Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

"Sayur asin umumnya dikenal sebagai produk fermentasi spontan sawi pahit, Brassica juncea (L.) Czern., oleh bakteri asam laktat (BAL) epifit di Indonesia, khususnya di Jawa. Informasi keanekaragaman BAL di sayur asin lokal Indonesia masih sangat terbatas, oleh karena itu perlu dilakukan penelitian lebih lanjut. Penelitian dilakukan untuk mengetahui keanekaragaman BAL di sayur asin lokal Indonesia. Telah dilakukan isolasi dan identifikasi BAL dari sebelas sampel sayur asin diperoleh dari Tulung Agung, Kediri, Solo,Yogyakarta, Kota Semarang dan Depok. BAL diisolasi dari sayur asin dan larutan fermentasi. Identifikasi BAL dilakukan secara molekuler berdasarkan sekuen 16S rDNA. Sebanyak 631 isolat BAL telah berhasil diisolasi dan diidentifikasi. Hasil identifikasi menunjukkan 20 spesies BAL yang telah diketahui namanya yaitu Lactobacilus farciminis (90 isolat), L. fermentum (106 isolat), L. namurensis (48 isolat), L. plantarum (309 isolat), L. paralimentarius (4 isolat), L. parafarraginis (1 isolat), L. nodensis (1 isolat), L. tucceti (11 isolat), L. acidophilus (1 isolat), L. helveticus (2 isolat), L. brevis (4 isolat), L. parabrevis (3 isolat), L. futsaii (11 isolat), L. versmoldensis (4 isolat), L. coryniformis (16 isolat), L. casei (12 isolat), L. rhamnosus (2 isolat), L. fabifermentans (3 isolat), L. satsumensis (1 isolat), L. zymae (1 isolat) dan 1 kandidat spesies baru Lactobacillus sp. B4 (1 isolat) secara genetik dekat dengan L. composti. Hasil identifikasi menunjukkan keanekaragaman BAL di sayur asin asal Jawa Indonesia cukup tinggi. Analisis intraspesies pada spesies dominan L. plantarum dan L. fermentum asal sayur asin menggunakan tiga teknik molekuler restriction fragment length polymorphism (RFLP) 16S-23S rDNA intergenic spacer region (ISR), random amplified polymorphic DNA-polymerase chain reaction (RAPD-PCR) dan enterobacterial repetitive intergenic consensus (ERIC-PCR) menunjukkan terdapat tiga kelompok genotip L. plantarum dan dua kelompok genotip L. fermentum asal sayur asin.

---

Sayur asin is commonly known as a spontaneous fermented mustard Brassica juncea (L.) Czern product by epiphytic lactic acid bacteria (LAB) in Indonesia, in particular Java. The information on LAB diversity in Indonesia was obviously limited. More investigation is required. Therefore, effort on inventory of LAB from sayur asin in Indonesia was carried out to determine its diversity. LAB diversity in eleven samples of sayur asin collected from Tulung Agung, Kediri, Solo, Yogyakarta, Kota Semarang and Depok was studied. LAB was isolated from both of fermented mustards and fermenting liquors. Molecular identification of the isolates was conducted based on 16S rDNA sequence data. A total of 631 isolates of LAB was successfully isolated and identified. The bacteria belong to 20 known species viz, Lactobacilus farciminis (90 isolates), L. fermentum (106 isolates), L. namurensis (48 isolates), L. plantarum (309 isolates), L. paralimentarius (4 isolates), L. parafarraginis (1 isolate), L. nodensis (1 isolate), L. tucceti (11 isolates), L. acidophilus (1 isolate), L. helveticus (2 isolates), L. brevis (4 isolates), L. parabrevis (3 isolates), L. futsaii (11 isolates), L. versmoldensis (4 isolates), L. coryniformis (16 isolates), L. casei (12 isolates), L. rhamnosus (2 isolates), L. fabifermentans (3 isolates), L. satsumensis (1 isolate), L. zymae (1 isolate) and 1 candidate of novel species Lactobacillus sp. B4 (1 isolate) phylogenetically closed to L. composti. The current study revealed high diversity of LAB present in sayur asin from Java, Indonesia. Study on intraspecies determination of predominant isolates belonging to L. plantarum and L. fermentum in sayur asin using three molecular techniques namely: restriction fragment length polymorphism (RFLP) 16S-23S rDNA intergenic spacer region (ISR), random amplified polymorphic DNA-polymerase chain reaction (RAPD-PCR) and enterobacterial repetitive intergenic consensus (ERIC-PCR) revealed that strains belong to L. plantarum and L. fermentum in sayur asin could be divided into three and two genotypic groups respectively"

"Tanaman sawi (Brassica juncea) merupakan tanaman yang rentan terhadap cekaman genangan sehingga diperlukan upaya untuk meningkatkan toleransinya. Pemberian asam salisilat secara eksogen dengan tepat dianggap mampu untuk meningkatkan toleransi tanaman pada cekaman genangan. Tujuan penelitian ini adalah mengetahui pengaruh waktu pemberian asam salisilat terhadap pertumbuhan dan aktivitas antioksidan tanaman sawi pada cekaman genangan. Rancangan percobaan yang digunakan yaitu rancangan acak kelompok dengan empat perlakuan yaitu kontrol, genangan, genangan + asam salisilat 0,5 mM (dua hari sebelum perlakuan genangan), dan genangan + asam salisilat 0,5 mM (bersamaan dengan perlakuan genangan). Perlakuan genangan diberikan pada 45 HST selama tiga hari kemudian dilakukan pemulihan selama tujuh hari. Parameter yang diukur yaitu tinggi tanaman, jumlah daun, dan aktivitas antioksidan. Hasil penelitian menunjukkan bahwa pemberian asam salisilat dua hari sebelum genangan (43 HST) dapat meningkatkan perubahan tinggi tanaman dan jumlah daun, serta aktivitas antioksidan, sedangkan pemberian asam salisilat bersamaan dengan genangan hanya dapat meningkatkan perubahan jumlah daun dan aktivitas antioksidan pasca genangan. Namun, peningkatan tersebut tidak berbeda nyata secara statistik dengan perlakuan genangan tanpa pemberian asam salisilat. Pada fase pemulihan, pemberian asam salisilat baik dua hari sebelum maupun bersamaan dengan genangan belum menunjukkan dampak yang positif terhadap perubahan tinggi tanaman dan jumlah daun, serta aktivitas antioksidan.

---

Mustard (Brassica juncea) is susceptible to waterlogging stress, special method is needed to increase their tolerance. Proper application of exogenous salicylic acid can increase plant tolerance to waterlogging stress. The purpose of this study is to determine the effect of application timing of salicylic acid on growth and antioxidant activity of mustard on waterlogging stress. The experimental design used was a randomized block design with four treatments; control, waterlogging, waterlogging + salicylic acid 0,5 mM (two days before waterlogging), and waterlogging + salicylic acid 0,5 mM (simultaneously with waterlogging). Waterlogging treatment was given in 45 DAP for three days then recovery was carried out for seven days. Parameters measured were plant height, number of leaves, and antioxidant activity. The results showed that application of salicylic acid two days before waterlogging (43 DAP) increased changes in plant height and number of leaves, and antioxidant activity, while application of salicylic acid simultaneously with waterlogging only increased changes in leaf number and antioxidant activity after waterlogging. However, this increase was not statistically significantly different from the waterlogging treatment without application of salicylic acid. In the recovery phase, application of salicylic acid didn’t show a positive effect on changes in plant height and number of leaves, and antioxidant activity."

"Logam berat yang mencemari badan tanah seperti Pb dan Cd tidak sedikit dihasilkan dari kegiatan manusia. Penelitian ini mencoba melakukan pengukuran bioavailabilitas logam berat Pb dan Cd dalam tanah terhadap sawi hijau (Brassica juncea L.) dengan teknik Diffusive Gradient In Thin Film (DGT), dimana ketersediaan Pb dan Cd dalam tanah juga dilihat dari fraksi-fraksi ekstraksi bertahap. DGT dapat mengukur keberadaan logam spesi labil. Spesi labil dapat mewakili jumlah logam yang mungkin terserap biota. DGT yang terdiri dari diffusive layer dan binding layer diuji kemampuannya dalam menyerap spesi logam labil Timbal (II). Pb terekstrak lebih banyak pada fraksi 3 (terikat dengan Mn-Oksida) dan 4 (terikat dengan Fe-Oksida), sedangkan untuk logam Cd terekstrak banyak pada fraksi 1 (fraksi tertukarkan) dan fraksi 2 ( terikat dengan karbonat). Hasil destruksi tanaman sawi yang ditanam pada media tanah spike logam Pb maupun Cd memberikan peningkatan kadar Pb dan Cd seiring bertambahnya konsentrasi Pb dan Cd yang diberikan ke tanah, namun terdapat penurunan penyerapan logam oleh sawi saat konsentrasi logam Pb > 1000 mg/kg dan saat konsentrasi logam Cd > 100 mg/kg. Sedangkan untuk hasil penggelaran DGT terjadi peningkatan konsentrasi DGT (CDGT) seiring bertambahnya konsentrasi logam pada tanah, juga untuk konsentrasi efektif logam yang terdapat pada tanah (CE) mengalami peningkatan seiring bertambahnya konsentrasi logam pada tanah. CE juga mempengaruhi berat kering sawi, konsentrasi logam yang diserap sawi, dan CDGT.

---

Heavy metals that pollute the soil body such as Pb and Cd is not few resulting from human activities. This research tries to perform measurements of the heavy metals bioavailability (Pb and Cd) in soil to Brassica juncea L. with Diffusive Gradient in Thin Film (DGT) Technique, where the availability of Pb and Cd in soil also seen from the faction of sequential extraction. DGT can measure the presence of labile metal species. Labile species may represent the amount of metal which may be absorbed by biota. DGT that consisting of a binding layer and diffusive layer are tested for their capacity to absorb labile metal species in Plumbum (II). Pb was extracted more on the 3rd fraction (bound to Mn-Oxide) and 4th (bound to Fe-Oxides), while for Cd was extracted more on 1st fraction (exchangeable faction) and 2nd faction (bound to carbonate).

The destruction results of green mustard that planted on soil Pb and Cd contaminaton media provides increased levels of Pb and Cd along with the increased of Pb and Cd concentration which was given to soil, but there is a decrease in metal uptake by green mustard while [Pb] > 1000 mg/kg and [Cd] > 100 mg/kg. For the results of DGT deployment, there is an increase of DGT concentration (CDGT) along with the increased metal concentration in soil, also for the effective metal concentration in soil (CE). CE also affects the weight of dry green mustard, metal concentrations of green mustard, and absorbed CDGT."

"Penyakit Demam Berdarah Dengue (DBD) merupakan penyakit yang banyak terdapat di Indonesia. Penyakit ini disebabkan oleh virus dengue (DENV) yang sampai saat ini belum ditemukan obatnya. Penelitian ini bertujuan untuk membuat senyawa dimer 4?-aminoasetofenon (4?-AAF) dengan menggunakan katalis enzim peroksidase yang berasal dari tumbuhan sawi hijau (Brassica juncea) dan mengetahui aktivitas antivirus DENV dari senyawa dimer tersebut. Dimer 4?-AAF disintesis menggunakan katalis enzim peroksidase dari tumbuhan sawi hijau pada pH 7 dan suhu ruang dengan kadar protein enzim 3,3085 mg/ml dan aktivitas spesifik enzim 0,0790 unit/ml. Produk dimer yang diperoleh memiliki bobot molekul 266,1 g/mol; panjang gelombang maksimum UV 335 nm dalam pelarut metanol; Retardation factor (Rf) Kromatografi Lapis Tipis (KLT) 0,78 dengan eluen heksana-etil asetat (7:3); nama IUPAC 1-{4-[(E)-2-(4-acetylphenyl)diazen-1-yl]phenyl}ethan-1-one; serta terbentuk melalui pembentukan jembatan -N=Nberdasarkan data spektrum IR, MS, serta 1H- dan 13C-NMR. Produk dimer dan bahan pemula 4?-AAF memiliki nilai CC50 terhadap sel Huh-7it1 masing-masing sebesar 386,82 μg/ml dan 332,74 μg/ml; serta nilai IC50 terhadap virus DENV-2 NGC masing-masing sebesar 86,05 μg/ml dan 150,22 μg/ml; dengan nilai SI masing-masing sebesar 4,50 dan 2,22. Kesimpulan dari penelitian ini adalah produk dimer 4?-AAF berhasil disintesis menggunakan katalis enzim peroksidase dari tumbuhan sawi hijau dan memiliki aktivitas antivirus DENV-2 NGC, dengan aktivitas yang lebih baik dari pada bahan pemulanya, serta tidak toksik terhadap sel Huh-7it1.

---

Dengue Haemorrhagic Fever (DHF) is a disease that is widely spread in Indonesia. The disease is caused by the dengue virus (DENV) which until now does not have a cure. This study aims to synthesize a dimeric compound of 4'- aminoacetophenone (4?-AAP) using peroxidase enzyme catalyst from green mustard plant (Brassica juncea) and to determine DENV antiviral activity of the dimeric compound. The 4?-AAP dimer was synthesized using peroxidase enzyme catalyst from green mustard plant at pH 7 and room temperature, with protein content of the enzyme of 3,3085 mg/ml and specific activity of the enzyme of 0,0790 unit/ml. The dimeric product has a molecular weight of 266.1 g/mol; UV maximum wavelength of 335 nm in methanol; Retardation factor (Rf) of Thin Layer Chromatography (TLC) of 0.78 with eluent hexane-ethyl acetate (7:3); IUPAC name of 1-{4-[(E)-2-(4-acetylphenyl)diazen-1-yl]phenyl}ethan-1-one; and was formed by forming -N=N- linkage, according to IR, MS, and 1H- and 13C-NMR spectrophotometry data. The dimeric product and starting material of 4?-AAP have CC50 values to the Huh-7it1 cells of 386.82 μg/ml and of 332.74 μg/ml, respectively; IC50 values against DENV-2 NGC virus of 86.05 μg/ml and of 150.22 μg/ml, respectively; and IS values of 4.50 and of 2.22, respectively. It can be concluded that the dimeric product of 4?-AAP was successfully synthesized using peroxidase enzyme catalyst from green mustard. The product also has DENV-2 NGC antiviral activity, has a better activity than its starting material, and is not toxic to the Huh-7it1 cellssynthesis, 4?-aminoacetophenone, peroxidase, Brassica juncea, antivirus, dengue."

"Tempoyak merupakan makanan fermentasi tradisional yang difermentasi oleh Bakteri Asam Laktat (BAL). Sebagai makanan fungsional, tempoyak diketahui memiliki efek mendukung fungsi fisiologis tubuh. Penelitian ini bertujuan untuk mengisolasi BAL dari tempoyak yang memiliki aktivitas antibakteri dan memiliki karakteristik seperti probiotik. Isolasi BAL menggunakan metode quadrant streak pada medium de Man Rogosa Sharpe Agar (MRSA) dengan penambahan kalsium karbonat (CaCO3) 0,3%. Karakterisasi dilakukan untuk mengetahui karakteristik morfologi (pengecatan Gram), fisiologi (uji pertumbuhan pada variasi konsentrasi bile, pH, NaCl, dan suhu), dan biokimia (uji O-F, katalase, oksidase, aerob, anaerob, dan koagulasi susu). Uji aktivitas antibakteri dilakukan dengan teknik difusi, yaitu uji antagonis dengan metode agar plug dan antibiosis dengan silinder terhadap delapan bakteri uji (Staphylococcus aureus NBRC 100910, Kocuria rhizophila NBRC 12078, Escherichia coli CP, Bacillus cereus G18, Klebsiella oxytoca G7, Proteus mirabilis, Pseudomonas aeruginosa WDCM 00114, dan Salmonella typhi). Hasil isolasi diperoleh 15 isolat yang menghasilkan zona bening pada MRSA dengan penambahan CaCO3. Sembilan di antara 15 isolat mampu menghasilkan zona bening secara terpisah setelah dilakukan konfirmasi ulang. Seluruh isolat tersebut digunakan untuk uji antagonis dan tiga isolat dengan indeks aktivitas tertinggi (T2.3, T3.1, dan T3.2) dipilih untuk karakterisasi dan uji antibiosis. Hasil karakterisasi menunjukkan ketiga isolat berbentuk batang dan memiliki beberapa karakteristik probiotik. Ketiga isolat juga menunjukkan aktivitas antibakteri terhadap delapan bakteri uji.

---

Tempoyak is a traditional fermented food fermented by Lactic Acid Bacteria (LAB). As a functional food, tempoyak is known to have beneficial effects that support physiological functions. This research aims to isolate LAB from tempoyak that have antibacterial activity and probiotic-like characteristics. Isolation of LAB was carried out using the quadrant streak method on de Man Rogosa Sharpe Agar (MRSA) supplemented with 0,3% Calcium Carbonate (CaCO3). Characterization was conducted to determine morphological (Gram-stain), physiological (growth test on various concentrations of bile, pH, NaCl, and temperatures) and biochemical characteristics (O-F, catalase, oxidase, aerobic and anaerobic tests, and milk-coagulating activity). Antibacterial activity tests were conducted using diffusion methods, namely the antagonistic test using the agar-plug method and antibiosis using cylinders against eight bacterial species (Staphylococcus aureus NBRC 100910, Kocuria rhizophila NBRC 12078, Escherichia coli CP, Bacillus cereus G18, Klebsiella oxytoca G7, Proteus mirabilis, Pseudomonas aeruginosa WDCM 00114, and Salmonella typhi). The isolation results yielded 15 clear-zone producing isolates on CaCO3-supplemented MRSA. Nine out of 15 isolates were found to have the ability to produce clear zones consistently after reconfirmation. All isolates were used for the antagonistic test, and the three isolates with the highest activity index (T2.3, T3.1, and T3.2) were chosen for further characterization and antibiosis tests. Characterization results showed that these three isolates were rod-shaped and had some probiotic characteristics. The three isolates also exhibited antibacterial activity against the eight tested bacteria."

"Penelitian bertujuan untuk mendeteksi gen resistan chloramphenicol dan erythromycin pada plasmid bakteri asam laktat (BAL) yang diisolasi dari pangan fermentasi tradisional Indonesia. Sebanyak 120 isolat bakteri asam laktat diuji resistansinya terhadap chloramphenicol 2 μg/ml dan erythromycin 1 μg/ml.Hasil penapisan menunjukkan sebanyak 49 isolat resistan terhadap chloramphenicol dan 16 isolat resistan terhadap erythromycin. Isolasi plasmid dilakukan pada isolat yang resistan dan diketahui plasmid terdapat pada isolat D2, T8, dan S34. Plasmid tersebut selanjutnya dideteksi dengan menggunakan lima pasang primer, yaitu cat, catpIP501, ermB, ermC, dan Tn554.Hasil menunjukkan gen resistan chloramphenicol (cat) berhasil dideteksi pada plasmid BAL dari pangan fermentasi tradisional Indonesia, sedangkan gen resistan erythromycin (ermB) tidak berhasil dideteksi.

---

The research investigated to detect the chloramphenicol and erythromycin resistance genes on plasmid of lactic acid bacteria (LAB) isolated from Indonesian traditional fermented foods. A total 120 isolates were screened for resistance to 2 μg/ml chloramphenicol and 1 μg/ml erythromycin.

The result showed that 49 isolates were resistance to chloramphenicol and 16 isolates were resistance to erythromycin. Plasmids from potential isolates then isolated and has been known there were in isolate D2, T8, and S34. Plasmids then has been detected with 5 pairs of specific primers: cat, catpIP501, ermB, ermC, and Tn554.

The result showed that chloramphenicol resistance gene (cat) has successfully detected on plasmid of LAB from Indonesian traditional fermented foods, however the erythromycin resistance gene (ermB) has not detected."

"Pembentukan senyawa dimer dari isoeugenol telah dilakukan dengan bantuan biokatalis enzim peroksidase dan hidrogen peroksida. Enzim peroksidase merupakan kelompok enzim oksidoreduktase yang mampu mengkatalisis reaksi oksidasi oleh hidrogen peroksida dari sejumlah substrat yang merupakan donor hidrogen seperti fenol dan anilin. Isolasi enzim peroksidase yang dilakukan terhadap tanaman sawi hijau (Brassica juncea) menghasilkan ekstrak enzim kasar dengan aktivitas spesifik 0,0395 U/mg. Hasil reaksi isoeugenol dengan berat sebesar 32,67 g yang dikatalisis oleh enzim peroksidase menghasilkan produk berupa minyak kental berwarna hitam kekuningan dengan berat 5,65 g (17,31%). Pemurnian produk dilakukan menggunakan KLT preparatif dan hasil yang diperoleh berupa kristal kuning selanjutnya diidentifikasi menggunakan instrumentasi UVVisibel, FT-IR, GC-MS dan polarimeter. Hasil identifikasi menunjukkan adanya senyawa dimer isoeugenol yaitu dehidrodiisoeugenol dengan m/z = 326 dan waktu retensi 14,95 menit sedangkan hasil pengukuran dengan polarimeter menunjukkan adanya sifat optis aktif pada senyawa hasil reaksi dengan sudut putar spesifik [α]25D = + 20,0° (c, 0.01 g/10 mL, metanol). Bioktivitas dari senyawa hasil reaksi menunjukkan hasil yang lebih baik daripada isoeugenol dimana bioaktivitas yang dilakukan meliputi uji BSLT dan uji aktivitas antioksidan. Untuk uji BSLT senyawa hasil reaksi memiliki nilai LC50 8,175 ppm sedangkan isoeugenol LC50 sebesar 8,939 ppm. Dan untuk uji aktivitas antioksidan senyawa hasil reaksi memiliki nilai IC50 0,7608 ppm dan isoeugenol memiliki nilai IC50 12,0727 ppm."