Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

"Mikroba endofit merupakan mikroba yang hidup bersimbiosis dengan tanaman inangnya dan dapat menghasilkan metabolit sekunder yang berpotensi seperti enzim, zat pengatur tumbuh, zat anti mikroba, anti fungi dan zat anti kanker. Metabolit ini bersifat bioaktif dan bermanfaat bagi tanaman inangnya dan juga bermanfaat bagi manusia. Di negara berkembang, kanker merupakan penyebab kematian utama disamping penyakit jantung dan serebrovaskular. Di Indonesia sebagai salah satu negara berkembang, kematian yang disebabkan penyakit kanker innempati urutan ke 6 dan jumlah penderita kanker akan meningkat setiap tahunnya. Keadaan ini mendorong pencarian dan pengembangan obat yang poten dan selektif terhadap sel kanker. Salah satunya dengan menggunakan bahan alam dari tanaman obat. Brucea javanica (L.) Merr dikenal oleh masyarakat dengan nama tanaman buah Makassar. Tanaman ini banyak digunakan oleh masyarakat untuk mengobati kanker leukemia, kanker servik, kanker kulit, kanker paru, disamping penggunaan sebagai obat malaria, dan disentri. Penelitian tentang bahan alam dari tanaman telah banyak dilakukan tetapi penelitian mengenai mikroba yang dapat menghasilkan suatu substansi zat anti kanker masih belum banyak dilakukan, oleh karena itu dilakukan penelitian mikroba endolit dari tanaman Bruceajavanica (L_) Merr. Sampel diambil dari 3 lokasi (Bogor, Cianjur dan Tawangmangu) Bagian tanaman yang digunakan adalah ranting, buah dan daun. Tujuan dari penelitian ini untuk mencari mikroba endoiit dari tanaman Brucea javanica (L) Men yang dapat menghasilkan metabolit sekunder yang berpotensi sebagai zat anti kanker. Metode yang digunakan untuk isolasi mikroba endofit adalah dengan sterilisasi. permukaan dan metode tanam langsung. Untuk mendapatkan metabolit sekunder diiakukan fermentasi cair menggunakan medium Potato Dextrose Yeast extract (PDY) dengan melode goyang selama 14 hari. Untuk uji sitotoksik digunakan sel Leukemia L1210, sel Raji, NS-l, sel HeLa serta sel Vero. Sebagai kontrol positif digunakan Doxoruhisin. Pengamatan dilakukan selama 24 jam dan 48 jam dengan menghitung sel hidup menggunakan metode tripan biru. Penghitungan IC5g dilakukan secara aritmatikal dengan rumus Reed and Muench. Untuk melihat mekanisme kerja pada proses sitotoksik dilakukan teknik pengecatan DNA menggunakan etidium bromida dan acridine orange. Dari penelitian ini diperoleh 46 bakteri endolil dan 45 kapang endofit. Dapat diidentifikasi 13 spesies bakteri endofit. Isolat kapang endolit 1.2.1.1 adalah kapang Fusarium chlamydosporum dan isolat kapang 1.2.2 adalah Glomereila sp. Hasil uji sitotoksik dari 18 kapang endotit terhadap sel Leukemia L1210,mempunyai IC 50 berkisar antara 3,29 - 15,90 ug/ml. Hasil uji sitotoksik isolat 1.2.1.1 diperoleh nilai IC50 tcrhadap sel Raji 58,35ug/ml, 88,39 ug/ml; IC50 sel NS-1 162,09 pg/ml, 66,24 pg/ml; IC;-3 sel HeLa 361,21 pg/ml, 219,97 ug/ml. IC50 Doxorubisin terhadap sel HeLa 79,14 dan 14,23. Nilai 1C50 terhadap sel Vero 1075,18 ug/ml, dan 656,82 pg,/ml. [C50 Doxorubisin terhadap sel Vero 290,77 dan 89,43 ug/ml. Data tersebut masing masing untuk pengamatan 24 jam dan 48 jam. Hasil uji Sitotoksik Fraksi akhir (F4) terhadap sel Leukemia diperoleh nilai IC5g 4,29 ug/ml. Hasil LC-MS puncak 3 dan 5 diperoleh senyawa senyawa yang mempunyai M (Berat molekul] 487 dan M 252 dalton yang mungkin merupakan derivat (turunan) Bruceosin dan turunan Canthin-6-onc. Bruceosin dan Canthin-6-one adalah metabolit sekunder dari tanaman Brucea javanica (L.) Merr. Diduga puncak 3 dan S kemungkinan merupakan senyawa derivat dari Bruceosin dan Canthine-6-one yang mempunyai efek sitotoksik. Dari hasil penelitian ini dapat disimpulkan kapang dan bakteri endotit dapat diisolasi dari tanaman Brucea javantca (L) Merr Bogor, Cianjur dan Tawangmangu. Isolat kode 1. 2.11 memiliki efek sitotoksik yang selektif terhadap sel kanker. Ada kecenderungan isolat 1.2.11 mempunyai efek sitotoksik terhadap sel NS-1 melalui mekanisme apoptosis."

"Kanker serviks berada di peringkat ketiga sebagai kanker yang paling banyak menyebabkan kematian wanita di seluruh dunia dan menempati peringkat pertama di negara berkembang. Kanker ini disebabkan oleh infeksi human papilloma virus (HPV) yang memiliki onkoprotein E6 dan E7 yang mempengaruhi regulasi epigenetik termasuk overekspresi gen histone deacetylase (HDAC) yang menyebabkan karsinogenesis serviks. Sehingga HDAC menjadi target inhibisi yang potensial untuk terapi kanker serviks. Pada penelitian ini, suatu seri terbaru senyawa turunan 4-[(2-okso-1,3-thiazolidin-3-yl)karbonil]anilin dirancang sebagai inhibitor HDAC (HDACI) terbaru berdasarkan pendekatan de novo. Aktivitas inhibisi dari ligan rancangan ini terhadap HDAC kelas II Homo sapiens ditentukan melalui simulasi molecular docking. Analisis docking menghasilkan delapan ligan terbaik (F, Ib14, O38, Kb17, Gd40, Aa50, Gc42, dan Bb38) yang memiliki afinitas pengikatan lebih baik dibandingkan standar. Kemudian analisis interaksi mengindikasikan bahwa seluruh ligan terbaik membentuk koordinasi dengan kofaktor zinc pada charge-relay system HDAC, juga ikatan hidrogen dan interaksi hidrofobik yang penting pada aktivitas inhibisi dari inhibitor HDAC. Analisis QSAR (quantitative structure-activity relationship) dari senyawa ini, termasuk karakter farmakologi, bioaktivitas, mutagenisitas-karsinogenisitas, dan karakter ADMET (absorpsi, distribusi, metabolisme, ekskresi, dan toksisitas) dilakukan secara in silico. Melalui analisis ini, kedelapan ligan terbaik memenuhi Lipinski’s rule of five, memiliki drug score yang lebih baik dibanding standar, dan juga menunjukkan bioaktivitas, bioavailabilitas oral, dan karakter ADMET yang baik. Seluruh ligan terbaik juga mudah disintesis serta terbukti sebagai senyawa baru yang belum pernah disintesis sebelumnya. Kestabilan kompleks HDAC-ligan pada pengaruh pelarut dikalkulasi melalui simulasi molecular dynamics (MD). Berdasarkan simulasi ini, ligan terbaik yang membentuk kompleks dengan HDAC memiliki stabilitas yang baik berdasarkan RMSD (root mean square deviation) dan analisis interaksi. Ligan terbaik ini dapat disintesis untuk pengujian klinis lebih lanjut. Penelitian ini diharapkan dapat menghasilkan inhibitor HDAC yang lebih potensial sebagai obat terbaru untuk terapi kanker serviks.

---

Cervical cancer ranks third as the most common deadly cancer in women worldwide and ranks first in developing countries. It is caused by human papillomavirus (HPV) infection which has E6 and E7 oncoproteins that induce epigenetic regulation including overexpression of histone deacetylases (HDACs) gene leading to cervical carcinogenesis. Thus HDACs becomes potential inhibition target for cervical cancer treatment.

In this study, a novel series of 4-[(2-oxo-1,3-thiazolidin-3-yl)carbonyl]aniline derivatives were designed as novel HDAC inhibitors (HDACIs) based on de novo approach. The inhibitory activity of these new designed ligands against Homo sapiens class II HDAC was determined by molecular docking simulation. Docking analysis has yielded eight best ligands (F, Ib14, O38, Kb17, Gd40, Aa50, Gc42, and Bb38) which have better binding affinity than the standards. Therefore, interaction analysis indicated that all best ligands were formed coordination with zinc cofactor in HDAC charge-relay system, also hydrogen bond and hydrophobic interaction which are essential for the HDAC inhibitory activities of these inhibitors.

QSAR (quantitative structure-activity relationship) analysis of these compounds including pharmacology properties, bioactivity, mutagenicity-carcinogenicity, and ADMET (absorption, distribution, metabolism, excretion, and toxicity) properties were done in silico. Through this analysis, all eight best ligands meet Lipinski’s rule of five, have a better drug score than standards, and shows good bioactivity, oral bioavailability and ADMET properties. All best ligands also have a good synthetic accessibility and were proved to be new compounds that never been synthesized before. Stability of HDAC-ligand complexes in the presence of solvent were also calculated through molecular dynamics (MD) simulation.

Based on this simulation, all best ligands complex with corresponding HDAC have a good stability based on RMSD (root mean square deviation) and interaction analysis. The best ligands can be synthesized for further clinical testing. This study is expected to produce more potent HDAC inhibitors as novel drugs for cervical cancer treatment."

"Kanker merupakan suatu penyakit yang dapat terjadi karena adanya kegagalan apoptosis. Kegagalan apoptosis ini disebabkan karena MDM2 menghambat aktivitas dari p53 sehingga procaspase-3 tidak teraktivasi menjadi caspase-3. Saat ini, pengobatan kanker telah banyak diterapkan. Namun pengobatan yang lebih efektif selalu dibutuhkan karena penyakit kanker terus bermutasi. Pencarian pun dilakukan dari sumber-sumber alam termasuk yang berasal dari laut. Pencarian senyawa bioaktif dari organisme laut ini tidaklah mudah sebab membutuhkan waktu yang lama dan biaya yang tidak murah. Oleh karena itu, digunakan pengujian secara in silico. Pada penelitian ini dilakukan penambatan senyawa bioaktif yang berasal dari saponin dan 2,5-piperazindion terhadap inhibitor MDM2 dan aktivator procaspase-3 dengan menggunakan parameter AutoDock dan Vina. Dari hasil penambatan, senyawa bioaktif terbaik yang direkomendasikan ialah yang memiliki energi bebas ikatan rendah yaitu 18-Oxotryprostatin A dan Intercedenside A sebagai Inhibitor MDM2 serta 6-Methoxyspirotryprostatin B dan Frondoside A sebagai aktivator procaspase-3.

---

Cancer is a disease that can occur because of apoptosis failure. The cause of apoptosis failure is MDM2, which can inhibit the activity of p53 so procaspase 3 can rsquo t be activated to caspase 3. Currently, the treatment of cancer has been applied widely. But the effective treatment always needed because cancer has been mutated. One of the treatments is the search of natural resources that comes from the sea. The search for bioactive compound from marine organisms is not easy because it takes a long time and the cost is not cheap. Therefore, in silico method is used.

In this research, we employed docking of bioactive compounds from saponin and 2,5 piperazinedione towards MDM2 inhibitor and procaspase 3 activator will be performed by using AutoDock and Vina. Based on the docking results, best recommended bioactive compounds are those who have low binding energy, they are 18 Oxotryprostatin A and Intercedenside A as MDM2 Inhibitor and 6 Methoxyspirotryprostatin B and Frondoside A as procaspase 3 activator."

"Latar belakang: Penyakit hati imbas obat akibat penggunaan obat anti tuberkulosis OAT merupakan salah satu faktor risiko yang telah dilaporkan Faktor kerentanan individu dalam memetabolisme dan detoksifikasi setiap obat yang dipengaruhi oleh faktor faktor genetik juga mempengaruhi kejadian penyakit hati imbas obat. Penelitian ini bertujuan untuk meneliti status asetilator enzim N Acetylator Transferase 2 NAT2 dan polimorfisme sitokrom P450 CYP 2E1 terhadap kejadian penyakit hati imbas obat. Metode: Studi kasus kontrol pada 50 pasien tuberkulosis di Rumah Sakit Cipto Mangunkusumo dan klinik paru PPTI yang dikelompokkan menjadi grup kasus n 25 dan grup kontrol n 25. Hasil: Dari 50 subyek penelitian didapatkan bahwa karakteristik subyek penelitian terbanyak berjenis kelamin perempuan 62 berusia 45 tahun 56 normoweight 66. Pada analisis bivariat terhadap faktor risiko kejadian penyakit hati imbas obat yang diinduksi oleh OAT hanya ditemukan faktor risiko status asetilator lambat enzim NAT2 yang signifikan dengan crude OR 1 563 95 KI 1 165 2 097 dengan p 0 002 sedangkan pada faktor risiko polimorfisme CYP 2E1 tidak ditemukan hasil yang bermakna secara statistik. Kesimpulan: Faktor risiko status asetilator lambat enzim NAT2 merupakan faktor risiko kejadian penyakit hati imbas obat yang diinduksi oleh OAT.

---

Background: Antituberculous agents is one of a drug induced liver injury's risk factors Individual susceptibility in drug metabolism and detoxification due to genetic factors was also reported lately. Among the individual susceptibility factors we would like to identify the genotype of N acetylator 2 enzyme status and polymorphism of cytochrome P450 2E1 as a risks factors of antituberculous agent induced liver injury.

Methods: This is a case control study in 50 tuberculous rsquo patient at Cipto Mangunkusumo hospital and PPTI clinics which were divided in control group n 25 and case group n 25.

Results: From 50 subjects the baseline charactersitic were mostly female 62 age 45 years old 56 normoweight 66 Bivariate analysis were performed to identify the risk factors and only slow acetylator status of NAT2 enzymes was found significant with crude OR 1 563 95 CI 1 165 ndash 2 097 p 0 002 but not in a CYP 2E1 polymorphism status.

Conclusions: Slow acetylator status of NAT2 enzymes was a risk factor for antituberculous agents ndash induced liver injury."

"Nanopartikel emas berpotensi dikembangkan sebagai nano medisin karena sifat nya yang mudah disintesa, mempunyai banyak kegunaan dan biokompatibel pada tubuh manusia. Dengan bantuan gom arab sebagai penstabil, vinkristin dikonjugasikan dengan nanopartikel emas. Penelitian ini berhasil mengembangkan sintesis dan karakterisasi nanopartikel emas berbasis gom arab terkonjugasi vinkristin dengan distribusi ukuran partikel rata rata dibawah 100 nm dengan menggunakan analisa ukuran partikel dan mikroskop transmisi elektron. Dilakukan uji sitotoksik dengan metode garam tetrazolium/ MTT [3-(4,5- dimethylthiazo-2-yl-)-2,5-diphenyl tetrazolium bromide] pada konjugat vinkristin-gom arab-nanopartikel emas menggunakan lini sel MCF-7 and CCRF. Hasil uji sitotoksisitas digambarkan dengan nilai IC50. Hasil uji pada 2 formula (vinkristin-gom arab-nanopartikel emas sebelum pemurnian dan sesudah pemurnian dengan kromatografi size exclusion) terhadap lini sel MCF-7 mempunyai IC50 berturut turut sebesar 3,59 and 3,10 μg/mL, sementara vinkristin murni sebagai pembanding menunjukkan IC50 yang lebih besar yaitu 125 μg/mL. Terhadap lini sel CCRF, konjugat sebelum pemurnian dan sesudah pemurnian nilai IC50 berturut turut adalah 1,026 μg/mL dan 2,607 ug/mL. Sementara berdasarkan data in vivo untuk melihat biodsitribusi konjugat pada hewan uji dan kemampuan sebagai agen pengontras pada Computed tomography (CT) termyata konjugat mampu terdistribusi di liver dan ginjal hewan uji dan dihasilkan nilai Haunsfield Unit (HU) pada uji dengan Computed tomography (CT) pada konjugat VCR-GA-AuNP lebih tinggi dibandingkan nilai HU pada Iodium sebagai pembanding. Dari hasil diatas dapat disimpulkan bahwa konjugat (Vinkristin-Gom Arab-Nanopartikel emas) mempunyai kemampuan untuk diteliti lebih lanjut dan dikembangkan sebagai bahan baru terapi obat kanker terarah.

---

Gold nanoparticles (AuNP) are potentially developed as nano medicine because AuNP are easily synthesized, functionalized, and biocompatible. With gum arabic as stabilizer, vincristine was conjugated with gold nanoparticles. Gold nanoparticles (AuNP) coated with conjugated gum arabic (GA) and vincristine (VCR) were successfully synthesized and characterized. The conjugation of GAVCR and AuNP displayed a narrow hydrodynamic particle size distribution with average size < 100 nm by TEM and particle size analyser. We investigated cytotoxic activity of conjugated vincristine-gum arabic-gold nanoparticle by tetrazolium salt assay (MTT) using cancer cell line MCF-7 and CCRF. Cytotoxic activity of conjugated VCR-GA-AuNP before and after purification by Size Exclusion Chromatography (SEC), against leukemia cell line CCRF and breast cancer cell line MCF-7 was described by IC50 value. All formulation had a cytototoxic of activity with IC50 <20 μg/ml. The IC50 of the conjugate before and after purification againts MCF-7 cell line were 3.59 and 3.10 ug/mL, respectively. Meanwhile, the IC50 of vincristine was considerable larger (>125 ug/mL). The IC50 of samples againts CCRF cell line were 1,026 μg/mL dan 2,607 ug/mL, respectively. Based on in vivo data to evaluate the biodistribution and their capacity for a contras agent, conjugate could distributed in the liver and kidneys with the resulting of Hounsfield Unit (HU) value of VCR-GA-AuNP is higher than the HU value of Iodine as a comparison. In conclusion, conjugated VCR-GA-AuNP had a good prospect for further investigation and could be developed as materials for new targeted cancer drug therapy."

"By focusing on general molecular mechanisms of antiviral drugs rather than therapies for individual viruses, this ready reference provides the critical knowledge needed to develop entirely novel therapeutics and to target new viruses.It begins with a general discussion of antiviral strategies, followed by a broad survey of known viral targets, such as reverse transcriptases, proteases, neuraminidases, RNA polymerases, helicases and primases, as well as their known inhibitors. The final section contains several cases studies of recent successful antiviral drug development.Edited by Erik de Clercq, the world authority on small molecule antiviral drugs, who has developed more new antivirals than anyone else."

"Over the past two decades the benefits of label-free biosensor analysis have begun to make an impact in the market, and systems are beginning to be used as mainstream research tools in many drug discovery laboratories. Label-free technologies for drug discovery summarises the latest and emerging developments in label-free detection systems, their underlying technology principles and end-user case studies that reveal the power and limitations of label-free in all areas of drug discovery.Label-free technologies discussed include SPR, NMR, high-throughput mass spectrometry, resonant waveguide plate-based screening, transmitted-light imaging, isothermal titration calorimetry, optical and impedance cell-based assays and other biophysical methods. The technologies are discussed in relation to their use as screening technologies, high-content technologies, hit finding and hit validation strategies, mode of action and ADME/T, access to difficult target classes, cell-based receptor/ligand interactions particularly orphan receptors, and antibody and small molecule affinity and kinetic analysis. Label-Free Technologies For Drug Discovery is an essential guide to this emerging class of tools for researchers in drug discovery and development, particularly high-throughput screening and compound profiling teams, medicinal chemists, structural biologists, assay developers, ADME/T specialists, and others interested in biomolecular interaction analysis."

"This book is about structural, physical, and chemical properties of fluorous compounds, selective fluoroalkylation of organic compounds by tackling the “negative fluorine effect”, synthetic and biological applications of fluorous reagents as phase tags, chemical applications of fluorous reagents and scavengers, methods for the synthesis of peptides and oligonucleotides, fluorous organic hybrid solvents for non-fluorous organic synthesis, fluorous catalysis : from the origin to recent advances, fluorous organocatalysis, thiourea based fluorous organocatalyst, fluoroponytailed crown ethers and quaternary ammonium salts as solid–liquid phase transfer catalysts in organic synthesis, fluorous hydrogenation, fluorous hydrosilylation, fluorous hydroformylation, incorporation of fluorous glycosides to cell membrane and saccharide chain elongation teflon AF materials, ecotoxicology of organofluorous compounds, and biology of fluoro-organic compounds."

"Efektifitas ECCT Electrical Capacitive Cancer Tomography untuk terapi kanker paru diselidiki dalam penelitian ini ECCT merupakan teknik terapi kanker menggunakan medan listrik statis dengan frekuensi 100 kHz dari sumber arus listrik bolak balik. ECCT menggunakan tegangan input 3V dan menghasilkan tegangan output 20 Vpp Rekonstruksi citra 2D dilakukan menggunakan software MATLAB R2009a Simulasi dilakukan berdasarkan metode elemen berhingga dengan menggunakan software COMSOL Multiphysics 3 5 untuk mengetahui besar nilai medan listrik yang efektif untuk terapi kanker paru. Hasil penelitian menunjukkan bahwa alat ECCT efektif pada daerah permukaan kanker paru paru karena terjadi peningkatan rasio permitivitas yang signifikan pada daerah interface antara 2 medium dan dipengaruhi juga oleh perubahan frekuensi dan tegangan. Sehingga pembunuhan sel kanker paru dapat dimulai dari permukaan Kata kunci ECCT medan listrik frekuensi tegangan kanker paru.

---

In this study the effectiveness of Electrical Capacitive Cancer Treatment ECCT in lung cancer therapy is being investigated ECCT is a technique of cancer treatment that uses electrostatic field from an AC current source with a frequency 100 kHz ECCT produces an AC output voltage of 20 Vpp from a DC input voltage of 3V 2D image reconstruction is done using MATLAB R2009a software. The simulation is carried out based on finite element method FEM using COMSOL Multyphysics 3 5 software to determine the optimal amount of electrical field for an effective lung cancer treatment. The simulation results show that ECCT device is effective at the surface area of lung cancer due to the significant increase of permittivity ratio at the interface between 2 medium and the change of frequency and voltage. So the killing of lung cancer cell can start from the surface of tissue Key words ECCT electric field frequency voltage lung cancer."