Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

Hasil Pencarian

Ditemukan 185722 dokumen yang sesuai dengan query
cover
Haidyan Wahyu Anugrha
"Deteksi cepat protein non-structural 1 (NS1) telah banyak digunakan untuk diagnosis infeksi dengue. Beberapa kit diagnostik yang mampu mendeteksi antigen NS1 sudah tersedia di Indonesia, salah satunya adalah SD Bioline Dengue Duo®. Penelitian ini merupakan studi cross-sectional, berbasis komunitas, yang mengevaluasi sensitivitas dan spesifisitas SD Bioline Dengue Duo® pada infeksi dengue primer dan sekunder di Jakarta, Indonesia dari tahun 2010 sampai 2011. Kinetika NS1 serta antibodi antidengue juga diamati. Sampel serum diambil dari 105 pasien dengan demam kurang dari 48 jam. Infeksi dengue dikonfirmasi menggunakan tiga tes standar emas, Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) dan/atau isolasi virus di cell line C6/36 dan/atau Imunoglobulin G (IgG) Enzyme Linked Immunosorbent Assay (ELISA).
Sensitivitas SD Bioline Dengue Duo® lebih tinggi pada infeksi primer (93,1% [95% CI, 92,7 sampai 100]) dibandingkan infeksi sekunder (86,1% [95% CI, 82,7 sampai 100]). Spesifisitas kit di kedua kelompok penelitian adalah 100%. Selain itu, penelitian kami menunjukkan bahwa pada infeksi sekunder, tes NS1 yang dilakukan sedini mungkin setelah onset demam berbuah pada sensitivitas kit yang lebih baik dibandingkan dengan studi-studi sebelumnya. Kemampuan kit untuk mendeteksi NS1 menurun seiring dengan perjalanan penyakit dan mencapai titik nadir pada hari ke 7 di kelompok infeksi primer maupun sekunder. Oleh karena sensitivitas yang baik dan spesifisitas yang sempurna, SD Bioline Dengue Duo® adalah alat yang dapat dipercaya untuk keperluan skrining infeksi dengue pada awal demam.

Some diagnostic kits capable of detecting dengue virus (DENV) NS1 are already available in Indonesia, one of which is SD Bioline Dengue Duo®. This research is a cross-sectional that evaluates the sensitivity and specificity of SD Bioline Dengue Duo® for primary and secondary DENV infection in Jakarta, Indonesia between 2010 and 2011. The kinetics of NS1 as well as anti-DENV antibodies detected by the kit was also observed. A panel of sera samples from 105 patients experiencing fever within the last 48 hours was tested. DENV infection was confirmed using three gold standard tests, Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) and/or virus isolation in C6/36 cell line and/or Imunoglobulin G (IgG) Enzyme Linked Immunosorbent Assay (ELISA).
The sensitivity of SD Bioline Dengue Duo® was higher in primary infection (93.1% [95% CI, 92.7 to 100]) than in secondary infection (86.1% [95% CI, 82.7 to 100]). The kit's specificity in both study groups was 100%. Moreover, our study showed that in secondary infection, NS1 test performed as early as 1 or 2 days after fever onset resulted in a better sensitivity of the kit compared to past studies. NS1 detection rate reduced over the course of the illness and was lowest on day 7 in both primary and secondary infection. Given its high sensitivity and excellent specificity, SD Bioline Dengue Duo® is a reliable tool for early screening for DENV infection.
"
Jakarta: Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia, 2014
S-Pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Alima Mawar Tasnima
"Infeksi dengue yang ditularkan melalui gigitan nyamuk Aedes aegypti kepada manusia kerap terjadi di area tropis dan subtropis. Oleh karena manifestasi klinis yang tidak spesifik, berbagai Rapid Diagnostic Tests (RDTs) termasuk SD Bioline Dengue Duo Antigen NS1 dan Antibodi IgM/IgG dibuat untuk memberikan diagnosis dini infeksi dengue yang lebih akurat.
Meskipun beberapa studi telah dilakukan untuk menguji sensitifitas dan spesifitas kit tersebut di berbagai negara tetapi informasi mengenai validitasnya dalam mendeteksi keberadaan protein NS1 dari DENV-3 belum dilaksanakan di Indonesia. Pada penelitian ini 105 serum dari pasien yang diduga menderita infeksi dengue diambil dan diuji menggunakan SD Bioline Dengue Duo. Standar baku emas yang digunakan pada penelitian ini adalah RT-PCR dan/atau isolasi virus di sel C6/36 dan atau kenaikan titer antibodi.
Hasil penelitian ini menunjukkan rasio deteksi NS1 berbanding terbalik dengan keberadaan antibodi IgM. Sensitivitas, spesifisitas, PPV, dan NPV menunjukkan 81.25%, 100%, 100%, dan 91.89% pada masing-masingnya di awal demam pasien yang terinfeksi DENV-3. Oleh karena itu, SD Bioline Dengue Duo sangat direkomendasikan untuk diagnosis infeksi DENV-3 karena cepat, mudah digunakan, sangat sensitive, spesifik, dan memiliki PPV dan NPV yang tinggi.

Dengue infection is transmitted through the bite of Aedes aegypti mosquitoes to human particularly occurs in tropic and subtropic area. Having unspecific spectrum of clinical manifestations, various rapid diagnostic tests (RDTs) including SD Bioline Dengue Duo NS1 antigen and IgM/IgG antibody were made to give early diagnosis of acute dengue infection.
Although several studies have been conducted to examine the sensitivity and spesificity of the kits in various countries, its validity to detect the presence of DENV-3 NS1 antigen has not been held in Indonesia. In total, 105 sera from patients suspected of suffering dengue infection were collected and subjected to SD Bioline Dengue Duo and RT-PCR test as the gold standard.
The result of this study showed NS1 detection rate was inversely proportional to the presence of IgM antibodies. The sensitivity, specificity, PPV, and NPV showed 81.25%, 100%, 100%, and 91.89% respectively at the beginning of fever in DENV-3 infected patients. Thus SD Bioline Dengue Duo is highly recommended for diagnosis of DENV-3 infction as it is rapid, easily applicable, sensitive, highly specific and has great PPV and NPV.
"
Jakarta: Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia, 2014
S-Pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
"[Infeksi dengue masih merupakan masalah kesehatan di dunia termasuk Indonesia.
Deteksi dini berperan penting sebagai dasar penatalaksanaan awal infeksi dengue.
Antigen NS1 pada virus dengue telah terbukti sebagai marka untuk diagnosis dini.
Penelitian ini menganalisis lebih lanjut mengenai sensitivitas dan spesifisitas kit
SD Bioline Dengue Duo terhadap keberadaan protein Non- Structural (NS1) pada
pasien yang terinfeksi virus dengue serotipe 2 (DENV-2). Kinetik NS1 dan
keberadaan imunoglobulin M (IgM) pada serum pasien pun dievaluasi dari hari
pertama demam sampai hari ketujuh. Penelitian ini merupakan penelitian berbasis
komunitas di Jakarta yang dimulai sejak Januari 2010 sampai Mei 2013. Kami
menggunakan sampel serum dari pasien dengan gejala klinis infeksi dengue.
Reverse Transcription – Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) dan/atau isolasi
virus dan/atau kenaikan titer imunoglobulin G (IgG) antidengue digunakan
sebagai baku emas. Sensitivitas, spesifisitas, nilai prediksi negatif dan positif
ditampilkan dalam tabel 2x2 dan area dibawah kurva dari Receiver Operating
Curve. Dari 105 pasien, 23 diantaranya positif terinfeksi DENV-2, sementara 34
orang teruji negatif infeksi virus dengue (DENV). Sensitivitas dan spesifisitas SD
Bioline Dengue Duo terhadap DENV-2 bernilai 78.3% dan 100% (CI 95%, 73.5%
sampai 94.2%). Hasil kinetik NS1 menunjukkan pola penurunan, yang dimulai
pada hari kelima. Namun, keberadaan IgM mengalami pola kenaikan secara
bertahap Dapat disimpulkan bahwa kit ini memiliki sensitivitas dan spesifisitas
tinggi terhadap DENV-2 sehingg, Dengue infection is still become the major health problem in the world, including
Indonesia. Early detection plays important role in developing early basic
management. NS1 antigen in dengue virus is proven to be an early marker for
early diagnosis and this research to analyzed the sensitivity and specificity of SD
Bioline Dengue Duo based on the presence of Non-Structural protein 1 (NS1) on
dengue serotype-2 virus (DENV-2) infected patients. Kinetics of NS1 and the
presence of immunoglobulin M (IgM) antibody were also evaluated from the 1st
day to 7th day. This research was a community-based study in Jakarta started from
January 2010 until May 2013. We used serum samples from patients with clinical
manifestation of dengue infection. Furthermore, Reverse Transcription –
Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) and/or virus isolation and/or augmentation
of immunoglobulin G (IgG) antidengue titer were used as a gold standard.
Sensitivity, specificity, negative and positive predictive value of diagnostic kit
will be presented in 2x2 tables and area under the curve of the Receiver Operating
Curve. From the total of 105 patients, 23 patients were confirmed positive for
DENV-2 infection, while 34 patients were confirmed negative DENV infection.
Sensitivity and specificity of SD Bioline Dengue Duo towards DENV-2
accounted for 78.3% and 100% (CI 95%, 73.5% to 94.2%), respectively. Kinetic
of NS1 depicted downward trend starting on the 5th day. Nevertheless, IgM
presence showed gradual increase trend. This indicates that this kit has high
sensitivity and specificity for DENV-2, therefore it can be used as a diagnostic kit
for dengue infection in Jakarta, Indonesia.]"
Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia, 2014
S-Pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
"[Angka kejadian infeksi dengue tinggi di Indonesia, dan Jakarta untuk lebih
spesifiknya. Virus dengue terdiri dari 4 serotipe, yang serotipe 1 (DENV-1), 2
(DENV-2), 3 (DENV-3), dan 4 (DENV-4). Sampai saat ini, penanganan infeksi
dengue masih mengandalkan diagnosis dini. Meskipun reverse transcription
polymerase chain reaction (RT-PCR) masih sebagai baku emas, metode ini cenderung
mahal dan sulit untuk dilakukan. Inilah alasan untuk pengembangan berbagai tes
cepat, termasuk diantaranya SD Bioline Dengue Duo. Dengan demikian, evaluasi SD
BIOLINE Dengue Duo akan bermanfaat dalam dunia klinis. Peneliti menggunakan
sampel serum yang diambil dari masyarakat, menguji sampel tersebut menggunakan
SD BIOLINE Dengue Duo, dan membandingkannya dengan baku emas [reverse
transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) dan isolasi virus pada lini sel
C6/36)]. Ditemukan bahwa sensitivitas, spesifisitas, NPV, dan PPV SD BIOLINE
Dengue Duo untuk mendeteksi demam berdarah serotype campur dan tidak diketahui
adalah 100%. Dalam infeksi DENV-4, SD BIOLINE Dengue Duo menunjukkan
sensitivitas 60% dan spesifisitas 100%., Dengue infection incidence remained high in Indonesia, and Jakarta to be more
specific. Dengue virus consists of 4 serotypes, which are dengue serotype 1 (DENV-1),
2 (DENV-2), 3 (DENV-3), and 4 (DENV-4). Until now, management of dengue infection
still relies on early diagnosis. Although Reverse transcription polymerase chain
reaction (RT-PCR) remains as a gold standard diagnostic method, this method is
costly and difficult to set up. These issues are the reasons for the development of
various rapid tests, including SD Bioline Dengue Duo. Evaluation of SD BIOLINE
Dengue Duo would therefore be beneficial in the clinical setting. Researchers used
serum sample taken from the community, tested the samples using SD BIOLINE
Dengue Duo, and compare it with the gold standard [Reverse Transcription –
Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) and virus isolation in cell line C6/36)]. It was
found that the sensitivity, specificity, NPV, and PPV of SD BIOLINE Dengue Duo
for detection of dengue of mixed and unknown serotype were 100%. In infection of
DENV-4, SD BIOLINE Dengue Duo showed a sensitivity of 60% and specificity of
100%.]"
Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia, 2014
S-Pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Diah Anjarini
"ABSTRAK
Pengembangan diagnosis DBD dengan pendekatan deteksi antigen saat ini
adalah deteksi IgM/IgG antibodi dan circulating dengue virus non-structural
protein 1 yang bersirkulasi dalam serum atau plasma penderita. Nonstructaral
protein I (NS1) merupakan glikoprotein yang diperlukan dalam proses replikasi
virus. Pada infeksi akut NSI disekresikan dari sel yang terinfeksi dan akan
bersirkulasi dalam darah penderita DBD baik pada infeksi primer maupun
infeksi sekunder. NSI dapat dideteksi pada penderita terinfeksi virus dengue
serotipe 1, 2, 3 maupun 4. NSI disekresi pada hari 1 sampai hari 9 saat onset
demarn, sehingga dengan deteksi NSI diharapkan diagnosis DBD dapat
ditegakkan lebih dini, atau secepatnya pada hari 1 onset demam. Saat ini sudah
tersedia secara komersial Diagnostik Kit SD Dengue Duo (Dengue NS1 Ag+Ab
Combo). Penelitian ini bertuiuan untuk mendapatkan alternatif diagnosis infeksi
virus dengue dengan melakukan uii validasi produk tersebut terhadap IgM, IgG
dan NS1 pada tersangka penderita DBD di Rumah sakit Imanuel Bandar
Lampung. Uji validasi meliputi sensitivitas, spesifisitas, nilai duga positif, nilai
duga negatif, rasio kecenderungan positif, rasio kecenderungan negatif dan
akurasi. Hasil uji dibandingkan dengan RT-'PCR sebagai baku emas (gold
standard). Hasilnya menunjukkan Dengue NSI Ag menunjukkan sensitivitas
(sebesar 100%), spesifisitas sebesar 92%, nilai duga positif (NDP) sebesar 58%,
nilai duga negatif (NDN) sebesar 100% dan akurasi sebesar 92,5%, nilai ROC
sebesar 95.8% menunjukkan bahwa NS-1 dapat mendiagnosis Dengue dengan baik
sekali.
Disimpulkan bahwa Diagnostik Kit SD Dengue Duo (Dengue NS1 Ag+Ab Combo )
layak dan memadai sebagai perangkat diagnosis DBD.
ABSTRACT
New approach of dengue diagnosis is detecting of circulating dengue
nonstructural protein 1 (NS1) IgM/IgG antibodies, antigen in patient sera or
plasma. NSI is a glycoprotein essential use for virus replication process. It is
secreted from infected cells and detectable in blood from the lst day afterthe
onset of fever up to day 9. This protein could be detected in dengue virus
infection either serotype 1,2,3 and 4 by NS1 detection and IgM/IgG. Prompt
diagnosis could be made as soon as on day 1 onset of fever. The NS I antigen assay
has been developed for commercial use Diagnostik Kit SD Dengue Duo (Dengue
NS1 Ag+Ab Combo). To find out an alternative dengue diagnostic tool Dengue
NS1. Ag was validated for early diagnosis of febrile stage in patients with
suspect dengue infection as a gold standard of the test was rely on RT-PCR.
The diagnostik Kit SD Dengue Duo (Dengue NS1 Ag+Ab Combo) shows
sensitivity 100%, spesificity 92%, positive predictive value (PPV) 58%, negatif
predictive value (NPV) 100% and accuracy 94,5% respectively, ROC 95.8%
the agreement between both tests were good. It was concluded that Diagnostik
Kit SD Dengue Duo (Dengue NS1 Ag+Ab Combo) and NSI Ag good and could be
used for early diagnosis of dengue virus infection."
Fakultas Kesehatan Masyarakat Universitas Indonesia , 2013
T36054
UI - Tesis Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Trusty Ayu Hapsari
"Demam Berdarah Dengue (DBD adalah salah satu masalah kesehatan di dunia. Penggunaan Non Structural-1 (NS-1) antigen dari virus dengue untuk deteksi awal telah terbukti sebagai salah satu solusi dari penentu infeksi dengue. Salah satu alat diagnosik yang tersedia di Indonesia adalah Bio-Rad NS1 Ag strip. Penelitian ini berjalan selama18 bulan di mulai dari tanggal November 2010 sampai dengan Mei 2012. Seratus dua pasien dengan demam kurang dari 2 hari terlibat dalam studi ini. Peneliti menggunakan Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction (RT-PCR), Virus isolation di sel C6/36, atau IgG and IgM titer ELISA sebagai standard emas dalam mendeteksi infeksi dengue. Dalam riset ini, kami menggunakan Bio-Rad NS1 antigen untuk mendeteksi keberadaan antigen NS1 dalam serum darah pasien yang terduga terkena demam berdarah. SPSS 16.0 digunakan untuk menganalisa data. Hasil yang diperoleh adalah dari 102 pasien yang terduga terkena demam berdarah, terdapat 68(68.3%) positf terkena demam berdarah dan 34(31.7%) negatif. Serotype virus juga dipeoleh mellaui RT PCR. Dari 68 pasien yang positif demam berdarah, ada 17 terkena DENV-1, 21 terinfeksi DENV-2, 16 terinfeksiDENV-3, 4 terinfeksi DENV-4, 8 terinfeksi campuran, dan 2 tidak diketahui serotypenya. Nilai sensitivitas dan specifisitas Bio-Rad NS1 Ag Strip dalam mendeteksi infeksi demam berdarah dengan nilai 86.2% dan 96.3%. Dalam mendeteksi infeksi DENV-1, sensitivitas and spesifisitas Bio-Rad NS1 Ag strip adalah 94.12dan 94.44% (95% CI, 80.5% to 97.7%). Sedangkan untuk mendeteksi DENV-3, alat ini mempunyai sensitivitas 75% dan spesifisitas 94.44% (95% CI, 69.3% to 93.5%). Bedasarkan hasil ini, Bio-Rad NS1 Ag Strip dapat dipergunakan sebagai alat untuk menegakan diagnosis dari infeksi demam berdarah DENV-1 dan DENV-3 pada awal demam.

Dengue infection has been one of the health issues in worldwide. The utilization of Non Structural-1 (NS1) antigen in order to detect early dengue infection has been proven to be one of the solutions. Diagnostic kit named Bio-Rad NS1Ag Strip is one of the kit that uses antigen which is available in Indonesia. The purpose of this study is to evaluate the sensitivity, specificity, PPV, and NPV value of the kit. This study was held in 18 months duration from November 2010 until Mei 2012. One hundred and two subjects with fever less than 48 hours were included in the study. RT-PCR or virus isolation C6/36 or ELISA antibody titer were used as the gold standard of this research. Bio-Rad NS1 Ag Strip was used to determine the presence of NS1 antigen in the patient. Data analysis and statistics uses SPSS 16.0.In the result, there were 68 (68.3%) positive and 34 (31.7%) negative. RT PCR also determined the virus’s stereotypes. There were 17 of DENV-1, 21 of DENV-2, 16 of DENV-3, 4 of DENV-4, 8 of mixed infection and 2 unknown serotypes. Bio-Rad NS1 Ag has 86.2% of sensitivity and 96.35 of specificity to detect all stereotypes. In for detecting DENV-1, the kit has 94.12% sensitivity and 94.44% (95% CI, 80.5% to 97.7%). Meanwhile, in detecting DENV-3, the kit has 75%sensitivity and 94.44% specificity (95% CI, 69.3% to 93.5%). According to these findings, Bio-Rad NS1 Ag strip is suitable as a diagnostic kit to make early diagnosis of dengue fever DENV-1 and DENV-3.
"
Depok: Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia, 2014
S-Pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Jusica Putri
"Infeksi dengue telah menjadi salah satu masalah kesehatan yang serius di Indonesia. Non Struktural-1 (NS-1) antigen dikenal sebagai indikator diagnostik awal infeksi dengue. Tujuan dari penelitian ini adalah mengetahui sensitivitas dan spesifisitas Biorad NS-1 Ag Strip sebagai pendeteksi infeksi dengue, baik primer maupun sekunder. Penelitian ini menggunakan desain penelitian kohort dengan konsekutif sampling. Dalam penelitian ini, kami menggunakan Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction (RT-PCR), atau isolasi virus dalam C6/36 cell line atau peningkatan titer antibodi sebagai standar baku emas. Kami juga menggunakan SPSS 17.0 dengan 2x2 table dan area under the curve (AUC) of the Receiver Operating Curve untuk menganalisis data. Populasi data dalam penelitian ini adalah 102 pasien dan 68,3% dari mereka dikonfirmasi sebagai pasien infeksi dengue. Hasil positif ini diklasifikasikan kembali menjadi infeksi primer dan sekunder, yaitu 27 (39,7%) dan 35 (51,5%) orang berturut-turut. Sensitivitas dan spesifisitas Bio-Rad NS1 Ag Strip infeksi dengue primer adalah 96.30% dan 100%. Namun, sensitivitas dan spesifisitas Bio-Rad NS1 Ag Strip untuk infeksi dengue sekunder adalah 85.71% dan 100 %. Bio-Rad NS1 Ag Strip memiliki sensitivitas dan spesifisitas yang tinggi untuk menentukan infeksi primer dan sekunder. Bio-Rad NS1 Ag Strip dianjurkan untuk digunakan sebagai deteksi dini infeksi dengue, baik primer maupun sekunder.

Dengue Infection has been one of the serious health problems in Indonesia. Non Structural-1 (NS-1) antigen was known to be the early diagnostic indicator of dengue infection. The purpose of this research is identifying the sensitivity and specificity of a diagnostic kit, called Biorad NS-1 Ag Rapid Test, which use NS-1 Antigen as the marker to detect primary and secondary dengue infection. Cohort with consecutive sampling was the most suitable research design to be applied in this study. We used Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction (RT-PCR), or virus isolation in C6/36 cell line or the increment of antibody titer as the gold standard in this study. We also used SPSS 17.0 with tables 2x2 and area under the curve (AUC) of the Receiver Operating Curve to analyze the data. Population data in this research were 102 patients and 68.3% of them confirmed as dengue infection patient. Furthermore, the positive results are classified into primary and secondary infection, which are 27 (39.7%) and 35 (51.5%) people, respectively. The sensitivity and specificity of Bio-Rad NS1 Ag Strip in primary dengue infection were 96.30% and 100%, respectively. However, the sensitivity and specificity of Bio-Rad NS1 Ag Strip for secondary dengue infection were 85.71% and 100 %, respectively. Bio-Rad NS1 Ag Strip has high sensitivity and specificity to determine both primary and secondary infection. As the result, Bio-Rad NS1 Ag Strip is recommended to be used for early detection of primary and secondary dengue infection.
"
Jakarta: Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia, 2013
S-Pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Patricia Lukas Goentoro
"Protein Non Struktural-1 (NS-1) dari virus dengue terbukti menjadi penanda
untuk diagnosis awal infeksi dengue. Bio-Rad NS1 Ag adalah salah satu alat
diagnostikdi Indonesia yang menggunakan NS1.Tujuan dari penelitian ini adalah
untuk mengukur sensitivitas dan spesifisitas kit pada virus dengue serotype-2
(DENV-2), virus dengue serotype-4 (DENV-4) dan infeksi campuran Uji
diagnostik dilakukan selama36 bulan (Maret2010 ?Februari 2013). Sebanyak 102
pasien dengan demam kurang dari 48 jam memenuhi kriteria inklusi dalam studi
ini. Reverse Transcripion-Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) atau isolasi
virus di cell line C6/36 atau kenaikan titer antibody dijadikan sebagai standar
baku penentu infeksi dengue. RT-PCR juga digunakan untuk menentukan serotipe
virus. Analisis statistik dilakukan dengan menggunakan SPSS versi 17.0. Variabel
data binomial disajikan dalam interval kepercayaan 95%. Sensitivitas dan
spesifisitas kit diagnostik disajikan dalam tabel 2x2 dan area di bawah kurva
(AUC) dari Receiver Operating Characteristics Curve. Dari 102 pasien secara
berurutan didapatkan DENV-1, DENV-2, DENV-3 dan DENV-4, adalah 17
(16.7%), 21 (20.5%), 16 (15.7%) dan 4 (3.9%). Pada penelitian ini juga
ditemukan infeksi campuran yaitu campuran (i)DENV-1 dan DENV-2, (ii)DENV-
1 dan DENV-3, (iii)DENV-1 dan DENV-4, (iv)DENV-1, DENV-3, dan DENV-4,
(v)DENV-2 dan DENV-4 dan (vi)serotipe yang tidak diketahui secara berurutan
adalah 2 (2.0%), 3 (2.9%), 1 (1.0%), 1 (1.0%), 1 (1.0%), dan 2 (2.0%).
Sensitivitas dan spesifisitas masing Bio-Rad NS1 Ag Strip untuk mendeteksi
infeksi DENV-2 adalah 76,2% dan 100% (95% CI, 76.8% to 99.3%). Sementara
itu, sensitivitas dan spesifisitas strip untuk mendeteksi infeksi DENV-4 adalah
50% dan 100% (95% CI, 50% to 100%). Sensitivitas dan spesifisitas Bio-Rad
NS1 Ag Strip pada infeksi campuran adalah 100% (95% CI, 95% to 100%). Bio-
Rad NS1 Ag memiliki sensitivitas tinggi dan spesifisitas untuk menentukan
infeksi akut DENV-2 dan infeksi campuran. Namun, Bio-Rad NS1 Ag memiliki
sensitivitas yang terbatas, namun spesifisitas tinggi untuk diagnosis infeksi akut
DENV-4.;Non Structural-1 (NS1) protein of dengue virus is proven to be a marker for early
diagnosis of dengue infection. Bio-Rad NS1 Ag Strip is one of the available
diagnostic kit in Indonesia that comprised of NS1. The aim of this study was to
measure the sensitivity and specificity of the kit within DENV-2, DENV-4and
mixed dengue virus serotypes. This study was done in 36 months (March 2010-
February 2013). There were 102 dengue suspected patients with fever less than 48
hours was fulfilling inclusion criteria. Reverse Transcription- Polymerase Chain
Reaction (RT-PCR) or virus isolation in C6/36 cell line or increase titer antibody
by ELISA was used as gold standard. RT-PCR was also used to determine
serotype of the dengue virus. SPSS version 17.0 was the main statistical tool that
we used. Data binominal variables was presented as incidence rates with 95%
confidence intervals. Sensitivity and specificity of diagnostic kit was presented in
2x2 tablesand area under the curve (AUC) of the Receiver Operating
Characteristics Curve. From 102 patients, 68 (68.3%) patients were confirmed
positive dengue infection. Within confirmed dengue infection patients by RT-PCR
we found DENV-1, DENV-2, DENV-3,DENV-4 17 (16.7%), 21 (20.5%), 16
(15.7%), 4 (3.9%), respectively. It was also found some mixed infection cases,
which were (i)DENV-1 and DENV-2, (ii)DENV-1 and DENV-3, (iii)DENV-1
and DENV-4, (iv)DENV-1, DENV-3 and DENV-4, (v)DENV-2 and DENV-4 and
(vi)unknown were of 2 (2.0%), 3 (2.9%), 1 (1.0%), 1 (1.0%), 1 (1.0%) and 2
(2.0%), respectively. The sensitivity and specificity of Bio-Rad NS1 Ag Strip for
DENV-2 sera collected were 76.2% and 100% (95% CI, 76.8% to 99.3%),
respectively. The sensitivity and specificity of Bio-Rad NS1 Ag Strip for DENV-4
were 50% and 100% (95% CI, 50% to 100%), respectively. The sensitivity and
specificity of Bio-Rad NS1 Ag Strip for mixed infection were both 100% (95%
CI, 95% to 100%). Bio-Rad NS1 Ag Strip has high sensitivity and specificity to
determine DENV-2 and mixed infection. On the other hand, Bio-Rad NS1 Ag
Strip has limited sensitivity, but high specificity for diagnosis of DENV-4 acute
infection;Non Structural-1 (NS1) protein of dengue virus is proven to be a marker for early
diagnosis of dengue infection. Bio-Rad NS1 Ag Strip is one of the available
diagnostic kit in Indonesia that comprised of NS1. The aim of this study was to
measure the sensitivity and specificity of the kit within DENV-2, DENV-4and
mixed dengue virus serotypes. This study was done in 36 months (March 2010-
February 2013). There were 102 dengue suspected patients with fever less than 48
hours was fulfilling inclusion criteria. Reverse Transcription- Polymerase Chain
Reaction (RT-PCR) or virus isolation in C6/36 cell line or increase titer antibody
by ELISA was used as gold standard. RT-PCR was also used to determine
serotype of the dengue virus. SPSS version 17.0 was the main statistical tool that
we used. Data binominal variables was presented as incidence rates with 95%
confidence intervals. Sensitivity and specificity of diagnostic kit was presented in
2x2 tablesand area under the curve (AUC) of the Receiver Operating
Characteristics Curve. From 102 patients, 68 (68.3%) patients were confirmed
positive dengue infection. Within confirmed dengue infection patients by RT-PCR
we found DENV-1, DENV-2, DENV-3,DENV-4 17 (16.7%), 21 (20.5%), 16
(15.7%), 4 (3.9%), respectively. It was also found some mixed infection cases,
which were (i)DENV-1 and DENV-2, (ii)DENV-1 and DENV-3, (iii)DENV-1
and DENV-4, (iv)DENV-1, DENV-3 and DENV-4, (v)DENV-2 and DENV-4 and
(vi)unknown were of 2 (2.0%), 3 (2.9%), 1 (1.0%), 1 (1.0%), 1 (1.0%) and 2
(2.0%), respectively. The sensitivity and specificity of Bio-Rad NS1 Ag Strip for
DENV-2 sera collected were 76.2% and 100% (95% CI, 76.8% to 99.3%),
respectively. The sensitivity and specificity of Bio-Rad NS1 Ag Strip for DENV-4
were 50% and 100% (95% CI, 50% to 100%), respectively. The sensitivity and
specificity of Bio-Rad NS1 Ag Strip for mixed infection were both 100% (95%
CI, 95% to 100%). Bio-Rad NS1 Ag Strip has high sensitivity and specificity to
determine DENV-2 and mixed infection. On the other hand, Bio-Rad NS1 Ag
Strip has limited sensitivity, but high specificity for diagnosis of DENV-4 acute
infection"
Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia, 2013
S-Pdf
UI - Skripsi Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Evy Suryani Arodes
"Demam berdarah dengue (DBD) merupakan suatu penyakit yang disebabkan oleh virus dengue (DENV) dan ditransmisikan oleh nyamuk yang hidup di daerah tropis dan subtropis. Insiden terjadinya demam dengue (DD) dan DBD meningkat secara dramatis di dunia selama beberapa dekade terakhir. Hingga saat ini belum ada terapi yang spesifik untuk infeksi dengue. Pengobatan hanya bersifat simptomatik. Walaupun demikian, pada kasus DBD dan SSD, perawatan dini dapat menurunkan angka morbiditas dan mortalitas. Untuk itu diperlukan uji laboratorium yang akurat untuk membantu menegakkan diagnosis dini infeksi dengue. Deteksi Antigen non struktural-1 (NS-1) telah tebukti mampu mendeteksi dini infeksi DENV. Pemeriksaan ini dapat memberikan hasil lebih dini, akurat dan dengan harga yang lebih murah. Dalam usaha mengembangan uji diagnosis berdasarkan NS-1 diperlukan antibodi anti-NS1. Kami telah berhasil memproduksi IgG anti-NS1 DENV. Untuk mendapatkan antibodi anti-NS1 DENV, protein NS-1 (90 μg/ml) koleksi Mikrobiologi disuntikkan pada kelinci dan selanjutnya antibodi dilabel dengan HRP yang dapat digunakan untuk mendeteksi protein NS1 pada serum pasien terinfeksi dengue. Antibodi IgG HRP yang diperiksa menggunakan metode direct ELISA menunjukkan nilai absorbansi tertinggi pada pengenceran 1:100 dan terendah pada pengenceran 1:12800. Uji NS-1 pada serum pasien menunjukkan hasil positif pada semua serum pasien terinfeksi DENV, baik DENV 1, 2, 3 dan 4. Sedangkan hasil negatif ditunjukkan pada serum pasien yang terinfeksi CMV dan EBV, serta pada serum orang sehat. Hasil ini menunjukan bahwa antibodi yang dilabel HRP dapat digunakan untuk pengembangan uji diagnostik untuk mendeteksi keberadaan antigen NS1 virus dengue dalam serum pasien.

Dengue fever is a disease caused by dengue virus and is transmitted by mosquito in tropical and subtropical regions. Dengue fever (DF) and dengue hemorraghic fever (DHF) have been dramatically increased in recent decades. Specific therapy to dengue infection is not available. The therapy is only symptomatic. In DHF and dengue shock syndrome (DSS) cases, early therapy can reduce morbidity and mortality rate. Therefore, laboratory assay are needed to accurately diagnose dengue infection at early stage. Detection of nonstructural-1 (NS1) antigen has been proven to provide early detection of DENV infection. The assay can provide early and accurate result with less expensive cost. In a attempt to develop an NS1 - based diagnostic test, we successfully produced anti- NS1 DENV antibody. To obtain anti NS1 DENV antibody, NS1 protein (90 μg/ml) collection of Microbiology was injected to rabbit. The antibodiy was further labeled with HRP and be used to detect NS1 protein in dengue patient sera. The antibody labeled with HRP by direct ELISA method showed the highest absorbance value in 1:100 dilution and the lowest absorbance in dilution 1:12800. NS1 test of patients serum using this labelled antibody showed positive result in all the sera of patients infected with DENV, either DENV 1, 2, 3, and 4. Whereas negative results are shown in the serum of patients infected with CMV and EBV, as well as the serum of healthy people. Therefore, the antibody labeled with HRP could be used for developing diagnostic assay to determine the presence of dengue virus NS1 antigen in patient sera.
"
Jakarta: Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia, 2016
T-Pdf
UI - Tesis Membership  Universitas Indonesia Library
cover
Tika Widayanti
"Infeksi dengue DENV adalah penyakit yang diperantarai nyamuk yang manifestasinya dapat mengarah pada dengue hemorrhagic fever DHF dan/atau dengue shock syndrome DSS yang dapat mengakibatkan kematian. Di Indonesia, DHF sudah endemis dan menjadi penyakit yang terjadi sepanjang tahun. Protein non struktural-1 NS1 dari DENV diketahui merupakan biomarker dalam diagnosis dengue karena protein ini bersirkulasi dalam darah selama fase akut penyakit. Penelitian ini bertujuan untuk mengembangkan antibodi monoklonal mAb untuk mendeteksi antigen NS1 dari DENV serotipe 3 DENV3. Sel hibridoma penghasil mAb diperoleh dengan memfusikan sel B dari mencit yang diimunisasi dengan antigen NS1 yang diekspresikan pada sel CHO-K1 dengan sel PAI myeloma. Seleksi hibridoma dengan ELISA indirect diperoleh 16 klona yang berpotensi menghasilkan antibodi anti-NS1.
Tujuh klona terbaik dipilih untuk dikarakterisasi dengan metode IFA terhadap antigen rekombinan NS1 dan hasilnya 6 klona positif menunjukkan reaksi sinyal fluoresens. Klona mAb 4-2D, 4-4F, dan 2-7A diuji terhadap protein NS1 native dari DENV1, DENV2, DENV3, dan DENV4, dan ketiga mAb tersebut mampu mengenali secara spesifik protein NS1 dan tidak bereaksi terhadap protein virus yang lain. Terdapat reaktivitas silang dengan 3 serotipe lainnya yang mengindikasikan bahwa mAb yang diujikan mengenali epitop lestari antigen NS1. Analisis prediksi epitop NS1 juga dilakukan secara in silico terhadap beberapa strain DENV lainnya. Namun, studi lebih lanjut mengenai pemetaan epitop dan afinitas pengikatan antigen-antibodi perlu dilakukan untuk menentukan mAb yang paling potensial sebagai bahan baku kit diagnostik.

Dengue DENV is a mosquito borne infection disease which its manifestation can be lead to a lethal dengue hemorrhagic fever DHF and or dengue shock syndrome DSS . In Indonesia, DHF has been endemic and the disease occurs throughout the year. Non structural 1 NS1 protein of DENV is known to be a biomarker in dengue diagnosis since the protein is abundantly circulating in the blood during acute phase of the disease. The aim of this study to develop monoclonal antibodies mAbs derived from DENV3 to detect NS1. Hybridoma mAb producing cells were obtained by fusing B cells from an immunized mice with NS1 antigen expressed on CHO K1 cells, with PAI myeloma cells. Hybridoma selection with indirect ELISA showed 16 clones that could be potentially produce anti NS1 antibodies.
Seven up to sixteen clones were selected to be characterized by IFA against recombinant NS1 antigen and the result showed 6 clones produce fluorescence signals. Clones mAb 4 2D, 4 4F, and 2 7A were tested against native NS1 proteins from DENV1, DENV2, DENV3, and DENV4, and these mAbs were able to recognize specifically NS1 protein and did not react against other viral proteins. There is a cross reactivity within 3 other serotypes which initially indicate that mAbs recognizes the conserved epitopes determinant of the NS1 antigen. Epitopes prediction analysis was also performed in silico against several others DENV strains. However, further studies of epitope mapping and antigen antibody binding affinity are necessary to determine the most potential mAbs for diagnostic tools.
"
Jakarta: Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia, 2017
T-Pdf
UI - Tesis Membership  Universitas Indonesia Library
<<   1 2 3 4 5 6 7 8 9 10   >>