Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

"Didalam skripsi ini dibahas sebuah simulasi penyandian siklis dengan menggabungkan teknik BCH (Bose Chaudhuri Hocquenghem) dan teknik RS (Reed-Solomon). Panjang kata sandi yang dipergunakan untuk masing-masing teknik adalah 7 bit dan panjang informasi yang dipergunakan adalah 3 bit.Penggabungan ini didasarkan pada kemampuan masing-masing teknik dalam mengkoreksi kesalahan dimana teknik BCH dapat mengkoreksi kesalahan sebanyak 1 bit secara acak (random) sedangkan teknik RS dapat mengkoreksi kesalahan sebanyak 2 bit simbol secara acak. Penggabungan ini dilakukan secara serial (concatenated) dan diharapkan dapat meningkatkan kemampuannya dalam mengkoreksi kesalahan pada informasi yang diterima.Simulasi penyandian siklis ini diaplikasikan dengan menggunakan sistem komunikasi antar komputer melalui kabel xtalk RS232. Dan dalam perancangan perangkat lunaknya menggunakan bahasa pemograman MATLAB versi 7.0.1 (R14). Setelah diujicoba software ini maka penggabungan kedua teknik RS (7, 3) dan teknik BCH (7, 3) maka akan dihasilkan panjang kata sandi 49 bit yang dibagi kedalam 7 byte simbol dengan masing-masing simbol terdiri dari 7 bit dan panjang informasi 9 bit. Sedangkan untuk kemampuan dalam mengkoreksi kesalahan adalah 14 bit kesalahan berurutan (2 byte simbol) ditambah dengan 1 bit kesalahan acak pada 5 byte simbol lainnya.

---

This final project developed error correcting simulation generated by combination of RS (Reed Solomon) method and BCH (Bose Chaudhuri Hocquenghem) method. 7 bit Code length used for each method and 3 bit information length for each method. The combination was done based on the different capability of each method to perform the error correction. The BCH method able to corrects 1 bit errors in random distribution while RS method able to corrects 2 bit error in symbol randomly. This combination constructed serially (concatenated) and was expected to improve its capability to correct errors on received information.

This cyclic code simulation was implemented by using the communication system between two computers through xtalk RS232 cable. The software was designed and built using programming language MATLAB ver. 7.0.1 (R14). The software tests had been carried out and it turned out that the combination of the two methods, RS (7, 3) and BCH (7, 3), the resulted in 49 bit code length consists of 7 byte symbols where every symbol consists of 7 bit and the length of 9 bit information. Error correction capability of the software is 14 bit burst error (2 byte symbol) and 1 bit random error on other 5 byte symbol."

"Skipsi ini membahas sebuah rancangan simulasi rangkaian pengoreksi kesalahan (error correction) dalam sistem komunikasi digital menggunakan program simulasi Simulink. Metode yang digunakan untuk mendeteksi dan mengoreksi kesalahan adalah metode penyandian siklis dengan teknik penyandian BCH (Bose Chaudhury Hocquenhem) CBCH(n,k) dan RS (Reed-Solomon) CRS(n,k). Kedua teknik tersebut digabungkan secara serial (concatetaned), dimana panjang kata sandi yang dipergunakan untuk penyandian RS adalah 15 simbol (digit) dan untuk BCH 15 bit. Sedangkan panjang informasinya, 5 simbol untuk penyandian RS dan kelipatan bulat k bit untuk BCH. Teknik RS (15,5) dapat memperbaiki kesalahan sebanyak 5 simbol secara acak, sedangkan teknik BCH (15,5) mampu memperbaiki 3 bit kesalahan secara acak. Dengan penggabungan kedua teknik tersebut dihasilkan rangkaian error correction yang mampu mengoreksi kesalahan acak sekitar 36 bit dan kesalahan mengelompok hingga 116 bit di belakang dan 43 bit di mana saja. Rancangan simulasi penyandian ini kemudian diaplikasikan pada perangkat signal processing DSK6713 dengan cara memasukkan rancangan program simulink ke perangkat DSK tersebut melalui program C6000 Code Composer Studio versi 3.1. Dari hasil pengujian dengan menggunakan fasilitas RTDX didapat bahwa program yang dibuat dengan model simulink dapat berjalan dengan baik pada DSK6713 dan sesuai dengan simulasi pada program simulink.

---

This thesis make a simulation design of an equipment for error correction in digital communication system using simulation program Simulink. The methode used to detect and correct the error is cyclic coding methode with BCH (Bose Chaudhury Hocquenhem) Code CBCH(n,k) and RS (Reed-Solomon) Code CRS(n,k) technique. Both the technique are combined in serial configuration (concatenated). For RS code we use 15 symbols (digits) codeword and 5 symbols information length. Whereas for BCH code we use 15 bits codeword and integer multiple of k bits information length. RS code (15,5) can correct 5 symbols random error and BCH code (15,5) can correct 3 bits random error. By combining the techniques obtained an error correction circuit that can correct up to about 36 bits of random error and up to 116 bits in rear and 43 bits anywhere of burst error. Simulation design of this coding then will be aplicated on signal processing equipment of DSK6713 by injecting the simulation program designed by simulink to the DSK using program C6000 Code Composer Studio version 3.1. From the result of the simulation testing using RTDX obtained that the program designed by simulink can be executed properly on DSK6713 and is suitable with the result of simulation on simulink."

"ABSTRAKPada tugas skripsi ini dibuat simulasi Modern π/4 DQPSK adengan teknikperbaikan kesalahan CRC, Konvolusi, dan Interleaver. Modem dengan tekniktersebut digunakan oleh DAMPS. Simulasi dibuat untuk mengetahui unjuk kerjatransmisi modern. Simulasi dibuat pada komputer pribadi dengan menggunakan bahasa pemrograman Borland C++. Hasil simulasi adalah grafik karateristik BER vsSNR untuk berbagai kombinasi penyandian.

---

"

"Virus influenza A/(H1N1) dapat menyebabkan infeksi akut pada sistem pernapasan manusia. Peran penting neuraminidase dalam replikasi virus dan tingginya conserved pada sisi aktif, membuat neuraminidase menjadi target utama dalam perancangan obat antiviral virus influenza. Namun perkembangan mutasi virus yang sangat cepat menyebabkan beberapa obat antiviral mulai mengalami resistensi terhadap virus tersebut. Pemilihan peptida sebagai kandidat obat karena peptide memiliki aktifitas dan selektifitas yang baik. Pembentukan siklisasi disulfida pada perancangan ligan peptida bertujuan untuk meningkatkan kestabilan dari peptida tersebut. Dari perancangan ligan didapatkan 5096 heksapeptida siklis sebagai kandidat obat. Simulasi molecular docking dilakukan untuk menapis ligan yang memiliki nilai ΔG dan interaksi antara ligan dan enzim dan molecular dynamics dilakukan untuk melihat interaksi intra dan intermolekuler, mencakup perubahan bentuk ikatan antara atom akibat adanya tekukan, uluran atau rotasi. Kedua simulasi dilakukan dengan menggunakan software MOE2008.10. Berdasarkan pada hasil simulasi molecular docking dan drug scan menunjukan terdapat dua ligan yang memiliki interaksi terhadap residu target dan sifat yang baik. Ligan tersebut adalah CRMYPC dan CRNFPC. Kedua ligan ini memiliki nilai ΔGbinding -31,7402 kkal/mol dan -31,0144 kkal/mol. Dan kedua ligan ini tidak bersifat mutagenik dan karsinogenik, dan bioavabilitas oral yang baik. Ligan CRMYPC memiliki interaksi yaitu ikatan hidrogen dengan residu sisi aktif neuraminidase pada simulasi molecular dynamics. Hasil diatas menunjukan bahwa ligan CRMYPC dapat digunakan sebagai kandidat penghambat neuraminidase untuk melawan virus influenza A subtibe H1N1.

---

Influenza A virus/ (H1N1) can cause severe infection in human respiratory system. Neuraminidase has important role in viral replication, which makes neuraminidase be a major target in drug design. However, the influenza A virus is evolving fast, some drug resistance strains are emerging. Thus, it is critical to seek potential alternative treatments. Peptides are preferable for designing inhibitor because of its high activity and specificity.

Cyclization of peptide ligands by S-S disulfide bridge in order to increase its stability. We have designed 5096 hexapeptide cyclic as drug candidates. We used MOE 2008.10 software for the molecular docking and dynamics simulation.

Based on the results of molecular docking simulations and drug scan showed there are two ligands that have good residual interaction of the target and properties. They are CRMYPC and CRNFPC, that have ΔGbinding -31,7402 kcal/mol and -31,0144 kcal/mol. Both of these ligands are not mutagenic and carcinogenic, and good oral bioavailability. The molecular dynamics simulation was performed ligand CRMYPC have hydrogen bonding interactions with residues active side of neuraminidase. Based on docking and dynamics simulation result, ligand CRMYPC could be proposed as a potential inhibitor of neuraminidase."

"Pada penelitian terdahulu telah diusulkan dua buah ligan polipeptida siklik disulfida-CDEEC dan CDGSC-sebagai inhibitor potensial untuk enzim RNA-dependent RNA-polymerase virus dengue melalui molecular docking. Simulasi molecular docking dilakukan dengan keadaan tanpa pelarut dimana enzim dibuat rigid dan ligan dibiarkan bebas berotasi untuk mencari konformasi terbaik. Pada kenyataan dalam sistem seluler terdapat pelarut yang membuat enzim memiliki pergerakan dinamis. Oleh karena itu dalam penelitian ini dilakukan simulasi dinamika molekul untuk memperkirakan sistem kompleks enzim-ligan yang lebih nyata. Simulasi dinamika molekul dijalankan pada selama 5ns pada suhu 300 dan 312 K. Pada akhir simulasi 300 K CDEEC membentuk ikatan dengan dua residu penting pada RdRp yaitu Arg-729 dan Arg-737 sedangkan CDGSC tidak berikatan dengan residu penting manapun. CDEEC juga memberikan hasil yang lebih baik dibanding CDGSC pada simulasi 312 K. CDEEC membentuk ikatan dengan dua residu penting yaitu Arg-737 dan Ser-710 sementara CDGSC tidak berikatan dengan satupun residu penting. Berdasarkan hasil tersebut CDEEC merupakan inhibitor yang lebih baik dan layak untuk dikembangkan sebagai obat anti dengue.

---

Previous researches have proposed two ligands of disulfide cyclic polypeptide which are CDEEC and CDGSC as potential inhibitor of RNA-dependent RNA-polymerase dengue virus by molecular docking. Molecular docking simulation is done without a solvent in which enzyme is made rigid and ligand was left free to rotate to find teh best conformation. In fact in a cellular system there is a solvent that makes the enzyme has a dynamic movement. Therefore in this paper molecular dynamics simulation is done to estimate more reliable condition of enzyme-ligand complex. In this work molecular dynamics simulation is done during 5 ns with two different temperature, 300 and 312 K. At the end of MD simulation at 300 K, CDEEC binds to two RdRp important residues, Arg-729 and Arg-737 while CDGSC doesn’t bind to any important residues. Simulation at 312 K also revealed nearly the same result, CDEEC binds to two RdRP important residues, Arg-737 and Ser-710, whereas CDGSC doesn’t bind to any important residues. Based on the result of these two simulation, CDEEC is proposed as a better inhibitor of RdRp dengue virus and feasible to be developed as anti-dengue drug."

"The most important and secret data which processed and saved using computer technology, the more people who do not have accessibility (hackers/crackers) trying to steal the data, so that cause very required once to take care of the data...."

"Resistensi oseltamivir sebagai inhibitor neuraminidase virus influenza A subtype H1N1 telah dilaporkan oleh Cheng, et al pada tahun 2009. Sebagai salah satu upaya mengatasi pemasalahan ini, beberapa penelitian yang menggunakan metode simulasi molecular docking telah dilakukan untuk merancang dan menemukan ligan peptide siklis yang dapat berperan sebagai inhibitor potensial neuraminidase H1N1 sehingga dapat menghambat replikasi virus tersebut.Pada penelitian ini dipelajari dan dievaluasi interaksi ligan terhadap enzim dalam keadaan terhidrasi dengan menggunakan metode simulasi dinamika molekul pada temperatur yang berbeda. Simulasi dilakukan terhadap tiga inhibitor peptida siklis disulfida yaitu DNY, LRL, NNY dan oseltamivir, zanamivir sebagai ligan standar. Hasil penelitian menunjukkan pergerakan dinamis yang dimiliki oleh kelima kompleks enzim-ligan dalam keadaan terhidrasi mempengaruhi interaksi ligan terhadap residu asam amino enzim.Pada akhir simulasi temperatur 300 K, ligan DNY memiliki interaksi dengan sisi katalitik enzim Asp 151, Arg 293, ligan LRL dengan Arg 118, Arg 293, ligan NNY dengan Asp 151, Glu 425 dan Arg 293. Pada temperatur 312 K, ligan DNY tidak memiliki interaksi dengan sisi katalitik enzim. Ligan LRL memiliki interaksi dengan sisi katalitik enzim Asp 151, Glu 425, Tyr 402, ligan NNY dengan Asp 151, Glu 278 dan Arg 293. Konformasi yang terlihat berbeda pada enzim memperlihatkan perilaku dinamis enzim dalam pelarut dan adanya pengaruh kehadiran inhibitor. Konformasi yang berubah akibat perilaku dinamis kompleks enzim-ligan juga dapat terlihat dalam plot kurva RMSD.

---

Resistence of oseltamivir as an inhibitor of neuraminidase influenza A virus subtype H1N1 has been reported by Cheng, et al in 2009. To solve this problem, several researchs by molecular docking method have been conducted to design and discover disulfide cyclic peptide ligand which become potential inhibitors for neuraminidase H1N1 to inhibit the replication of this virus.

This research was studied and evaluated the interaction of ligands toward enzyme in the hydrated state using molecular dynamics simulation at two different temperatures. Simulations performed on three disulfide cyclic peptide inhibitors namely DNY, LRL, NNT along with oseltamivir, zanamivir as a standard ligand. The result provided that dynamic movement of five proposed ligand in the hydrate state affecting ligand interaction of the enzyme amino acid residues.

In the end of simulation, two of three disulfide cyclic peptide inhibitors have good interaction with catalytic site of the enzyme. At the end of simulation temperature of 300 K, DNY formed hydrogen bond with catalytic site Asp 151, Arg 293, LRL with Arg 118, Arg 293, NNY with Asp 151, Glu 425 and Arg 293. Then at the end of simulation temperature of 312 K, DNY could not form hydrogen bond with catalytic site of enzyme. LRL formed hydrogen bond with Asp 151, Glu 425, Tyr 402, NNY with Asp 151, Glu 278, and Arg 293. Different conformations of enzymes which occur during simulation showed the dynamic behaviour of the enzyme in the presence of solvent and inhibitor. The changing of enzymes conformation as the result of dynamic behaviour of the enzyme in the presence of solvent and inhibitor also could be seen in RMSD curve."