Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

"Demam berdarah dianggap sebagai masalah kesehatan utama bukan hanya di Indonesia, tetapi juga banyak negara lain. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui kinetik Non Structural-1 (NS1) dan persen positif antigen NS1 yang dideteksi dengan menggunakan diagnostik dini Strip Ag Bio-rad NS1 pada hari demam ke 1 sampai 3. Uji diagnostik ini dilakukan di Laboratorium Mikrobiologi Universitas Indonesia melalui pemeriksaan laboratorium pada 102 sampel dari pasien yang diduga demam berdarah. Standar baku untuk uji ini adalah Reverse Transcription - Polymerase Chain Reaction (RT-PCR), isolasi virus di cell line C6/36, serta kenaikan titer antibodi. Program SPSS 17.0 digunakan untuk analisis data. Dari total pasien yang terlibat dalam penelitian ini, 68 (68.3%) pasien terinfeksi demam berdarah. Investigasi lebih lanjut dalam mendeteksi keberadaan antigen NS-1 berdasarkan hari demam dilakukan pada penelitian ini. Berdasarkan hasil yang diperoleh, keberadaan NS-1 pada pasien terinfeksi demam berdarah pada hari demam ke 1, 2 dan 3 adalah 100%, 96,36%, dan 94.55% berturut - turut. Kesimpulan penelitian ini adalah bahwa Strip Ag Bio-Rad NS1 dapat digunakan sebagai deteksi dini demam berdarah di Indonesia.

---

Dengue is considered as a major health problem in not only Indonesia, but many other countries. The aim of this study was to know the kinetic of Non-Structural-1 (NS1) and positive percentage of NS1 detected by a diagnostic kit Bio-Rad NS1 Ag Strip Test during first until third day of fever. This diagnostic test was conducted in Microbiology Laboratorium of Universitas Indonesia by performing laboratory examination to 102 serum samples of dengue suspected patients. Gold standard of this study was Reverse Transcription - Polymerase Chain Reaction (RT-PCR), virus isolation in C6/36 cell line, and increase of antibody titer. SPSS 17.0 program was used to analyze the data. Based on total patients involved, 68 (68.3%) patients were infected with dengue. Further investigation on detecting presence of NS-1 antigen according to days of fever was done in this study. From the result, presence of NS-1in dengue-infected patients during day 1, 2, and 3 of fever were 100%, 96.36%, and 94.55% respectively. Conclusion of this study was that Bio-Rad NS1 Ag Strip can be used as early detection of dengue fever in Indonesia."

"Protein Non Structural 1 NS 1 telah digagaskan untuk menjadi alat diagnostik dini untuk infeksi demam berdarah karena keberadaannya yang cukup tinggi pada saat fase akut dari infeksi ini NS 1 adalah protein yang sangat penting bagi virus dengue untuk melakukan replikasi virus Penelitian ini bertujuan untuk menetapkan kinetik NS 1 pada hari demam ke 4 sampai dengan 6 dengan menggunakan Strip Bio Rad Ag di komunitas di Jakarta Seluruh penelitian ini berjalan selama 36 bulan Maret 2010 ndash Februari 2013 Terdapat 102 pasien diduga terinfeksi demam berdarah yang memenuhi kriteria inklusi Serum darah pasien dites menggunakan RT PCR atau isolasi virus di line sel C6 36 atau kenaikan titer antibodi sebagai standar baku dan sedangksn Strip Bio Rad NS 1 Ag digunakan sebagai metode diagnostik yang digunakan dalam penelitian ini SPSS 17 0 merupakan alat statistik yang digunakan dalam riset ini Dari kesuluruhan 68 68 3 pasien terbukti positive terinfeksi dan 34 31 7 merupakan negatif untuk infeksi dengue Sementara itu hanya 54 52 94 pasien yang terdiagnosis positif infeksi dengue pada hari demam ke 4 6 Kinetik NS 1 selama hari demam ke 4 6 terdeteksi masing masing sebanyak 83 64 69 09 and 47 27 Kinetik NS 1 pada pasien dengue infeksi primer sejak hari demam ke 4 sampai dengen 6 terdeteksi sebanyak 100 83 33 dan 75 Secara kontras kinetik NS 1 di pasien degue infeksi sekunder dari hari demam ke 4 6 adalah 73 33 60 dan 26 67 Terdeteksinya NS 1 akan semakin menurun seiring dengan bertambahnya hari demam Antingen NS 1 pada pasien dengue infeksi primer lebih lama keberadaannya dibandingkan dengen pasien dengue infeksi sekunder.

---

NS 1 has been purposed to be use as an early method to diagnose dengue infection because of its appearance in the acute phase of the infection NS 1 is a protein that essential for dengue virus to do the virus replication This study has aimed to determining the kinetic of NS 1 by using Bio Rad NS 1 Ag Strip for dengue infection during day 4 6th of fever in community in Jakarta The entire study was conducted in 36 months March 2010 ndash February 2013 There were 102 suspected dengue infection patients that fulfill the inclusion criteria tested for the NS 1 antigen in their blood serum using RT PCR or isolation of the viruses in C6 36 cell line or increasing antibody titer as the gold standard Meanwhile Bio Rad NS 1 Ag Strip was used as the diagnostic method use in this study Data were analyzed using SPSS 17 0 Overall 68 68 3 patients were considered positive and 34 31 7 patients were negative for dengue infection Meanwhile only 54 52 94 patients were positive at the day 4 6th of fever The kinetic of NS 1 during day 4 6th day of fever were 83 64 69 09 and 47 27 respectively The kinetic of NS 1 in primary patients from day 4 to day 6 were 100 83 33 and 75 respectively In contrast the kinetic of NS 1 in secondary patients from day 4 to day 6 respectively were 73 33 60 and 26 67 The presences of NS 1 antigen were decreasing as the day of fever keeps progressing The availability of NS 1 antigen in primary dengue infected patients was longer than the secondary dengue infected patients."

"Demam Berdarah Dengue (DBD adalah salah satu masalah kesehatan di dunia. Penggunaan Non Structural-1 (NS-1) antigen dari virus dengue untuk deteksi awal telah terbukti sebagai salah satu solusi dari penentu infeksi dengue. Salah satu alat diagnosik yang tersedia di Indonesia adalah Bio-Rad NS1 Ag strip. Penelitian ini berjalan selama18 bulan di mulai dari tanggal November 2010 sampai dengan Mei 2012. Seratus dua pasien dengan demam kurang dari 2 hari terlibat dalam studi ini. Peneliti menggunakan Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction (RT-PCR), Virus isolation di sel C6/36, atau IgG and IgM titer ELISA sebagai standard emas dalam mendeteksi infeksi dengue. Dalam riset ini, kami menggunakan Bio-Rad NS1 antigen untuk mendeteksi keberadaan antigen NS1 dalam serum darah pasien yang terduga terkena demam berdarah. SPSS 16.0 digunakan untuk menganalisa data. Hasil yang diperoleh adalah dari 102 pasien yang terduga terkena demam berdarah, terdapat 68(68.3%) positf terkena demam berdarah dan 34(31.7%) negatif. Serotype virus juga dipeoleh mellaui RT PCR. Dari 68 pasien yang positif demam berdarah, ada 17 terkena DENV-1, 21 terinfeksi DENV-2, 16 terinfeksiDENV-3, 4 terinfeksi DENV-4, 8 terinfeksi campuran, dan 2 tidak diketahui serotypenya. Nilai sensitivitas dan specifisitas Bio-Rad NS1 Ag Strip dalam mendeteksi infeksi demam berdarah dengan nilai 86.2% dan 96.3%. Dalam mendeteksi infeksi DENV-1, sensitivitas and spesifisitas Bio-Rad NS1 Ag strip adalah 94.12dan 94.44% (95% CI, 80.5% to 97.7%). Sedangkan untuk mendeteksi DENV-3, alat ini mempunyai sensitivitas 75% dan spesifisitas 94.44% (95% CI, 69.3% to 93.5%). Bedasarkan hasil ini, Bio-Rad NS1 Ag Strip dapat dipergunakan sebagai alat untuk menegakan diagnosis dari infeksi demam berdarah DENV-1 dan DENV-3 pada awal demam.

---

Dengue infection has been one of the health issues in worldwide. The utilization of Non Structural-1 (NS1) antigen in order to detect early dengue infection has been proven to be one of the solutions. Diagnostic kit named Bio-Rad NS1Ag Strip is one of the kit that uses antigen which is available in Indonesia. The purpose of this study is to evaluate the sensitivity, specificity, PPV, and NPV value of the kit. This study was held in 18 months duration from November 2010 until Mei 2012. One hundred and two subjects with fever less than 48 hours were included in the study. RT-PCR or virus isolation C6/36 or ELISA antibody titer were used as the gold standard of this research. Bio-Rad NS1 Ag Strip was used to determine the presence of NS1 antigen in the patient. Data analysis and statistics uses SPSS 16.0.In the result, there were 68 (68.3%) positive and 34 (31.7%) negative. RT PCR also determined the virus’s stereotypes. There were 17 of DENV-1, 21 of DENV-2, 16 of DENV-3, 4 of DENV-4, 8 of mixed infection and 2 unknown serotypes. Bio-Rad NS1 Ag has 86.2% of sensitivity and 96.35 of specificity to detect all stereotypes. In for detecting DENV-1, the kit has 94.12% sensitivity and 94.44% (95% CI, 80.5% to 97.7%). Meanwhile, in detecting DENV-3, the kit has 75%sensitivity and 94.44% specificity (95% CI, 69.3% to 93.5%). According to these findings, Bio-Rad NS1 Ag strip is suitable as a diagnostic kit to make early diagnosis of dengue fever DENV-1 and DENV-3."

"Protein Non Struktural-1 (NS-1) dari virus dengue terbukti menjadi penandauntuk diagnosis awal infeksi dengue. Bio-Rad NS1 Ag adalah salah satu alatdiagnostikdi Indonesia yang menggunakan NS1.Tujuan dari penelitian ini adalahuntuk mengukur sensitivitas dan spesifisitas kit pada virus dengue serotype-2(DENV-2), virus dengue serotype-4 (DENV-4) dan infeksi campuran Ujidiagnostik dilakukan selama36 bulan (Maret2010 ?Februari 2013). Sebanyak 102pasien dengan demam kurang dari 48 jam memenuhi kriteria inklusi dalam studiini. Reverse Transcripion-Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) atau isolasivirus di cell line C6/36 atau kenaikan titer antibody dijadikan sebagai standarbaku penentu infeksi dengue. RT-PCR juga digunakan untuk menentukan serotipevirus. Analisis statistik dilakukan dengan menggunakan SPSS versi 17.0. Variabeldata binomial disajikan dalam interval kepercayaan 95%. Sensitivitas danspesifisitas kit diagnostik disajikan dalam tabel 2x2 dan area di bawah kurva(AUC) dari Receiver Operating Characteristics Curve. Dari 102 pasien secaraberurutan didapatkan DENV-1, DENV-2, DENV-3 dan DENV-4, adalah 17(16.7%), 21 (20.5%), 16 (15.7%) dan 4 (3.9%). Pada penelitian ini jugaditemukan infeksi campuran yaitu campuran (i)DENV-1 dan DENV-2, (ii)DENV-1 dan DENV-3, (iii)DENV-1 dan DENV-4, (iv)DENV-1, DENV-3, dan DENV-4,(v)DENV-2 dan DENV-4 dan (vi)serotipe yang tidak diketahui secara berurutanadalah 2 (2.0%), 3 (2.9%), 1 (1.0%), 1 (1.0%), 1 (1.0%), dan 2 (2.0%).Sensitivitas dan spesifisitas masing Bio-Rad NS1 Ag Strip untuk mendeteksiinfeksi DENV-2 adalah 76,2% dan 100% (95% CI, 76.8% to 99.3%). Sementaraitu, sensitivitas dan spesifisitas strip untuk mendeteksi infeksi DENV-4 adalah50% dan 100% (95% CI, 50% to 100%). Sensitivitas dan spesifisitas Bio-RadNS1 Ag Strip pada infeksi campuran adalah 100% (95% CI, 95% to 100%). Bio-Rad NS1 Ag memiliki sensitivitas tinggi dan spesifisitas untuk menentukaninfeksi akut DENV-2 dan infeksi campuran. Namun, Bio-Rad NS1 Ag memilikisensitivitas yang terbatas, namun spesifisitas tinggi untuk diagnosis infeksi akutDENV-4.;Non Structural-1 (NS1) protein of dengue virus is proven to be a marker for earlydiagnosis of dengue infection. Bio-Rad NS1 Ag Strip is one of the availablediagnostic kit in Indonesia that comprised of NS1. The aim of this study was tomeasure the sensitivity and specificity of the kit within DENV-2, DENV-4andmixed dengue virus serotypes. This study was done in 36 months (March 2010-February 2013). There were 102 dengue suspected patients with fever less than 48hours was fulfilling inclusion criteria. Reverse Transcription- Polymerase ChainReaction (RT-PCR) or virus isolation in C6/36 cell line or increase titer antibodyby ELISA was used as gold standard. RT-PCR was also used to determineserotype of the dengue virus. SPSS version 17.0 was the main statistical tool thatwe used. Data binominal variables was presented as incidence rates with 95%confidence intervals. Sensitivity and specificity of diagnostic kit was presented in2x2 tablesand area under the curve (AUC) of the Receiver OperatingCharacteristics Curve. From 102 patients, 68 (68.3%) patients were confirmedpositive dengue infection. Within confirmed dengue infection patients by RT-PCRwe found DENV-1, DENV-2, DENV-3,DENV-4 17 (16.7%), 21 (20.5%), 16(15.7%), 4 (3.9%), respectively. It was also found some mixed infection cases,which were (i)DENV-1 and DENV-2, (ii)DENV-1 and DENV-3, (iii)DENV-1and DENV-4, (iv)DENV-1, DENV-3 and DENV-4, (v)DENV-2 and DENV-4 and(vi)unknown were of 2 (2.0%), 3 (2.9%), 1 (1.0%), 1 (1.0%), 1 (1.0%) and 2(2.0%), respectively. The sensitivity and specificity of Bio-Rad NS1 Ag Strip forDENV-2 sera collected were 76.2% and 100% (95% CI, 76.8% to 99.3%),respectively. The sensitivity and specificity of Bio-Rad NS1 Ag Strip for DENV-4were 50% and 100% (95% CI, 50% to 100%), respectively. The sensitivity andspecificity of Bio-Rad NS1 Ag Strip for mixed infection were both 100% (95%CI, 95% to 100%). Bio-Rad NS1 Ag Strip has high sensitivity and specificity todetermine DENV-2 and mixed infection. On the other hand, Bio-Rad NS1 AgStrip has limited sensitivity, but high specificity for diagnosis of DENV-4 acuteinfection;Non Structural-1 (NS1) protein of dengue virus is proven to be a marker for earlydiagnosis of dengue infection. Bio-Rad NS1 Ag Strip is one of the availablediagnostic kit in Indonesia that comprised of NS1. The aim of this study was tomeasure the sensitivity and specificity of the kit within DENV-2, DENV-4andmixed dengue virus serotypes. This study was done in 36 months (March 2010-February 2013). There were 102 dengue suspected patients with fever less than 48hours was fulfilling inclusion criteria. Reverse Transcription- Polymerase ChainReaction (RT-PCR) or virus isolation in C6/36 cell line or increase titer antibodyby ELISA was used as gold standard. RT-PCR was also used to determineserotype of the dengue virus. SPSS version 17.0 was the main statistical tool thatwe used. Data binominal variables was presented as incidence rates with 95%confidence intervals. Sensitivity and specificity of diagnostic kit was presented in2x2 tablesand area under the curve (AUC) of the Receiver OperatingCharacteristics Curve. From 102 patients, 68 (68.3%) patients were confirmedpositive dengue infection. Within confirmed dengue infection patients by RT-PCRwe found DENV-1, DENV-2, DENV-3,DENV-4 17 (16.7%), 21 (20.5%), 16(15.7%), 4 (3.9%), respectively. It was also found some mixed infection cases,which were (i)DENV-1 and DENV-2, (ii)DENV-1 and DENV-3, (iii)DENV-1and DENV-4, (iv)DENV-1, DENV-3 and DENV-4, (v)DENV-2 and DENV-4 and(vi)unknown were of 2 (2.0%), 3 (2.9%), 1 (1.0%), 1 (1.0%), 1 (1.0%) and 2(2.0%), respectively. The sensitivity and specificity of Bio-Rad NS1 Ag Strip forDENV-2 sera collected were 76.2% and 100% (95% CI, 76.8% to 99.3%),respectively. The sensitivity and specificity of Bio-Rad NS1 Ag Strip for DENV-4were 50% and 100% (95% CI, 50% to 100%), respectively. The sensitivity andspecificity of Bio-Rad NS1 Ag Strip for mixed infection were both 100% (95%CI, 95% to 100%). Bio-Rad NS1 Ag Strip has high sensitivity and specificity todetermine DENV-2 and mixed infection. On the other hand, Bio-Rad NS1 AgStrip has limited sensitivity, but high specificity for diagnosis of DENV-4 acuteinfection"

"[Infeksi dengue masih merupakan masalah kesehatan di dunia termasuk Indonesia.Deteksi dini berperan penting sebagai dasar penatalaksanaan awal infeksi dengue.Antigen NS1 pada virus dengue telah terbukti sebagai marka untuk diagnosis dini.Penelitian ini menganalisis lebih lanjut mengenai sensitivitas dan spesifisitas kitSD Bioline Dengue Duo terhadap keberadaan protein Non- Structural (NS1) padapasien yang terinfeksi virus dengue serotipe 2 (DENV-2). Kinetik NS1 dankeberadaan imunoglobulin M (IgM) pada serum pasien pun dievaluasi dari haripertama demam sampai hari ketujuh. Penelitian ini merupakan penelitian berbasiskomunitas di Jakarta yang dimulai sejak Januari 2010 sampai Mei 2013. Kamimenggunakan sampel serum dari pasien dengan gejala klinis infeksi dengue.Reverse Transcription – Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) dan/atau isolasivirus dan/atau kenaikan titer imunoglobulin G (IgG) antidengue digunakansebagai baku emas. Sensitivitas, spesifisitas, nilai prediksi negatif dan positifditampilkan dalam tabel 2x2 dan area dibawah kurva dari Receiver OperatingCurve. Dari 105 pasien, 23 diantaranya positif terinfeksi DENV-2, sementara 34orang teruji negatif infeksi virus dengue (DENV). Sensitivitas dan spesifisitas SDBioline Dengue Duo terhadap DENV-2 bernilai 78.3% dan 100% (CI 95%, 73.5%sampai 94.2%). Hasil kinetik NS1 menunjukkan pola penurunan, yang dimulaipada hari kelima. Namun, keberadaan IgM mengalami pola kenaikan secarabertahap Dapat disimpulkan bahwa kit ini memiliki sensitivitas dan spesifisitastinggi terhadap DENV-2 sehingg, Dengue infection is still become the major health problem in the world, includingIndonesia. Early detection plays important role in developing early basicmanagement. NS1 antigen in dengue virus is proven to be an early marker forearly diagnosis and this research to analyzed the sensitivity and specificity of SDBioline Dengue Duo based on the presence of Non-Structural protein 1 (NS1) ondengue serotype-2 virus (DENV-2) infected patients. Kinetics of NS1 and thepresence of immunoglobulin M (IgM) antibody were also evaluated from the 1stday to 7th day. This research was a community-based study in Jakarta started fromJanuary 2010 until May 2013. We used serum samples from patients with clinicalmanifestation of dengue infection. Furthermore, Reverse Transcription –Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) and/or virus isolation and/or augmentationof immunoglobulin G (IgG) antidengue titer were used as a gold standard.Sensitivity, specificity, negative and positive predictive value of diagnostic kitwill be presented in 2x2 tables and area under the curve of the Receiver OperatingCurve. From the total of 105 patients, 23 patients were confirmed positive forDENV-2 infection, while 34 patients were confirmed negative DENV infection.Sensitivity and specificity of SD Bioline Dengue Duo towards DENV-2accounted for 78.3% and 100% (CI 95%, 73.5% to 94.2%), respectively. Kineticof NS1 depicted downward trend starting on the 5th day. Nevertheless, IgMpresence showed gradual increase trend. This indicates that this kit has highsensitivity and specificity for DENV-2, therefore it can be used as a diagnostic kitfor dengue infection in Jakarta, Indonesia.]"

"Infeksi dengue telah menjadi salah satu masalah kesehatan yang serius di Indonesia. Non Struktural-1 (NS-1) antigen dikenal sebagai indikator diagnostik awal infeksi dengue. Tujuan dari penelitian ini adalah mengetahui sensitivitas dan spesifisitas Biorad NS-1 Ag Strip sebagai pendeteksi infeksi dengue, baik primer maupun sekunder. Penelitian ini menggunakan desain penelitian kohort dengan konsekutif sampling. Dalam penelitian ini, kami menggunakan Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction (RT-PCR), atau isolasi virus dalam C6/36 cell line atau peningkatan titer antibodi sebagai standar baku emas. Kami juga menggunakan SPSS 17.0 dengan 2x2 table dan area under the curve (AUC) of the Receiver Operating Curve untuk menganalisis data. Populasi data dalam penelitian ini adalah 102 pasien dan 68,3% dari mereka dikonfirmasi sebagai pasien infeksi dengue. Hasil positif ini diklasifikasikan kembali menjadi infeksi primer dan sekunder, yaitu 27 (39,7%) dan 35 (51,5%) orang berturut-turut. Sensitivitas dan spesifisitas Bio-Rad NS1 Ag Strip infeksi dengue primer adalah 96.30% dan 100%. Namun, sensitivitas dan spesifisitas Bio-Rad NS1 Ag Strip untuk infeksi dengue sekunder adalah 85.71% dan 100 %. Bio-Rad NS1 Ag Strip memiliki sensitivitas dan spesifisitas yang tinggi untuk menentukan infeksi primer dan sekunder. Bio-Rad NS1 Ag Strip dianjurkan untuk digunakan sebagai deteksi dini infeksi dengue, baik primer maupun sekunder.

---

Dengue Infection has been one of the serious health problems in Indonesia. Non Structural-1 (NS-1) antigen was known to be the early diagnostic indicator of dengue infection. The purpose of this research is identifying the sensitivity and specificity of a diagnostic kit, called Biorad NS-1 Ag Rapid Test, which use NS-1 Antigen as the marker to detect primary and secondary dengue infection. Cohort with consecutive sampling was the most suitable research design to be applied in this study. We used Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction (RT-PCR), or virus isolation in C6/36 cell line or the increment of antibody titer as the gold standard in this study. We also used SPSS 17.0 with tables 2x2 and area under the curve (AUC) of the Receiver Operating Curve to analyze the data. Population data in this research were 102 patients and 68.3% of them confirmed as dengue infection patient. Furthermore, the positive results are classified into primary and secondary infection, which are 27 (39.7%) and 35 (51.5%) people, respectively. The sensitivity and specificity of Bio-Rad NS1 Ag Strip in primary dengue infection were 96.30% and 100%, respectively. However, the sensitivity and specificity of Bio-Rad NS1 Ag Strip for secondary dengue infection were 85.71% and 100 %, respectively. Bio-Rad NS1 Ag Strip has high sensitivity and specificity to determine both primary and secondary infection. As the result, Bio-Rad NS1 Ag Strip is recommended to be used for early detection of primary and secondary dengue infection."

"Demam berdarah dengue (DBD) adalah penyakit yang disebabkan oleh virus dengue, bersifat endemik di daerah tropis dan sub tropis, terutama di daerah perkotaan. Virus dengue yang ditransmisikan terutama oleh nyamuk Aedes aegypti juga merupakan penyakit arbovirus yang penting dalam ha[ morbiditas dan mortalitas. Di Indonesia, DBD pertama kali dilaporkan di Jakarta dan Surabaya pada tahun 1968. Tahun-tahun selanjutnya kasus DBD berfluktuasi jumlahnya setiap tahun dan cendenung meningkat. Faktor virus seperti variasi stereotipe dan genotipe virus dengue diyakini berperan menentukan derajat keparahan penyakit. Pada penelitian ini dilakukan analisis variasi genetik gen E dan NS I virus DEN-3 yang diisolasi dari pasien dengan manifestasi klinis yang berbeda, yaitu mulai clan yang ringan (DD) sampai yang terberat yaitu DBD dan DSS. Strain DS 002/06 (DD), DS 029/06 (DBD), DSA 02/06 (DSS) dan 17104 (DBD) diisolasi dan kasus dengue di Jakarta tahun 2004 dan 2006. Keempat strain tersebut kemudian dibandingkan dengan 11 strain DEN-3 yang berasal dan Indonesia dan Thailand. Homologi nukleotida gen E ditemukan berkisar antara 92,4 - 99.9%, sedangkan untuk asam amino E antara 96,5-100%. Sementara itu homologi gen NSI berkisar antara 92,1- 99,9% untuk nukleotida dan 97,1-100% untuk asam aminonya. Dijumpai berbagai variasi di sepanjang kedua gen tersebut, tetapi tidak ditemukan perbedaan yang spesifik yang bisa membedakan antara strain penyebab DD, DBD dan DSS. Analisis filogenetik menunjukkan bahwa semua strain strain DEN-3 Indonesia yang disolasi pada tahun 2004 dan 2006 konsisten berada di subtype I."

"Infeksi dengue yang ditularkan melalui gigitan nyamuk Aedes aegypti kepada manusia kerap terjadi di area tropis dan subtropis. Oleh karena manifestasi klinis yang tidak spesifik, berbagai Rapid Diagnostic Tests (RDTs) termasuk SD Bioline Dengue Duo Antigen NS1 dan Antibodi IgM/IgG dibuat untuk memberikan diagnosis dini infeksi dengue yang lebih akurat. Meskipun beberapa studi telah dilakukan untuk menguji sensitifitas dan spesifitas kit tersebut di berbagai negara tetapi informasi mengenai validitasnya dalam mendeteksi keberadaan protein NS1 dari DENV-3 belum dilaksanakan di Indonesia. Pada penelitian ini 105 serum dari pasien yang diduga menderita infeksi dengue diambil dan diuji menggunakan SD Bioline Dengue Duo. Standar baku emas yang digunakan pada penelitian ini adalah RT-PCR dan/atau isolasi virus di sel C6/36 dan atau kenaikan titer antibodi.Hasil penelitian ini menunjukkan rasio deteksi NS1 berbanding terbalik dengan keberadaan antibodi IgM. Sensitivitas, spesifisitas, PPV, dan NPV menunjukkan 81.25%, 100%, 100%, dan 91.89% pada masing-masingnya di awal demam pasien yang terinfeksi DENV-3. Oleh karena itu, SD Bioline Dengue Duo sangat direkomendasikan untuk diagnosis infeksi DENV-3 karena cepat, mudah digunakan, sangat sensitive, spesifik, dan memiliki PPV dan NPV yang tinggi.

---

Dengue infection is transmitted through the bite of Aedes aegypti mosquitoes to human particularly occurs in tropic and subtropic area. Having unspecific spectrum of clinical manifestations, various rapid diagnostic tests (RDTs) including SD Bioline Dengue Duo NS1 antigen and IgM/IgG antibody were made to give early diagnosis of acute dengue infection.

Although several studies have been conducted to examine the sensitivity and spesificity of the kits in various countries, its validity to detect the presence of DENV-3 NS1 antigen has not been held in Indonesia. In total, 105 sera from patients suspected of suffering dengue infection were collected and subjected to SD Bioline Dengue Duo and RT-PCR test as the gold standard.

The result of this study showed NS1 detection rate was inversely proportional to the presence of IgM antibodies. The sensitivity, specificity, PPV, and NPV showed 81.25%, 100%, 100%, and 91.89% respectively at the beginning of fever in DENV-3 infected patients. Thus SD Bioline Dengue Duo is highly recommended for diagnosis of DENV-3 infction as it is rapid, easily applicable, sensitive, highly specific and has great PPV and NPV."

"ABSTRAKInfeksi dengue merupakan salah satu masalah kesehatan utama di Indonesia.Perubahan manifestasi klinis yang cepat dari ringan hingga berat bahkan kematianmenyebabkan perlunya pendeteksian dini infeksi dengue. Salah satu metodedeteksi yang potensial untuk diterapkan sebagai pendeteksian dini adalahpendeteksian antigen NS1 dengue. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkanprotein rekombinan NS1 dengue serotipe 4 strain Indonesia dengan menggunakansistem Pichia pastoris yang dapat digunakan untuk pembuatan antibodi anti-NS1.Sampel yang digunakan adalah RNA virus dengue serotipe 4 strain Indonesia IDS96/10. Metode penelitian adalah ekperimental yang meliputi pembuatan cDNA,pengklonaan pada bakteri Escherichia coli, skrining sel transforman, sekuensing,transformasi sel P. pastoris strain X-33, analisa fenotipe, dan ekspresi protein.Diperoleh 6 koloni P. pastoris strain X-33 rekombinan dengan fenotipe Mut+ danterdeteksi protein rekombinan NS1 dengue serotipe 4 dengan ukuran antara 72hingga 95 kDa pada protein standard, diperkirakan berukuran 80 kDa. Hasilanalisa nukleotida dan asam amino menunjukkan tidak terjadi mutasi pada genNS1 dan terletak pada in frame yang sesuai pada vektor pPICZαB. Protein NS1yang diperoleh diharapkan dapat merangsang terbentuknya antibodi anti-NS1yang selanjutnya dapat digunakan untuk mendeteksi antigen NS1 pada serumpasien.

---

ABSTRACTDengue infection is a major health problem in Indonesia. Clinical manifestationrapidly changing from mild to severe even death. Therefore early detectionbecomes very important. One of potential detection methods to be applied as anearly detection is NS1 dengue antigen detection. The aim of this research was toexpress NS1 recombinant protein of dengue virus serotype 4 strain Indonesiausing Pichia pastoris. Dengue virus RNA from infected pasien serum IDS 96/10was used in this research. To get recombinant protein we constructed NS1recombinant plasmid in vector P. pastoris. First, we amplified NS1 gene andcloned it to Escherichia coli. We selected transformant cells and and recombinantplasmid was transfected to yeast by electroporation. We selected yeasttransformants and analized the phenotype. Methanol was used to induceexpression recombinant protein. Protein expression was determined by SDSPAGEand Western Blot. By Western Blot using antibody to dengue viruses, wefound protein recombinant with molecular weight around 72-95 kDa. This sizewas similar with dimer of NS1 size. In the future, this recombinant protein can beused to produce antibody anti-NS1 that able to detect NS1 antigen in patient sera."

"ABSTRAKInfeksi DENV masih menjadi masalah kesehatan masyarakat Indonesia, karena angka kesakitan semakin meningkat, masih menimbulkan kematian dan sering terulangnya kejadian luar biasa (KLB). Salah satu permasalahan terbesar pada manajemen pasien yang terinfeksi adalah untuk memperoleh hasil diagnosis yang cepat dan spesifik dari infeksi DENV pada fase akut. Deteksi NS1 virus dengue merupakan solusi untuk deteksi dini infeksi dengue. Pada penelitian ini dilakukan produksi antibodi anti-NS1 DENV 2 berlabel HRP untuk mendeteksi antigen NS1 DENV. Untuk mendapatkan antibodi anti-NS1 DENV 2, protein NS1 sebanyak 500µg disuntikkan ke kelinci. Booster dilakukan sebanyak tiga kali dengan menyuntikkan NS1 500µg. Antibodi anti-NS1 yang dihasilkan oleh kelinci kemudian dilabel menggunakan horseradish peroxidase (HRP) dan dilakukan optimasi slot blot immunoassay. Setelah antibodi anti-NS1 DENV 2 berlabel HRP dikonfirmasi dengan direct ELISA, dilakukan uji reaksi silang. Pada penelitian ini digunakan 15 plasma pasien positif dengue yang terdiri dari serotipe 1, 2, 3 dan 4, 3 plasma negatif dengue, 1 plasma orang sehat dan 1 kontrol positif yaitu protein NS1 DENV 2. Hasil menunjukkan, antibodi anti-NS1 DENV serotipe 2 dapat mengenali NS1 yang berasal dari serotipe 1,2,3, dan 4. Hal ini disebabkan karena protein NS1 merupakan glikoprotein yang sangat terkonservasi diantara keempat serotipe dengue. Adanya kemiripan epitop NS1 DENV 2 dengan serotipe lainnya membuat antibodi anti-NS1 DENV 2 dapat mengenali protein NS1 dari serotipe dengue yang lain. Sedangkan hasil negatif ditunjukkan pada plasma pasien orang sehat. Untuk sampel 3 plasma negatif dengue, hasil slot blot menunjukkan 2 negatif dan 1 indeterminate. Disimpulkan bahwa antibodi anti-NS1 DENV 2 berlabel HRP dapat digunakan untuk dalam uji slot blot untuk mendeteksi keempat serotipe virus dengue.

---

ABSTRACTDENV infection remains a public health problem in Indonesia, as the number of illnesses is still increasing, causing death and frequent recurrence of outbreaks. One of the biggest problems in managing infected patients is how to get a rapid and specific diagnosis of DENV in the acute phase. Detection of dengue virus is a solution for early detection of dengue infection. In this study, production of labelled anti-NS1 DENV 2 antibody to be used for dengue antigen detection. To get anti-NS1 DENV 2 antibody, protein NS1 500 μg was injected into rabbit. Booster is done three times by injecting NS1 500 μg. Anti-NS1 antibodies produced by rabbits then were labeled by horseradish peroxidase (HRP). After confirmation of labelled anti-NS1 DENV antibody and optimation of in-house slot blot immunoassay, cross reactivity between DENV serotype was performed. In this study, 15 dengue positive patients serotypes 1, 2, 3 and 4, three dengue negative plasma, 1 healthy person plasma and 1 positive control on NS1 DENV 2 were used. The results showed that anti-NS1 DENV serotype 2 antibody could recognize NS1 from serotypes 1,2,3, and 4. This may be because the NS1 protein is a highly conserved glycoprotein among four dengue serotypes. The similarity of NS1 DENV 2 epitopes with other serotypes makes NS1 DENV 2 antibody can recognize NS1 protein from other dengue serotypes. While negative results are shown on the plasma of healthy patients. For a sample of 3 negative plasma dengue, the result of the blot slot showed 2 negatives and 1 indeterminate. An HRP-labelled anti-NS1 DENV 2 antibody could be used in slotblot immunassay to detect NS1 of four serotype of dengue infection."