Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

"[Penicillium marneffei merupakan fungi patogen yang ditemukan di AsiaTenggara, khususnya Thailand. Penisiliosis dapat menyebabkan mikosis sistemiksehingga membahayakan nyawa penderita immunocompromised, khususnyapenderita HIV/AIDS. Antifungi seperti Fluconazole dan Ketoconazole, digunakanuntuk mengatasi infeksi P. marneffei. Akan tetapi, penggunaan antifungi secarajangka panjang dapat memicu kemungkinan munculnya mutan resisten P.marneffei. Resistensi pada fungi dapat dipengaruhi beberapa faktor, salah satunya,overekspresi transporter pengeluaran obat (drug efflux transporter). Mekanismepompa pengeluaran obat diatur oleh berbagai transporter. Transporter yang palingumum diketahui ialah transporter ABC (ATP-binding-cassette) dan MFS (MajorFacilitator Superfamily). Transporter ABC multidrug (MDR) pada P. marneffeitelah dipelajari dengan baik, sedangkan transporter MFS MDR pada fungitersebut, belum mendapatkan perhatian yang sama. Penelitian ini fokus pada satutransporter MFS MDR P. marneffei, yakni PMAA 067100, yang diekspresikanpada Saccharomyces cerevisiae ADΔ; sistem ekspresi yang sangat rentan terhadapberbagai macam antifungi. Pengamatan melalui mikroskop konfokal dan uji DiskDiffusion menunjukkan bahwa transporter PMAA 067100 terlokalisasi padamembran sel S. cerevisiae ADΔ dan resisten terhadap Fluconazole danTerbinafine.;Penicillium marneffei has been known as a pathogenic fungi which isfound in Southeast Asia, especially Thailand. The infection by this fungirecognized as Penicilliosis, that caused systemic mycosis, might be lethal inimmunocompromised patient, specifically HIV/AIDS patient. Antifungal such asFluconazole and Ketoconazole, had been used against P. marneffei infection.However, the long-term-use of antifungal might cause an emerging resistant strainof P. marneffei. The resistance phenomenon in fungi is caused by several factors,one of it is the overexpression of drug efflux transporter. Mechanism of this effluxpump is regulated by some of transporters such as ABC (ATP-binding-cassette)and MFS (Major Facilitator Superfamily) transporter. The ABC multidrug (MDR)transporter of P. marneffei has been studied well, yet the underrated MFS MDRtransporter of the same fungi has not received the same attention. This study focuson one of P. marneffei MFS MDR transporter, known as PMAA 067100, whichwas expressed in Saccharomyces cerevisiae ADΔ; an expression system which isvery susceptible to many kind of antifungal. Observation through confocalmicroscope and Disk Diffusion test showed that PMAA 067100 transporter waslocalized in S. cerevisiae ADΔ cell membrane and resistant against Fluconazoleand Terbinafine., Penicillium marneffei has been known as a pathogenic fungi which isfound in Southeast Asia, especially Thailand. The infection by this fungirecognized as Penicilliosis, that caused systemic mycosis, might be lethal inimmunocompromised patient, specifically HIV/AIDS patient. Antifungal such asFluconazole and Ketoconazole, had been used against P. marneffei infection.However, the long-term-use of antifungal might cause an emerging resistant strainof P. marneffei. The resistance phenomenon in fungi is caused by several factors,one of it is the overexpression of drug efflux transporter. Mechanism of this effluxpump is regulated by some of transporters such as ABC (ATP-binding-cassette)and MFS (Major Facilitator Superfamily) transporter. The ABC multidrug (MDR)transporter of P. marneffei has been studied well, yet the underrated MFS MDRtransporter of the same fungi has not received the same attention. This study focuson one of P. marneffei MFS MDR transporter, known as PMAA 067100, whichwas expressed in Saccharomyces cerevisiae ADΔ; an expression system which isvery susceptible to many kind of antifungal. Observation through confocalmicroscope and Disk Diffusion test showed that PMAA 067100 transporter waslocalized in S. cerevisiae ADΔ cell membrane and resistant against Fluconazoleand Terbinafine.]"

"Gejala infeksi virus chikungunya dapat menjadi hambatan sosioekonomi sehingga diperlukan deteksi dini infeksi tersebut. Badan Pengkajian dan Penerapan Teknologi (BPPT) memulai pengembangan kit diagnostik infeksi virus chikungunya berbasis imunologi menggunakan Rapid Diagnostic Test dari antibodi monoklonal envelope 1 (E1). Penelitian kloning dan ekspresi gen E1 virus chikungunya dari isolat Jambi bertujuan untuk memperoleh plasmid rekombinan pYES2-E1 dan protein rekombinan E1 dari host Saccharomyces cerevisiae INVSc1. Teknik yang digunakan yaitu kloning DNA plasmid pembawa gen E1 yang akan ditransformasikan ke Escherichia coli dan S. cerevisiae. Analisis hasil ekpresi protein E1 rekombinan menggunakan teknik western blot. Hasil dari penelitian ini menunjukkan plasmid rekombinan pYES2-E1 diperoleh menggunakan verifikasi teknik PCR dan double digestion. Hasil ekspresi protein rekombinan E1 pada S. cerevisiae INVSc1 menunjukkan terdapat band yang berukuran 34—43 kDa menggunakan teknik western blot. Protein E1 rekombinan yang berhasil terekspresi pada S. cerevisiae diperlukan validasi menggunakan antibodi monoklonal E1. Hasil isolasi plasmid pYES2-E1 dilanjutkan dengan verifikasi sekuensing DNA.

---

Symptoms of chikungunya virus infection can be a socioeconomic challenges, so early detection of the infection is needed. The Agency for the Assessment and Application of Technology (BPPT) began the development of an immunology-based chikungunya virus infection diagnostic kit using the Rapid Diagnostic Test from monoclonal envelope 1 (E1) antibodies. Research on cloning and expression of the chikungunya virus E1 gene from the Jambi isolate aimed to obtain recombinant pYES2-E1 plasmids and E1 recombinant proteins from the host Saccharomyces cerevisiae INVSc1. The technique used is to clone plasmid DNA E1 gene carriers which will be transformed into Escherichia coli and S. cerevisiae. Analysis of recombinant E1 protein expression using the western blot technique. The results of this study indicate that the recombinant pYES2-E1 plasmid was obtained using PCR verification techniques and double digestion. The results of E1 recombinant protein expression in S. cerevisiae INVSc1 showed a band of 34—43 kDa using western blotting technique. The recombinant E1 protein in S. cerevisae that was successfully expressed required validation using monoclonal E1 antibodies. The results of the pYES2-E1 plasmid isolation were followed by verification of DNA sequencing."

"

Manifestasi klinis seseorang yang terinfeksi virus chikungunya (CHIKV) mirip dengan seseorang yang terinfeksi virus dengue (DENV) sehingga menyulitkan para praktisi kesehatan dalam melakukan diagnosis penyakit. Badan Pengkajian dan Penerapan Teknologi (BPPT) telah memulai pengembangan kit diagnostik infeksi CHIKV berbasis protein rekombinan untuk mendeteksi keberadaan partikel CHIKV dalam serum darah. Penelitian sebelumnya, BPPT telah berhasil memproduksi serum antibodi poliklonal anti-CHIKV sebagai langkah awal pengembangan kit diagnostik. Penelitian kloning dan ekspresi gen envelope 2 (E2) virus chikungunya (CHIKV) Isolat Indonesia pada Saccharomyces cerevisiae merupakan penelitian lanjutan dengan tujuan untuk memperoleh plasmid rekombinan pYES2-E2 CHIKV dan untuk memperoleh protein rekombinan E2 yang diekspresikan oleh Saccharomyces cerevisiae. Protein rekombinan E2 yang dihasilkan akan diuji reaktivitasnya dengan menggunakan antibodi poliklonal anti-CHIKV yang telah diproduksi BPPT sebelumnya. Hasil penelitian menunjukkan bahwa plasmid rekombinan pYES2-E2 CHIKV telah berhasil diperoleh berdasarkan 2 metode verifikasi yaitu metode PCR dan metode digesti. Hasil analisis ekspresi protein dengan SDS PAGE menunjukkan pita protein pada berbagai macam ukuran. Analisis protein dengan western blotting memberikan hasil dengan munculnya pita protein pada kisaran ukuran 25--35 kDa. Protein rekombinan E2 CHIKV diduga telah berhasil diperoleh dan memerlukan pengujian lebih lanjut dengan menggunakan antibodi poliklonal anti-CHIKV.

---

Diagnosis of people-infected chikungunya virus (CHIKV) is quite challenging since it has similar symptoms with dengue virus infection. Badan Pengkajian dan Penerapan Teknologi (BPPT) had started the development of diagnostic kit chikungunya virus infection based on recombinant protein to improve the diagnosis of CHIKV infection. Previous research, BPPT had successfully produced policlonal antibody anti-CHIKV serum. Cloning and expression of envelope 2 (E2) gene chikungunya virus isolate from Indonesia in Saccharomyces cerevisiae is aimed to produce recombinant plasmid pYES2-E2 CHIKV and to produce recombinant protein E2 expressed by S. cerevisiae.  The results were recombinant plasmid pYES2-E2 CHIKV had successfully achieved based on 2 verification methods (PCR and digestion method). Protein expression analysis by western blotting gave result a single band appearance suspected E2 CHIKV protein with molecule size ranged from 25 to 35 kDa. Sample which positively contains recombinant protein E2 CHIKV is continued to test its reactivity with policlonal antibody anti-CHIKV serum which had previously produced by BPPT.

"

"Enzim glucose oxidase (GOX) telah dikenal lama sebagai bahan baku biosensor glukosa. Enzim GOX mengkatalisis reaksi oksidasi dari β-D-glucose menjadi D-glucono-δ-lactone dan hidrogen peroksida (H2O2) dengan menggunakan oksigen sebagai akseptor elektron. Klona gen GOX yang berasal dari Aspergillus niger di dalam vektor ekspresi Saccharomyces cerevisiae INVSc1 pYES2/CT telah berhasil di dapatkan pada penelitian sebelumnya. Penelitian ini bertujuan untuk mengekspresikan gen GOX rekombinan di dalam S. cerevisiae INVSc1. Plasmid rekombinan pYES2/CT yang mengandung gen GOX berhasil ditransformasi ke dalam S. cerevisiae INVSc1 menggunakan metode LiAc. Protein total diekstraksi menggunakan berbagai variasi metode. Metode vortex dengan penambahan glass beads sebagai teknik ekstraksi yang optimal. Protein rekombinan diinduksi dengan konsentrasi induser 2, 4 dan 8% galaktosa. Hasil induksi ekspresi protein tidak terlihat secara jelas, walaupun kemungkinan besar protein rekombinan GOX terdapat pada fase supernatan. Berdasarkan uji menggunakan glucose assay dan analisis biosensor glukosa, protein rekombinan GOX induksi dengan 8% galaktosa selama 48 jam mempunyai aktivitas lebih tinggi dibandingkan GOX komersial. Pada masa datang, perbaikan perlu dilakukan untuk mendapatkan hasil ekspresi protein GOX rekombinan yang optimal.

---

Glucose oxidase (GOX) enzyme has been applied as a raw material glucose biosensor. GOX enzyme catalyses the oxidation of β-D-glucose into D-glucono-δ-lactone and hydrogen peroxide (H2O2) using oxygen as an electron acceptor. Previously, GOX gene from Aspergillus niger was successfully cloned into Saccharomyces cerevisiae expression vector, pYES2/CT.

The purpose of this study was to express recombinant GOX gene in S. cerevisiae INVSc1. Recombinant plasmid pYES2/CT containing GOX gene was successfully transformed into S. cerevisiae INVSc1 using the LiAc method. Then the total proteins were extracted using various protocols with glass beads lyses method as the optimal extraction technique. The recombinant protein was induced by of 2, 4 and 8% galactose inducer.

However induced expression of this protein was not significantly observed, although it was shown that recombinant GOX protein was likely to be present in the supernatant phase. Based on glucose liquid assay and a preliminary glucose biosensor analysis, the recombinant GOX protein induced with 8% galactose for 48 hours had a higher activity than commercial GOX. In the future, further improvements need to be done to obtain optimal recombinant GOX protein expression."

"The whole cell immobilization in ethanol fermentation can be done by using natural carriers or through synthetic carriers. All of these methods have the same purpose of retaining high cell concentrations within a certain defined region of space which leads to higher ethanol productivity. Lignocellulosic plant substance represents one of highlypotential sources in ethanol production. Some studies have found that cellulosic substances substances can also be used as a natural carrier in cell immobilization by re-circulating pre-culture medium into a reactor. In this experiment, rice hulls without any treatment were used to immobilize Saccharomyces cerevisiae through semi solid state incubation combined with re-circulating pre-culture medium. The scanning electron microscopy (SEM) pictures of the carrier showthat the yeast cells are absorbed and embedded to the ricehull pore. In liquid batch fermentation system with an initialsugar concentration of 50 g/L, nearly 100% total sugar was consumed after 48 hours. This resulted in an ethanol yield of 0.32 g ethanol/g glucose, which is 62.7% of the theoretical value. Ethanol productivity of 0.59 g/(L.h) is 2.3 fold higher than that of free cells which is 0.26 g/(L.h). An effort to reuse the immobilized cells in liquid fermentationsystem showed poor results due to cell desorption in the first batch which led to high sugar concentration inhibitory effect in the second batch fermentation. This might be solved by using semi solid fermentation process in the future work. "

"ABSTRAKp-glukan memiliki banyak manfaat terutama di bidang kesehatan, diantaranya adalah sebagai anti kanker, anti tumor, mempertinggi sistemkekebalan tubuh dan menurunkan kadar kolesterol dalam darah. Dinding selS. cerews/ae mongandung 80-90% polisakarida yang sobagian bosarmerupakan p-glukan. Penelitian ini bertujuan mencari sumber karbon yangtepat bagi pertumbuhan S. cerevisiae, yang mudah didapatkan, dan lebihmurah harganya untuk meningkatkan produksi p-glukan. Sumber karbonyang digunakan yaitu glukosa, gula pasir mark Gulaku, sukrosa, dan molase.Proses fermentasi dilakukan dengan menggunakan fermentor air lift.Tahapan proses fermentasi meliputi pemurnian galur, peremajaan, prekultur,preparasi fermentor dan running fermentor h'mgga 84 jam. Pengambilansampei dilakukan untuk pengukuran pertumbuhan sel, analisis protein dankarbohidrat, serta ekstraksi p-glukan-. Pengukuran pertumbuhan sel dilakukanberdasarkan tingkat kekeruhan sel {Optical Density) menggunakanspektrofotometer UVA/IS pada A 550 nm. Kadar protein dalam media diukurmenggunakan metode Lowry pada A 755 nm, dan kadar karbohidrat diukurmenggunakan metode fenol sulfat pada A 490 nm. Hasil pengukuranpertumbuhan sel menunjukkan bahwa molase memiliki tingkat pertumbuhansel yang lebih tinggi tetapi tidak memberikan perbedaan yang nyata biladibandingkan sumber karbon lainnya. Analisis kadar protein dan karbohidratAdalami medium cenderung menurun. Ekstraksi p-glukan menunjukkan hasil deng^h urutan dari yang tertinggi yaitu dengan media sukrosa, gula pasir;merk Gulaku, molase, dan giukosa masing-masing sebesar 1100,0, 1000,0,966,7, dan 933,3 mg/L Dengan demikian sukrosa dan gula pasir dapat dipilihsebagai pengganti giukosa untuk memproduksi (3-glukan, selain itu molasejuga merupakan salah satu alternatif yang bisa dipilih karena molase mampumenghasilkan (3-glukan sebaik giukosa."

"Microbial Fuel Cell (MFC) adalah seperangkat alat yang mengubanenergi kimia dari proses metabolisme mikroba menjadi energi listrik. Mikroba(e.g. Saccharomyces cerevisiae) dapat digunakan untuk memproduksi listrikkarena proses metabolismenya rnelibatkan transpor elektron Prinsip dasarMFC adalan memanfaatkan proses transfer elektron dari pemecanan substratyang digunakan mikroorganisme ke elektroda (anoda). Proses transferelektron dari dalam sel ke anoda dapat dibantu senyawa redoks yang disebutmediator. Mediator yang digunakan dalam penelitian ini adalan methyleneblue (MB) yang diimobilisasi pada elektroda (anoda). Desain MFC padapenelitian ini menggunakan sistem dua kompartemen dengan protonexchange membrane (PEM) yang memisahkan kedua kornparternen. Selainmenggunakan PEM, akan dicoba juga penggunaan membran cangkang telursebagai pengganti PEM. Cyclic voltamogram yang didapat menunjukkanbanvva MB yang terimobilisasi pada elektroda karbon pasta memiliki sitatelektroaktit (reversibel). Uji ditusi yang dilakukan pada membran cangkangtelur rnenunjukkan banwa proton (H+), methylene blue, Fe(CN)63`, danglukosa dapat berditusi melewati membran cangkang telur. Produksi listrikMFC pada kondisi anoda anaerob dan aerasi oksigen pada katodamenghasilkan voltase dan arus maksimum sebesar 22,17 mV/cm2 dan 2,01 pA/cm? Produksi Iistrik pada MFC yang menggunakan membrancangkang telur menghasilkan voltase dan arus maksimum sebesar11,92 mV/omg dan 1,92 pA/cm?"

"An experiment to study the effect of elicitor derived from Saccharomyces cerevisiae (Hansen) on ajmalicine content of Catharanthus roseus (L) G. Don. callus cultures has been conducted. Callus was induced from leaf segment and grew on medium Zenk (1977) supplemented with 2,5 x 10 M NAA dan 10 M BAP. Callus on the third subculture level was elicited with elicitor derived from S. cerevisiae. The following concentrations of elicitor tested were 0;0,5; ang 2,5 %(g/v) and the harvesting times were 0,18, 36 and 72 hour. The ajmalicine was analized qualitatively and quantitavely by using high performance liquid chromatography (HPLC). Ajmalicine content was influenced concentration of elicitor and harvrst was analized. Guanlititatively by using high performance liquid chromatography (HPLC). Ajmalicine content was influenced by concentration of elicitor and harvesting time. A significant increase of ajmalicine content (303. 475 kurang lebih 5.602 ug/gDW) was achieved bu addition of elicitor of 0.5% (g/v) after 36 hour. This study show a significant increase of ajmalicine content in C, roseus callus cultures after being challenged with S. cerevisiae elicitor i.e. 69,334 %."

"Proyeksi penurunan suplai air bersih perkapita terjadi akibat keterbatasan sumber dan kenaikan populasi manusia. Pemanfaatan air laut yang berlimpah dengan teknologi desalinasi yang ada saat ini masih membutuhkan energi yang besar. Penelitian ini akan memaparkan hasil pengujian teknologi desalinasi baru yang hemat energi. Microbial Fuel Cell (MFC), yang bekerja dengan reaksi redoks dan merubah kesetimbangan ion, direkayasa dalam penelitian ini untuk desalinasi. MFC direkayasa menjadi 3 chamber (anoda-garam-katoda) yang dibatasi AEM (Anion Exchange Membrane) dan CEM (Cation Exchange Membrane), yang dinamakan MDC (Microbial Desalination Cell). Variasi jumlah elektroda, rasio kultur dan substrat di chamber anoda serta pengujian kenaikan volume kultur dan substrat di chamber anoda diamati pengaruhnya terhadap performa desalinasi dan jumlah energi listrik yang dihasilkan. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa dengan menggunakan 3 pasang elektroda, rasio kultur dan substrat 2:3 dan penaikan volume kultur dan substrat 1,5 kali menghasilkan performa desalinasi terbaik dengan laju desalinasi 0,377 mmol/jam, salt removal 34,52%, dan power density rata-rata 2,26.10-2 W/m3.

---

Declining projection of clean water supply percapita is caused by restrictiveness of water sources and rise of human population. Sea water utilization using current desalination technology still require huge amount of energy.

This research provides new energy-saving desalination technology. Microbial fuel cell which work by redox reaction resulted in imbalance ion concentration among chambers is engineered for desalination application without external energy using 3 chambers (anoda-salt-cathode), named MDC (Microbial Desalination Cell). Number of electrodes, ratio of culture:substrate, volume progression of culture and substrate are evaluated in terms of desalination and electrical energy generating performance.

This research show that MDC using 3 pairs of electrodes, culture and substrate's ratio of 2:3, and culture and progression 1.5 times of culture and substrate’s volume, give best desalination performance by desalination rate 0.377 mmol/h, salt removal 34.52%, and average power density 2.26.10-2 W/m3."

"Bioetanol muncul sebagai alternatif yang menjanjikan sebagai pengganti bahan bakar fosil, karena potensi sumber daya hayati (biomassa) yang cukup besar di Indonesia. Prosesnya sederhana dengan melakukan fermentasi biomassa menggunakan mikroorganisme penghasil etanol, seperti Saccharomyces cerevisiae. Hasil kultivasi secara umum kurang memberikan hasil yang memuaskan ketika fermentasi, khususnya pada hidrolisat lignoselulosa. Hal ini dapat diatasi dengan kultivasi menggunakan hidrolisat tersebut sehingga ketahanan khamir terhadap inhibitor bertambah. Media yang digunakan adalah hidrolisat tandan kosong sawit karena merupakan biomassa lignoselulosa yang mudah ditemukan di Indonesia. Kultivasi dilakukan secara batch untuk mendapatkan kondisi aerasi dan nutrisi optimal dengan cara menganalisis konsentrasi sel yang dihasilkan serta uji coba fermentasi etanol S. cerevisiae yang telah dikeringkan. Didapatkan kondisi optimal aerasi 1 v/v per menit dengan penambahan glukosa 5 g/L dengan yield etanol sebanyak 24%. Scale-up produksi didapatkan produk sebanyak 43,7 gram dengan biaya Rp 19.958,00 per gram.

---

Bioethanol emerges as a promising alternative to replace fosil-based fuel because of the biomass potency in Indonesia. The process in making it is rather simple, which is by fermenting biomass using ethanol producing microorganisms like Saccharomyces cerevisiae. A problem arises when conventional cultivated S. cerevisiae are used to ferment, especially on hydrolysate from lignocellulosic biomass, where they do not give a satisfying result. This can be solved by cultivating using the same hydrolysate used for fermentation so that the yeast can be more resistant towards inhibitors from the hydrolysate. The medium used is empty fruit bunch since it is easily found in Indonesia. Batch system is used for cultivation to get optimal aeration and nutrition condition by analyzing cell number and ethanol yield from dried S. cerevisiae. Condition of 1 v/v per minute aeration and added glucose 5 g/L with ethanol yield 24% is found to be most effective. Production scale-up resulted to 43,7 gram of dried yeast with cost Rp 19.958,00 per gram."