Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

"Pendahuluan : Di Indonesia, menurut Biro Pusat Statistik, persentase penggunaan benzena terhadap seluruh bahan kimia yang digunakan oleh sektor Industri diperkirakan sebesar 20-40%. Pada industri minyak dan gas, para pekerja terpajan benzena dalam waktu yang lama, sehingga ada kemungkinan menderita efek toksik benzena berupa gangguan metabolisme lemak, dalam hal ini trigliserida pada pekerja terpajan benzena rendah dengan dan tanpa patahan kromosom limfosit. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui perbedaan rerata kadar trigliserida pada pekerja terpajan benzena rendah dengan dan tanpa patahan kromosom limfosit dalam kurun waktu 1 tahun (2011-2012, serta pengaruhnya terhadap faktor sosiodemografi dan pekerjaan. Metode : Penelitian ini menggunakan disain kohort retrospektif. Tempat penelitian dilakukan di sebuah industri migas X. Jumlah sampel yang memenuhi kriteria inklusi den eksklusi adalah 99 orang. Pengumpulan data dilakukan dengan menggunakan data sekunder, yaitu data kepegawaian dari bagian SDM dan data pemeriksaan kesehatan berkala pekerja tahun 2011 dan 2012. Analisis bivariat dengan uji kemaknaan chi square. Hasil : Rata-rata perubahan kadar trigliserida dengan patahan kromosom limfosit tahun 2011-2012 yaitu 2,52 sedangkan rata-rata perubahan kadar trigliserida tanpa patahan kromosom limfosit tahun 2011-2012 yaitu 7,08. Kesimpulan dan Saran : Hipotesis diterima karena : rerata perubahan perbedaan kadar trigliserida dengan patahan kromosom limfosit lebih rendah dibandingkan rerata perubahan perbedaan kadar trigliserida tanpa patahan kromosom limfosit pada tahun 2011 dan 2012. Pada pekerja dengan patahan kromosom limfosit dengan kadar rata-rata trigliserida tinggi atau normal perusahaan melakukan pemeriksaan kadar trigliserida minimal 6 bulan sekali.

---

Introduction: In Indonesia, pursuant to Central Statistics Bureau, percentage of benzene utilization upon all chemical material used by Industrial sector was estimated at 20-40%. In oil and gas industry, workers exposed to benzene for a long time, thereby there is a possibility to suffer benzene toxic effect in form of fat metabolism disorder, in this regard triglycerides in workers exposed to low benzene with and without lymphocyte chromosome breakage. The purpose of this research is to understand the different of average levels of triglycerides in workers exposed to low benzene with and without lymphocyte chromosome breakage in period of 1 year (2011-2012), and its affect to socio demographic and work.

Method: This research is using retrospective cohort design. Place of research is in oil and gas industry of X. The amount of sample that comply with inclusion and exclusion criteria is 99 peoples. Data collection was conducted by using secondary data, that is employment data form the Human Resources division and workers? periodic health examination in year of 2011 and 2012. Bivariate analysis with chi square significant test.

Results: Average level change of triglyceride with lymphocyte chromosome breakage in year of 2011-2012 is 2.52 while average level change of triglyceride without lymphocyte chromosome breakage in year of 2011-2012 is 7.08.

Conclusion and Recommendation: Hypothesis is accepted due to: different average change of triglyceride levels with lymphocyte chromosome breakage is lower than the average change of triglyceride levels without lymphocyte chromosome breakage in year of 2011 and 2012. For workers with lymphocyte chromosome breakage with high average levels of triglyceride or normal, a company performs examination of triglyceride levels at least every 6 months."

"ABSTRACTAt the department of Biology - University of Indonesia, the use of a modified von Hemel procedure in slide processing often gives incomplete metaphases due to chromosome losses during the processing. This study is to know the percentage of the incomplete metaphases, to test if the chromosome loss is influenced by chromosome size, and how far all of these will give rise to a false diagnosis. The material is a harvest of fixated blood culture from five normal female patients (46,XX). Slides were prepared from the material and "R-band" stained. Then we analyzed and searched for 115 metaphases with only one chromosome loss that could be analyzed. The result shows that 64.19 % out of 1303 metaphases were incomplete, and 9.29 % or 121 metaphases with only one chromosome loss. It is found that each chromosome has different probability of loss which depends on the size of chromosome. The smaller the chromosome, the greater the chance of loss, but all of these do not lead to any false diagnosis. Chromosome Loss During Slide Processing Using a Modified Von Hemel Procedure;Chromosome Loss During Slide Processing Using a Modified Von Hemel Procedure"

"The chromosome is a set of DNA structure that carry information about our life. The information can be obtained through Karyotyping. The process requires a clear image so the chromosome can be evaluate well. Preprocessing have to be done on chromosome images that is image enhancement. The process starts with image background removing. The image will be cleaned background color. The next step is image enhancement. This paper compares several methods for image enhancement. We evaluate some method in image enhancement like Histogram Equalization (HE), Contrast-limiting Adaptive Histogram Equalization (CLAHE), Histogram Equalization with 3D Block Matching (HE+BM3D), and basic image enhancement, unsharp masking. We examine and discuss the best method for enhancing chromosome image. Therefore, to evaluate the methods, the original image was manipulated by the addition of some noise and blur. Peak Signal-to-noise Ratio (PSNR) and Structural Similarity Index (SSIM) are used to examine method performance. The output of enhancement method will be compared with result of Professional software for karyotyping analysis named Ikaros MetasystemT M . Based on experimental results, HE+BM3D method gets a stable result on both scenario noised and blur image.Kromosom adalah kumpulan struktur DNA yang membawa informasi makhluk hidup. Informasi yang dapat diperoleh dengan proses Kariotyping. Proses ini membutuhkan citra yang jelas sehingga kromosom dapat dievaluasi dengan baik. Preprocessing harus dilakukan pada citra kromosom melalui penajaman citra. Proses ini dimulai dengan menghapus latar belakang citra. Langkah berikutnya ialah penajaman citra menggunakan metode image enhancement. Makalah ini membandingkan beberapa metode untuk peningkatan citra. Kami mengevaluasi beberapa metode dalam peningkatan gambar seperti Histogram Equalization (HE), Contrast-limiting Adaptive Histogram Equalization (CLAHE), Histogram Equalization with 3D Block Matching (HE+BM3D), dan unsharp masking. Penulis mengevaluasi dan membahas metode terbaik untuk meningkatkan citra kromosom. Oleh karena itu, untuk mengevaluasi metode, gambar asli dimanipulasi dengan penambahan beberapa kebisingan dan blur. Peak Signal-to-noise Ratio (PSNR) and Structural Similarity Index (SSIM) digunakan untuk mengukur kinerja metode. Hasil penajaman dari metode-metode yang dievaluasi akan dibandingkan dengan hasil software profesional untuk analisis kariotipe bernama Ikaros Metasystem T M . Berdasarkan eksperimen diperoleh hasil bahwa HE + BM3D merupakan metode yang paling stabil pada kedua skenario baik citra mengandung noise maupun citra yang kabur."

"Penelitian transformasi fragmen DNA Xanthomonas campestris ke dalam Escherichia coli DH5αα, digunakan vektor plasmid Escherichia coli (pUC19). DNA kromosom diisolasi dengan metoda CTAB. DNA plasmid diisolasi dengan metoda alkali lisis. Kedua sumber DNA dipotong menggunakan enzim restriksi EcoRI. Sel kompeten disiapkan dengan CaCl2, transformasi menggunakan metoda kejutan panas.Hasil transformasi didapatkan sebanyak 5 koloni putih (yang mengandung fragmen DNA), dengan frekuensi transformasi sebesar 1,22 x 10-8 koloni putih/sel kompeten. Elektoforesis agarosa menunjukkan variasi ukuran DNA fragmen sebesar 0,5 ? 7,5 kb. Penelitian lebih lanjut perlu dilakukan dengan pembuatan pustaka genom untuk mendapatkan hasil transformasi yang lebih banyak.

---

Research on DNA transformation of Xanthomonas campestris into Escherichia coli DH5αα using plasmid vector Escherichia coli (pUC19). was carried out. DNA chromosome was isolated using CTAB method, alkali lysis method was used to isolate DNA plasmid. Both of DNA plasmid and chromosome were digested using restriction enzyme EcoRI. Competent cell was prepared with CaCl2 and heat shock method for transformation procedure.The result revealed transformation obtain 5 white colonies, with transformation frequency was 1,22 x 10-8 colony/competent cell. Electrophoresis analysis showed the DNA fragment (insert) in range 0.5 ? 7,5 kb. Further research should be carried out to prepare the genomic library to obtain better result of transformant."

"Ion kalsium (Ca2+) merupakan kation yang berperan dalam kondensasi kromosom. Berbagai penelitian mengenai pengaruh Ca2+ terhadap struktur kromosom telah dilaporkan. Akan tetapi, penelitian-penelitian tersebut masih terbatas pada galur sel kanker atau sel hewan mamalia dengan pendekatan analisis ultrastruktur. Pengaruh Ca2+ terhadap struktur dan pola banding kromosom pada sel manusia non-kanker belum diketahui. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengaruh Ca2+ terhadap struktur dan pola banding kromosom dari sel darah manusia melalui teknik GTL-banding. Sel darah manusia dikultur, kemudian dilakukan pemanenan kromosom dan banding menggunakan pewarna Leishman. Pengaruh Ca2+ dievaluasi dengan menginkubasikan kromosom pada dua larutan berbeda, yaitu larutan 1 mM BAPTA sebagai chelator spesifik Ca2+ dan 1 mM EDTA sebagai chelator kation, dan dibandingkan dengan kontrol. Data yang diperoleh dianalisis secara kualitatif dengan mengamati struktur dan pola banding kromosom, serta secara kuantitatif dengan menentukan nilai kromosom berdasarkan kriteria Quality Assessment (QA) dari International System for Human Cytogenetics Nomenclature (ISCN). Hasil yang diperoleh menunjukkan kromosom kelompok perlakuan 1 mM BAPTA memiliki struktur tidak padat, membentuk struktur fibrous, dan berukuran lebih lebar dibandingkan kromosom kontrol dengan pola banding tidak jelas dan kabur. Kromosom kelompok perlakuan 1 mM EDTA membentuk struktur tidak padat dan berukuran lebih panjang dibandingkan kelompok kontrol. Rata-rata nilai kromosom pada kelompok kontrol, BAPTA, dan EDTA berturut-turut adalah 4,467 ± 0,78; 4,30 ± 0,75; dan 4,467 ± 0,86. Perbedaan struktur kromosom, pola banding, dan rata-rata nilai kromosom pada kromosom 1 mM BAPTA dan 1 mM EDTA menunjukkan bahwa kation Ca2+ merupakan faktor penting dalam kondensasi struktur kromosom.

---

Calcium ion (Ca2+) is a cation that has a major role in chromosome condensation. Studies about Ca2+ effect in chromosome structure have been reported. However, the studies are limited for cancer cell lines using the ultrastructure analysis approach. The effect of Ca2+ on chromosome structure and banding pattern of the human non-cancer cell line is still unknown. This study aims to determine the effect of Ca2+ on human blood cell chromosome structure and banding pattern using the GTL-banding technique. The blood cell was cultured and then the chromosome was harvested and banded with Leishman dye. The Ca2+ effect was evaluated by using 1 mM BAPTA as Ca2+ specific chelator and 1 mM EDTA as common cation chelator and then compared with the control. The data were then analysis both qualitatively by observing chromosome structure and banding pattern, as well as quantitatively by determining chromosome value based on Quality Assessment (QA) from International System for Human Cytogenetics Nomenclature (ISCN). The result showed that the BAPTA-treated chromosome structure was fuzzy, fibrous, and wider than the control group with a less clear banding pattern than the control. In addition, EDTA-treated chromosome structure was less condensed and longer than those of the control. The mean chromosome value of control, BAPTA-, and EDTA-treated chromosome are 4.467 ± 0.78; 4.30 ± 0.75; and 4.467 ± 0.86. Distinct characteristic of chromosome structure, banding pattern, and mean of chromosome value from BAPTA- and EDTA-treated chromosome further indicates that Ca2+ plays an important role in chromosome condensation."

"ABSTRAK Sampai saat terapi radiasi merupakan pengobatan pilihan terhadap kanker nasofaring. Radiasi yang diberikan tersebut dapat menyebabkan penurunan jumlah limfosit. Penurunan jumlah limfosit di atas diduga antara lain karena terjadi aberasi kromosom. Dari penelitian sebelumnya terlihat bahwa radiasi rnengakibatkan aberasi kromosom pada penderita yang menjalani terapi radiasi. Tipe-tipe aberasi kromosom yang terbentuk dapat berupa kromosom disentrik, kromosom asentrik dan kromosom cincin. Terapi radiasi diberikan dengan dosis 200 cGy per hari, lima kali berturut-turut dalam seminggu selama kira-kira enam minggu. Sampel diperoleh dari darah tepi penderita kanker nasofaring yang belum mendapat radiasi (kontrol= 0 cGy), setelah terapi radiasi 2000 cGy, 4000 cGy, serta 6000 cGy. Dari uji Kruskal-Wallis yang dilanjutkan dengan "criticai range" Kruskal-Wallis, menunjukan kromosom disentrik dan kromosom asentrik berbeda nyata antara kontrol dengan penderita yang mendapat radiasi (2000 cGy, 4000 cGy, 6000 cGy), sedangkan jumlah kromosom cincin terbanyak pada radiasi 4000 eGy (P < 0,05). Aberasi lain tidak dipengaruhi oleh dosis radiasi. Uji Spearman memperlihatkan kromosom cincin dan kromosom asentrik berkorelasi negatif terhadap jumlah limfosit (P < 0,05), sebaliknya antara kromosom disentrik dengan jumlah limfosit tidak ada korelasi negatif (P 0,05)."

"Kromosom merupakan untai DNA yang mengalami penebalan akibat kondensasi. Kondensasi struktur kromosom sangat mempengaruhi segregasi kromosom saat fase mitotik. Penelitian sebelumnya telah melaporkan bahwa kondensasi kromosom sel HeLa dipengaruhi oleh ion kalsium ( ), namun pengaruh Ca2+ pada kromosom manusia normal belum diketahui. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengaruh terhadap struktur kromosom limfosit manusia dengan pemberian 1 mM 1, 2-bis(2-aminophenoxy)ethane-N-N,N’,N’-tetraacetic acid (BAPTA, chelator Ca2+), 1 mM ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA, chelator kation), dan PBS (kontrol) yang diamati menggunakan mikroskop cahaya. Sampel darah dikultur selama 72 jam, kemudian kromosom limfosit diisolasi dan diberi perlakuan 1 mM BAPTA, 1 mM EDTA, dan PBS. Kromosom diwarnai dengan Giemsa dan diamati dengan mikroskop cahaya. Hasil yang diperoleh menunjukkan struktur kromosom kontrol lebih pendek, padat, serta memiliki intensitas pewarna yang pekat dibandingkan dengan kromosom yang diberi perlakuan 1 mM BAPTA dan 1 mM EDTA yang memiliki struktur yang lebih panjang, lebih berongga, serta intensitas pewarna yang kurang pekat. Hasil analisis kuantitatif menunjukkan panjang, lebar, dan luas rata-rata kromosom kontrol sebesar 1,73±0,73 μm, 0,55±0,43 μm, dan 3,5±2,17 μm2, sedangkan panjang, lebar, dan luas rata-rata kromosom yang diberi 1 mM BAPTA sebesar 2,91±1,3 μm, 1,43±0,43 μm, dan 4,17±2,75 μm2. Rata-rata panjang dan lebar kromosom yang diberi 1 mM EDTA sebesar 2,26±0,52 μm dan 0,93±0,29 μm. Hasil tersebut memperlihatkan bahwa Ca2+ berperan penting dalam kondensasi struktur kromosom limfosit.

---

The Chromosome is a DNA strand that undergoes thickening due to condensation. Condensation of chromosomal structure affects the segregation of chromosomes during the mitotic phase. Previous studies have reported that chromosomal condensation of HeLa cells is affected by calcium ions (Ca2+). Nevertheless, the effect of Ca2+ on human normal cells has yet to be investigated. This study aims to determine the effect of Ca2+ on the chromosomal structure of human lymphocyte by the treatments of 1 mM 2-bis(2-aminophenoxy)ethane-N-N,N’,N’-tetraacetic acid (BAPTA, a Ca2+ chelator), 1 mM ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA, a cation chelator), and PBS (control), using a light microscope. The blood sample was cultured for 72 hours, followed by lymphocyte chromosomes isolation. After that, the samples were treated with PBS (control), 1 mM BAPTA, and 1 mM EDTA. Chromosomes were then stained with Giemsa and observed using a light microscope. The qualitative analysis showed that control chromosomes have shorter, and more condensed structures with a high dye intensity compared with those treated with 1 mM BAPTA and 1 mM EDTA which showed a longer and fibrous structure with low dye intensity. The quantitative analysis showed that the average length, width, and area of the control chromosome was 1.73±0.73 μm, 0.55±0.2 μm, and 3.5±2.17 μm2, respectively. while those treated with 1 mM BAPTA were 2.91±1.3 μm, 1.43±0.43 μm, and 4.17±2.75 μm2. Then, the average length and width of 1 mM EDTA chromosome was 2.26±0.52 μm and 0.93±0.29 μm. These results showed that Ca2+ plays an important role in the lymphocyte chromosome structure."

"Penelitian jumlah kromosom Asteraceae di lingkungan Kampus Universitas Indonesia (UI) Depok telah dilakukan sebelumnya pada tahun 2013. Dilaporkan bahwa jumlah kromosom 8 dari 21 spesies Asteraceae yang ada di lingkungan tersebut telah berhasil dihitung, dan 5 di antaranya memiliki variasi jumlah kromosom. Penelitian ini dilakukan untuk melengkapi data jumlah kromosom Asteraceae yang ada di lingkungan Kampus UI Depok. Telah dilakukan penghitungan jumlah kromosom ujung akar Porophyllum ruderale, Youngia japonica, Cosmos caudatus, Synedrella nodiflora, Ageratum conyzoides, Cyanthillium cinereum, dan Chromolaena odorata pada bulan April hingga Juni 2015. Jumlah kromosom 5 spesies Asteraceae yang berhasil ditentukan adalah Cosmos caudatus (2n=ca.22, 2n=ca.26, 2n=ca.32, 2n=ca.36, 2n=ca.38, 2n=ca.40, dan 2n=ca.44), Synedrella nodiflora (2n=ca.18, 2n=ca.26, 2n=ca.29, 2n=ca.34, 2n=ca.36, 2n=37, 2n=39, dan 2n=40), Ageratum conyzoides (2n=37 dan 2n=ca.42), Cyanthillium cinereum (2n=9, 2n=16, dan 2n=18), dan Chromolaena odorata (2n=ca.40, 2n=ca.44, 2n=57, dan 2n=60). Cosmos caudatus, Synedrella nodiflora, Cyanthillium cinereum, dan Chromolaena odorata bersifat mixoploid. Mixoploidi tidak dapat ditentukan pada spesies Ageratum conyzoides.

---

Study of chromosome number of Asteraceae at Universitas Indonesia (UI) Campus Depok has been conducted previously in 2013. Result has been reported on chromosome numbers of 8 from 21 Asteraceae species at Universitas Indonesia, and 5 of them have variation in chromosome number. This study was addressed to complete chromosome number data of Asteraceae at Universitas Indonesia Campus Depok. Root tips chromosome counting of Porophyllum ruderale, Youngia japonica, Cosmos caudatus, Synedrella nodiflora, Ageratum conyzoides, Cyanthillium cinereum, dan Chromolaena odorata has been done from April to June 2015. Result shows that 5 species chromosome numbers are Cosmos caudatus (2n=ca.22, 2n=ca.26, 2n=ca.32, 2n=ca.36, 2n=ca.38, 2n=ca.40, and 2n=ca.44), Synedrella nodiflora (2n=ca.18, 2n=ca.26, 2n=ca.29, 2n=ca.34, 2n=ca.36, 2n=37, 2n=39, and 2n=40), Ageratum conyzoides (2n=37 and 2n=ca.42), Cyanthillium cinereum (2n=9, 2n=16, and 2n=18), and Chromolaena odorata (2n=ca.40, 2n=ca.44, 2n=57, and 2n=60). Cosmos caudatus, Synedrella nodiflora, Cyanthillium cinereum, and Chromolaena odorata are mixoploid. Mixoploidy cannot be determined on Ageratum conyzoides."

"Penelitian jumlah kromosom famili Asteraceae di lingkungan kampus Universitas Indonesia Depok telah dilakukan pada 13 dari total 21 spesies pada tahun 2013 dan 2015. Penelitian ini bertujuan untuk melengkapi data jumlah kromosom pada 8 spesies lainnya, namun hanya 4 spesies yang berhasil diperoleh. Metode yang dilakukan adalah modifikasi orcein-squash. Empat spesies Asteraceae yamg diperoleh yaitu Blumea balsamifera (tribe Inuleae). Eclipta prostrata (tribe Heliantheae), Porophyllum ruderale (tribe Tageteae), dan Youngia japonica (tribe Cichorieae). Jumlah kromosom keempat spesies tersebut telah diketahui, yaitu Blumea balsamifera (2n=12, 16, dan 18), Eclipta prostrata (2n=10, ca.11, 12, 14, ca.15, 16, ca.17, 18, 20, dan 22), Porophyllum ruderale (2n=ca.18, 20, ca.22, 24, 26, 28, 0, 32, 34, ca.36, dan 38), dan Youngia japonica (2n= 8, 10, 12, 14, ca.14, 16 ca.16, 18, ca.18, 20, dan 22).

---

Study of chromosome number on Asteraceae family that located in Universitas Indonesia has been conducted previously on 13 spesies from total 21 species in 2013 and 2015. This research was addressed to complete the data of chromosome number on 8 species of Asteraceae that located in Universitas Indonesia, but only 4 species of Asteraceae were successfully found. The study was held using orcein-squash modification method. The species that successfully found are Blumea balsamifera (tribe Inuleae). Eclipta prostrata (tribe Heliantheae), Porophyllum ruderale (tribe Tageteae), and Youngia japonica (tribe Cichorieae). Chromosome numbers of those species were known. They are Blumea balsamifera (2n=12, 16, and 18), Eclipta prostrata (2n=10, ca.11, 12, 14, ca.15, 16, ca.17, 18, 20, and 22), Porophyllum ruderale (2n=ca.18, 20, ca.22, 24, 26, 28, 0, 32, 34, ca.36, and 38), and Youngia japonica (2n= 8, 10, 12, 14, ca.14, 16 ca.16, 18, ca.18, 20, and 22)."