Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

"Tujuan Untuk mengetahui frekuensi infeksi Cryptosporidium sp pada anak bawah tiga tahun (batita) dengan deteksigen 18S rRNA dari tinja yang sudah dipreservasi lama dan membandingkannya dengan modifi kasi metode tahanasam (MTA) dari tinja hasil konsentrasi.Metode Sejumlah 188 feses anak batita yang telah tersimpan selama 13 bulan di 4oC, dikonsentrasikan dengan teknik air eter,selanjutnya dibuat sediaan, dipulas dengan pewarnaan MTA; sisa konsentrat diekstraksi DNA dengan teknik kejut panas dingindan penambahan proteinase K, lalu dilakukan PCR langsung terhadap gen 18S rRNA.Hasil Proporsi sampel positif Cryptosporidium adalah 34.6% dengan PCR gen 18s rRNA dan 4.8% dengan pulasanMTA dari tinja konsentrasi. Secara statistik perbedaan kedua hasil tersebut bermakna.Kesimpulan Frekuensi infeksi Cryptosporidium sp di batita tinggi sekali dan penyimpanan tinja dalam larutan kaliumdikromat selama 13 bulan, tampaknya tidak mempengaruhi hasil PCR. Tingginya frekuensi infeksi Cryptosporidium dipopulasi itu menunjukkan tingginya transmisi di daerah tersebut sehingga berpotensi menular ke kelompok yang rentanmisalnya imunokompromais.

---

AbstractAim To identify the frequency of Cryptosporidium infection in children below 3 years old by examining concentrated long term preserved stool using PCR detection of 18S rRNA gene and compared with modified (acid fast staining) technique. Methods Hundred eighty eight stools from children ≤ 3 years old, were stored for 13 months in 2.5% K2Cr2O7 solution at 40C. Cryptosporidium oocysts were isolated by water-ether concentration technique. The concentrates were smeared onto object glass and stained with modified acid fast staining, and the rest of the concentrates were DNA extracted by freezing and thawing cycles and proteinase K digestion, then direct PCR was done to detect 18S rRNA gene. Result The proportion of positive stools for Cryptosporidium sp by acid fast staining from concentrated stools and 18S rRNA PCR were 4.8% and 34.6% respectively, which showed statistically significant difference. Conclusion The frequency of Cryptosporidium infection among children ≤ 3 years old was very high and stool storage in K2Cr2O7 for 13 months did not affect the PCR result. High prevalence of Cryptosporidium infection indicated high transmission in that area and the potential to be transmitted to other individuals such as the immunocompromised."

"ABSTRAKKriptosporidiosis adalah penyakit parasitik yang disebabkan olehCryptosporidium sp~ parasit kokstdia intraseluler pada manusia dan hewan danmerupakan agen yang menyebabkan enterokolitis. Cryptasporidium sp. dapatmenyebabkan penyakit gastrointestinal pada manusia, terutama anak-anak danpenderita imunodefisieosi. Angka kejadian infuksi umumnya lebih tinggi padaanak-anak dibandingkan orang dewasa skala klinis kriptosporidiosis sangat luasmulai dari asimtomatik sampai diare persisten. Selain menyebabkan diare, infeksiini juga dapat menyebabkan malnutrisi Selama ini metode pulasan modifikasilaban asarn mcrupeksn nilai baku emas bagi pemeriksaan Cryptosparidium sp.Namun sensitivitas tekrrik ini rendah dan sangat bergantung pada ketrampilanserta pengalaman tenaga mikroskopis dalaM melihat Cryptosparidium sp. Deteksi ookista Cryptosporidlum dengan antibodi monoklonal terhadap dinding ookistaCryptosparidium (CmAbs) merupakan metoda yang sensitif dan spesifik untukmendeteksi ookista dari apusan tinja dibandingkan metode pewarnaankonvensional Penelitian ini, menggunakan teknik imunofluoresen denganan!ibodi monoklonal yang telal1 dilabel oleh FITC untuk deteksi kriptosporidiosispada batita. Hasilnya akan dlbandingkan dengan PCR dalam hal sensitivitas danspesifisitas. Penelitian ini adalah penelitian kualitatif dengan desain crosssectional menggunakan uji diagnostik. Hasil uji skrining dan tingkat agreementdihitung. Dari 239 sampel tinja yang diperiksa, didapatkan freknensikriptosporidiosis pada anak batita sebanyak 24,3%. Kriptosporidiosis umumtetiadi pada populasi anak-anak di bawah tiga tahun. Dibandingkan danganmetode konvensional yaitu pewamaan modifikasi tahan asam dan auramin fenoJ,deteksi kriptosporidiosis dengan pemeriksaan imunofluoresen langsung lebihsensitif dllll lebih spesifik (p=O,OOO). Dibandingkan dengan PCR, pemeriksaanlmunofluoresen langsung memiliki sensitivitas 86,2% dan spesifisitas 98,9%.Sehingga dapat digunakan sebagai altemalif untuk deteksi ooldstaCryptosporidium sp. pada sampel tinja terutama untuk studi epidemiologi atauskrining Penilaian terhadap adanya faktor resiko jenis kelamin, status gizi dandiare teenyata didapatkan hasil tidak bermakna

---

AbstractCryptosporidiosis is a parasitic disease caused by CryptospOridium sp,coccidian parasite intracellular in human and animaL Cryptosporidium sp cancause gastrointestinal diseases in human, particularly in children andimmununodeficiency individuals. Generally. the incidence higher among children!han the adults. The clinical manifestations are wide, ranging from asymptomaticto persistent diarrhea and malnutrition in children. Modified acid fast stainingmethod has been a gold standard to detect Cryptosporidlum sp, however, thistechnique has low sensitivity and depends mulct on the experience and skill of thetechnician. Detection of Cryptosporidium sp oocyst using monoclonal antibodyto Cryptosporldium sp wall (CmAbs) is a more sensitive and specific method todetermine an oocyst from stooL The objective of this study is to determinecryptosporidiosis proportion between toddlers by FITC monoclonal antibodytechnique. The result will be compared to PCR on its sensitivity and specificity tocryptosporidiosis diagnosis. This research is qualitative interpretation with crosssectional design study which using diagnostic test The result of the screening testand lhe levels of agreement were quantified. Of 239 fecal samples examined,there were 24,3% positive oocyst Cryptosporidium sp, Cryptosporidiosis iscommon in children under three years old population. Comparing to conventionalmethods, MTA and Af, cryptosporidiosis detection using directimmunofluorescent test is more sensitive and specific (p=O,OOO), Comparing toPCR technique~ direct immunofluorescent test has sensitivity 86~2% andspecificity 98,9%. Statistically, direct immunofluorescent test can can be used asan alternative method to detect CJYP!osporidium sp. compared to PCR (p--o,06S),in particular for epidemiological study or population screening. Evaluation on riskfactors such as sex. malnutrition and diarrhea symptom appear that there is nosignificant differences."

"Infeksi saluran cerna oleh parasit memiliki angka morbiditas dan mortalitas yang tinggi di seluruh dunia. Angka kejadian infeksi saluran cerna oleh parasit tertinggi didapatkan di negara berkembang dan negara dengan tingkat ekonomi rendah terutama di daerah-daerah tropis. Indonesia sebagai negara tropis dan negara berkembang dengan tingkat ekonomi rendah diperkirakan memiliki prevalensi infeksi saluran cerna oleh parasit yang cukup tinggi. Parasit penyebab infeksi saluran cerna sangat beragam dan penelitian mengenai parasit penyebab infeksi saluran cerna di Indonesia masih sedikit tetapi penelitian yang dilakukan oleh Kang dan kawan-kawan di India mendapatkan infeksi saluran cerna oleh parasit terbanyak disebabkan oleh Giardia (53,8%) dan Cryptosporidium (39,7%).Cryptosporidium pertama kali ditemukan pada anak imunokompeten berusia 3 tahun pada tahun 1976. Setelah itu Cryptosporidium dilaporkan menimbulkan endemik di daerah Milwaukee pada tahun 1993 yang menginfeksi 400.000 orang. Meskipun telah dilakukan berbagai pencegahan dan kesadaran masyarakat mengenai kebersihan makin tinggi, ternyata angka kejadian cryptosporidiosis yang tercatat di Amerika Serikat tetap tinggi yaitu pada tahun 1999 dilaporkan terdapat 2.769 kasus, tahun 2001 terdapat 3.787 kasus dan pada tahun 2002 terdapat 3.016 kasus.Beberapa peneliti telah melaporkan kejadian cryptosporidiosis pada penderita acquired immunodeficiency syndrome (AIDS) dan pengidap human immunodeficiency virus (HIV). Seiring dengan meningkatnya angka kejadian AIDS dan pengidap H1V di dunia maka diperkirakan angka kejadian cryptosporidiosis turut meningkat. Di Indonesia sendiri telah dilaporkan peningkatan kasus AIDS mencapai 5823 kasus dan 4333 kasus HIV sehingga diperkirakan angka kejadian cryptosporidiosis juga turut meningkat.Prevalensi cryptosporidiosis di negara berkembang diperkirakan berkisar 5-20% dan di negara miskin mencapai lebih dari 30%. Cryptosporidium lebih sering menginfeksi anak-anak. Prevalensi tertinggi terjadi pada anak usia di bawah 5 tahun. Perch dkk dalam penelitiannya mendapatkan prevalensi terbanyak pada usia di bawah 3 tahun. Diperkirakan hal ini erat hubungannya dengan status imun anak. Berbagai hal dapat mempengaruhi terjadinya cryptosporidiosis seperti kekurangan air bersih, sanitasi buruk, kepadatan rumah tinggal, banyak hewan di lingkungan perumahan, letak rumah dekat dengan sungai atau peternakan, rumah tinggal yang terkena banjir, musim, serta faktor risiko individu seperti status gizi. Katsumata dan kawan-kawan dalam penelitian yang dilakukan di Surabaya mendapatkan faktor risiko infeksi Cryptosporidium berupa kepadatan rumah tinggal, musim hujan dan rumah tinggal yang terlanda banjir. Saat ini belum terdapat data prevalensi infeksi Cryptosporidium pada anak balita maupun faktor risiko penyakit ini di Jakarta."

"Cryptosporidiurn sp. adalah parasit protozoa usus intraseluler yang rnenginfeksi berbagai hewan verteblata termasuk manusia dan menyehabkan penyakit kriptosporidiosis, juga merupakan agen penycbab diare yang bersifat oportunistik. Gejaia yang berulang dan angka penularan yang tinggi akan menurunkan kualitas hidup penderita sehingga diperlukan diagnosis kriptosporidiosis yang cepat secara mikroskopis pada sediaan tinja yang diwarnai.Tesis ini bcrtujuan membandingkan metode pewamaan modiiikasi tahan asam (MTA) dan auramin fenol (AF) untuk dcteksi ookista Cryploaporidiwn sp. dari sampel tirja dengan dan tanpa konsentrasi. Sensitivitas dan spesifisitas setiap metode dari tinja yang dikonsentrasi, ditentukan dengan PCR* sebagai baku emaa Penelitian ini adalah penelitian kualitatif dengan desain cross sectional menggunakan uji diagnostik. Hasil uji skrining dan tingkat agreement dihitung Dari 130 sampel tirqa yang diperiksa, 5,4%, 10%, 10%, l9,2% dan 32,3% positif Cryprosporidium sp. dengan metode MTA tanpa konsentrasi, MTA dikonsentrasi, AF tanpa konsenuasi, AF dikonsemrasi dan PCR*. I-Iasil positif ookista Cfgptosporidium sp. lebih banyak ditemukan pada sediazm tinja yang dikonsentrasi. Hasil tidak berbeda bermakna pada perbandingan basil MTA dengan dan tanpa konsentrasi(p=0,07), sedangkan hasil berbeda bcrmakna pada AF (p=0,00). Sensitivitas MTA dan AF tinja konsentrasi adalah 30,9% dan 54,8%; spesifisitas 100% dan 97,7% dibandingkan dengan PCR*. Metode pewarnaan AF memiliki nilai sensitivitas lebih tinggi, tetapi spesifisitasnya sama dengan MTA. Metode pewamaan AF dapat digunakan scbagai altematif dari pewamaan MTA untuk deteksi ookista Cfyptosporidium sp. pada sampel tinja.

---

Cryptosporzdnm sp. is intestinal protozoa parasite intracellular which infect widely vertebrata include human and cause cryptosporidiosis disease, also opportunistic agent for diarrhea. Reinfection and high transmission can decrease quality of life patient, so it needs a quick diagnostic with microscopy analysis to stain fecal smears. The objective of this study is to investigate the comparison of the modified acid fast (MAF) and auramine phenol (APh) staining method in order to detecting Cryptosporidium sp. oocysts 'nom unconcentrated and concentrated fecal sample. The sensitivity and specificity of each method from concentrated fecal sample was determined with PCR* as the gold standard.

The result of the screening test and the levels of agreement were quantified This research is qualitative interpretation with cross sectional design study which using diagnostic test. Of the |30 fecal samples that has examined, 5,4%, 10%, 10%, 19,2% and 32,3% were positive Cryptosporidium sp. by the MAF unconcentrated, MAF concentrated, APh unconoentrated, APh concentrated and PCR* method respectively. The majority of positive Cryptosporidium sp. samples were found in concentrated samples.

The results have no significant differences between MAF staining with unconcentrated and concentrated fecal sample (p=0,07), but there is a significant difference for APh staining (p=0,00). In comparison with PCR* results, the sensitivities of MAF and APh concentrated methods were 30,9% and 54,8%; the specificities were l00% and 97,7% respectively. The APh staining method apparently has more sensitivity than MAF staining method, but has the same speciticity. The APh staining method proved to be a valuable altemative to MAF staining for detection of' Cryptosporidium sp. oocysts in fecal sample."

"Helicobacter pylori has been known as a cause of chronic gastritis, a predisposition to gastric and duocenal ulcers, and a class I gastric carcinogen. Throughout the world, H. pylori infection is very common, reaching 40% -50% of the population in developed nations and 80% - 90% of the population in developing nations.Several techniques have been used to detect H. pylori infection, such as the urea breath test, rapid urease test, serological test, as well as biopsies of gastric or duodenal tissues for culture and histopathology. In this review article, we will discuss a relatively new method to detect H. pylori antigen in stools with enzyme immunoassay, and comparisons with other standard techniques. However, the H. pylori stool antigen test is not yet commercially available in Indonesia."

"Cryprosporidium sp adalah parasit yang merupakan protozoa penyebab diare pada individu lmunodefisiensi seperti penderita HlV/AIDS, Diagnosis criptosporidiosis dengan menemukan ookista pada tinja menggunakan metode pulasan tahan asam dinilai kurang sensitif. Deteksi koproantigen Crypto:,poridium sp menggunakan ELISA diketahui lebih sensitif dan spesifik. Penelitian ini bertujuan untuk deteksi koproantigen Cryptosporidlum sp pada pasien HIV/AJDS dengan diare kronik menggunakan ELISA dan MTA serta melihat korelasi antara nilai absorbansi dengan hitung ookista. Sebanyak 95 sampel tinja dari pasien HIV/AIDS dengan diare kronik diperiksa menggunakan pulasan tahan asam yang merupakan gold standort dan deteksi koproantigen. Frekuensi kriptosporidiosis menggunakan deteksi koproantigen sebesar 36,8% dan dengan metode MTA 11,6%. Nilai sensitivitas dan spesifisitas koproantigen dibandingkan dengan pulasan tahan asam sebesar 100% dan 71A%. Tidak terdapat korelasi antara nilai absorbansi dengan hitung ookista.

---

Cryptosporidium sp is a protozoan parasite, causes severe diarrhea in immunodeficient hosts like the HIV/AIDS patients. Diagnosis of cryptosporidiosis by finding the oocyst from stool by modified acid fast staining, is insensitive. Coproantigen detection offers more sensitive and specific technique to detect Cryptosporidium infection. The objective of this study is to determine cryptosporidiosis proportion among HIVIAIDS patients by Cryptosporidial antigen detection in stool compare it to modified acid fast staining and determine its correlation with oocyts count. A number of 95 stool specimens from the HIV/AIDS patients with chronic diarrhea were subjected to coproantigen ELISA test and modified acid-fast staining (gold standard). The frequency of Criptosporidial infection was 36,8% and 11,6% respectively by coproantigen detection and AF staining with 100% sensitivity and 71.4% specificity. There is no correlation between optical density and oocyst count."

"Cryptosporidium sp adalah parasit yang merupakan protozoa penyebab diare pada individu imunodefisiensi seperti penderita HIV/AIDS. Diagnosis criptosporidiosis dengan menemukan ookista pada tinja menggunakan metode pulasan tahan asam dinilai kurang sensitif. Deteksi koproantigen Cryprosporidfum sp mengunakan ELISA diketahui lebih sensitif dan spesifik. Penelitian ini bertujuan untuk deteksi koproantigen Cryptosporidium sp pada pasien HIV/AIDS dengan diare kronik menggunakan ELISA dan MTA serta melihat korelasi antara nilai absorbansi dengan hitung ookista. Sebanyak 95 sampel tinja dari pasien HIV/AIDS dengan diare kronik diperiksa rnenggunakan pulasan tahan asam yang merupakan gold standorr dan deteksi koproantigen. Frekuensi kriptosporidiosis menggunakan deteksi koproantigen sebesar 36,8% dan dengan metode MTA lI,6%. Nilai sensitivitas dan spesifisitas koproantigen dibandingkan dengan pulasan tahan asam sebesar 100% dan '71,4%. Tidak terdapat korlasi antara nilai absorbansi dengan hitung ookista.

---

Cryptosporidium sp is a protozoan parasite, causes severe diarrhea in imrnunodeticient hosts like the HIV/AIDS patients. Diagnosis of cryptosporidiosis by finding the oocyst from stool by modified acid fast staining, is insensitive. Coproantigen detection offers more sensitive and specific technique to detect Cqptosporidium infection. The objective of this study is to determine eryptosporidiosis proportion among HTV/AIDS patients by Cryptosporidial antigen detection in stool compare it to modified acid fast staining and determine its correlation with ooeyts count. A number of 95 stool specimens from the HIV/AIDS patients with chronic diarrhea were subjected to coproantigen ELISA test and modified acid-fast staining (gold standard). The frequency of Criptosporidial infection was 36,8% and 11,6% respectively by coproantigen detection and AF staining with 100% sensitivity and 71,4% specificity. There is no correlation between optical density and oocyst count."

"Latar Belakang: Metode PCR dapat digunakan untuk mengidentifikasi DNA suatu organisme. ldentifikasi gen 18S rRNA sudah hanyak dipakai untuk mempelajari sejumlah organisms eukariot seperti tanaman, hewan dan protozoa termasuk Cryptosporidium sp. Penelitian terdahulu pada anak batita di daerah kumuh dan rawan banjir di Jakarta yang dideteksi secara mikroskopis dengan pcwarnaan modifikasi tahan 838111 (MTA), didapatkan prevalensi 2,l% yang rendah dibandingkan negara berkembang lain yang keadaan lingkungan dan populasinya mirip Indonesia. Deteksi Cryptosporidium sp. secara molekular di feses dengan PCR memungkinkan diagnosis lebih akurat dan cepat. Tujuan: mengembangkan metode PCR :mink deteksi gen ISS rRNA Cryptosporidium sp. pada feses yang disimpan dalam larutan kalium bikromat 2,5% selama 1 bulan. Metode: sejumlah 188 sampel feses yang disimpan dalam larutan kalium bikromat dikonsentrasikan dengan teknik air-eter, selanjutnya dilakukan ekstraksi DNA terhadap konsentrat dan sebagian lagi dipulas dengan MTA. Amplifikasi DNA Cryptosporidium terhadap gen 18S rRNA dilakukan dengan program PCR iangsung, siklus 39 kali. Hasil: pemeriksaan dengan metode MTA konsentrasi didapatkan sembilan sampel positif (4,8%) sedangkan dengan PCR didapatkan 65 sampel positif (34,6%). Kesimpulan: Larutan kalium bikromat dapat dipakai untuk penyimpanan ookista Cryptosporidfwn sp. tanpa mempengaruhi hasil PCR maupun mikroskopis.

---

Background: PCR method can be used to characterize an organism DNA. Identification of 18S rRNA gene has been widely used to study eukaryotes like plants, animals and protozoa such as Cryptosporidium sp. Previous study on Cryptosporidium sp. in children under tluee years old in a slum area in Jakarta, detected by direct modiiied acid fast (MAF) showed 2.1% prevalence, which was unexpectedly much lower than other developing country with similar enviromnent and study population. Detection of Cryptosporidium sp. by molecular technique, PCR will offer more accurate and efficient diagnosis.

Objective: develop PCR method to detect Cryptosporidium sp. 18S rRNA gene of stool from stools preserved in potassium dichromate solution for 13 months.

Methods: There were l88 stool samples which have been kept in 2.5% potassium dichromate for 13 months. These samples were concentrated by water-ether technique, extracted the DNA and stained by MAF. Amplihcation of Cnprosporidium sp. ISS rRNA gene was using direct PCR for 39 cycles.

Result: of samples with MAF has found 9 positive (4,8%) and samples with PCR has presented 65 positive (34,6%).

Conclusion: Potassium dichromate solution can be used to preserve oocysts of Cryptosporidium sp since it does not interfere the PCR and microscopic examination result."

"ABSTRAKToksoplasmosis merupakan penyakit yang disebabkan oleh Toxoplasma gondii. Penyakit infeksi ini dapat menyebabkan kondisi fatal bila terjadi pada pasien imunokompromis, misalnya adalah toksoplasma ensefalitis (TE) yang menyerang sistem saraf pusat. Untuk menegakkan diagnosis Toxoplasma sebagai penyebab kelainan SSP (sistem saraf pusat) pada pasien HIV sangat sulit, sehingga diperlukan metode pemeriksaan lain sebagai alternatif, salah satunya adalah pemeriksaan PCR mendeteksi gen B1 dari Toxoplasma gondii. Penelitian ini bertujuan untuk mengembangkan metode PCR pada sampel CSS (cairan serebrospinal) yang sesuai untuk menegakkan diagnosis TE dan mengetahui keunggulan dan kelemahan pemeriksaan PCR dibandingkan pemeriksaan IgG anti-Toxoplasma pada cairan serebrospinal. Penelitian dilakukan pada cairan serebrospinal pasien HIV/AIDS dengan gangguan serebral. Hasil pemeriksaan PCR dari 88 sampel CSS pasien HIV yang datang ke Laboratorium Parasitologi FK UI, adalah 23 (26,1%) positif dan 65 (73,9%) negative T. gondii. Ada hubungan postif bermakna antara pemeriksaan PCR dengan pemeriksaan IgG anti-Toxoplasma dari CSS.

---

ABSTRACT

Toksoplasmosis is a disease caused by infection of Toxoplasma gondii. This infection can caused a life threatening condition in immunocompromised patients, for example toxoplasma ensefalitis (TE) which attack central nervous system. It is very difficult to diagnose Toxoplasma as a cause of CNS infection in HIV patient, so we need another methods as alternative, one of which is one of which is a PCR detection of Toxoplasma gondii B1 gene. This research aims to develop a PCR method on samples Cerebrospinal Fluid (CSF) that suitable for TE diagnosis and determine the advantages and disadvantages PCR methods compared to detection of anti-Toxoplasma IgG from CSF. The study was conducted in the cerebrospinal fluid of patients with HIV / AIDS with cerebral disorders. PCR examination results of 88 samples CSS HIV patients who came to the Laboratory of Parasitology FK UI, was 23 (26.1%) positive and 65 (73.9%) negative T. gondii. There is a significant positive relationship between PCR and detection anti-Toxoplasma IgG from CSF."