Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

"Ikan mujair (Oreochromis mossambicus) merupakan salah satu jenis ikan air tawar dari famili Cichlidae dan genus Oreochromis yang memiliki bentuk adaptasi serta tingkat toleransi yang tinggi terhadap kondisi habitatnya, misalnya pada tingkat salinitas yang tinggi. Danau Laut Mati Oemasapoka di Perairan Pulau Rote merupakan salah satu danau air asin yang menjadi habitat ikan mujair. Penelitian ini dilakukan untuk mengetahui hubungan kekerabatan spesies ikan mujair yang diperoleh dari Danau Laut Mati Oemasapoka dengan ikan mujair dari danau air tawar, Danau Ledulu yang berada pada perairan yang sama dengan melakukan identifikasi molekuler menggunakan metode DNA barcoding dengan gen CO1. Tahapan DNA barcoding terdiri atas ekstraksi DNA, amplifikasi gen CO1 melalui reaksi PCR, dan sekuensing. Hasil penelitian menunjukkan gen CO1 mampu mengidentifikasi bahwa ikan mujair yang hidup di danau air asin, Danau Laut Mati Oemasapoka merupakan jenis spesies yang sama dengan ikan mujair yang hidup di danau air tawar, Danau Ledulu dengan persentase kemiripan sebesar 99,53—100%. Rekonstruksi pohon filogenetik yang dibentuk dengan metode Maximum Likelihood, model evolusi Kimura 2-Parameter, dan uji bootstrap 1000x menunjukkan bahwa ikan mujair dari Danau Laut Mati Oemasapoka dan Danau Ledulu berada dalam satu klade yang sama dengan jarak genetik sebesar 0,000—0,004. Analisis keragaman haplotipe dari ikan mujair yang diperoleh dari Danau Laut Mati Oemasapoka dan Danau Ledulu terdapat satu haplotipe dengan nilai keragaman sebesar 0,0824. Rendahnya nilai keragaman haplotipe tersebut dapat disebabkan karena ikan mujair Danau Laut Mati Oemasapoka dan Danau Ledulu memiliki tingkat migrasi yang rendah.

---

Tilapia fish (Oreochromis mossambicus) is one type of freshwater fish from the family Cichlidae and genus Oreochromis which has a form of adaptation and a high level of tolerance to habitat conditions, for example at high salinity levels. Dead Sea Lake Oemasapoka, Rote Island is one of the saltwater lakes that is a habitat for tilapia fish. This study was conducted to determine the relationship between tilapia species obtained from Dead Sea Lake Oemasapoka and tilapia fish from freshwater lake, Lake Ledulu which are in the same waters by conducting molecular identification using DNA barcoding method with CO1 gene. The DNA barcoding stages consist of DNA extraction, CO1 gene amplification through PCR reactions, and sequencing. The results of this study indicate that the CO1 gene is able to identify that tilapia fish that live in saltwater lakes, Dead Sea Lake Oemasapoka are the same species as tilapia fish that live in freshwater lakes, Lake Ledulu with a similar percentage of 99,53-100%. Reconstruction of the phylogenetic tree using the Maximum Likelihood method Kimura 2-Parameter evolution model, and 1000x bootstrap test showed that tilapia fish from Dead Sea Lake Oemasapoka and Lake Ledulu were in the same clade with a genetic distance of 0.000-0.004. Analysis of haplotype diversity of tilapia fish obtained from Dead Sea Lake Oemasapoka and Lake Ledulu there is one haplotype with a diversity value of 0.0824. The low value of this haplotype diversity can be caused by a low migration rate."

"Phylogenetic tree merupakan suatu diagram berbentuk tree yang merepresentasikan hubungan evolusi atau kekerabatan antar spesies yang hidup di bumi. Phylogenetic tree dibentuk berdasarkan struktur genetik spesies yang dinyatakan dalam sekuens DNA atau protein. Penulisan tugas akhir ini bertujuan untuk membangun sebuah aplikasi berbasis web yang digunakan untuk membangun phylogenetic tree dari sebuah matriks jarak (distance matrix) berdasarkan sekuens DNA. Metode pembentukan tree yang dipakai dalam aplikasi ini adalah metode berdasarkan jarak (distance methods) dan algoritma yang dipakai adalah neighbor-joining (NJ). Algoritma ini memerlukan input berupa matriks jarak dan menghasilkan output berupa tree. Tree yang dihasilkan dapat dipakai untuk melihat hubungan kekerabatan antar spesies yang terlibat atau spesies yang dibandingkan. Aplikasi ini dibuat dengan menggunakan bahasa pemrograman php yang bersifat open source, sehingga dapat diakses secara online.Kata kunci : phylogenetic tree, matriks jarak, neighbor-joining, sekuens DNA.viii + 70 hlm.; lamp.Bibliografi: 12 (2002-2008)"

"Penelitian mengenai keanekaragaman lobster air tawar di Kabupaten Sorong Selatan, Maybrat, dan Jayawijaya dilakukan pada bulan Agustus 2016. Penelitian bertujuan untuk melihat keanekaragaman lobster air tawar melalui analisis morfometrik dan DNA Barcoding. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa karakteristik A1-D6 dari ke empat lokasi pengambilan sampel terdapat perbedaan yang signifikan p.

---

Research on the Research on the diversity of freshwater crayfish in Sorong Selatan Regency, Maybrat, and Jayawijaya conducted in August 2016. The study aims to see the diversity of freshwater crayfish through morphometric analysis and DNA Barcoding. These results indicate that the A1 D6 characteristics of all four sampling sites there are significant differences p "

"Bacopa sp. merupakan genus tanaman air yang umumnya digunakan sebagai tanaman hias akuarium. Sekitar 60 spesies Bacopa tersebar di seluruh dunia. Namun, data molekuler dan analisis filogenetik terhadap spesies-spesies tersebut masih sangat terbatas. Studi ini dilakukan untuk mengidentifikasi tujuh spesies Bacopa menggunakan penanda molekuler dan mengetahui hubungan kekerabatan antar spesies melalui nilai jarak genetik. Sebanyak tujuh spesies Bacopa diamati secara morfologi dan diidentifikasi secara molekuler menggunakan sekuens rbcL melalui metode DNA Barcoding dan RAPD marker. Hasil amplifikasi DNA Bacopa sp. divisualisasikan pada gel agarosa dengan konsentrasi 1,5% (rbcL) dan 2% (RAPD marker). Data yang didapatkan kemudian diolah menggunakan aplikasi MEGA (rbcL) dan NTSys (RAPD marker) untuk diketahui hubungan kekerabatannya. Amplifikasi tujuh spesies Bacopa sp. menggunakan rbcL menghasilkan tujuh amplikon yang berukuran sekitar 600 bp. Selain itu, amplifikasi menggunakan delapan primer RAPD juga berhasil dilakukan pada lima spesies Bacopa sp. dan menunjukkan tingkat polimorfisme sebesar 100%. Bacopa rotundifolia dan B. myriophylloides tidak berhasil diamplifikasi oleh delapan primer RAPD karena ketidakcocokan cetakan DNA dengan primer. Analisis filogenetik berdasarkan sekuens rbcL menggunakan metode UPGMA menunjukkan bahwa tujuh spesies Bacopa memiliki rentang jarak genetik 0,000—0,024, sedangkan berdasarkan RAPD, tujuh spesies Bacopa memiliki rentang jarak genetik 0,000—0,625. Identifikasi menggunakan sekuens rbcL lebih dianjurkan karena hasil RAPD sulit untuk diinterpretasikan dan dapat menimbulkan salah tafsir.

---

Bacopa sp. is a genus of aquatic plants commonly used as aquarium ornamental plants. About 60 species of Bacopa are distributed throughout the world. However, data on molecular identification and phylogenetic analysis of this species are still limited. This study was conducted to identify seven species of Bacopa using molecular markers and determine the relationship among species through the value of genetic distance. A total of seven species of Bacopa were observed morphologically and identified molecularly using rbcL sequences through DNA barcoding and RAPD marker methods. The results of Bacopa DNA amplification were visualized on agarose gel with a concentration of 1.5% (rbcL) and 2% (RAPD marker). The data obtained then processed using the MEGA (rbcL) and NTSys (RAPD marker) applications to determine the relationship among them. Amplification of seven species Bacopa sp. using rbcL resulted in an amplicon measuring about 600 bp. In addition, amplification using eight RAPD primers was also successfully carried out on five species of Bacopa and showed a polymorphism rate of 100%. Bacopa rotundifolia and B. myriophylloides were not successfully amplified by eight RAPD primers due to a mismatch of DNA templates with primers. Phylogenetic analysis based on rbcL sequences using the UPGMA method showed that seven Bacopa species had a genetic distance range of 0.000-0.024, while based on RAPD, seven Bacopa species had a genetic distance range of 0.000-0.625. Identification using the rbcL sequence is recommended because RAPD results are difficult to interpret and can lead to misinterpretation."

"Mikroplastik didefinisikan sebagai partikel plastik dengan ukuran <5 mm. Mikroplastik dapat masuk ke dalam tubuh organisme air khususnya ikan melalui oral dan insang. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui bentuk dan kelimpahan mikroplastik pada air, insang dan saluran pencernaan ikan mujair Oreochromis mossambicus (Peters, 1852) serta menguji perbedaan kelimpahan mikroplastik pada ikan mujair di Danau Kenanga dan Danau Agathis Universitas Indonesia. Penelitian dilakukan di Departemen Biologi FMIPA UI, Depok. Sampel ikan mujair diperoleh sebanyak total 20 ekor dari kedua danau dengan panjang tubuh relatif antara 16--19 cm. Insang dan saluran pencernaan dari 20 sampel ikan mujair diisolasi, kemudian diekstraksi dan dihancurkan menggunakan larutan asam nitrat (HNO3) 65%. Sampel yang telah diekstraksi kemudian diberi larutan NaCl jenuh agar mikroplastik mengapung ke permukaan. Sampel diteteskan sebanyak 1 ml pada Sedgwick Rafter Chamber kemudian diamati di bawah mikroskop dan dihitung jumlah mikroplastik berdasarkan bentuk partikelnya. Total kelimpahan rata-rata mikroplastik pada air Danau Kenanga sebesar 1.766,6 ± 40,11 partikel/L, sementara total kelimpahan rata-rata mikroplastik air pada Danau Agathis sebesar 1.885,53 ± 106,27 partikel/L. Total kelimpahan rata-rata mikroplastik ikan mujair pada Danau Kenanga di insang sebanyak 6.232 ± 1.898,66 partikel/ind dan di saluran pencernaan sebanyak 9.108 ± 4.027,14 partikel/ind, sementara total kelimpahan rata-rata mikroplastik ikan mujair pada Danau Agathis di insang sebanyak 6.716 ± 2.467,67 partikel/ind dan di saluran pencernaan sebanyak 4.038 ± 2.180,75 partikel/ind. Persentase komposisi bentuk mikroplastik yang ditemukan dominan pada Danau Kenanga terdapat bentuk fragmen sebesar 40% di air; fiber 80% di insang dan fiber 75% di saluran pencernaan, Sementara komposisi bentuk mikroplastik yang ditemukan dominan pada Danau Agathis terdapat bentuk fiber sebesar 43% di air; 75% di insang dan 67% di saluran pencernaan. Hasil analisis statistik Uji Mann-Whittney menunjukkan adanya perbedaan secara signifikan kelimpahan mikroplastik pada ikan mujair di Danau Kenanga dan Danau Agathis, Universitas Indonesia.

---

Microplastics are define as plastic particles with a size of <5 mm. Microplastics can enter the body of aquatic organisms, especially fish through the mouth and gills. This study aims to determine the shape and abundance of microplastics in water, gill and digestive tract tilapia fish Oreochromis mossambicus (Peters, 1852) at Kenanga Pond and Agathis Pond, University of Indonesia and to analyze and examine differences in the abundance of microplastics in tilapia fish at Kenanga Pond and Agathis Pond, University of Indonesia. The study was conducted at Department of Biology FMIPA UI, Depok. Total 20 tilapia fish from the two lakes with relative length between 16--19 cm. Gills and digestive tract samples were obtained of tilapia fish were isolated, extracted and then crushed using a saturated solution of nitric acid (HNO3) 65%. The extracted sample is then given NaCl solution so that the microplastic floats to the surface. As much as 1 ml NaCl were dropped in the Sedgwick Rafter Chamber then observed under a microscope. The number of microplastic was calculated based on the type. The average total abundance of microplastics in the water of Kenanga Pond was 1.766,6 ± 40,11 particles/L, meanwhile the average total abundance of microplastics in the water of Agathis Pond was 1.885,53 ± 106,27 particles/L. The average total microplastics in tilapia gill at Kenanga Pond was 6.232 ± 1.898,66 particles/ind and in the digestive tract was 9.108 ± 4,027.14 particles/ind, meanwhile the average total abundance microplastics in tilapia gill at Agathis Pond was 6.716 ± 2.467,67 particles/ind and in the digestive tract was 4.038 ± 2.180,75 particles/ind. The percentage composition of the microplastic form that was found dominant at Kenanga Pond were as much as 40% fragments in the water; 80% fiber in the gills and 75% fiber in the digestive tract. Meanwhile, the percentage composition of the microplastic form that was found dominant at Agathis Pond were as much as 43% fiber in the water; 75% in the gills and 67% in the digestive tract. The results of the Mann-Whittney test statistical analysis showed that there was significant difference between abundance of microplastics in tilapia fish at of Kenanga Pond and Agathis Pond, University of Indonesia."

"Telah dilakukan penelitian yang bertujuan untuk menganalisis bentuk dan kelimpahan mikroplastik pada air, insang, dan saluran pencernaan ikan mujair Oreochromis mossambicus dan ikan setan merah Amphilophus labiatus yang terdapat di Situ Salam, Kampus Universitas Indonesia, Depok. Sampel air diambil sebanyak 20 L lalu disaring menggunakan plankton net sampai volume air menjadi 200 ml sementara sampel ikan mujair dan ikan setan merah diambil masing-masing 10 ekor dengan jala lalu disimpan di wadah penyimpanan berisi formalin 40%. Ekstraksi sampel dilakukan di Laboratorium Biologi Kelautan, Departemen Biologi, FMIPA UI dengan metode dekstruksi oleh HNO3 65% kemudian dilakukan analisis bentuk dan kelimpahan mikroplastik di bawah mikroskop. Hasil penelitian menunjukkan, rata-rata total kelimpahan mikroplastik pada air diperoleh 153,7 ± 44,2 partikel L-1, pada saluran pencernaan ikan mujair diperoleh 2.868 ± 723,5 partikel ind-1, pada saluran pencernaan ikan setan merah diperoleh 3.548,4 ± 1031,4 partikel ind-1, pada insang ikan mujair diperoleh 3.782,6 ± 1.171,6 partikel ind-1, dan pada insang ikan setan merah diperoleh 3.848 ± 863,1 partikel ind-1. Bentuk mikroplastik yang mendominasi pada air situ, saluran pencernaan, dan insang adalah bentuk fiber. Berdasarkan hasil Uji T Dua Sampel terhadap sampel insang dan pencernaan dari ikan mujair dan ikan setan merah menunjukkan tidak ada perbedaan signifikan.

---

Research has been carried out that aims to analyze the shape and microplastics in the water, gills, and digestive tract of tilapia fish Oreochromis mossambicus and red devil fish Amphilophus labiatus that found in Salam Lake, University of Indonesia Campus, Depok. Water samples were taken as much as 20 L and then filtered using a plankton net until the water volume became 200 ml while samples of tilapia fish and red devil fish were taken each with a net and stored in a storage container containing formalin 40%. Sample extraction was carried out at the Marine Biology Laboratory, Department of Biology, FMIPA UI with the destruction method by HNO3 65% and then analyzed the shape and abundance of microplastics under a microscope. The results showed that the average total abundance of microplastics in water was 153,7 ± 44,2 L-1 particles, in the digestive tract of tilapia fish it was obtained 2.868 ± 723,5 ind-1 particles, in the digestive tract of red devil fish obtained 3.548,4 ± 1.031,4 ind-1 particles, in the gills of tilapia fish obtained 3.782,6 ± 1.171,6 ind-1 particles, and in the gills of red devil fish obtained 3.848 ± 863,1 particles ind-1. The predominant form of microplastic in the water, digestive tract, and gills is the form of fiber. Based on the results of the Two-Sample T-Test on gill and digestive samples of tilapia fish and red devil fish, there is no significant difference."

"Telah dilakukan penelitian yang bertujuan untuk menganalisis bentuk dan kelimpahan mikroplastik pada air, insang, dan saluran pencernaan ikan mujair Oreochromis mossambicus dan ikan setan merah Amphilophus labiatus yang terdapat di Situ Salam, Kampus Universitas Indonesia, Depok. Sampel air diambil sebanyak 20 L lalu disaring menggunakan plankton net sampai volume air menjadi 200 ml sementara sampel ikan mujair dan ikan setan merah diambil masing-masing 10 ekor dengan jala lalu disimpan di wadah penyimpanan berisi formalin 40%. Ekstraksi sampel dilakukan di Laboratorium Biologi Kelautan, Departemen Biologi, FMIPA UI dengan metode dekstruksi oleh HNO3 65% kemudian dilakukan analisis bentuk dan kelimpahan mikroplastik di bawah mikroskop. Hasil penelitian menunjukkan, rata-rata total kelimpahan mikroplastik pada air diperoleh 153,7 ± 44,2 partikel L-1, pada saluran pencernaan ikan mujair diperoleh 2.868 ± 723,5 partikel ind-1, pada saluran pencernaan ikan setan merah diperoleh 3.548,4 ± 1031,4 partikel ind-1, pada insang ikan mujair diperoleh 3.782,6 ± 1.171,6 partikel ind-1, dan pada insang ikan setan merah diperoleh 3.848 ± 863,1 partikel ind-1. Bentuk mikroplastik yang mendominasi pada air situ, saluran pencernaan, dan insang adalah bentuk fiber. Berdasarkan hasil Uji T Dua Sampel terhadap sampel insang dan pencernaan dari ikan mujair dan ikan setan merah menunjukkan tidak ada perbedaan signifikan.

---

Research has been carried out that aims to analyze the shape and microplastics in the water, gills, and digestive tract of tilapia fish Oreochromis mossambicus and red devil fish Amphilophus labiatus that found in Salam Lake, University of Indonesia Campus, Depok. Water samples were taken as much as 20 L and then filtered using a plankton net until the water volume became 200 ml while samples of tilapia fish and red devil fish were taken each with a net and stored in a storage container containing formalin 40%. Sample extraction was carried out at the Marine Biology Laboratory, Department of Biology, FMIPA UI with the destruction method by HNO3 65% and then analyzed the shape and abundance of microplastics under a microscope. The results showed that the average total abundance of microplastics in water was 153,7 ± 44,2 L-1 particles, in the digestive tract of tilapia fish it was obtained 2.868 ± 723,5 ind-1 particles, in the digestive tract of red devil fish obtained 3.548,4 ± 1.031,4 ind-1 particles, in the gills of tilapia fish obtained 3.782,6 ± 1.171,6 ind-1 particles, and in the gills of red devil fish obtained 3.848 ± 863,1 particles ind-1. The predominant form of microplastic in the water, digestive tract, and gills is the form of fiber. Based on the results of the Two-Sample T-Test on gill and digestive samples of tilapia fish and red devil fish, there is no significant difference. "

"Penelitian bertujuan untuk memperoleh dan mengidentifikasi isolat-isolat bakteri endofit yang potensial senyawa bioaktif antidiare dari tanaman N. altissima; mendeteksi, memurnikan dan mengidentifikasi senyawa bioaktif antidiare yang dihasilkan; serta menganalisis mekanisme kerjanya dalam menghambat pertumbuhan bakteri uji. Bakteri endofit diisolasi dari bagian akar, kulit batang, dan daun tanaman N. altissima. Bakteri endofit diisolasi dan dimurnikan menggunakan medium Nutrient Agar NA dan Luria Bertani LB agar. Aktinomisetes endofit diisolasi dan dimurnikan menggunakan medium Starch Casein Agar SCA dan International Streptomyces Project ISP 2 agar. Identifikasi bakteri dan aktinomisetes endofit dilakukan secara molekuler dengan melakukan analisis filogenetik sekuen nukleotida bakteri dari daerah 16S rRNA dengan metode Neighbour Joining NJ . Isolasi dan purifikasi senyawa dilakukan dengan metode maserasi menggunakan pelarut etil asetat dan kromatografi kolom. Senyawa bioaktif dideteksi dengan teknik Kromatografi Lapis Tipis KLT bioautografi. Senyawa bioaktif yang dihasilkan oleh bakteri dan aktinomisetes endofit diidentifikasi dengan menggunakan KLT, spektroskopi Resonansi Magnetik Inti NMR dan Spektroskopi Massa LC-MS . Mekanisme aksi dari senyawa bioaktif antidiare dianalisis dengan menggunakan mikroskop elektron scanning SEM . Dari 185 isolat bakteri endofit yang diperoleh, 104 isolat 56,21 dari bagian daun; 51 isolat 27,56 dari bagian kulit batang; dan 30 isolat 16,21 dari bagian akar. Sedangkan dari 33 isolat aktinomisetes endofit yang diperoleh, dua isolat 6,06 dari bagian kulit batang, 31 isolat 93,94 dari bagian akar, dan tidak diperoleh isolat aktinomisetes dari daun. Spesies bakteri endofit potensial ialah Pseudomonas aeruginosa strain UICC B-40, P. aeruginosa strain UICC B-93, dan P. azotoformans strain UICC B-91. Sedangkan aktinomisetes endofit potensial diidentifikasi sebagai Streptomyces sp. strain UICC B-92 dan Nonomuraea sp. strain UICC B-94. Hasil identifikasi senyawa menunjukkan bahwa senyawa bioaktif yang diperoleh dari P. aeruginosa strain UICC B-40 diduga merupakan senyawa metabolit baru, terdiri atas 2E,5E -phenyl tetradeca-2,5-dienoate C20H28O2 . Senyawa bioaktif aktinomisetes Streptomyces sp. strain UICC B-92 ialah 4-O-glucocyl, 1-carboxyl-phenazine C19H18N2O8 . Senyawa turunan phenazine dengan adanya gugus gula dari isolat Streptomyces sp. strain UICC B-92 diduga merupakan senyawa bioaktif baru. Hasil bioassai aktivitas antibakteri menunjukkan baik senyawa bioaktif dari P. aeruginosa strain UICC B-40 maupun Streptomyces sp. strain UICC B-92 menghambat bakteri Gram positif Bacillus cereus strain ATCC 10876 dan Staphylococcus aureus strain ATCC 25923. Mekanisme penghambatan dari kedua senyawa menunjukkan adanya aktivitas lisis terhadap membran sel bakteri uji, ditunjukkan dengan terjadinya pemanjangan ukuran sel, kerusakan dan kebocoran membran sel sehingga mengganggu permeabilitas membran sel dan akhirnya menyebabkan kematina sel. Senyawa metabolit P. aeruginosa strain UICC B-40 lebih potensial sebagai senyawa antidiare dibandingkan senyawa metabolit dari Streptomyces sp. strain UICC B-92.Kata kunci : antidiare, bakteri endofit, 16S rRNA, lisis, Neesia altissima, spektroskopi.

---

The aims of this study were to obtain potential endophytic bacteria and actinomycetes from N. altissima as anti diarrhea bioactive producer and to screen and identify their anti diarrhea bioactive compound and to investigate the mechanism of action of the bioactive compound in inhibiting the growth of diarrhea causing bacteria. Media for endophytic bacteria isolation and purification were NA and LB agar, while media for endophytic actinomycetes isolation and purification were SCA and ISP2 agar. Identification of endophytic bacteria and actinomycetes was carried out based on phylogenetic analysis of DNA sequence generated from 16S rRNA region. Isolation, purification, and detection of bioactive compounds were carried out using maceration process, column chromatography and Thin Layer Chromatography TLC bioautography, respectively. Identification were elucidated using Nuclear Magnetic Resonance NMR and Liquid Chromatography Mass Spectroscopy LC MS analyses. The mechanism of action of bioactive compound were morphologically observed using scanning electron microscope SEM . In this study, from a total 185 endophytic bacteria obtained, 104 isolates 56.21 obtained from leaves, 30 isolates 16.21 from roots, and 51 isolates 27.56 from stem barks. From a total 33 endophytic actinomycetes isolates obtained, 31 isolates 93.94 from roots, two isolates 6.06 from stem barks, and no isolates obtained from leaves. Based on phylogenetic analysis of nucleotide sequence generated from 16S rRNA region, two isolates of endophytic bacteria determined as P. aeruginosa strain UICC B 40 and one isolate belongs to P. azotoformans strain UICC B 91 two isolates of endophytic actinomycetes determined as Streptomyces sp. strain UICC B 92 and Nonomuraea sp. strain UICC B 94 . On the basis of 1H NMR spectral data and supported with molecular weight data from LC MS analysis, bioactive compound from P. aeruginosa strain UICC B 40 was identified as growth associated metabolite, and determined as 2E,5E phenyl tetradeca 2,5 dienoate C20H28O2 . In addition, bioactive compound from Streptomyces sp. strain UICC B 92 was identified as 4 O glucocyl, 1 carboxyl phenazine C19H18N2O8 . The bioactive compound from Streptomyces sp. strain UICC B 92 is suggested as novel type of phenazine derivative. All of bioactive compounds showed high in vitro antibacterial activity against two Gram positive bacteria, Bacillus cereus strain ATCC 10876 and Staphylococcus aureus strain ATCC 25923. The bioactive compounds from P. aeruginosa strain UICC B 40 and Streptomyces sp. strain UICC B 92 showed membrane cell walls lysis mechanism. The cell walls of S. aureus strain ATCC 25923 and B. cereus strain ATCC 10876 were apparently damaged after treated by the antibacterial compound. Occurrence of local rupture or pore formation in the cell membranes was also found and causing leakage of essential intracellular constituents from the cells. The bioactive compound from P. aeruginosa strain UICC B 40 is more potential as anti diarrhea compound than that from Streptomyces sp. strain UICC B 92.Key words antidiarrhea, endophyte bacteria, 16S rRNA, lysis, Neesia altissima, spectroscopy."

"Penerapan teknologi modern dalam sistem produksi nelayan seiring pembangunan ekonomi mengimbaskan perubahan struktural. Ketidak sesuaian bentuk teknologi tangkap ikan (fishing gear technology) yang diaplikasikan nelayan ternyata merupakan sebab utama tidak optimalnya tingkat produksi ikan yang dieksplorasi. Selain itu, penempatan nelayan tradisional semata-mata sebagai obyek bantuan dan sasaran pembangunan karena tidak dilibatkan sepenuhnya dalam proses perencanaan pembangunan ditengah lingkup persaingan perebutan sumber daya perikanan yang semakin terbatas potensinya, turut pula sebagai penyumbang dilema terikatnya komunitas nelayan dalam lingkaran kemiskinan dan statusquo. Pilihan teknologi "bagan boat" yang diterapkan dalam moda penangkapan ikan nelayan Kecamatan Sibolga merupakan suatu bentuk keberdayaan komunitas sosial, dimana sinergi ke-magnitude-an teknologi memiliki efek terhadap dinamika ekonomi dan tingkat kesejahteraan nelayan, dan melahirkan dampak sosial ekonomi bagi masyarakat pantai. Pengkajian kerangka pemikiran penelitian didasarkan atas teori moderninasi dan perubahan sosial dari aliran struktural fungsional sebagai kerangka untuk menjelaskan hubungan pilihan teknologi nelayan dengan perubahan struklur sosial ekonomi masyarakat pantai. Metode pengumpulan data utama ditempuh dengan teknik survey dan wawancara semi terbuka. Sedangkan data sekunder ditelaah dari naskah dan dokumen yang berkaitan dengan obyek penelitian. Hasil analisis data penelitian menawarkan kesimpulan sebagai berikut: pertama pilihan teknologi `bagan boat" oleh nelayan ternyata mampu meningkatkan pengetahuan nelayan tentang prasyarat teknologi yang diaplikasikan, serta merasionalkan nilai dan prilaku kerja nelayan dengan penerapan prinsip manajemen dalam proses produksi, kedua perubahan teknologi memiliki dampak sosial ekonomi diantaranya: (a) melebarnya rentang kesenjangan ekonomi karena distribusi penghasilan yang timpang antara nelayan pemilik alat produksi dan nelayan non-pemilik, (b) dominasi kelompok nelayan pemilik dalam relasi kega melemahkan daya tawar (bargaining position) nelayan non-pemilik, karena tidak berfungsinya mekanisme pasar dan aturan bagi basil, serta belum eksisnya peran lembaga sosial ekonomi dalam jaringan pemasaran perikanan laut, (c) meningkatnya intensitas materialisme budaya dalam hubungan antar lapisan sosial masyarakat pantai, (d) bertambahnya kausal potensi konflik pada masyarakat pantai karena peningkatan kuantitas pengeksplorasi perairan tradisional berpotensi sebagai penyulut disintegrasi sosial akibat perebutan pangsa (domain) yang terbatas oleh sifat pertumbuhan sumber daya perikanan (aquatic resources) yang bersifat alamiah dan tak terekayasa (unrenewable), dan ketiga implikasi modernisasi alat produksi memperjelas fungsi-fungsi jaringan kelembagaan sosial ekonomi dalam memaksimalkan produktivitas pengadopsi teknologi. "

"Tulisan yang berjudul nelayan, toke motor, dan toke ikan ini merupakan suatu deskripsi mengenai hubungan kerja nelayan. Pendeskripsian ini menggambarkan hubungan kerja dalam aktivitas produksi, pemasaran, dan bagi hasil. Yang ingin diketahui dalam pendeskripsian ini adalah bagaimana pola hubungan kerja nelayan. Penelitian ini dilakukan di desa Kuala Secapah Kecamatan Mempawah Hilir Kabupaten Pontianak. Metode yang digunakan adalah wawancara mendalam pada 39 informan dan partisipasi observasi dalam kegiatan produksi, pemasaran dan bagi hasil. Pengumpulan data didasarkan pada pemahaman pengetahuan masyarakat lokal dalam merumuskan realita kehidupannya, yang kemudian diinterpretasi melalui proses dialog antara peneliti dengan informan dalam menafsirkan arti suatu gejala. Hubungan kerja yang selalu terjalin diantara ketiga pelaku ini secara struktural menempatkan toke ikan (agen) pada posisi yang lebih tinggi dan lebih memegang peranan yang dominan dalam mengendalikan hubungan kerja baik dalam kegiatan produksi maupun pemasaran. Demikian Pula praktek pola hubungan yang berbau ijon terhadap nelayan, kolusi dan oligopoli lebih mewarnai aktivitas pemasaran, sehingga pelaksanaan praktek lelang terbuka tidak pernah terwujud. Dalam keberlangsungan hubungan kerja ini, konflik merupakan suatu gejala yang selalu muncul walau masih sebatas konflik yang bersifat tertutup diantara para pelaku hubungan kerja. Munculnya konflik yang bersifat tertutup ini menandakan adanya perbedaan kepentingan diantara pelaku hubungan kerja, namun konflik yang terjadi masih disikapi sebagai konflik individu bukan sebagai konflik antar kelas dalam masyarakat nelayan. Selain itu konflik yang bersifat tertutup ini juga merupakan suatu pertanda masih ada upaya pemeliharaan sikap harmoni pada masyarakat nelayan, dan sekaligus penggambaran adanya sikap pasrah dan nerima dikalangan nelayan (pekerja) dalam menyadari keberadaannya pada posisi yang lemah dan tidak berdaya. Kepasrahan dan ketidakberdayaan nelayan (pekerja) juga tergambar dalam sistem bagi hasil yang diterapkan yang menempatkan penghasilan nelayan jauh lebih kecil dari yang diterima oleh toke motor maupun toke ikan, dan kepasrahan dalam menerima ketentuan harga. Guna mengangkat kesejahteraan hidup para nelayan kearah kesejahteraan yang agak berimbang dengan mitra kerjanya perlu pengaturan dan campurtangan pemerintah berkenaan dengan masalah bagi hasil, perlindungan kerja, dan penyempurnaan sistem pemasaran."