Hasil Pencarian  ::  Simpan CSV :: Kembali

"Sebagai salah satu negara kepulauan terbesar di dunia dan memiliki kekayaan keanekaragaman hayati yang tinggi, membuat Indonesia memiliki banyak perbedaan pada kondisi lingkungan, tingkat keanekaragaman hayati, hingga pada tingkat komposisi kimia dan kuantitas suatu senyawa yang terdapat dalam suatu makhluk hidup, salah satunya adalah senyawa metabolit sekunder. Hal ini membuat perlu adanya analisis secara metabolomik terhadap suatu makhluk hidup dengan membandingkan lokasi yang berbeda. Phyllidiella nigra merupakan salah satu Nudibranchia yang banyak ditemui di Pulau Rambut dan Pulau Pramuka, Kepulauan Seribu, DKI Jakarta. Phyllidiella nigra mendapatkan metabolit sekunder dari mangsanya dengan cara mengakumulasi kemudian memanfaatkan senyawa metabolit sekunder untuk peran ekologisnya seperti sebagai antimicrobial, antifeedant, dan antifouling. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis dan mengetahui perbandingan metabolit sekunder pada Phyllidiella nigra di lokasi yang berbeda yaitu Pulau Rambut dan Pulau Pramuka. Sampel diambil dengan cara jelajah bebas sebanyak sepuluh sampel. Metabolit sekunder diekstraksi menggunakan metanol 96%, diuapkan, kemudian dideteksi menggunakan GC-MS. Data kemudian dianalisis dengan PCA dengan scatter plot dan HCA dengan dendrogram. Terdapat delapan senyawa yang dapat dianalisis, tiga senyawa diantaranya memiliki pengaruh yang tinggi dalam pembentukan kelompok yaitu 1-propene-1,2,3-tricarboxylic acid, tributyl ester; tributyl acetylcitrate; dan phenol, 2,4-bis (1,1- dimethylethyl)-. Senyawa metabolit sekunder di kedua pulau tidak ditemukan adanya perbedaan karena berdasarkan PCA dan HCA, sampel di kedua pulau saling campur dan tidak membentuk kelompok sesuai lokasinya yaitu Pulau Rambut dan Pulau Pramuka.

---

As one of the largest archipelagic countries in the world that is rich in biodiversity, Indonesia has various environmental conditions and biodiversity, either at the chemical composition and quantity contained in a living thing such as secondary metabolites. Hence, there is a need to perform a metabolomic analysis of a living thing that lived at different locations. Phyllidiella nigra is one of the Nudibranchia that is commonly found on Rambut Island and Pramuka Island, Kepulauan Seribu, DKI Jakarta. Phyllidiella nigra accumulates secondary metabolites from its prey and then used the compounds for several ecological roles such as antimicrobial, antifeedant, and antifouling. This study analyses and compares the secondary metabolites of Phyllidiella nigra from two different locations, namely Rambut Island and Pramuka Island. Samples were taken by free-roaming as many as ten. The secondary metabolites were extracted using 96% methanol, evaporated, and then detected using GC-MS. Data was then analyzed by PCA with scatter plot and HCA with dendrogram. Eight compounds could be analyzed, three of which were dominant on group formation, namely 1-propene-1,2,3-tricarboxylic acid, tributyl ester; tributyl acetylcitrate; and phenol, 2,4-bis (1,1-dimethylethyl)-. There were no differences in the secondary metabolites between islands. Based on PCA and HCA, the samples on the two islands mixed and did not form groups according to their location, namely Rambut Island and Pramuka Island."

"Ekstrak daun Dendrophthoe pentandra (L.) Miq. telah diketahui memiliki aktivitas antioksidan. Hal tersebut terkait dengan kandungan senyawa metabolit sekunder pada ekstrak daun yang berperan sebagai agen antioksidan. Adapun aktivitas antioksidan dari ekstrak daun D. pentandra dapat berbeda-beda tergantung dari spesies inang yang ditumpanginya. Namun, penelitian yang membandingkan aktivitas antioksidan D. pentandra pada inang yang berbeda belum banyak dilakukan. Tujuan dari penelitian ini yaitu membandingkan aktivitas antioksidan serta total kandungan fenol dan flavonoid ekstrak daun D. pentandra yang dikoleksi dari empat spesies inang (Melia azedarach, Syzygium aqueum, Trachelospermum jasminoides, dan Lagerstroemia speciosa) di Kampus Universitas Indonesia, serta menganalisis korelasi antara aktivitas antioksidan dengan total kandungan fenol dan flavonoid ekstrak daun D. pentandra. Aktivitas antioksidan ekstrak air daun D. pentandra diuji dengan metode 1,1-Diphenyl-2-Picrylhydrazyl (DPPH) dan analisis metabolit sekunder dilakukan dengan uji total phenol content (TPC) dan total flavonoid content (TFC). Berdasarkan uji ANOVA, diketahui bahwa aktivitas antioksidan, kandungan fenol serta flavonoid menunjukkan adanya perbedaan signifikan dari keempat spesies inang. Hasil penelitian menunjukkan bahwa semua ekstrak D. pentandra memiliki aktivitas antioksidan dengan rentang nilai IC50 sebesar 235,89—337,13 µg/ml. Hasil analisis korelasi menunjukkan bahwa tingginya aktivitas antioksidan berkorelasi kuat dengan kandungan fenol dan flavonoid. Ekstrak dengan aktivitas antioksidan tertinggi dihasilkan oleh inang L. speciosa (IC50= 235,89 µg/ml) dan M. azedarach (IC50= 236,46 µg/ml). Kedua inang tersebut juga terkonfirmasi memiliki kandungan fenol dan flavonoid tertinggi, yaitu berturut-turut 190,76 Gallic Acid Equivalent (mg GAE/g) dan 190,67 Quercetin Equivalent (mg QE/g) (L. speciosa); serta 187,20 mg GAE/g dan170,67 mg QE/g (M. azedarach).

---

Leaves extracts of Dendrophthoe pentandra (L.) Miq. has been known to have antioxidant activity. The level of antioxidant activity of D. pentandra individuals may be varied according to its secondary metabolite composition. As the secondary metabolite composition of a D. pentandra individual is affected by its host species, antioxidant activity of the individual may also differ according to the host species. The aims of this study were to investigate the antioxidant activity, total phenols and flavonoids contents of D. pentandra leaves water extracts collected from four host species (Melia azedarach, Syzygium aqueum, Trachelospermum jasminoides, and Lagerstroemia speciosa) in Universitas Indonesia Campus, and analyze the correlation between antioxidant activity and the total phenols and flavonoids contents of D. pentandra leaves water extracts. Antioxidant activity of each extract was evaluated using 1,1-Diphenyl-2-Picrylhydrazyl (DPPH) assay, while the secondary metabolite analysis was performed using total phenol content (TPC) and total flavonoid content (TFC) assay. Based on the ANOVA test, the antioxidant activity, phenols content, and flavonoid contents of all extracts were significantly different. The IC50 value obtained from DPPH assay from all extracts ranged from 235.89 µg/ml to 337.13 µg/ml. Moreover, the antioxidant activity of the samples was correlated strongly with phenols and flavonoids contents. The highest antioxidant activity was presented by L. speciosa (IC50= 235.89 µg/ml) and M.azedarach (IC50= 236.46 µg/ml). Those two extracts also confirmed to have the highest phenols and flavonoids contents, respectively 190.76 Gallic Acid Equivalent (mg GAE/g) and 190.67 Quercetin Equivalent (mg QE/g) (L. speciosa); also 187.20 mg GAE/g and 170.67 mg QE/g (M. azedarach)."

"Penelitian yang dilakukan bertujuan untuk mengetahui senyawa metabolit sekunder hasil isolasi dari ekstrak etil asetat yang terdapat pada Bionutrien AGF. Bionutrien AGF merupakan pupuk alami yang berfungsi sebagai pemberi nutrisi dan meningkatkan daya tahan tanaman. Metode isolasi yang digunakan dalam penelitian ini adalah dengan cara maserasi menggunakan pelarut etil asetat. Pemisahan dan pemurnian senyawa dilakukan dengan menggunakan beberapa teknik kromatografi yaitu kromatografi cair vakum (KCV) dan kromatografi lapis tipis (KLT). Selanjutnya analisis kandungan senyawa menggunakan teknik spektroskopi yaitu FTIR dan GC-MS. Berdasarkan hasil analisis GC-MS pada fraksi non polar dari etil asetat terdapat 32 senyawa termasuk didalamnya tiga senyawa utama yaitu squalen, kariofilen dan kariofilen oksida dengan kadar masing-masing secara berturut-turut 11,34% , 15,81% dan 22,53%. Kata kunci : bionutrien, maserasi, kromatografi, squalen, kariofilen, kariofilen oksida. Isolation and characterization of secondary metabolites component from Bionutrien AGF ethyl acetat extract was cure out. Bionutrien AGF used to biofertilizer that can be a provide nutritions and increases plant resistance. The method used in this study was maceration with ethyl acetat as the solvent. Separation and purification of component made using several chromatographic techniques, including vacuum liquid chromatography (KCV) and thin layer chromatography (TLC). Further analysis of compounds using IR spectroscopy and GC-MS. According to GC-MS results the non-polar fraction of ethyl acetate containing 32 component including three main component are squalene (11,34%), caryophyllene (15,81% ) and caryophyllene oxide (22,53 %). "

"Penelitian biosintesis nanopartikel perak (AgNP) menggunakan ekstrak tumbuhan banyak dikembangkan karena ramah lingkungan dan hemat biaya. Salah satu spesies dari genus Diospyros yang telah diketahui potensinya untuk biosintesis AgNP yaitu Diospyros celebica Bakh. (eboni). Penelitian ini dilakukan untuk mengeksplorasi kembali biosintesis AgNP menggunakan air rebusan daun eboni dengan variasi pada parameter biosintesis, yakni rasio volume ekstrak dan AgNO3 (v/v). Tujuan penelitian ini ialah: (1) memperoleh AgNP dari hasil biosintesis menggunakan air rebusan daun eboni; (2) menganalisis spektrum UV-Vis yang terbentuk dari berbagai rasio volume ekstrak dan AgNO3 (5,0:1; 2,0:1; 0,5:1; 0,2:1; 0,1:1) selama waktu reaksi (25 menit, 1 jam, 3 jam, 24 jam); dan (3) mengetahui senyawa yang terkandung dalam air rebusan daun eboni. Pengamatan AgNP dilakukan dengan melihat perubahan warna larutan dan spektrum UV-Vis. Uji kualitatif fitokimia dan spektrum UV-Vis dari ekstrak digunakan untuk memprediksi senyawa yang bertindak sebagai reduktor. Hasil penelitian menunjukkan warna larutan berubah dari kuning muda menjadi cokelat keabuan, yang mengindikasikan terbentuknya AgNP. Keberadaan AgNP dalam larutan dikonfirmasi dengan terbentuknya puncak absorbansi di 350-700 nm. Analisis spektrum UV-Vis menunjukkan laju pembentukkan AgNP tercepat dan jumlah AgNP terbanyak berada pada rasio 0,2:1. Namun demikian, stabilitas AgNP yang terbaik ditunjukkan pada rasio 0,5:1. Bentuk AgNP pada rasio 0,5:1; 0,2:1; dan 0,1:1 bervariasi, yaitu batang, bola, oval, dan pelat, berdasarkan analisis dekonvolusi. Air rebusan daun eboni mengandung senyawa fenol, flavonoid, saponin, alkaloid, dan senyawa turunan klorofil, yang mungkin berperan penting dalam proses biosintesis nanopartikel perak tersebut.

---

Research on biosynthesis of silver nanoparticles (AgNP) using plant extracts is growing rapidly because eco-friendly and cost-effective. One species of the genus Diospyros that has known potential for AgNP biosynthesis is Diospyros celebica Bakh. (ebony). This study was conducted to explore AgNP biosynthesis using boiled water extract from ebony leaves with variation in biosynthetic parameter, which is volume ratio of extract and AgNO3. This study aim: (1) to obtain AgNP from biosynthesis using boiled water extract of ebony leaves; (2) to analyze the UV-Vis spectrum from biosynthetic solutions with various volume ratios of extracts and AgNO3 (5.0:1; 2.0:1; 0.5:1; 0.2:1; 0.1:1) during reaction time (25 minutes, 1 hour, 3 hours, 24 hours); and (3) to determine phytochemical compounds contained in boiled water extract of ebony leaves. Silver nanoparticles was observed by discoloration of the solution and UV-Vis spectrum. Phytochemical qualitative test and UV-Vis spectrum of extract was performed to predict compounds that act as reductant. The results showed that the mixture colour changed from light yellow to grayish brown, which indicates formation of silver nanoparticles. The presence of silver nanoparticles in solution was confirmed by absorbance peaks at 350-700 nm. UV-Vis spectrum analysis showed the fastest formation rate of AgNP, and the highest number of AgNP was at ratio 0.2:1. However, the best stability of AgNP were showed at ratio 0.5:1. The shapes of AgNP in ratio of 0.5:1; 0.2:1; and 0.1:1 varies, which are rod, sphere, oval, and plate, based on the deconvolution analysis. Boiled water extract of ebony leaves contained phenolic compound, flavonoid, saponin, alkaloid, and chlorophyll derivates, which may play an important role in the biosynthesis of silver nanoparticles."

"Hakim A. 2010. The diversity of secondary metabolites from Genus Artocarpus (Moraceae). Nusantara Bioscience 2:146-156.Several species of the Artocarpus genus (Moraceae) have been investigated their natural product. The secondary metabolitessuccessfully being isolatad from Artocarpus genus consist of terpenoid, flavonoids, stilbenoid, arylbenzofuran, neolignan, and adductDiels-Alder. Flavonoid group represent the compound which is the most found from Artocarpus plant. The flavonoids compound whichare successfully isolated from Artocarpus plant consist of the varied frameworks like chalcone, flavanone, flavan-3-ol, simple flavone,prenylflavone, oxepinoflavone, pyranoflavone, dihydrobenzoxanthone, furanodihydrobenzoxanthone, pyranodihydrobenzoxanthone,quinonoxanthone, cyclopentenoxanthone, xanthonolide, dihydroxanthone."

"Pandemi yang disebabkan oleh SARS-CoV-2 telah memicu situasi darurat kesehatan di seluruh dunia. Varian Omicron yang menyebar dengan cepat semakin mendesak pencarian terapi yang tepat untuk menghindari infeksi yang lebih berat. TMPRSS2 manusia dan protein spike SARS-CoV-2 varian Omicron diidentifikasi sebagai protein target melalui penapisan secara komputasi. Metode yang digunakan adalah penapisan virtual berbasis struktural; analisis prediksi absorption, distribution, metabolism, excretion, dan toxicity (ADMET); dan simulasi dinamika molekuler. Ligan uji yang digunakan adalah senyawa metabolit sekunder invertebrata laut Indonesia. Camostat dan nafamostat (ko-kristal) digunakan sebagai ligan pembanding terhadap penghambatan TMPRSS2 sedangkan mefloquine ligan pembanding terhadap Protein Spike. Berdasarkan hasil penambatan molekul, acanthomanzamine C (-9,75 kkal/mol) dan cortistatin G (-9,39 kkal/mol) memiliki aktivitas yang lebih baik terhadap penghambatan TMPRSS2 dibandingkan dengan camostat (-8,25 kkal/mol) dan nafamostat (-6,52 kkal/mol). Sebagai inhibitor protein spike SARS-CoV-2 varian Omicron, acanthomanzamine C (-9,19 kkal/mol) dan cortistatin J (-8,89 kkal/mol) juga menunjukkan penghambatan yang lebih baik dibandingkan dengan mefloquine (-6,34 kkal/mol). Ligan uji tersebut juga telah memenuhi seluruh kriteria ADMET yang ditetapkan. Dari hasil analisis simulasi dinamika molekuler menunjukkan pengikatan yang stabil senyawa ligan uji terhadap protein target setelah simulasi berjalan 60 nanodetik dan memiliki energi ikatan bebas MMGBSA dan MMPBSA yang lebih baik dibandingkan ligan pembanding diantaranya TMPRSS2–acanthomanzamine C (-28,2067; -24,6639 kkal/mol), TMPRSS2–cortistatin G (-29,9908; -24,8869 kkal/mol), protein spike–acanthomanzamine C (-45,1414; -27,8749 kkal/mol), dan protein spike–cortistatin J (-37,8537; -35,6439 kkal/mol). Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa acanthomanzamine C, cortistatin G, dan cortistatin J merupakan senyawa hits sebagai kandidat terapi untuk infeksi SARS-CoV-2.

---

The pandemic caused by SARS-CoV-2 has triggered a global health emergency. The rapid spread of the Omicron variant has further intensified the urgency to search for appropriate therapies to prevent severe infections. The human TMPRSS2 and spike protein of the SARS-CoV-2 Omicron variant were identified as the target proteins through computational screening. The methods used are structure-based virtual screening; absorption, distribution, metabolism, excretion, and toxicity (ADMET) analysis; and molecular dynamics simulation. Bioactive marine invertebrates from Indonesia were employed as test ligands. Camostat and nafamostat (co-crystal) were utilized as reference ligands against TMPRSS2, whereas mefloquine was used as a reference ligand against spike protein. Following a molecular docking, acanthomanzamine C (-9,75 kcal/mol) and cortistatin G (-9,39 kcal/mol) had better activity against TMPRSS2 inhibition compared to camostat (-8,25 kcal/mol) and nafamostat (-6,52 kcal/mol). As inhibitors of spike protein of SARS-CoV-2 Omicron variant, acanthomanzamine C (-9,19 kcal/mol) and cortistatin J (-8,89 kcal/mol) also showed better inhibition compared to mefloquine (-6,34 kcal/mol). The test ligands have also met all the established ADMET criteria. The results of the molecular dynamics analysis showed stable binding of the test ligands to the target proteins after the initial 60 nanoseconds and had free binding energies of MMGBSA/MMPBSA that were better than the comparison ligands, including TMPRSS2–acanthomanzamine C (-28,2067; -24,6639 kcal/mol), TMPRSS2–cortistatin G (-29,9908; -24,8869 kcal/mol), spike protein–acanthomanzamine C (-45,1414; -27,8749 kcal/mol), and spike protein–cortistatin J (-37,8537; -35,6439 kcal/mol).  These results indicate that acanthomanzamine C, cortistatin G, and cortistatin J are hits compounds as candidate therapies for SARS-CoV-2 infection."

"Dewasa ini, biosintesis nanopartikel menjadi hal yang menarik dan banyak dikembangkan oleh para peneliti karena ramah lingkungan dan kemampuannya dalam mensintesis nanopartikel logam, oksida, maupun nanopartikel magnetik. Penelitian ini mempelajari biosintesis nanopartikel magnetik oksida besi menggunakan ekstrak daun Pometia pinnata J.R.Frost. G.Forst. Oleh karena itu, dilakukan empat metode sintesis yang berbeda yang nantinya akan dipelajari pengaruh perbedaan sintesis tersebut terhadap struktur serta ukuran nanopartikel yang dihasilkan.Pembentukan nanopartikel magnetik dapat terlihat dari perubahan warna larutan serta terdapatnya partikel yang tertarik saat didekatkan dengan magnet. Perbedaan metode sintesis memperlihatkan perubahan warna larutan yang berbeda, namun semuanya memperlihatkan bahwa nanopartikel yang dihasilkan bersifat magnetik. Karakterisasi sifat optik nanopartikel yang dihasilkan dipelajari menggunakan UV-Vis, serta karakterisasi strukturnya dipelajari menggunakan TEM, PSA, XRD, dan TGA.Dari hasil karakterisasi tersebut memperlihatkan bahwa dengan metode sintesis yang berbeda, semuanya menghasilkan partikel yang berukuran nanometer dan memiliki sifat magnet. Dari hasil karakterisasi menggunakan XRD, ke-empat sampel memperlihatkan struktur amorf. Dengan metode sintesis yang sama, namun dengan prekursor yang berbeda yaitu Fe NO3 3.9H2O serta dilakukan annealing terhadap sampel 3 dan sampel 4, puncak XRD baru dapat terlihat. Puncak-puncak yang terdeteksi pada XRD setelah proses annealing adalah puncak-puncak yang dimiliki oleh fasa Fe3O4.

---

Biosynthesis of nanoparticles has become a great interest in recent times due to their environmental friendly and capability for preparing metallic, oxides, and also magnetic nanoparticles. This particular research is studying about biosynthesis of magnetic nanoparticle using Pometia pinnata J.R.Frost. G.Forst. leaves extract with a precursor of FeCl3.6H2O. Therefore, we will do 4 different synthesis methods and observe the effect of the synthesis methods to structure and size of produced nanoparticle.

The formation of magnetic nanoparticles could be observed through the changes of solution colour and the availability of particles pulled by magnet. Each synthesis methods shows different colour of solution, however every methods are resulting nanoparticles with magnetic properties. Optical properties of produced nanoparticles are studied using UV Vis Spectroscopy, while the structure characteristics are studied using TEM, PSA, XRD, and TGA.

The characterization results shows that all four of different synthetic methods are producing particles with nanometer size and have magnetic properties. From the XRD results, all four samples showing amorphous structure. With the same methods, but with different precursor, which is Fe NO3 3.9H2O, and with the annealing process done to sample 3 and 4, the peaks in the XRD results will be revealed. The peaks detected in XRD results after annealing process is the same peaks that owned by Fe3O4 phase. "