lebih murah dan praktis. Sementara itu Umifenovir (arbidol) merupakan senyawa elektroaktif yang dapat berinteraksi dengan spike glikoprotein SARS-CoV-2. Pada penelitian ini interaksi umifenovir dan glikoprotein S2 dipelajari dengan studi elektrokimia di permukaan elektroda boron-doped diamond (BDD). Sebelum dilakukan studi elektrokimia, dilakukan studi penambatan molekul dengan Homology Modelling dan Molecular Docking menggunakan umifenovir. Studi interaksi umivenofir terhadap glikoprotein S2 SARS CoV-2 menghasilkan affinity binding sebesar -6,1 kcal/mol. Sedangkan studi elektrokimia umifenovir menggunakan elektroda BDD pada rentang potensial dari (-0,8 V) hingga (+0,8 V) dan scan rate 50 mV/s menunjukkan korelasi linear pada rentang konsentrasi 10- 100 μM. Selanjutnya deteksi spike glikoprotein S2 SARS CoV-2 menggunakan kondisi optimum dengan 100 μM umifenovir dan 0,0025 μg/mL spike glikoprotein melalui perbandingan 20:1 menunjukkan nilai limit deteksi (LoD) dan limit kuantifikasi (LoQ) berturut-turut sebesar 0,001497 μg/mL dan 0,004991 μg/mL. Hasil studi menunjukkan bahwa ode deteksi yang dikembangkan dengan elektroda BDD dapat digunakan untuk sampel klinis SARS-CoV-2.

---

SARS-CoV-2 is RNA virus causing Covid-19 which has become the global pandemic in the last two years. To date, RT-PCR is the best method for Covid-19 detection. However, the costly chemical reagents and instruments for this method suggesting another cheaper and practical method is necessary. Meanwhile, umifenovir (arbidol) is an electroactive compound which can interact with the SARS-CoV-2 glicoprotein spike. In this research, umifenovir interaction with glicoprotein S2 is investigated through the electrochemical study on the electrode surface of boron-doped diamond (BDD). Prior to the electrochemical study, computational study using Homology Modelling dan Molecular Docking was performed for umifenovir. Affinity binding of -6.1 kcal/mol was obtained from the umivenofir against glicoprotein S2 SARS CoV-2. On the other hand, the electrochemical study on umifenovir using BDD electrode in the potential range of -0.8 V to +0.8 Vand scan rate of 50 mV/s shows a linear correltaion in the concentration range of 10-100 μM. Moreover, the detection of S2 SARS CoV-2 glicoprotein spike using the optimum condition of 100 μM umifenovir and 0.0025 μg/mL glicoprotein spike with 20:1 ratio shows the limit of detection (LoD) and limit of quantification (LoQ) are 0.001497 μg/mL and 0.004991 μg/mL, respectively. The results of this study reveal that the detection method developed with BDD electorde can be applied for the real samples of SARS-CoV-2."

"COVID-19 atau Coronavirus disease adalah penyakit infeksius yang mudahmenular melalui tetesan air liur atau bersin orang yang terinfeksi, sehinggawabah COVID-19 ditetapkan sebagai pandemi oleh WHO pada tanggal 11Maret 2020. Pencegahan penyebaran virus ini dapat dilakukan dengan tesdiagnostik skala besar dan sejauh ini belum dilaporkan pengembangan metodeelektrokimia sebagai sensor COVID-19. Umifenovir (Arbidol) adalah salah satujenis antiviral agent yang dapat berinteraksi dengan spike glikoprotein SARSCoV-2 sehingga dapat berpotensi digunakan sebagai pendeteksi COVID-19.Penelitian ini mempelajari perilaku elektrokimia umifenovir pada screen-printedcarbon electrode (SPCE). Hasil pengukuran dengan teknik cyclic voltammetrypada rentang potensial -0,6 V hingga +0,6 V dengan scan rate 50 mV/s dalam50 mM PBS pH 7,4 menunjukkan bahwa umifenovir bersifat elektroaktif denganpuncak oksidasi dan reduksi pada +0,2 V dan -0,19 V. Puncak oksidasi danreduksi ini mengalami penurunan arus jika dilakukan penambahan spikeglikoprotein pada larutan umivenovir. Penurunan arus mencapai keadaanoptimum menggunakan umifenovir 170 μM, pH 7,4, dan waktu kontak selama10 menit. Sejalan dengan studi elektrokimia, studi komputasi juga dilakukanuntuk mengetahui interaksi molekular antara umifenovir dengan spikeglikoprotein SARS-CoV-2. Selektivitas sensor diprediksi melalui simulasipenambatan molekul umifenovir dengan SARS-CoV dan virus Influenza. Hasilpenambatan molekul (docking) menunjukkan bahwa kompleks umifenovirdengan SARS-CoV-2 terbentuk spontan dengan nilai ΔGbinding sebesar -7,7306kcal/mol. Hasil ini tidak jauh berbeda pada kompleks umifenovir dengan SARSCoVyang memiliki ΔGbinding sebesar -7,7935 kcal/mol. Hasil tersebutmemprediksi adanya kompetisi SARS-CoV-2 dengan SARS-CoV untukberinteraksi dengan umifenovir.

---

COVID-19 or Coronavirus disease is an infectious disease that can be easilytransmitted through droplets of saliva or sneezes of an infected person, so thatthe COVID-19 outbreak was declared a pandemic by WHO on March 11, 2020.The virus spread can be prevented with large-scale diagnostic tests and so far ithas not been reported the development of electrochemical methods as a sensorfor COVID-19. Umifenovir (Arbidol) is a type of antiviral agent that can interactwith the spike glycoprotein of SARS-CoV-2, thus it has the potential to be usedas a COVID-19 detector. In this study, the electrochemical behavior ofumifenovir on a screen-printed carbon electrode (SPCE) is studied.Measurement results using the cyclic voltammetry technique in a potential rangeof -0.6 V to +0.6 V with a scan rate of 50 mV/s in 50 mM PBS pH 7.4 indicatethat umifenovir is an electroactive molecule with oxidation and reduction peaksat +0.2 V and -0.19 V. Peak current decrease, both in the oxidation and reductionpeak current, occurred when the spike glycoprotein was added in the umivenovirsolution. Current reduction reached the optimum state using umifenovir 170 μM,pH 7.4, and contact time for 10 minutes. Computational studies were alsoconducted to determine the molecular interactions between umifenovir and thespike glycoprotein of SARS-CoV-2. Sensor selectivity was predicted by dockingsimulations of umifenovir molecules with SARS-CoV and influenza viruses.The docking results showed that the umifenovir complex with SARS-CoV-2formed spontaneously with a ΔGbinding value of -7.7306 kcal/mol. These resultswere not much different with the umifenovir complex with SARS-CoV whichhad ΔGbinding of -7.7935 kcal/mol. These results predict SARS-CoV-2competition with SARS-CoV to interact with umifenovir"

"RT-qPCR (Real-Time Reverse-Transcription Polymerase Chain Reaction) berbasis SYBR Green, merupakan metode alternatif yang dapat digunakan untuk pendeteksian SARS-CoV-2 (Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2), selain berbasis TaqMan. Pada penelitian ini, primer yang dirancang menargetkan gen RdRP (Ribonucleic Acid/RNA-Dependent Ribonucleic Acid Polymerase) berdasarkan sekuens SARS-CoV-2 di Indonesia. Efisiensi dari metode yang dilakukan diketahui sebesar 97,82% dan limit of detection-nya adalah sampel dengan CT (cycle threshold) sebesar 41,25. Pada hasil uji spesifisitas, dua puluh sampel RNA positif SARS-CoV-2 terdeteksi positif dan delapan dari sepuluh sampel RNA negatif SARS-CoV-2 terdeteksi negatif. Dua sampel negatif yang terdeteksi positif karena terdeteksinya primer-dimer. Metode memenuhi kriteria presisi dengan hasil koefisien variasi pada intra-assay kurang dari 10% dan pada inter-assay kurang dari 15%. Sebagai langkah awal pengembangan deteksi kuantitatif, pada penelitian ini juga dilakukan percobaan penumbuhan transforman menggunakan sel kompeten One Shot® TOP10 dan One Shot® BL21(DE3) dengan plasmid kontrol DNA (deoxyribonucleic acid) pUC19 sebagai pemastian efisiensi sel kompeten yang dapat digunakan untuk penumbuhan kloning transforman gen RdRP SARS-CoV-2. Jumlah koloni bakteri yang berhasil tumbuh dari dua jenis sel kompeten tersebut tidak sesuai dengan ekspektasi panduan dari produsen. Selain itu, pada penelitian ini telah berhasil didapatkan fragmen gen target RdRP untuk kloning dengan PCR konvensional.

---

SYBR Green-based RT-qPCR (Real-Time Reverse-Transcription Polymerase Chain Reaction) is an alternative method to detect SARS-CoV-2 (Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2), besides the TaqMan-based. In this study, the primers were designed to target the RdRP (Ribonucleic Acid/RNA-Dependent Ribonucleic Acid Polymerase) gene based on a SARS-CoV-2 sequence in Indonesia. The method's efficiency is known to be 97,82% and the limit of detection is a sample with a CT (cycle threshold) of 41,25. At the specificity test results, all twenty positive RNA samples of SARS-CoV-2 were detected as positive. Eight from ten negative RNA samples of SARS-CoV-2 were detected as negative, the remaining detected primer-dimer. The method meets the criteria of precision with the results of the coefficient of variation was less than 10% and 15% for intra-assay and inter-assay, respectively. As an initial step in developing quantitative detection, in this study, the efficiency of One Shot® TOP10 and One Shot® BL21(DE3) competent cells were confirmed using a DNA (deoxyribonucleic acid) control plasmid pUC19. Both types of competent cells do not meet the expectation based on the manufacturer. In addition, for cloning, the RdRP gene target fragment was successfully obtained by conventional PCR."

"Studi elektrokimia berupa voltametri siklik dan kronoamperometri pada asam askorbat telah berhasil dilakukan pada screen printed carbon electrode (SPCE) dan SPCE termodifikasi multi-walled carbon nanotubes (SPCE-MWCNT) yang masing-masing memiliki luas permukaan aktif sebesar 0,138 cm2 dan 0,126 cm2. Pengaruh laju pemindaian dan konsentrasi asam askorbat yang dilarutkan dengan phosphate buffered saline (PBS) 0,1 M pH 7,4 terhadap arus dipelajari dengan menggunakan voltametri siklik dimana hubungan keduanya berlangsung linear, sama seperti pengaruh arus terhadap waktu yang dipelajari dengan menggunakan kronoamperometri. Elektroda SPCE dan SPCE-MWCNT teroksidasi masing-masing pada 0,2237 V dan 0,2756 V saat diberikan asam askorbat 10 mM dengan siklus potensial rentang -1 V hingga 1 V. Reaksi yang terjadi pada permukaan kedua elektroda tersebut merupakan reaksi yang dikontrol difusi dikarenakan hubungan antara log puncak arus anodik dan log laju pemindaian menunjukkan hasil yang linier dengan nilai kemiringan mendekati 0,5, yaitu sebesar 0,220 dan 0,222 untuk masing-masing SPCE dan SPCE-MWCNT. Batas deteksi dan batas kuantifikasi pada SPCE ditemukan masing-masing sebesar 1,2588 mM dan 3,8145 mM untuk pengujian menggunakan voltametri siklik, serta 2,8393 mM dan 8,6040 mM untuk pengujian menggunakan kronoamperometri. Sedangkan batas deteksi dan batas kuantifikasi pada SPCE-MWCNT ditemukan masing-masing sebesar 0,5197 mM dan 1,5748 mM untuk pengujian menggunakan voltametri siklik, serta 1,1486 mM dan 3,4805 mM untuk pengujian menggunakan kronoamperometri. Pada pengujian kronoamperometri menggunakan SPCE dan SPCE-MWCNT, dihasilkan juga persamaan linear masing-masing sebesar y=0,008x+0,07774 dan y=0,0091x+0,04781. Hal ini menunjukkan bahwa SPCE dan SPCE-MWCNT memiliki aktivitas katalitik yang baik terhadap oksidasi asam askorbat.

---

Electrochemical study through cyclic voltammetry and chronoamperometry on ascorbic acid was successfully accomplished on screen printed carbon electrode (SPCE) and SPCE modified with multi-walled carbon nanotubes (SPCE-MWCNT) with an active surface area of 0.138 cm2 dan 0.126 cm2, respectively. The effect of scan rate and concentration of dissolved ascorbic acid in phosphate buffered saline (PBS) 0.1 M pH 7.4 on the current were studied using cyclic voltammetry, where the relationship between them was linear. Similarly, the effect of current on time when studied using chronoamperometry also resulted in a linear relationship. The SPCE and SPCE-MWCNT electrodes were oxidized at 0.2237 V and 0.2756 V, respectively, when given 10 mM ascorbic acid with the range of cyclic potential -1 V to 1 V. The reaction which occurs on both the electrode surfaces are diffusion-controlled reaction, since the relationship between the log of peak anodic current and the log of the scan rate shows linear results with both slope values approximated to 0.5, which are 0.220 and 0.222 to be exact for SPCE and SPCE-MWCNT, respectively. The limit of detection (LOD) and the limit of quantification (LOQ) in SPCE were found to be 1.2588 mM dan 3.8145 mM, respectively, when tested using cyclic voltammetry, as well as 2.8393 mM and 8.6040 mM when tested using chronoamperometry. Meanwhile, LOD and LOQ in the SPCE-MWCNT were found to be 0.5197 mM and 1.5748 mM, respectively, when tested using cyclic voltammetry, as well as 1.1486 mM and 3.4805 mM when tested using chronoamperometry. In the chronoamperometric test using SPCE and SPCE-MWCNT, the resulting linear equations were y=0.008x+0.07774 and y=0.0091x+0.04781, respectively. These phenomena indicated that both SPCE and SPCE-MWCNT had a significant catalytic activity towards ascorbic acid oxidation."

"Pandemi yang disebabkan oleh SARS-CoV-2 telah memicu situasi darurat kesehatan di seluruh dunia. Varian Omicron yang menyebar dengan cepat semakin mendesak pencarian terapi yang tepat untuk menghindari infeksi yang lebih berat. TMPRSS2 manusia dan protein spike SARS-CoV-2 varian Omicron diidentifikasi sebagai protein target melalui penapisan secara komputasi. Metode yang digunakan adalah penapisan virtual berbasis struktural; analisis prediksi absorption, distribution, metabolism, excretion, dan toxicity (ADMET); dan simulasi dinamika molekuler. Ligan uji yang digunakan adalah senyawa metabolit sekunder invertebrata laut Indonesia. Camostat dan nafamostat (ko-kristal) digunakan sebagai ligan pembanding terhadap penghambatan TMPRSS2 sedangkan mefloquine ligan pembanding terhadap Protein Spike. Berdasarkan hasil penambatan molekul, acanthomanzamine C (-9,75 kkal/mol) dan cortistatin G (-9,39 kkal/mol) memiliki aktivitas yang lebih baik terhadap penghambatan TMPRSS2 dibandingkan dengan camostat (-8,25 kkal/mol) dan nafamostat (-6,52 kkal/mol). Sebagai inhibitor protein spike SARS-CoV-2 varian Omicron, acanthomanzamine C (-9,19 kkal/mol) dan cortistatin J (-8,89 kkal/mol) juga menunjukkan penghambatan yang lebih baik dibandingkan dengan mefloquine (-6,34 kkal/mol). Ligan uji tersebut juga telah memenuhi seluruh kriteria ADMET yang ditetapkan. Dari hasil analisis simulasi dinamika molekuler menunjukkan pengikatan yang stabil senyawa ligan uji terhadap protein target setelah simulasi berjalan 60 nanodetik dan memiliki energi ikatan bebas MMGBSA dan MMPBSA yang lebih baik dibandingkan ligan pembanding diantaranya TMPRSS2–acanthomanzamine C (-28,2067; -24,6639 kkal/mol), TMPRSS2–cortistatin G (-29,9908; -24,8869 kkal/mol), protein spike–acanthomanzamine C (-45,1414; -27,8749 kkal/mol), dan protein spike–cortistatin J (-37,8537; -35,6439 kkal/mol). Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa acanthomanzamine C, cortistatin G, dan cortistatin J merupakan senyawa hits sebagai kandidat terapi untuk infeksi SARS-CoV-2.

---

The pandemic caused by SARS-CoV-2 has triggered a global health emergency. The rapid spread of the Omicron variant has further intensified the urgency to search for appropriate therapies to prevent severe infections. The human TMPRSS2 and spike protein of the SARS-CoV-2 Omicron variant were identified as the target proteins through computational screening. The methods used are structure-based virtual screening; absorption, distribution, metabolism, excretion, and toxicity (ADMET) analysis; and molecular dynamics simulation. Bioactive marine invertebrates from Indonesia were employed as test ligands. Camostat and nafamostat (co-crystal) were utilized as reference ligands against TMPRSS2, whereas mefloquine was used as a reference ligand against spike protein. Following a molecular docking, acanthomanzamine C (-9,75 kcal/mol) and cortistatin G (-9,39 kcal/mol) had better activity against TMPRSS2 inhibition compared to camostat (-8,25 kcal/mol) and nafamostat (-6,52 kcal/mol). As inhibitors of spike protein of SARS-CoV-2 Omicron variant, acanthomanzamine C (-9,19 kcal/mol) and cortistatin J (-8,89 kcal/mol) also showed better inhibition compared to mefloquine (-6,34 kcal/mol). The test ligands have also met all the established ADMET criteria. The results of the molecular dynamics analysis showed stable binding of the test ligands to the target proteins after the initial 60 nanoseconds and had free binding energies of MMGBSA/MMPBSA that were better than the comparison ligands, including TMPRSS2–acanthomanzamine C (-28,2067; -24,6639 kcal/mol), TMPRSS2–cortistatin G (-29,9908; -24,8869 kcal/mol), spike protein–acanthomanzamine C (-45,1414; -27,8749 kcal/mol), and spike protein–cortistatin J (-37,8537; -35,6439 kcal/mol).  These results indicate that acanthomanzamine C, cortistatin G, and cortistatin J are hits compounds as candidate therapies for SARS-CoV-2 infection."

"SARS-CoV-2 merupakan virus RNA envelop dengan rantai untai tunggal positif yang menyebabkan COVID-19. Sejak awal teridentifikasi, SARS-CoV-2 menyebar secara luas dan cepat di seluruh dunia, sehingga WHO pada 11 Maret 2020 menyatakan COVID-19 sebagai suatu pandemi. SARS-CoV-2 mampu menginfeksi sel inang melalui proses pengikatan spike glikoprotein terhadap ACE2. Hingga saat ini, metode deteksi RT-PCR menjadi metode terbaik dalam deteksi COVID-19, namun penggunaannya dibatasi oleh reagen dan instrumentasi yang mahal. Oleh karena itu metode alternatif deteksi COVID-19 dapat menjadi solusi, salah satunya adalah sensor elektrokimia. Umifenovir (arbidol) merupakan senyawa elektroaktif yang dapat berinteraksi dengan spike glikoprotein SARS-CoV-2. Simulasi penambatan molekul menggunakan Molecular Operating Environment (MOE) memprediksi interaksi umifenovir-spike glikoprotein S2 SARS-CoV-2 terjadi secara optimum pada pH 7.4 dan temperatur 300K dengan △G binding -7.8414 kcal mol-1. Interaksi dimediasi oleh residu asam amino asam glutamat (Glu780) pada chain A. Uji interferensi menunjukkan kompleks umifenovir-HA H1N1 memberikan nilai △G binding -7.5822 kcal mol-1, namun tidak cukup kompetitif untuk mengganggu kompleks umifenovir-spike glikoprotein S2 SARS-CoV-2. Hasil studi komputasi kemudian menjadi acuan dalam pengukuran elektrokimia. Pada penelitian ini, perilaku elektrokimia umifenovir dipelajari menggunakan elektroda carbon foam (CF) yang dipreparasi secara hidrotermal-karbonisasi dan dikarakterisasi menggunakan instrumentasi XRD, FTIR, Raman, dan SEM-EDS. Elektroda carbon foam memiliki struktur berpori 3D dengan luas permukaan besar yang menyediakan situs reaksi reduksi-oksidasi bagi umifenovir. Melalui teknik cyclic voltammetry (CV) dan amperometri, ditemukan bahwa keberadaan spike glikoprotein S2 SARS-COV-2 menyebabkan penurunan respon arus umifenovir dengan waktu kontak optimum yaitu 5 menit. Pada konsentrasi yang sama, HA H1N1 dan spike glikoprotein S2 SARS-CoV-2 menyebabkan munculnya efek gabungan yang menurunkan respon arus umifenovir secara signifikan. Hasil tersebut mengindikasikan sensor elektrokimia umifenovir bersifat kurang selektif terhadap senyawa interferensi.

---

SARS-CoV-2 is a positive single-stranded RNA envelope virus that causes COVID-19. Since its initial identification, SARS-CoV-2 has spread widely and rapidly throughout the world, so the WHO on March 11, 2020 declared COVID-19 as a pandemic. SARS-CoV-2 is able to infect host cells through the binding process of spike glycoprotein to ACE2. Until now, the RT-PCR detection method has been the best method for detecting COVID-19, but its use is limited by expensive reagents and instrumentation. Therefore, an alternative method of detecting COVID-19 can be a solution, one of which is an electrochemical sensor. Umifenovir (arbidol) is an electroactive compound that can interact with the SARS-CoV-2 spike glycoprotein. Molecular docking simulation using Molecular Operating Environment (MOE) predicts the umifenovir-spike glycoprotein S2 SARS-CoV-2 interaction will occur optimally at pH 7.4 and temperature 300K with △G binding -7.8414 kcal mol-1. The interaction is mediated by the amino acid residue of glutamic acid (Glu780) in chain A. The interference test showed the umifenovir-HA H1N1 complex gave △G binding value of -7.5822 kcal mol-1, but was not competitive enough to interfere with the umifenovir-spike glycoprotein S2 complex of SARS-CoV. -2. The results of computational studies then become a reference in electrochemical measurements. In this study, the electrochemical behavior of umifenovir was studied using carbon foam (CF) electrodes prepared by hydrothermal carbonization and characterized using XRD, FTIR, Raman, and SEM-EDS instrumentation. The carbon foam electrode has a 3D porous structure with a large surface area that provides an oxidation-reduction reaction site for umifenovir. Through cyclic voltammetry (CV) and amperometry techniques, it was found that the presence of the SARS-COV-2 spike glycoprotein S2 caused a decrease in the current response of umifenovir with an optimum contact time of 5 minutes. At the same concentration, HA H1N1 and spike glycoprotein S2 SARS-CoV-2 caused a combined effect that significantly decreased the current response of umifenovir. These results indicate that the umifenovir electrochemical sensor is less selective for interfering compounds."

"ABSTRAKPenelitian ini bertujuan untuk mengetahui studi elektrokimia dari logam tembaga pada Printed Circuit Board PCB pada larutan asam sulfat H2SO4 dengan konsentrasi 0,1 M, 0,2 M dan 0,5 M dengan menggunakan metode pengujian pelindian yang disertai dengan pengujian polarisasi linear korosi dan pengujian Electrochemical Impedance Spectroscopy EIS . Pengujian polarisasi linear korosi dilakukan untuk mengetahui laju korosi dari sampel yang digunakan. Hasil dari pengujian linear korosi menunjukkan bahwa larutan asam sulfat dengan konsentrasi 0,5 M memiliki nilai icorr paling tinggi yang berarti laju korosinya juga paling cepat sebesar 3,76 mm/tahun. Selanjutnya dilakukan pengujian Electrochemical Impedance Spectroscopy EIS yang bertujuan untuk mengetahui ketahanan transfer muatan Rct atau ketahanan sampel terhadap korosi. Hasil yang didapatkan pengujian dengan menggunakan larutan asam sulfat 0,5 M memiliki ketahanan paling buruk yang memiliki nilai Rct sebesar 179 ? dan berarti laju pelindian paling tinggi. Pengujian ini menggunakan variabel waktu celup untuk mengetahui perilaku sampel terhadap variabel waktu. Lembaran tembaga dilakukan pengujian yang sama untuk variabel pembanding pada pengujian ini.

---

ABSTRACT

The purpose of this research is to know electrochemical studies of copper metal on Printed Circuit Board PCB in sulfuric acid solution H2SO4 with concentrations of 0.1 M, 0.2 M and 0.5 M using leaching testing method accompanied by linear corrosion polarization testing and Electrochemical Impedance Spectroscopy EIS testing. Linear linear polarization testing was performed to determine the corrosion rate of the samples used. The result of corrosion linear test showed that the solution of sulfuric acid with a concentration of 0.5 M has the highest icorr value which means the fastest corrosion rate is 3.7669 mm year. Furthermore, the testing of Electrochemical Impedance Spectroscopy EIS which aims to determine the resistance of charge transfer Rct or sample resistance to corrosion. The results obtained by testing using 0.5 sulfuric acid solution have the worst resistance that has a Rct value of 179 and means the highest leaching rate. This test uses immerse time variable to know the behavior of the sample against time variable. The copper sheets were carried out the same tests for the comparison variables in this test. "

"Nikel dan kobalt adalah salah satu logam yang sangat penting seiring dengan kemajuan teknologi yang sangat pesat. Nikel dan kobalt merupakan logam yang sangat berkaitan erat dengan baja nirkarat atau stainless steel dan juga baterai generasi terbaru yaitu baterai berbasis Ni/Co. Hal ini mendorong penelitian dibidang ekstraksi kedua logam tersebut untuk dilakukan lebih dalam lagi.Pada penelitian ini akan dilakukan studi elektrokimia dari bijih nikel laterit dengan metode reduction roasting yang akan diikuti dengan pelindian pada larutan asam sulfat (hidrometalurgi). Metode ini memiliki beberapa keuntungan yang lebih baik daripada proses ekstraksi konvensional dari bijih nikel yaitu dengan pirometalurgi karena konsumsi energinya yang lebih kecil dan biaya operasi yang lebih murah. Sebelum dilakukan studi elektrokimia sampel terlebih dahulu melalui proses reduksi (sampai T = 1000°C dengan waktu penahanan selama 1 jam).Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui bagaimana perilaku dari bijih nikel laterit saat dilakukan pelindian pada larutan asam klorida (HCl) dengan konsentrasi yang divariasikan (1 M, 2 M, 4 M dan 6 M) pada temperatur ruang (±25°C) dengan metode studi elektrokimia, yaitu Open Circuit Potential, Electrochemical Impedance Spectroscopy, dan Linear Polarization. Nilai OCP mengalami kenaikan seiring dengan kenaikan konsentrasi larutan. Dari grafik LP dapat dilihat bahwa terbentuk lapisan pasif pada setiap konsentrasi.Hasil pengujian EIS menunjukkan kecenderungan penipisan lapisan pasif seiring dengan meningkatnya konsentrasi yang dapat dilihat dari nilai CPE yang meningkat. Dari studi elektrokimia yang telah dilakukan menujukkan bahwa dengan adanya peningkatan konsentrasi larutan terjadi kenaikan laju pelarutan.

---

Nickel and cobalt are one of the most important metals as technology advances very rapidly. Nickel and cobalt are metals that are strongly associated with stainless steel and the latest generation batteries which is Ni/Co-based batteries. This encourages research in the field of extraction of these two metals to be done even deeper.

In this research, electrochemical studies of laterite nickel ore will be carried out by roasting reduction method which will be followed by leaching in sulfuric acid solution (hydrometallurgical). This method has several advantages over conventional extraction processes from nickel ore, such as pyrometallurgy because of its lower energy consumption and lower operating costs. Before the electrochemical studies are carried out, the sample first goes through the reduction process stage (up to T = 1000°C with holding time = 1 hour).

The purpose of this study was to determine how the behavior of laterite nickel ore when leach in hydrochloric acid (HCl) solution with varied concentrations (1 M, 2 M, 4 M and 6 M) at room temperature (± 25°C) with electrochemical study method (Open Circuit Potential, Electrochemical Impedance Spectroscopy and Linear Polarization). OCP values increase with increasing concentration of solution. From the LP chart it can be seen that a passive layer is formed at each concentration.

The EIS test results show the tendency of thinning of the passive layer along with increasing concentration which can be seen from the increasing CPE value. From the electrochemical studies that have been carried out shows that the increase in solution concentration causes an increase in the dissolution rate."

"Indonesia memiliki kekayaan alam laut yang sangat beragam, yang dapat berpotensi untuk mengandung senyawa bioaktif yang masih kurang dieksplorasi lebih dalam. Dalam penelitian ini, peneliti ingin mengeksplorasi senyawa metabolit sekunder yang berasal dari invertebrata laut yang berada di perairan Indonesia dalam kegunaannya untuk mengatasi masalah pandemi yang terjadi di dunia selama 3 tahun terakhir. Sebanyak 137 senyawa yang diperoleh dari berbagai spesies invertebrata laut seperti karang lunak, tunikata, dan spons ditapiskan dengan menggunakan penapisan virtual terhadap ACE2 dan Spike Protein Virus varian omicron. Selanjutnya setelah didapatkan 20 senyawa yang memiliki potensi dari proses penapisan, dilakukan proses studi penambatan molekuler dan prediksi ADMET untuk menemukan senyawa terbaik dari senyawa yang telah terpilih. Setelah didapatkan senyawa paling baik, dilakukan studi dinamika molekuler untuk melihat kestabilan ligan-reseptor pada senyawa yang terbaik. Dari hasil penelitian didapatkan bahwa ada 2 senyawa yaitu Acanthomanzamine E dan Cortistatin L, yang menunjukkan hasil yang cukup menjanjikan sebagai bloker terhadap ACE2 dan juga SARS-CoV-2 Omicron SPV. Acanthomanzamine E memiliki energi ikatan sebesar -12,87 kcal mol dan -8,61 kcal/mol terhadap ACE2 dan SPV, sementara Cortistatin L memiliki energi ikatan sebesar -9,96 kcal/mol dan -7,56 kcal/mol terhadap ACE2 dan SPV. Simulasi MD sebesar 50ns menunjukkan kestabilan kedua senyawa pada reseptornya masing-masing, dan juga dibandingkan terhadap senyawa pembanding yaitu XX5 untuk pembanding terhadap ACE2 dan Ceftriaxone digunakan sebagai senyawa pembanding terhadap Spike Protein Virus SARS-CoV-2 varian omicron.

---

Indonesia has diversified marine creatures, which could potentially have bioactive substances still underexplored. In this research, we tried to explore these secondary metabolites from Indonesian marine invertebrates to find the lead compound in overcoming the pandemic problem that happened in the world for the last 3 years. A total of 137 compounds from different types of invertebrates, such as soft corals, tunicates, and sea sponges screened against ACE2 and Spike Protein Virus of the Omicron variant. From the virtual screening. we obtained top 20 compounds that have potential to bind with the receptors. Furthermore, molecular docking and ADMET prediction studied in the top 20 compounds to filter compound down to the best 2 compounds. We also did preliminary molecular dynamics studies to see the stability of ligand-receptor occur between the best compound and the receptor. We found that two compounds, Acanthomanzamine E and Cortistatin L, show prominent results as ACE2 and SARS-CoV-2 blockers, especially from molecular docking, which have -12,87 kcal/mol and -9,96 kcal/mol towards ACE2 and -8,61 kcal/mol and -7,56 kcal/mol towards SPV Omicron respectively. We see promising results from the 50 ns MD simulation of these compounds and their comparison which is XX5 for ACE2 receptor and Ceftriaxone in Spike Protein Virus SARS-CoV-2 omicron variant."