Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

"Virus dengue (DENV) adalah penyebab penyakit infeksi yang endemik di 100 negara di dunia. DENV dapat menyebabkan infeksi primer dan sekunder. Infeksi sekunder diperkirakan lebih berat dan akan menyebabkan menjadi Demam Berdarah Dengue (DBD) dan Sindrom Renjatan Dengue (SRD). Penatalaksanaan yang lebih dini dan tepat akan membantu mengurangi terjadinya kasus berat seperti DBD dan SRD. Teknik diagnostik yang dikembangkan belum ada yang dapat mendeteksi secara cepat dan tepat pada awal infeksi terutama untuk virus dengue strain Indonesia. Tujuan penelitian ini untuk mendapatkan kondisi yang optimal untuk deteksi DENV dan analisis validasi tehnik in house multiplek realtime Reverse Transcriptase-Polimerase Chain Reaction (rRT-PCR) sehingga dapat digunakan untuk deteksi dini dan cepat infeksi DENV. Rancangan penelitian ini adalah penelitian eksperimental laboratorium. Strain standar DENV diisolasi dengan kit Roche® dan spesimen diekstraksi dengan kit Qiagen®. Strain standar DENV digunakan untuk optimasi suhu annealing dan konsentrasi primer masing-masing serotipe DENV dengan metode in house multiplek rRT-PCR berbasis SYBR green. Sebagai pembanding digunakan RT-PCR konvensional dengan menggunakan primer di daerah C-PrM. Primer in house multiplek rRT-PCR didesain di daerah envelope pada masing masing serotipe. Analisis limit of detection (LOD) dilakukan dengan pengenceran titer virus 105, 104, 103, 102, 10 dan 1 FFU/ml (in house multiplek rRT-PCR) pada keempat serotipe. Hasil in house multiplek rRT-PCR dibandingkan dengan hasil RT-PCR konvensional Lanciotti pada pasien dengue yang telah masuk dalam kriteria inklusi dan eksklusi. Suhu annealing optimal didapatkan pada suhu 58oC sedangkan konsentrasi optimal masing-masing primer untuk in house multiplek rRT-PCR adalah 4 pmol. LOD RNA pada DENV-1, DENV-2, DENV-3, DENV-4 adalah 1 FFU/ml, 10 FFU/ml, 104 FFU/ml dan 1 FFU/ml. In house multiplek rRT-PCR dibandingkan RT-PCR konvensional mempunyai sensitivitas sebesar 100%, spesifisitas 94,2 %, nilai prediksi positif 85,7% dan nilai prediksi negatif 100 %. In house multiplek rRT-PCR berbasis SYBR green merupakan metode yang dini, cepat dan tepat untuk deteksi DENV pada awal infeksi dengan sensitivitas dan spesifisitas yang baik sebagai metode diagnostik infeksi dengue dimasa mendatang.

---

Dengue virus (DENV) is an infectious disease that is endemic in 100 countries in the World. Dengue virus infections can cause primary and secondary. Secondary infection is estimated to be more severe DHF and SDD. Developed diagnostic technique that no one has been able to quickly and accurately detect the infection early, especially for the Indonesian strain of dengue virus. The purpose of this study is to obtain optimal conditions for the detection of dengue infection and analysis techniques in-house validation of multiplex real-time Reverse Transcriptase-Polymerase Chain Reaction (rRT-PCR) for the Indonesian strain of dengue virus.

Design of this study is an experimental research laboratory. Standard strains of dengue virus was isolated with a kit Roche® and the specimen was extracted with Qiagen® kit. Standard strains of dengue virus is used for optimization primer annealing temperature and the concentration primers of each serotype dengue virus by multiplex rRT-PCR method based on SYBR green. Primers for RT-PCR conventional based lanciotii et al while rRT-PCR primer was designed in the envelope gen at each serotype. Limit of detection (LOD) by diluting the virus titer 105, 104, 103, 102 FFU /ml performed by rRTPCR in all four serotypes.

The results of multiplex rRT-PCR compared with results of conventional RT-PCR in patients with dengue lanciotti superbly into the criteria inclusion and exclusion. Optimal annealing temperature results obtained at a temperature of 58oC and optimal primer concentration of 4 pmol of each primer for 25 ul total reaction. LOD RNA in DENV-1, DENV-2, DENV-3 and DENV-4 at titer of 1 FFU / ml, 10 FFU/ml, 104 FFU/ml and 1 FFU/ml. .In house multiplex rRT-PCR compared with RT-PCR has a sensitivity of 100%, specificity 95,2%, positive predictive value 85,7% and negative predictive value of 100%. In-house multiplex rRT-PCR with SYBR green-based research is a method that is rapid and precise detection of dengue virus in early infection with good sensitivity and specificity compared to RT-PCR as a diagnostic method in the future dengue infection."

"Pendahuluan : Infeksi dengue merupakan masalah kesehatan utama di Indonesia yang berdampak pada kematian akibat renjatan, apabila diagnosis dan penatalaksanaan tidak dilakukan secara dini. Kendala yang dihadapi dalam protokol deteksi kebocoran plasma selama ini adalah faktor yang menyebabkan negatif palsu, waktu yang di perlukan relatif lama, serta waktu terjadinya kebocoran plasma yang tidak dapat dipastikan. Ultrasonografi abdomen menjadi alat diagnostik potensial untuk menilai kebocoran plasma dan menjadi indikator prognostik. Tujuan : Menghitung nilai sensitivitas dan spesifisitas ultrasonografi abdomen dalam mendeteksi kebocoran plasma pada infeksi dengue dewasa berdasarkan pemeriksaan albumin darah, serta mendapatkan karakteristik efusi pleura, asites dan penebalan dinding kandung empedu dalam ultrasonografi abdomen pada infeksi dengue. Metode : Penelitian ini menggunakan desain potong lintang ( cross sectional study ) serial dengan menggunakan data primer. Hasil : Pada hari ke 3 sampai hari ke 5 demam, ultrasonografi abdomen memiliki sensitivitas 100% dan spesifisitas 100%, sedangkan pada hari ke 6 didapatkan sensitivitas 100% dan spesifisitas 83,3% dibandingkan pemeriksaan albumin darah sebagai standar baku emas. Kesimpulan : Ultrasonografi abdomen dapat dimasukkan ke dalam protokol diagnostik infeksi dengue sebagai alternatif pemeriksaan albumin darah.

---

Introduction : Dengue infection has been the major health issue in Indonesia, which may lead to death because of shock. The protocol in detecting plasma leakage have several problems that can make false negative. Abdominal ultrasound is a potential diagnostic modality in detecting this condition. There were no spesific studies to determine the role of ultrasound in dengue infection.

Objective : to asses the sensitivity and specificity of abdominal ultrasound in detecting plasma leakage of dengue infection compared to serum albumin and also to determine the characteristic of pleural effusion, ascites and thickening of gall bladder wall.

Method : This study is using serial cross sectional design with primary data.

Result : At third until fifth day of fever, the sensitivity and specificity of abdominal ultrasound is both 100%. At sixth day of fever, the sensitivity is 100% and the specificity is 83,3% compared to serum albumin.

Conclusion: Abdominal ultrasound can be implemented to diagnostic protocol of dengue infection as an alternative examination in detecting plasma leakage and should be performed at fourth and fifth day of fever."

"Demam berdarah dianggap sebagai masalah kesehatan utama bukan hanya di Indonesia, tetapi juga banyak negara lain. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui kinetik Non Structural-1 (NS1) dan persen positif antigen NS1 yang dideteksi dengan menggunakan diagnostik dini Strip Ag Bio-rad NS1 pada hari demam ke 1 sampai 3. Uji diagnostik ini dilakukan di Laboratorium Mikrobiologi Universitas Indonesia melalui pemeriksaan laboratorium pada 102 sampel dari pasien yang diduga demam berdarah. Standar baku untuk uji ini adalah Reverse Transcription - Polymerase Chain Reaction (RT-PCR), isolasi virus di cell line C6/36, serta kenaikan titer antibodi. Program SPSS 17.0 digunakan untuk analisis data. Dari total pasien yang terlibat dalam penelitian ini, 68 (68.3%) pasien terinfeksi demam berdarah. Investigasi lebih lanjut dalam mendeteksi keberadaan antigen NS-1 berdasarkan hari demam dilakukan pada penelitian ini. Berdasarkan hasil yang diperoleh, keberadaan NS-1 pada pasien terinfeksi demam berdarah pada hari demam ke 1, 2 dan 3 adalah 100%, 96,36%, dan 94.55% berturut - turut. Kesimpulan penelitian ini adalah bahwa Strip Ag Bio-Rad NS1 dapat digunakan sebagai deteksi dini demam berdarah di Indonesia.

---

Dengue is considered as a major health problem in not only Indonesia, but many other countries. The aim of this study was to know the kinetic of Non-Structural-1 (NS1) and positive percentage of NS1 detected by a diagnostic kit Bio-Rad NS1 Ag Strip Test during first until third day of fever. This diagnostic test was conducted in Microbiology Laboratorium of Universitas Indonesia by performing laboratory examination to 102 serum samples of dengue suspected patients. Gold standard of this study was Reverse Transcription - Polymerase Chain Reaction (RT-PCR), virus isolation in C6/36 cell line, and increase of antibody titer. SPSS 17.0 program was used to analyze the data. Based on total patients involved, 68 (68.3%) patients were infected with dengue. Further investigation on detecting presence of NS-1 antigen according to days of fever was done in this study. From the result, presence of NS-1in dengue-infected patients during day 1, 2, and 3 of fever were 100%, 96.36%, and 94.55% respectively. Conclusion of this study was that Bio-Rad NS1 Ag Strip can be used as early detection of dengue fever in Indonesia."

"Latar belakang. Salah satu penentu manifestasi klinis dengue berat adalah kebocoran plasma. Limfosit dan monosit berperan dalam patogenesis kebocoran plasma infeksi dengue sehingga berpotensi sebagai prediktor kebocoran plasma. Tujuan. Menentukan kemampuan hitung jenis limfosit dan monosit demam hari kedua sebagai prediktor kebocoran plasma pada fase kritis infeksi dengue. Metode. Desain kohort retrospektif pasien rawat inap di RSUPN Cipto Mangunkusumo, RSUP Persahabatan dan RSPAD Gatot Soebroto dari tahun 2010 ̶ 2015, memenuhi kriteria inklusi: berusia > 15 tahun; didiagnosis dengue menurut WHO 1997; dikonfirmasi pemeriksaan NS-1/pemeriksaan serologis anti dengue; memiliki data darah perifer lengkap dan hitung jenis mulai demam hari ke-2; USG abdomen, dan/atau albumin pada fase kritis. Dilakukan analisis Reciever Operating Characteristic Curves (ROC curve) dengan interval kepercayaan (IK) 95% dan multivariat regresi logistik untuk memperoleh model prognostik. Hasil. Terdapat 63 subjek dianalisis. Insidens kebocoran plasma 49%. Nilai absolut limfosit dan nilai absolut monosit demam hari ke-2 berpotensi menjadi prediktor kebocoran plasma pada fase kritis dengan AUC 0,65 dan 0,64. Titik potong optimal nilai absolut limfosit dan nilai absolut monosit yang berpotensi sebagai prediktor kebocoran plasma sebesar 1323 dan 770. Nilai absolut limfosit memiliki sensitivitas 90%, spesifisitas 16%. Nilai absolut monosit memiliki sensitivitas 94%, spesifisitas 34%. Model prognostik nilai absolut monosit dan persentase limfosit meningkatkan AUC menjadi 0,723. Simpulan. Kemampuan prediksi kebocoran plasma nilai absolut limfosit dan nilai absolut monosit demam hari kedua lemah. Namun kemampuan tersebut ditingkatkan menjadi sedang oleh model prognostik yang melibatkan persentase limfosit dan nilai absolut monosit.

---

Background. The severity of dengue infection was determined by plasma leakage. Lymphocytes and monocytes played an important role in the pathogenesis of plasma leakage in dengue infection so they potentially used as predictors for plasma leakage in a critical phase of dengue infection.

Aim. Determined the percentage and absolute number of lymphocytes and monocytes measured on the second day of fever as a predictors for plasma leakage in a critical phase of dengue infection.

Method. The research was retrospective cohort study of inpatients at Cipto Mangunkusumo Hospital, Persahabatan General Hospital and Gatot Subroto Military Hospital Jakarta from 2010 ̶ 2015. The inclusion criteria: age > 15 years, suffering from dengue infection according to the diagnostic criteria of WHO in 1997, confirmed by examination of NS-1 or serological anti-dengue, peripheral blood count and differential leucocyte count during treatment from second day of fever, abdominal ultrasound, and / or albumin in the critical phase. Analyses were performed using ROC curve. Multivariate analysis was performed to elicit prognostic models.

Results. We determined 63 subjects. The incidence of plasma leakage was 49%. Absolute number of lymphocytes and monocytes on second day of fever were potentially useful as predictors for plasma leakage. The AUC was 0.65 and 0.644. The optimal cut-off point for absolute number of lymphocytes were 1323, the sensitivity was 90% and the specificity 16%. The cut-off for absolute number of monocytes was 770, the sensitivity was 94%, specificity 34%. We found optimal prognostic model which include percentage of lymphocytes and absolute number of monocytes. It could increase the AUC until 0,723.

Conclusion. The absolute number of lymphocytes and monocytes on second day of fever in dengue infections were potentially useful as predictors for plasma leakage in a critical phase of dengue infection. Predictive capability could be increased by prognostic model which include percentage of lymphocytes and absolute number of monocytes as predictors."

"Kebocoran plasma pada fase kritis berhubungan dengan morbiditas dan mortalitas infeksi dengue. Hingga saat ini belum diketahui pasti patofisiologinya dan kejadiannya belum dapat diprediksi. Diteliti peran respons imun pejamu dengan kejadian kebocoran plasma pada pasien dengue dengan melihat hubungan antara hitung virus intra-monosit dan hitung monosit absolut pada fase akut dengan kejadian kebocoran plasma pada fase kritis, serta mengetahui adanya antibodi terhadap sel endotel yang kemungkinan berperan pada kebocoran plasma. Penelitian ini merupakan kohort prospektif dengan 127 subjek penelitian yang terinfeksi serotipe DENV tunggal berdasarkan rt-PCR dan dirawat di rumah sakit sebelum hari keempat demam. Spesimen darah diambil pada hari kedua demam, dan perubahan klinis dan laboratoris dipantau hingga hari ketujuh perawatan. Kebocoran plasma ditentukan pada fase kritis hari ke-5 sampai ke-7, berdasarkan kriteria WHO dan dengue score. Pada pasien dengan kebocoran plasma berdasarkan kriteria WHO, tidak terdapat perbedaan hitung virus DENV plasma pada hari kedua demam (p = 0,325) dengan pasien tanpa kebocoran plasma. Hitung virus DEN intra-monosit lebih tinggi secara bermakna (p = 0,031). Jika dikelompokkan berdasarkan dengue score, perbedaan hitung DENV intra-monosit bermakna antara kelompok skor > 3 dan skor < 1 (p = 0,07), namun tidak ditemukan perbedaan antara kelompok skor 2 dan < 1 (p = 0,14) dan antara skor 2 dan skor > 3 (p = 0,23). Demikian pula tidak ada perbedaan bermakna hitung DENV plasma pada ketiga kelompok tersebut (nilai p masing-masing adalah 0,07, 0,14, dan 0,95). Hitung absolut monosit darah tepi mengalami penurunan pada semua pasien, dengan titik terendah pada hari ketiga demam. Penurunan lebih besar secara bermakna (p = 0,015) terjadi pada kelompok dengan kebocoran plasma. Dengan titik potong hitung monosit absolut hari ketiga 250 sel/L, diperoleh AUC 0,742 untuk memprediksi kebocoran plasma dengan kriteria WHO, dan AUC 0,647 untuk memprediksi dengue score > 3 pada fase kritis. Selain itu, ditemukan antibodi terhadap sel endotel pada pasien terinfeksi DENV, dengan 3 target lebih banyak diekspresikan pada pasien dengan kebocoran plasma adalah protein berukuran 37 kDa, 75 kDa, dan 120 kDa. Kebocoran plasma pada fase kritis berhubungan dengan hitung virus DENV intra-monosit yang lebih lebih tinggi dan jumlah absolut monosit darah tepi yang lebih rendah pada fase akut. Dengan titik potong hitung monosit absolut pada hari ketiga 250 sel/L dapat diprediksi kejadian kebocoran plasma pada fase kritis. Ditemukan antibodi terhadap sel endotel yang kemungkinan berhubungan dan berpotensi sebagai penanda prediktor kebocoran plasma.

---

Plasma leakage during the critical phase is associated with morbidity and mortality from dengue infection. Until now, the pathophysiology is remains unclear, and the occurrence is unpredictable. We examine the role of host immune response in the pathophysiology of plasma leakage in dengue infected patients by studying the association of intra-monocyte DENV viral load and monocyte absolute count during the acute phase with plasma leakage during critical phase. We also examined the existence of anti-endothelial antibody in dengue infected patients’ plasma that could potentially be involved in the plasma leakage. This prospective cohort study involved 127 subjects with single DENV serotype infected identified by rt-PCR and hospitalized for three days after the fever occurs. Blood samples were taken on the second day, and all the patients were monitored until the 7th day for clinical and laboratory changes. Plasma leakage was determined on fifth to seventh day, according to the WHO criteria and dengue score. In the plasma leakage group, based on WHO criteria, there was no significant difference in plasma DENV viral load (p = 0.325), while the intra-monocyte DENV viral load was significantly higher (p = 0.031). Based on the dengue score grouping, intra-monocyte DENV viral load was significantly higher on score > 3 compared to score < 1 (p = 0.07), but there was no significant difference between scores 2 and < 1 (p = 0.14), and between scores 2 and > 3 (p = 0.23). There were no significant differences in plasma DENV viral load among those groups (respective p values: 0.07, 0.14, and 0.95). The monocyte absolute count decreased in all the patients, with the lowest count was reached on the third day of fever. On day 3, the monocyte absolute counts were significantly lower among plasma leakage patients compared to non-plasma leakage patients (p = 0.015). By using a cut-off point of absolute monocyte count of 250 cells/L, We obtained an AUC of 0.742 which was used to predict the occurrence of plasma leakage in the critical phase based on WHO criteria, and AUC 0.647 to predict dengue score > 3. We also found the anti-endothelial antibodies in the acute plasma of dengue infected patients. The prominent antibodies targeting endothelial proteins of 37 kDa, 75 kDa, and 120 kDa were expressed more among the plasma leakage groups. Plasma leakage during the critical phase is associated with higher intra-monocyte DENV viral loads and lower monocyte absolute count compared to the acute phase. The monocyte absolute count cut-off point of 250 cells/L on the third day may be used as predictor of plasma leakage. Anti- endothelial antibodies were detected in acute plasma and might be associated and used as predictors of plasma leakage."

"Infeksi virus dengue masih merupakan masalah kesehatan dunia saat ini termasuk di Indonesia. Provinsi DKI Jakarta pada tahun 2009 dilaporkan 158.912 kasus dengan jumlah kematian 1.420 orang (CFR 0,89%). Tingginya jumlah rawat inap di rumah sakit ini juga menjadi beban yang cukup besar.Tujuan: untuk mengetahui faktor-faktor yang mempengaruhi lama rawat inap pada pasien yang terinfeksi virus dengue di RSUP Persahabatan, Jakarta Timur.Metode: Menggunakan desain potong lintang (cross-sectional).Hasil: Jumlah kasus infeksi dengue di RSUP Persahabatan tahun 2010 adalah 2168. Didapatkan subjek 450 orang dari total 633 subjek yang tercatat selama 1 Januari - 31 Juni 2010. Berdasarkan hasil analisis multivariat diperoleh 4 variabel yang memiliki hubungan bermakna dengan lama rawat inap pasien yang terinfeksi virus dengue yaitu lama sakit sebelum masuk RS (p=0.000, OR=0.229, 95% CI 0.134-0.392), penyulit (p=0.003, OR = 2.050, CI 95% : 1.276 ? 3.293),jumlah trombosit (p=0.013, OR=2.585, 95% CI 1.220-5.478) dan jumlah leukosit (p=0.024, OR=1.624, 95% CI 1.065-2.475). Variabel yang paling dominan yang berhubungan dengan lama rawat inap adalah jumlah trombosit. Dari hasil tersebut disarankan agar klinisi dan akademisi perlu meningkatkan standar pelayanan penyakit yang lebih efektif dan efisien pada pasien yang terinfeksi virus dengue.

---

Background: Dengue fever remains as health problem in the world, especially in tropic and sub-tropic zone include Indonesia. DKI Jakarta province in 2009 was reported 158.912 cases with mortality rate 1.420 cases (CFR 0,89%). Very high of hospitalization rate in the hospital due to dengue infection increase the burden for the government and community.

Objective: to find out factors affect to the hospitalization days in patients with dengue virus infection in Persahabatan Hospital, East Jakarta

Method: This study was implemented using cross-sectional design.

Result: There was 450 subject from total 633 cases reported during 1 January - 31 June 2010. Based on bivariate analysis there is 4 variable which has significant correlation with hospitalization days in patients with dengue virus infection in Persahabatan Hospital. They are days of sick before hospitalized (p=0.000, OR=0.229, 95% CI 0.134-0.392), complication (p=0.003, OR = 2.050, CI 95% : 1.276 ? 3.293), trombocyte (p=0.013, OR=2.585, 95% CI 1.220-5.478), leucocyte (p=0.024, OR=1.624, 95% CI 1.065-2.475). Dominant variable which has significant correlation with hospitalization days is trombocyte. From those result, suggestion for clinician and academician are to increase services standart to be more effective and efficient for patients with dengue virus infection."

"Virus dengue merupakan virus kelas Flaviviridae yang ditularkan melalui gigitan nyamuk Aedes aegypti yang sebelumnya telah terinfeksi oleh virus dengue. Diagnostik dini dilakukan dalam upaya menekan penyebaran virus ini agar pasien yang terinfeksi bisa ditangani lebih cepat. NS1 merupakan protein yang terdapat pada virus dengue dapat ditemukan di darah pasien satu hari setelah gejala infeksi primer maupun sekunder. Hal ini menjadikan NS1 penanda biologis serta target nanobodi yang tepat dalam diagnosis infeksi virus dengue. Nanobodi yang mengenali antigen NS1 pada DENV menjadi potensi alat uji diagnostik dengue karena sifatnya yang lebih unggul daripada antibodi konvensional. Penelitian ini berfokus pada pembuatan prototipe tes diagnostik cepat berbasis uji aliran lateral untuk mendeteksi NS1 pada virus dengue menggunakan nanobodi anti-NS1. Pada penelitian ini, nanobodi anti-NS1 klon DD7 dan DD5 diekspresikan pada E. coli BL21(DE3). Dalam pembuatan prototipe, dilakukan optimasi formulasi konjugasi antara nanopartkel emas dengan nanobodi anti-NS1. Sebanyak tiga optimasi dilakukan dalam mendapatkan konjugasi nanopartikel emas dengan nanobodi yang optimal, yaitu optimasi pH buffer, konsentrasi nanobodi, dan diameter nanopartikel emas. pH buffer optimal untuk klon DD5 dan DD7 adalah buffer borat pH 9, konsentrasi nanobodi optimal untuk klon DD5 dan DD7 adalah 10 ng, dan diameter optimal nanopartikel emas untuk klon DD5 dan DD7 adalah 40 nm. Pada pembuatan prototipe, konjugasi antara nanopartikel emas dan nanobodi klon DD5 belum berhasil mendeteksi antigen yaitu berupa virus dengue pada bagian test line prototipe dan untuk konjugasi antara nanopartikel emas untuk klon DD7 menghasilkan reaksi false positive pada prototipe.

---

Dengue virus is a class of Flaviviridae virus transmitted through the bite of Aedes aegypti mosquitoes that have previously been infected by the dengue virus. Early diagnostics are carried out in an effort to suppress the spread of this virus so that infected patients can be treated faster. NS1 is a protein found in the dengue virus that can be found in the patient's blood one day after symptoms of primary or secondary infection.This makes NS1 a biosensor as well as a precise target for nanobodies in the diagnosis of dengue virus infection. Nanobodies that recognize NS1 antigens in DENV are potential dengue diagnostic test kits because they are superior to conventional antibodies. This research focuses on making rapid diagnostic tests based on lateral flow assay to detect NS1 in dengue viruses using anti-NS1 nanobodies as an alternative diagnostic test on dengue virus. In this study, anti-NS1 nanobodies of DD7 and DD5 clones were expressed in E. coli BL21(DE3). In making prototypes, optimization of conjugate formulations between gold nanoparticles and anti-NS1 nanobodies was carried out. A total of three optimizations were carried out in obtaining the conjugation of gold nanoparticles with optimal nanobodies, namely optimization of buffer pH, nanobody concentration, and diameter of gold nanoparticles. The optimal buffer pH for DD5 and DD7 clones is pH 9 borate buffer, the optimal nanobody concentration for DD5 and DD7 clones is 10 ng, and the optimal diameter of gold nanoparticles for DD5 and DD7 clones is 40 nm. In making the prototype, the conjugation between gold nanoparticles and DD5 clone nanobodies has not succeeded in detecting antigens in the form of dengue virus in the prototype test line and for conjugation between gold nanoparticles for DD7 clones resulting in false positive reactions in the prototype."

"[Angka kejadian infeksi dengue tinggi di Indonesia, dan Jakarta untuk lebihspesifiknya. Virus dengue terdiri dari 4 serotipe, yang serotipe 1 (DENV-1), 2(DENV-2), 3 (DENV-3), dan 4 (DENV-4). Sampai saat ini, penanganan infeksidengue masih mengandalkan diagnosis dini. Meskipun reverse transcriptionpolymerase chain reaction (RT-PCR) masih sebagai baku emas, metode ini cenderungmahal dan sulit untuk dilakukan. Inilah alasan untuk pengembangan berbagai tescepat, termasuk diantaranya SD Bioline Dengue Duo. Dengan demikian, evaluasi SDBIOLINE Dengue Duo akan bermanfaat dalam dunia klinis. Peneliti menggunakansampel serum yang diambil dari masyarakat, menguji sampel tersebut menggunakanSD BIOLINE Dengue Duo, dan membandingkannya dengan baku emas [reversetranscription polymerase chain reaction (RT-PCR) dan isolasi virus pada lini selC6/36)]. Ditemukan bahwa sensitivitas, spesifisitas, NPV, dan PPV SD BIOLINEDengue Duo untuk mendeteksi demam berdarah serotype campur dan tidak diketahuiadalah 100%. Dalam infeksi DENV-4, SD BIOLINE Dengue Duo menunjukkansensitivitas 60% dan spesifisitas 100%., Dengue infection incidence remained high in Indonesia, and Jakarta to be morespecific. Dengue virus consists of 4 serotypes, which are dengue serotype 1 (DENV-1),2 (DENV-2), 3 (DENV-3), and 4 (DENV-4). Until now, management of dengue infectionstill relies on early diagnosis. Although Reverse transcription polymerase chainreaction (RT-PCR) remains as a gold standard diagnostic method, this method iscostly and difficult to set up. These issues are the reasons for the development ofvarious rapid tests, including SD Bioline Dengue Duo. Evaluation of SD BIOLINEDengue Duo would therefore be beneficial in the clinical setting. Researchers usedserum sample taken from the community, tested the samples using SD BIOLINEDengue Duo, and compare it with the gold standard [Reverse Transcription –Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) and virus isolation in cell line C6/36)]. It wasfound that the sensitivity, specificity, NPV, and PPV of SD BIOLINE Dengue Duofor detection of dengue of mixed and unknown serotype were 100%. In infection ofDENV-4, SD BIOLINE Dengue Duo showed a sensitivity of 60% and specificity of100%.]"

"

Demam berdarah dengue (DBD) merupakan penyakit infeksi global dengan insiden dan mortalitas tinggi. Virus dengue (DENV), penyebab dari infeksi ini, memiliki vektor nyamuk Aedes aegypti dan Aedes albopictus. Namun, hingga saat ini belum ada antivirus spesifik yang tersedia dan upaya pencegahan masih belum efektif. Propil galat merupakan unsur fenolik berpotensi sebagai kandidat antivirus DENV, tetapi belum diketahui bagaimana mekanisme penghambatannya. Pada penelitian ini, akan dilakukan analisis penghambatan reseptor sel dan pengikatan envelope DENV oleh propil galat untuk mengidentifikasi mekanisme propil galat sebagai antivirus DENV secara in vitro dan in silico. Studi ini merupakan eksperimen laboratorium untuk menganalisis mekanisme propil galat sebagai antivirus DENV pada tahap penempelan virus secara in vitro. Strain DENV yang digunakan adalah DENV-2 dan sel kultur yang digunakan adalah sel Vero. Persentase penghambatan diperoleh dengan metode focus assay, sedangkan persentase viabilitas menggunakan metode MTT assay. Selain itu, uji in silico dilakukan untuk mengetahui energi ikatan dan konstanta inhibisi propil galat terhadap protein E. Persentase penghambatan propil galat perlakuan reseptor dan protein E yakni berturut-turut sebesar 9 ± 2,65% dan 53 ± 9,85%. Persentase viabilitas pada perlakuan tahap penempelan virus ke sel adalah 125±1%. Energi ikatan propil galat terhadap protein E adalah -3,21 kkal/mol dengan konstanta inhibisi sebesar 4,44 mM. Propil galat memiliki efek penghambatan terhadap DENV-2 dan tidak toksik jika diberikan pada tahap penempelan virus secara in vitro. Energi ikatan antara protein E dengan propil galat sangat rendah sehingga ikatannya spontan dan afinitasnya baik. Propil galat lebih berpotensi sebagai profilaksis DENV-2.

---

Dengue hemorrhagic fever (DHF) is a global infectious disease with a high incidence and mortality. Dengue virus (DENV), the etiologic agent, has Aedes aegypti and Aedes albopictus as its vectors. However, there is no specific antivirus available and prevention efforts are still ineffective. Propyl gallate is a potential candidate for DENV antivirus, but the mechanism is not yet known. In this study, inhibition of cell receptor and binding of DENV envelope by propyl gallate were conducted to identify its in vitro and in silico mechanism as an anti-DENV. This is an experimental study to analyze the mechanism of propyl gallate as  DENV antivirus in viral attachment stage. DENV-2 was the strain used and the culture cell used was the Vero cell. The inhibitory percentage was obtained by focus assay method, while the viability percentage using MTT assay method. In addition, in silico test was carried out to calculate propyl gallates binding energy and inhibition constant for protein E. The inhibitory percentage of propyl gallate towards receptor and viral envelope are 9±2.65% and 53±9.85%, respectively. The viability percentage in viral attachment inhibition was 125±1%. The binding energy of propyl gallate to protein E was -3.21 kcal/mol with inhibition constant of 4.44 mM. Hence, propyl gallate has an inhibitory effect on DENV-2 and is non-toxic if given in viral attachment stage. The low binding energy between protein E and propyl gallate shows spontaneous bond with a good affinity. Propyl gallate is more potential as DENV-2 prophylaxis.

 

"

"Demam berdarah dengue (DBD) merupakan suatu penyakit yang disebabkan oleh virus dengue (DENV) dan ditransmisikan oleh nyamuk yang hidup di daerah tropis dan subtropis. Insiden terjadinya demam dengue (DD) dan DBD meningkat secara dramatis di dunia selama beberapa dekade terakhir. Hingga saat ini belum ada terapi yang spesifik untuk infeksi dengue. Pengobatan hanya bersifat simptomatik. Walaupun demikian, pada kasus DBD dan SSD, perawatan dini dapat menurunkan angka morbiditas dan mortalitas. Untuk itu diperlukan uji laboratorium yang akurat untuk membantu menegakkan diagnosis dini infeksi dengue. Deteksi Antigen non struktural-1 (NS-1) telah tebukti mampu mendeteksi dini infeksi DENV. Pemeriksaan ini dapat memberikan hasil lebih dini, akurat dan dengan harga yang lebih murah. Dalam usaha mengembangan uji diagnosis berdasarkan NS-1 diperlukan antibodi anti-NS1. Kami telah berhasil memproduksi IgG anti-NS1 DENV. Untuk mendapatkan antibodi anti-NS1 DENV, protein NS-1 (90 μg/ml) koleksi Mikrobiologi disuntikkan pada kelinci dan selanjutnya antibodi dilabel dengan HRP yang dapat digunakan untuk mendeteksi protein NS1 pada serum pasien terinfeksi dengue. Antibodi IgG HRP yang diperiksa menggunakan metode direct ELISA menunjukkan nilai absorbansi tertinggi pada pengenceran 1:100 dan terendah pada pengenceran 1:12800. Uji NS-1 pada serum pasien menunjukkan hasil positif pada semua serum pasien terinfeksi DENV, baik DENV 1, 2, 3 dan 4. Sedangkan hasil negatif ditunjukkan pada serum pasien yang terinfeksi CMV dan EBV, serta pada serum orang sehat. Hasil ini menunjukan bahwa antibodi yang dilabel HRP dapat digunakan untuk pengembangan uji diagnostik untuk mendeteksi keberadaan antigen NS1 virus dengue dalam serum pasien.

---

Dengue fever is a disease caused by dengue virus and is transmitted by mosquito in tropical and subtropical regions. Dengue fever (DF) and dengue hemorraghic fever (DHF) have been dramatically increased in recent decades. Specific therapy to dengue infection is not available. The therapy is only symptomatic. In DHF and dengue shock syndrome (DSS) cases, early therapy can reduce morbidity and mortality rate. Therefore, laboratory assay are needed to accurately diagnose dengue infection at early stage. Detection of nonstructural-1 (NS1) antigen has been proven to provide early detection of DENV infection. The assay can provide early and accurate result with less expensive cost. In a attempt to develop an NS1 - based diagnostic test, we successfully produced anti- NS1 DENV antibody. To obtain anti NS1 DENV antibody, NS1 protein (90 μg/ml) collection of Microbiology was injected to rabbit. The antibodiy was further labeled with HRP and be used to detect NS1 protein in dengue patient sera. The antibody labeled with HRP by direct ELISA method showed the highest absorbance value in 1:100 dilution and the lowest absorbance in dilution 1:12800. NS1 test of patients serum using this labelled antibody showed positive result in all the sera of patients infected with DENV, either DENV 1, 2, 3, and 4. Whereas negative results are shown in the serum of patients infected with CMV and EBV, as well as the serum of healthy people. Therefore, the antibody labeled with HRP could be used for developing diagnostic assay to determine the presence of dengue virus NS1 antigen in patient sera."