Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

"ABSTRACTTanaman obat dipercaya oleh masyarakat Indonesia memiliki berbagai khasiat untuk menyembuhkan penyakit. Senyawa aktif yangada pada tanaman dapat berasal dari metabolit sekunder ataudari bakteri endofit dan filosfer yang hidup berasosiasidengan tanaman obat. Sebanyak 18 isolat bakteri endofit dan 32 isolat bakteri filosfer telah dimurnikan dari tanaman Citrus sp.,Pluchea indica, Curcuma longa, Nothopanax scuttelarium,Piper crocatum, dan Andrographis paniculata.Sebanyak 72% isolat bakteri endofit memiliki aktivitasproteolitik dan sebanyak 11% memiliki aktivitas lipolitik.Bakteri filosfer yang memiliki aktivitas proteolitik sebanyak 59% dan sebanyak 19% memiliki aktivitas lipolitik. Analisis keragaman bakteri tersebut dilakukan dengan teknik amplified ribosomal DNArestriction analysis (ARDRA) dan digesti gen penyandi 16S rRNA dengan menggunakan enzim restriksi endonuklease MspI, RsaI, danSau961. Keragaman bakteri endofit dan filosfer pada beberapa sampel tanaman obat cukup tinggi. Bakteri yang diisolasi daritanaman obat yang sama tidak selalu memiliki kekerabatangenetik yang dekat. Sementara itu, bakteri asal tanaman P.indicamemiliki kekerabatan yang cukup dekat satu sama lain.

---

AbstractHerbal plants have been believed by Indonesians to be an alternative medicine to treat illnesses. The bioactivecompounds in the plant can be derived from secondary metabolites or from endophytic and phyllosphere bacteria which coexist within medicinal plants. A total of 18 endophytic bacteria and 32 phyllosphere bacteria were isolated from the herbal plants ofCitrus sp., Pluchea indica, Curcuma longa, Nothopanax scuttelarium, Piper rocatum, and Andrographis paniculata. About 72% of endophytic bacteria isolates have proteolytic activity and about 11% havelipolytic activity. On the other hand, about 59% of phyllosphere bacteria isolates have proteolytic activity and about 19% have lipolytic activity. Phylogenetic diversity analysis was conducted by using the amplified ribosomal DNA restriction analysis (ARDRA) method and the sequence of 16S rDNA was digested with endonuclease restrictionenzymes: MspI, RsaI, and Sau961. The diversity of endophytic and phyllosphere bacterium from the samples of herbal plants was high. Bacteria isolated from the same herbal plant does not always have a close genetic relationship except for the bacteria isolated from the P. indica plant which showed a close genetic relationship with each other."

"Buku yang berjudul "Duke's handbook of medicinal plants of Latin America" ini ditulis oleh James A. Duke, Mary Jo Bongenschutz-Godwin, dan Andrea R. Ottosen. Buku ini membahas tentang tumbuhan-tumbuhan Amerika Latin yang dapat diolah menjadi obat."

"Diabetes melitus merupakan gangguan metabolisme kronis yang ditandai dengan tingginya kadar glukosa darah. Salah satu terapi diabetes melitus yaitu menurunkan kadar glukosa post-prandial melalui penghambatan enzim yang menghidrolisis karbohidrat yaitu α-amilase dan α-glukosidase. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi golongan senyawa kimia dan mengetahui penghambatan aktivitas enzim pada 10 ekstrak tanaman yang digunakan secara tradisional sebagai antidiabetes. Ekstraksi dilakukan menggunakan metode refluks dengan etanol 70%. Uji penghambatan α-amilase dilakukan menggunakan spektrofotometer UV-Vis (λ=540 nm). Hasil menunjukkan bahwa ekstrak etanol daun bungur (Lagerstroemia speciosa (L.) Pers.) memiliki persen penghambatan terbesar yaitu 80,06%. Sedangkan, uji penghambatan α-glukosidase dilakukan menggunakan microplate reader (λ=405 nm). Hasil menunjukkan ekstrak etanol daun bungur memiliki aktivitas penghambatan terbaik dengan nilai IC50 33,86 μg/mL. Hasil penapisan fitokimia menunjukkan bahwa pada 10 ekstrak yang diuji umumnya mengandung golongan senyawa alkaloid, flavonoid, glikosida, saponin, tanin, dan terpenoid."

"Alzheimer merupakan penyakit neurodegeneratif yang dapat disebabkan oleh penumpukan plak tanda penuaan pada otak dan mempengaruhi kerja neuron sehingga neuron menjadi kurang sensitif terhadap respon selular. Penelitian terdahulu menemukan bahwa enzim BACE1 berperan penting dalam proses pembentukan plak tanda penuaan sehingga dapat menjadi target pengobatan penyakit Alzheimer. Pada penelitian ini, dilakukan penapisan virtual senyawa dari basis data tanaman obat Indonesia sebagai inhibitor BACE1 menggunakan Autodock dan Autodock Vina yang divalidasi menggunakan basis data A Directory of Useful Decoys: Enhanced (DUD-E). Validasi dilakukan terhadap kedua peranti lunak menggunakan parameter Enrichment Factor, Receiver Operating Characteristics, dan Area Under Curve. Kesimpulan dari validasi adalah ukuran grid box yang digunakan pada Autodock yaitu grid 30x30x30 dan 11,25x11,25x11,25 pada Vina (setelah penyetaraan unit). Nilai EF 1% dan AUC grid 30 pada Autodock adalah 7,74 dan 0,73, sedangkan pada Vina adalah 4,6 dan 0,77. Berdasarkan hasil penapisan virtual, diperoleh 6 peringkat teratas senyawa menggunakan Autodock (energi ikat kkal/mol -7,84 ~ -8,79) yaitu Azadiradione, Cylindrin, Lanosterol, Sapogenin, Simiarenol, dan Taraxerol. Hasil penapisan virtual pada Autodock Vina memberikan 7 senyawa peringkat teratas (energi ikat kkal/mol -8,8 ~ -9,4) yaitu Bryophyllin A, Diosgenin, Azadiradione, Sojagol, Beta amyrin, Epifriedelinol, dan Jasmolactone C. Hanya Azadiradione yang memberikan hasil penapisan virtual pada kedua peranti lunak dan berinteraksi dengan daerah aktif BACE1 pada residu Trp 76 dari Autodock dan Thr 232 dari Autodock Vina.

---

Lzheimer's is a neurodegenerative disease that can be caused by buildup of plaque signs of aging in the brain and affect the work of neurons so neurons become less sensitive to cellular responses. Research previously found that the BACE1 enzyme plays an important role in the process Plaque formation is a sign of aging so that it can become a treatment target Alzheimer's disease. In this study, virtual screening of compounds from database of Indonesian medicinal plants as using BACE1 inhibitors Autodock and Autodock Vina are validated using A database Directory of Useful Decoys: Enhanced (DUD-E). Validation is carried out against both software uses Enrichment Factor, Receiver Operating Characteristics, and Area Under Curve.

Conclusion of validation is the size of the grid box used in Autodock, which is a 30x30x30 and grid 11,25x11,25x,25,25 for Vina (after equalization unit). EF value of 1% and AUC grid 30 in Autodock is 7.74 and 0.73, while in Vina it is 4.6 and 0.77. Based on the results of virtual screening, obtained the top 6 compounds using Autodock (kcal / mol binding energy -7.84 ~ -8.79) namely Azadiradione, Cylindrin, Lanosterol, Sapogenin, Simiarenol, and Taraxerol. Screening results virtual on Autodock Vina provides 7 top-ranked compounds (binding energy kcal / mol -8.8 ~ -9.4) namely Bryophyllin A, Diosgenin, Azadiradione, Sojagol, Beta amyrin, Epifriedelinol, and Jasmolactone C. Only Azadiradione provide virtual screening results on both software and interact with BACE1 active area on Trp 76 residue from Autodock and Thr 232 from Autodock Vina."